More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0951 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_0204  reverse gyrase  35.05 
 
 		 1231 aa  637    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0575  reverse gyrase  36.08 
 
 		 1283 aa  685    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0951  reverse gyrase  100 
 
 		 1030 aa  2092    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1245  reverse gyrase  35.32 
 
 		 1237 aa  655    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.000744005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1363  reverse gyrase  35.93 
 
 		 1124 aa  633  1e-180  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0692  reverse gyrase  36.38 
 
 		 1232 aa  630  1e-179  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000186605 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1663  reverse gyrase  36.68 
 
 		 1144 aa  632  1e-179  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1396  reverse gyrase  35.43 
 
 		 1242 aa  628  1e-178  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0259  reverse gyrase  34.9 
 
 		 1227 aa  626  1e-178  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.665057  normal  0.100628 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0014  reverse gyrase  36.51 
 
 		 1122 aa  625  1e-177  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.492155  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0775  reverse gyrase  38.33 
 
 		 1104 aa  620  1e-176  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0811  reverse gyrase  33.94 
 
 		 1284 aa  622  1e-176  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0752  reverse gyrase  38.52 
 
 		 1104 aa  617  1e-175  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.412278  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2236  reverse gyrase  34.61 
 
 		 1220 aa  619  1e-175  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.309719  hitchhiker  0.000091621 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1131  reverse gyrase  38.07 
 
 		 1122 aa  613  9.999999999999999e-175  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1941  reverse gyrase  33.47 
 
 		 1166 aa  550  1e-155  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1418  reverse gyrase  32.5 
 
 		 1143 aa  533  1e-150  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00239755  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1748  reverse gyrase  33.76 
 
 		 1149 aa  533  1e-150  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.21829  normal  0.0908503 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0460  DNA topoisomerase I  29.77 
 
 		 702 aa  214  7e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.159815  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1381  DNA topoisomerase I  30.28 
 
 		 696 aa  207  1e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1984  DNA topoisomerase I  28.94 
 
 		 710 aa  206  2e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.073944  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0600  DNA topoisomerase I  30.16 
 
 		 711 aa  204  7e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00101448  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1223  DNA topoisomerase I  29.82 
 
 		 697 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1026  DNA topoisomerase I  29.55 
 
 		 697 aa  200  9e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00786254  unclonable  0.0000000108626 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1700  DNA topoisomerase I  30.61 
 
 		 693 aa  199  3e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00616947  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0572  DNA topoisomerase I  27.89 
 
 		 686 aa  199  3e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0758735  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1381  DNA topoisomerase I  29.25 
 
 		 695 aa  197  6e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.500118 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2212  DNA topoisomerase I  29.42 
 
 		 798 aa  197  7e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0083  DNA topoisomerase I  28.24 
 
 		 751 aa  196  1e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1346  DNA topoisomerase I  29.84 
 
 		 708 aa  196  1e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000122971  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0779  DNA topoisomerase I  28.76 
 
 		 706 aa  197  1e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000394767  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07540  DNA topoisomerase I  29.28 
 
 		 691 aa  196  2e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00641456  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1851  DNA topoisomerase I  29.79 
 
 		 839 aa  195  3e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2658  DNA topoisomerase I  29.48 
 
 		 859 aa  195  4e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00218044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1526  DNA topoisomerase I  30.79 
 
 		 696 aa  194  6e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000864041  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02352  DNA topoisomerase I  28.97 
 
 		 886 aa  194  7e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.346512  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1660  DNA topoisomerase I  27.44 
 
 		 894 aa  194  9e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.367793  unclonable  0.0000368554 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3717  DNA topoisomerase I  28.43 
 
 		 696 aa  193  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000589001  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1024  DNA topoisomerase I  29.38 
 
 		 696 aa  194  1e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.352033  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1585  DNA topoisomerase I  27.44 
 
 		 894 aa  193  1e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.328544  normal  0.0409432 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1289  DNA topoisomerase I  28.31 
 
 		 684 aa  192  2.9999999999999997e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.781177  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4636  DNA topoisomerase I  27.7 
 
 		 894 aa  192  2.9999999999999997e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3437  DNA topoisomerase I  28.82 
 
 		 872 aa  192  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.500167 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2200  DNA topoisomerase I  27.58 
 
 		 895 aa  192  2.9999999999999997e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.170187  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2139  DNA topoisomerase I  29.48 
 
 		 869 aa  191  4e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.124713 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3603  DNA topoisomerase I  29.48 
 
 		 869 aa  191  4e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0171104  normal  0.313127 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2842  DNA topoisomerase I  27.68 
 
 		 798 aa  192  4e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1956  DNA topoisomerase I  29.37 
 
 		 700 aa  191  4e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1674  DNA topoisomerase I  29.37 
 
 		 700 aa  192  4e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2705  DNA topoisomerase I  27.66 
 
