More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1396 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1396  reverse gyrase  100 
 
 		 1242 aa  2520    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1941  reverse gyrase  35.66 
 
 		 1166 aa  638    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1131  reverse gyrase  36.79 
 
 		 1122 aa  649    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1663  reverse gyrase  34.56 
 
 		 1144 aa  657    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0692  reverse gyrase  36.22 
 
 		 1232 aa  705    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000186605 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0811  reverse gyrase  37.03 
 
 		 1284 aa  722    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0259  reverse gyrase  36.05 
 
 		 1227 aa  708    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.665057  normal  0.100628 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0014  reverse gyrase  35.41 
 
 		 1122 aa  643    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.492155  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0204  reverse gyrase  35.25 
 
 		 1231 aa  719    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2236  reverse gyrase  51.36 
 
 		 1220 aa  1273    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.309719  hitchhiker  0.000091621 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0575  reverse gyrase  37.04 
 
 		 1283 aa  751    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1245  reverse gyrase  36.09 
 
 		 1237 aa  729    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.000744005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1363  reverse gyrase  34.85 
 
 		 1124 aa  636    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0951  reverse gyrase  35.56 
 
 		 1030 aa  630  1e-179  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1418  reverse gyrase  35.05 
 
 		 1143 aa  627  1e-178  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00239755  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0752  reverse gyrase  35.38 
 
 		 1104 aa  589  1e-166  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.412278  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0775  reverse gyrase  34.98 
 
 		 1104 aa  585  1.0000000000000001e-165  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1748  reverse gyrase  33.26 
 
 		 1149 aa  580  1e-164  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.21829  normal  0.0908503 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0083  DNA topoisomerase I  30.41 
 
 		 751 aa  229  2e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1526  DNA topoisomerase I  30.86 
 
 		 696 aa  221  6e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000864041  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1854  DNA topoisomerase I  29.95 
 
 		 700 aa  221  7.999999999999999e-56  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1678  DNA topoisomerase I  29.8 
 
 		 700 aa  215  4.9999999999999996e-54  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2058  DNA topoisomerase I  29.65 
 
 		 700 aa  212  4e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0161  DNA topoisomerase I  29.19 
 
 		 695 aa  208  6e-52  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2296  DNA topoisomerase I  29.94 
 
 		 704 aa  206  2e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2212  DNA topoisomerase I  28.68 
 
 		 798 aa  205  4e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1551  DNA topoisomerase I  28.79 
 
 		 689 aa  205  4e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1223  DNA topoisomerase I  27.61 
 
 		 697 aa  204  7e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2433  DNA topoisomerase I  28.63 
 
 		 798 aa  202  3e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.336729  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1615  DNA topoisomerase I  28.59 
 
 		 836 aa  201  1.0000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.830191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07540  DNA topoisomerase I  30.29 
 
 		 691 aa  199  2.0000000000000003e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00641456  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1851  DNA topoisomerase I  28.79 
 
 		 839 aa  199  3e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1700  DNA topoisomerase I  28.98 
 
 		 693 aa  199  3e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00616947  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0011  DNA topoisomerase I  28.46 
 
 		 760 aa  198  5.000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2741  DNA topoisomerase I  28.96 
 
 		 746 aa  198  6e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.123661  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2658  DNA topoisomerase I  29.43 
 
 		 859 aa  197  9e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00218044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3274  DNA topoisomerase I  29.73 
 
 		 910 aa  197  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.384669 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0485  DNA topoisomerase I  28.26 
 
 		 711 aa  197  1e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1335  DNA topoisomerase I  27.95 
 
 		 691 aa  197  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.419976  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1310  DNA topoisomerase I  27.95 
 
 		 691 aa  197  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2069  DNA topoisomerase I  27.47 
 
 		 758 aa  195  4e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2230  DNA topoisomerase I  29.12 
 
 		 694 aa  195  4e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4636  DNA topoisomerase I  27.79 
 
 		 894 aa  195  5e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1430  DNA topoisomerase I  28.83 
 
 		 789 aa  195  6e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000308935  decreased coverage  0.00155997 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0600  DNA topoisomerase I  28.1 
 
 		 711 aa  194  6e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00101448  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1026  DNA topoisomerase I  28.08 
 
 		 697 aa  194  1e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00786254  unclonable  0.0000000108626 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0572  DNA topoisomerase I  28.44 
 
 		 686 aa  194  1e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0758735  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0171  DNA topoisomerase I  29.05 
 
 		 743 aa  193  2e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1984  DNA topoisomerase I  27.03 
 
 		 710 aa  192  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.073944  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2073  DNA topoisomerase I  28.34 
 
 		 802 aa  192  2.9999999999999997e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4027  DNA topoisomerase I  28.36 
 
