More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0692 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_0014  reverse gyrase  37 
 
 		 1122 aa  702    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.492155  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1396  reverse gyrase  36.22 
 
 		 1242 aa  708    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0204  reverse gyrase  77.51 
 
 		 1231 aa  1946    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1663  reverse gyrase  36.77 
 
 		 1144 aa  719    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2236  reverse gyrase  36.39 
 
 		 1220 aa  741    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.309719  hitchhiker  0.000091621 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1363  reverse gyrase  35.53 
 
 		 1124 aa  692    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0259  reverse gyrase  77.9 
 
 		 1227 aa  1948    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.665057  normal  0.100628 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0692  reverse gyrase  100 
 
 		 1232 aa  2448    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000186605 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0811  reverse gyrase  44.25 
 
 		 1284 aa  1034    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0575  reverse gyrase  40.57 
 
 		 1283 aa  783    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1245  reverse gyrase  74.9 
 
 		 1237 aa  1908    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.000744005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1418  reverse gyrase  37.36 
 
 		 1143 aa  660    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00239755  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1131  reverse gyrase  33.39 
 
 		 1122 aa  623  1e-177  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0951  reverse gyrase  36.47 
 
 		 1030 aa  623  1e-177  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1941  reverse gyrase  33.68 
 
 		 1166 aa  614  9.999999999999999e-175  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0775  reverse gyrase  35.24 
 
 		 1104 aa  610  1e-173  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0752  reverse gyrase  34.99 
 
 		 1104 aa  609  1e-173  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.412278  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1748  reverse gyrase  33.81 
 
 		 1149 aa  589  1e-166  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.21829  normal  0.0908503 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1381  DNA topoisomerase I  31.09 
 
 		 696 aa  226  2e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2181  DNA topoisomerase I  30 
 
 		 693 aa  224  9.999999999999999e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0024842  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1700  DNA topoisomerase I  30.02 
 
 		 693 aa  223  1.9999999999999999e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00616947  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1223  DNA topoisomerase I  29.81 
 
 		 697 aa  218  5e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0600  DNA topoisomerase I  30.45 
 
 		 711 aa  216  2.9999999999999995e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00101448  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1381  DNA topoisomerase I  29 
 
 		 695 aa  216  2.9999999999999995e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.500118 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1551  DNA topoisomerase I  27.99 
 
 		 689 aa  213  3e-53  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1027  DNA topoisomerase I  28.66 
 
 		 702 aa  210  1e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0572  DNA topoisomerase I  30.02 
 
 		 686 aa  210  1e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0758735  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1984  DNA topoisomerase I  29.09 
 
 		 710 aa  209  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.073944  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0690  DNA topoisomerase I  30.88 
 
 		 633 aa  209  3e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000142344  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2658  DNA topoisomerase I  30.77 
 
 		 859 aa  208  6e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00218044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1526  DNA topoisomerase I  30.17 
 
 		 696 aa  208  7e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000864041  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1208  DNA topoisomerase I  28.12 
 
 		 721 aa  207  8e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000400838  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0666  DNA topoisomerase I  31.08 
 
 		 633 aa  207  9e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000220674  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2230  DNA topoisomerase I  28.96 
 
 		 694 aa  207  1e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2356  DNA topoisomerase I  28.62 
 
 		 879 aa  205  4e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0613436  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1289  DNA topoisomerase I  28.12 
 
 		 684 aa  205  5e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.781177  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1354  DNA topoisomerase I  28.28 
 
 		 849 aa  204  7e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.75959  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3826  DNA topoisomerase I  30.58 
 
 		 852 aa  204  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.801079  normal  0.0383535 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0840  DNA topoisomerase  28.46 
 
 		 694 aa  204  9.999999999999999e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000150599  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1678  DNA topoisomerase I  28.73 
 
 		 700 aa  202  1.9999999999999998e-50  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0196  DNA topoisomerase  28.73 
 
 		 835 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0916  DNA topoisomerase I  29.11 
 
 		 693 aa  203  1.9999999999999998e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000916095  hitchhiker  0.000814664 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2296  DNA topoisomerase I  27.23 
 
 		 704 aa  202  3e-50  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25110  DNA topoisomerase I  30.03 
 
 		 868 aa  201  6e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02352  DNA topoisomerase I  30.02 
 
 		 886 aa  201  7e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.346512  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2148  DNA topoisomerase I  29.87 
 
 		 868 aa  201  7e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1560  DNA topoisomerase I  30.73 
 
 		 877 aa  201  9e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1851  DNA topoisomerase I  27.48 
 
 		 839 aa  201  1.0000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2842  DNA topoisomerase I  30.65 
 
 		 798 aa  200  1.0000000000000001e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2420  DNA topoisomerase I  26.87 
 
 		 715 aa  200  1.0000000000000001e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0191  DNA topoisomerase I  29.88 
 