 		 878 aa  191  5e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1679  DNA topoisomerase I  29.48 
 
 		 869 aa  191  5e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229175 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3656  DNA topoisomerase I  30.05 
 
 		 692 aa  191  5e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000216314  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1729  DNA topoisomerase I  27.15 
 
 		 894 aa  191  5.999999999999999e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0724746 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2148  DNA topoisomerase I  28.32 
 
 		 868 aa  191  9e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1615  DNA topoisomerase I  29.45 
 
 		 836 aa  190  9e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.830191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0747  DNA topoisomerase I  27.96 
 
 		 694 aa  190  1e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.894323  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1102  DNA topoisomerase I  29.59 
 
 		 691 aa  189  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000153126  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3876  DNA topoisomerase I  29.23 
 
 		 876 aa  189  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.198302  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25110  DNA topoisomerase I  28.16 
 
 		 868 aa  189  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3875  DNA topoisomerase I  29.7 
 
 		 692 aa  188  4e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000221974  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1655  DNA topoisomerase I  29.32 
 
 		 869 aa  188  5e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.967668  normal  0.788315 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1304  DNA topoisomerase I  29.32 
 
 		 708 aa  188  5e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.01574  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3287  DNA topoisomerase I  28.8 
 
 		 870 aa  187  6e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2433  DNA topoisomerase I  28.39 
 
 		 798 aa  187  6e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.336729  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3340  DNA topoisomerase  28.48 
 
 		 853 aa  187  6e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0213  DNA topoisomerase I  27.32 
 
 		 767 aa  188  6e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00304522  normal  0.312261 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1027  DNA topoisomerase I  28.03 
 
 		 702 aa  187  1.0000000000000001e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0873  DNA topoisomerase I  26.61 
 
 		 877 aa  187  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.143011 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0846  DNA topoisomerase I  26.61 
 
 		 877 aa  187  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3880  DNA topoisomerase I  29.54 
 
 		 692 aa  187  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000115411  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1312  DNA topoisomerase I  29.72 
 
 		 692 aa  186  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000876522  unclonable  7.60195e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3684  DNA topoisomerase I  29.21 
 
 		 692 aa  186  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0116868  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3592  DNA topoisomerase I  29.21 
 
 		 692 aa  186  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00080901  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3971  DNA topoisomerase I  29.21 
 
 		 692 aa  186  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000571341  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0485  DNA topoisomerase I  26.32 
 
 		 711 aa  186  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3845  DNA topoisomerase I  29.21 
 
 		 692 aa  186  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.270330000000001e-60 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2463  DNA topoisomerase I  27.91 
 
 		 804 aa  185  3e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0304  DNA topoisomerase I  28.83 
 
 		 748 aa  186  3e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000372801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3574  DNA topoisomerase I  29.04 
 
 		 692 aa  186  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000026995  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1560  DNA topoisomerase I  27.3 
 
 		 877 aa  186  3e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2230  DNA topoisomerase I  28.34 
 
 		 694 aa  184  5.0000000000000004e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2250  DNA topoisomerase I  26.99 
 
 		 880 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2485  DNA topoisomerase I  28.67 
 
 		 692 aa  184  5.0000000000000004e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000595417  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2356  DNA topoisomerase I  27.11 
 
 		 879 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0613436  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1021  DNA topoisomerase I  28.45 
 
 		 669 aa  185  5.0000000000000004e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0905515  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3931  DNA topoisomerase I  29.37 
 
 		 692 aa  184  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000332787  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2181  DNA topoisomerase I  29.59 
 
 		 693 aa  184  6e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0024842  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0840  DNA topoisomerase  27.77 
 
 		 694 aa  184  6e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000150599  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0196  DNA topoisomerase  28.73 
 
 		 835 aa  184  7e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1583  DNA topoisomerase I  28.36 
 
 		 868 aa  184  8.000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.590699 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3514  DNA topoisomerase I  28.96 
 
 		 869 aa  184  8.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0158  DNA topoisomerase I  27.72 
 
 		 765 aa  184  8.000000000000001e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1430  DNA topoisomerase I  28.27 
 
 		 789 aa  184  9.000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000308935  decreased coverage  0.00155997 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1013  DNA topoisomerase I, putative  30.02 
 
 		 705 aa  184  9.000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1335  DNA topoisomerase I  28.55 
 
 		 691 aa  183  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.419976  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0358  DNA topoisomerase I  27.8 
 
 		 683 aa  183  1e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000301729  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2328  DNA topoisomerase I  28.15 
 
 		 895 aa  183  1e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.664503  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1310  DNA topoisomerase I  28.55 
 
 		 691 aa  183  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2296  DNA topoisomerase I  28.05 
 
 		 704 aa  183  1e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0011  DNA topoisomerase I  28.81 
 
 		 760 aa  182  2e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>