More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_2236 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_0204  reverse gyrase  37.34 
 
 		 1231 aa  750    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1396  reverse gyrase  51.36 
 
 		 1242 aa  1256    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1363  reverse gyrase  35.74 
 
 		 1124 aa  645    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0259  reverse gyrase  37.44 
 
 		 1227 aa  737    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.665057  normal  0.100628 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0014  reverse gyrase  36.83 
 
 		 1122 aa  642    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.492155  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0692  reverse gyrase  35.71 
 
 		 1232 aa  727    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000186605 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0811  reverse gyrase  36.66 
 
 		 1284 aa  704    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1131  reverse gyrase  36.53 
 
 		 1122 aa  663    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1663  reverse gyrase  36.52 
 
 		 1144 aa  662    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0575  reverse gyrase  37.37 
 
 		 1283 aa  758    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1245  reverse gyrase  38.21 
 
 		 1237 aa  759    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.000744005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2236  reverse gyrase  100 
 
 		 1220 aa  2485    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.309719  hitchhiker  0.000091621 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1941  reverse gyrase  34 
 
 		 1166 aa  630  1e-179  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0951  reverse gyrase  34.31 
 
 		 1030 aa  608  9.999999999999999e-173  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1748  reverse gyrase  34.5 
 
 		 1149 aa  608  9.999999999999999e-173  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.21829  normal  0.0908503 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1418  reverse gyrase  35 
 
 		 1143 aa  597  1e-169  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00239755  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0775  reverse gyrase  34.91 
 
 		 1104 aa  587  1e-166  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0752  reverse gyrase  34.64 
 
 		 1104 aa  580  1e-164  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.412278  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0083  DNA topoisomerase I  29.39 
 
 		 751 aa  213  2e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07540  DNA topoisomerase I  29.97 
 
 		 691 aa  212  4e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00641456  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1223  DNA topoisomerase I  28.85 
 
 		 697 aa  209  2e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25110  DNA topoisomerase I  29.38 
 
 		 868 aa  209  3e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2148  DNA topoisomerase I  29.38 
 
 		 868 aa  208  4e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0572  DNA topoisomerase I  29.63 
 
 		 686 aa  208  5e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0758735  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1310  DNA topoisomerase I  28.31 
 
 		 691 aa  207  8e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1335  DNA topoisomerase I  28.31 
 
 		 691 aa  207  8e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.419976  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0816  DNA topoisomerase I  29.22 
 
 		 689 aa  205  4e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.996687  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1526  DNA topoisomerase I  29.48 
 
 		 696 aa  203  1.9999999999999998e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000864041  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2658  DNA topoisomerase I  27.8 
 
 		 859 aa  201  7e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00218044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1289  DNA topoisomerase I  27.91 
 
 		 684 aa  199  3e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.781177  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02352  DNA topoisomerase I  29 
 
 		 886 aa  199  3e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.346512  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2139  DNA topoisomerase I  29.39 
 
 		 869 aa  199  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.124713 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3603  DNA topoisomerase I  29.39 
 
 		 869 aa  199  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0171104  normal  0.313127 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1984  DNA topoisomerase I  28.06 
 
 		 710 aa  199  4.0000000000000005e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.073944  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14470  DNA topoisomerase I  28.33 
 
 		 868 aa  199  4.0000000000000005e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1679  DNA topoisomerase I  29.39 
 
 		 869 aa  199  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229175 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1381  DNA topoisomerase I  28.59 
 
 		 696 aa  198  6e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1655  DNA topoisomerase I  29.24 
 
 		 869 aa  197  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.967668  normal  0.788315 
 
 
-
 
NC_002978  WD1133  DNA topoisomerase I  27.51 
 
 		 816 aa  197  1e-48  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4953  DNA topoisomerase I  28.34 
 
 		 946 aa  197  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.47647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0840  DNA topoisomerase  29.12 
 
 		 694 aa  197  1e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000150599  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1700  DNA topoisomerase I  28.72 
 
 		 693 aa  197  1e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00616947  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0600  DNA topoisomerase I  28.75 
 
 		 711 aa  197  1e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00101448  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1430  DNA topoisomerase I  28.51 
 
 		 789 aa  196  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000308935  decreased coverage  0.00155997 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3876  DNA topoisomerase I  28.35 
 
 		 876 aa  196  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.198302  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1026  DNA topoisomerase I  27.42 
 
 		 697 aa  194  6e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00786254  unclonable  0.0000000108626 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1535  DNA topoisomerase I  28.26 
 
 		 896 aa  194  8e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.351865  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2181  DNA topoisomerase I  29.58 
 
 		 693 aa  194  9e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0024842  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2839  DNA topoisomerase I  27.44 
 
 		 768 aa  194  1e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3469  DNA topoisomerase I  29.31 
 
 		 891 aa  193  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.661677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1381  DNA topoisomerase I  27.67 
 