 		 823 aa  201  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2058  DNA topoisomerase I  28.57 
 
 		 700 aa  200  1.0000000000000001e-49  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1854  DNA topoisomerase I  28.48 
 
 		 700 aa  199  2.0000000000000003e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1005  DNA topoisomerase I  29.12 
 
 		 706 aa  200  2.0000000000000003e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00429671  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1346  DNA topoisomerase I  30.46 
 
 		 708 aa  200  2.0000000000000003e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000122971  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1021  DNA topoisomerase I  29.61 
 
 		 669 aa  200  2.0000000000000003e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0905515  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0083  DNA topoisomerase I  28.66 
 
 		 751 aa  199  3e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0571  DNA topoisomerase I  28.03 
 
 		 702 aa  199  4.0000000000000005e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0291  DNA topoisomerase I  30.13 
 
 		 923 aa  197  9e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0747  DNA topoisomerase I  29 
 
 		 694 aa  197  9e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.894323  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3876  DNA topoisomerase I  30.14 
 
 		 876 aa  197  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.198302  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0460  DNA topoisomerase I  27.01 
 
 		 702 aa  197  1e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.159815  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0923  DNA topoisomerase I  29.07 
 
 		 714 aa  197  1e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0843  DNA topoisomerase I  29.53 
 
 		 869 aa  197  1e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.077347  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1655  DNA topoisomerase I  29.56 
 
 		 869 aa  196  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.967668  normal  0.788315 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1583  DNA topoisomerase I  29.26 
 
 		 868 aa  196  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.590699 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0075  DNA topoisomerase I  29.03 
 
 		 798 aa  196  2e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0779  DNA topoisomerase I  29.08 
 
 		 706 aa  196  2e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000394767  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1146  DNA topoisomerase I  28.37 
 
 		 879 aa  197  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.368466  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0914  DNA topoisomerase I  28.73 
 
 		 868 aa  196  3e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1585  DNA topoisomerase I  29.04 
 
 		 894 aa  196  3e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.328544  normal  0.0409432 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1660  DNA topoisomerase I  29.04 
 
 		 894 aa  196  3e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.367793  unclonable  0.0000368554 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1704  DNA topoisomerase I  31.64 
 
 		 858 aa  195  5e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.11411  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0161  DNA topoisomerase I  27.62 
 
 		 695 aa  195  6e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0932  DNA topoisomerase I  29.31 
 
 		 914 aa  194  8e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.231933  normal  0.891499 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1335  DNA topoisomerase I  27.6 
 
 		 691 aa  194  8e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.419976  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1615  DNA topoisomerase I  29.98 
 
 		 836 aa  194  8e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.830191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1310  DNA topoisomerase I  27.6 
 
 		 691 aa  194  8e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1024  DNA topoisomerase I  30.51 
 
 		 696 aa  194  9e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.352033  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2792  DNA topoisomerase I  28.31 
 
 		 831 aa  193  1e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0208029  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1026  DNA topoisomerase I  28.92 
 
 		 697 aa  194  1e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00786254  unclonable  0.0000000108626 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1644  DNA topoisomerase I  27.33 
 
 		 762 aa  193  1e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1211  DNA topoisomerase I  30.11 
 
 		 849 aa  194  1e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2139  DNA topoisomerase I  29.13 
 
 		 869 aa  192  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.124713 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14470  DNA topoisomerase I  30.03 
 
 		 868 aa  193  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1679  DNA topoisomerase I  29.13 
 
 		 869 aa  192  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229175 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3603  DNA topoisomerase I  29.13 
 
 		 869 aa  192  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0171104  normal  0.313127 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2831  DNA topoisomerase I  28.24 
 
 		 894 aa  192  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.442826 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1535  DNA topoisomerase I  28.94 
 
 		 896 aa  193  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.351865  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2885  DNA topoisomerase I  28.31 
 
 		 831 aa  193  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.106774  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1304  DNA topoisomerase I  28.32 
 
 		 708 aa  193  2e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.01574  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1674  DNA topoisomerase I  27.39 
 
 		 700 aa  192  2.9999999999999997e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1729  DNA topoisomerase I  28.55 
 
 		 894 aa  192  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0724746 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0846  DNA topoisomerase I  28.4 
 
 		 877 aa  192  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0175  DNA topoisomerase I  26.7 
 
 		 694 aa  192  2.9999999999999997e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.636929  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2841  DNA topoisomerase I  29.07 
 
 		 889 aa  192  4e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.598505  hitchhiker  0.00000400834 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3717  DNA topoisomerase I  27.81 
 
 		 696 aa  192  4e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000589001  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0873  DNA topoisomerase I  28.4 
 
 		 877 aa  192  4e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.143011 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3689  DNA topoisomerase I  29.63 
 
 		 756 aa  192  5e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000324271  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1347  DNA topoisomerase I  29.74 
 
 		 780 aa  192  5e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000873362  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>