 		 943 aa  192  2.9999999999999997e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.563129 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3340  DNA topoisomerase  27.74 
 
 		 853 aa  192  2.9999999999999997e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1690  DNA topoisomerase I  28.51 
 
 		 836 aa  191  5e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0132784  unclonable  0.00000000244427 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0779  DNA topoisomerase I  28.77 
 
 		 706 aa  192  5e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000394767  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0175  DNA topoisomerase I  28.72 
 
 		 694 aa  191  5e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.636929  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0816  DNA topoisomerase I  29.12 
 
 		 689 aa  191  8e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.996687  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0109  DNA topoisomerase I  27.34 
 
 		 799 aa  191  8e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1995  DNA topoisomerase I  28.42 
 
 		 691 aa  191  9e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2839  DNA topoisomerase I  27.49 
 
 		 768 aa  191  1e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0106  DNA topoisomerase I  28.53 
 
 		 747 aa  190  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4389  DNA topoisomerase I  28.63 
 
 		 793 aa  190  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00166014  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0571  DNA topoisomerase I  28.4 
 
 		 702 aa  190  2e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0213  DNA topoisomerase I  28.38 
 
 		 767 aa  190  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00304522  normal  0.312261 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4408  DNA topoisomerase I  28.44 
 
 		 949 aa  189  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0610462 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2181  DNA topoisomerase I  29.48 
 
 		 693 aa  189  2e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0024842  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1381  DNA topoisomerase I  27.79 
 
 		 696 aa  189  3e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0334  DNA topoisomerase I  27.89 
 
 		 825 aa  188  5e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1381  DNA topoisomerase I  27.62 
 
 		 695 aa  188  6e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.500118 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1644  DNA topoisomerase I  30.29 
 
 		 762 aa  188  6e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1027  DNA topoisomerase I  28.31 
 
 		 702 aa  187  8e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3717  DNA topoisomerase I  28.02 
 
 		 696 aa  187  8e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000589001  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0840  DNA topoisomerase  28.66 
 
 		 694 aa  187  9e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000150599  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0916  DNA topoisomerase I  28.48 
 
 		 693 aa  187  9e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000916095  hitchhiker  0.000814664 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0652  DNA topoisomerase I  29.55 
 
 		 703 aa  187  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.957627  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0873  DNA topoisomerase I  29.28 
 
 		 877 aa  187  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.143011 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0846  DNA topoisomerase I  29.28 
 
 		 877 aa  187  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2632  DNA topoisomerase I  26.63 
 
 		 797 aa  187  1.0000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.080388  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0717  DNA topoisomerase I  29.61 
 
 		 703 aa  187  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0604415  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2189  DNA topoisomerase I  27.56 
 
 		 857 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.824425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1674  DNA topoisomerase I  28.02 
 
 		 700 aa  186  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1956  DNA topoisomerase I  27.87 
 
 		 700 aa  186  3e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2463  DNA topoisomerase I  27.49 
 
 		 804 aa  186  3e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0460  DNA topoisomerase I  27.78 
 
 		 702 aa  186  3e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.159815  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0191  DNA topoisomerase I  26.4 
 
 		 823 aa  185  5.0000000000000004e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1347  DNA topoisomerase I  29.26 
 
 		 780 aa  185  5.0000000000000004e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000873362  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2420  DNA topoisomerase I  28.86 
 
 		 715 aa  185  6e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2722  DNA topoisomerase I  29.22 
 
 		 690 aa  184  1e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000409136  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1346  DNA topoisomerase I  26.75 
 
 		 708 aa  184  1e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000122971  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_624  topoisomerase IA  29.18 
 
 		 703 aa  184  1e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00715  DNA topoisomerase I  27.89 
 
 		 841 aa  183  2e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.446013  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14470  DNA topoisomerase I  28.24 
 
 		 868 aa  183  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3287  DNA topoisomerase I  28.64 
 
 		 870 aa  182  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1655  DNA topoisomerase I  28.16 
 
 		 869 aa  183  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.967668  normal  0.788315 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2090  DNA topoisomerase I  27.46 
 
 		 834 aa  183  2e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475207  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0027  DNA topoisomerase I  27.72 
 
 		 874 aa  183  2e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2711  DNA topoisomerase I  27 
 
 		 779 aa  183  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000391579  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04049  DNA topoisomerase I  26.59 
 
 		 830 aa  182  2.9999999999999997e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3591  DNA topoisomerase I  26.67 
 
 		 824 aa  182  2.9999999999999997e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.405231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3437  DNA topoisomerase I  28.77 
 
 		 872 aa  182  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.500167 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3603  DNA topoisomerase I  28.46 
 
 		 869 aa  182  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0171104  normal  0.313127 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>