 		 695 aa  193  2e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.500118 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0378  DNA topoisomerase I  27.65 
 
 		 905 aa  193  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.381193  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0334  DNA topoisomerase I  27.42 
 
 		 825 aa  192  2.9999999999999997e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0460  DNA topoisomerase I  27.58 
 
 		 702 aa  192  2.9999999999999997e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.159815  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3340  DNA topoisomerase  27.93 
 
 		 853 aa  192  2.9999999999999997e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2212  DNA topoisomerase I  27.56 
 
 		 798 aa  192  2.9999999999999997e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0161  DNA topoisomerase I  28.26 
 
 		 695 aa  192  4e-47  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0213  DNA topoisomerase I  26.52 
 
 		 767 aa  192  4e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00304522  normal  0.312261 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2250  DNA topoisomerase I  28.86 
 
 		 880 aa  191  5.999999999999999e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1803  DNA topoisomerase I  27.91 
 
 		 906 aa  191  5.999999999999999e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0789615  hitchhiker  0.0000387309 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2433  DNA topoisomerase I  26.94 
 
 		 798 aa  191  7e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.336729  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2073  DNA topoisomerase I  26.44 
 
 		 802 aa  191  7e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2356  DNA topoisomerase I  28.97 
 
 		 879 aa  191  9e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0613436  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2609  DNA topoisomerase I  28.42 
 
 		 880 aa  190  1e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0281339  decreased coverage  0.00102405 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2489  DNA topoisomerase I  28.42 
 
 		 880 aa  190  1e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.297791  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1855  DNA topoisomerase I  28.42 
 
 		 880 aa  190  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000497797 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2496  DNA topoisomerase I  28.42 
 
 		 880 aa  190  1e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0106  DNA topoisomerase I  27.37 
 
 		 747 aa  190  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1674  DNA topoisomerase I  27.73 
 
 		 700 aa  190  1e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1690  DNA topoisomerase I  27.99 
 
 		 836 aa  189  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0132784  unclonable  0.00000000244427 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1956  DNA topoisomerase I  27.58 
 
 		 700 aa  189  2e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3514  DNA topoisomerase I  27.75 
 
 		 869 aa  189  3e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1347  DNA topoisomerase I  28.46 
 
 		 780 aa  189  4e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000873362  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0497  DNA topoisomerase I  28.79 
 
 		 919 aa  189  4e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.324618  normal  0.923376 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1583  DNA topoisomerase I  27.88 
 
 		 868 aa  189  4e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.590699 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0302  DNA topoisomerase I  28.95 
 
 		 857 aa  188  5e-46  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0358  DNA topoisomerase I  28.66 
 
 		 683 aa  188  6e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000301729  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9223  DNA topoisomerase  28.46 
 
 		 883 aa  187  7e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1971  DNA topoisomerase I  28.41 
 
 		 883 aa  188  7e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.819086  normal  0.697086 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1322  DNA topoisomerase I  28.01 
 
 		 872 aa  187  8e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.425671  normal  0.143441 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1021  DNA topoisomerase I  27.55 
 
 		 669 aa  187  9e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0905515  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3287  DNA topoisomerase I  27.58 
 
 		 870 aa  187  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3437  DNA topoisomerase I  28.53 
 
 		 872 aa  187  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.500167 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0916  DNA topoisomerase I  28.29 
 
 		 693 aa  187  1.0000000000000001e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000916095  hitchhiker  0.000814664 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0171  DNA topoisomerase I  27.67 
 
 		 743 aa  186  2.0000000000000003e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2420  DNA topoisomerase I  28.92 
 
 		 715 aa  186  2.0000000000000003e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2478  DNA topoisomerase I  28.24 
 
 		 895 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0075  DNA topoisomerase I  26.61 
 
 		 798 aa  186  3e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2001  DNA topoisomerase I  27.95 
 
 		 964 aa  185  4.0000000000000006e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2230  DNA topoisomerase I  28.44 
 
 		 694 aa  185  4.0000000000000006e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2842  DNA topoisomerase I  26.7 
 
 		 798 aa  185  5.0000000000000004e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1615  DNA topoisomerase I  28.02 
 
 		 836 aa  185  5.0000000000000004e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.830191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1346  DNA topoisomerase I  29.46 
 
 		 708 aa  185  6e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000122971  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2841  DNA topoisomerase I  28.21 
 
 		 889 aa  184  6e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.598505  hitchhiker  0.00000400834 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1851  DNA topoisomerase I  28.38 
 
 		 839 aa  185  6e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0109  DNA topoisomerase I  27.26 
 
 		 799 aa  184  8.000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0191  DNA topoisomerase I  26.95 
 
 		 823 aa  184  9.000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2463  DNA topoisomerase I  27.01 
 
 		 804 aa  184  9.000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2069  DNA topoisomerase I  27.88 
 
 		 758 aa  184  9.000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1551  DNA topoisomerase I  27.22 
 
 		 689 aa  184  1e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>