More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1663 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1396  reverse gyrase  34.56 
 
 		 1242 aa  660    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0259  reverse gyrase  37.55 
 
 		 1227 aa  718    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.665057  normal  0.100628 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1663  reverse gyrase  100 
 
 		 1144 aa  2321    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2236  reverse gyrase  36.6 
 
 		 1220 aa  666    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.309719  hitchhiker  0.000091621 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1363  reverse gyrase  55.78 
 
 		 1124 aa  1257    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0811  reverse gyrase  36.79 
 
 		 1284 aa  735    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1418  reverse gyrase  36.95 
 
 		 1143 aa  769    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00239755  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0014  reverse gyrase  56.59 
 
 		 1122 aa  1250    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.492155  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0204  reverse gyrase  37.48 
 
 		 1231 aa  746    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0575  reverse gyrase  39.3 
 
 		 1283 aa  826    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1245  reverse gyrase  38.17 
 
 		 1237 aa  758    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.000744005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0692  reverse gyrase  36.69 
 
 		 1232 aa  718    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000186605 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1131  reverse gyrase  35.6 
 
 		 1122 aa  633  1e-180  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0951  reverse gyrase  36.42 
 
 		 1030 aa  625  1e-177  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0752  reverse gyrase  35.65 
 
 		 1104 aa  604  1.0000000000000001e-171  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.412278  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0775  reverse gyrase  35.74 
 
 		 1104 aa  600  1e-170  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1941  reverse gyrase  33.28 
 
 		 1166 aa  584  1.0000000000000001e-165  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1748  reverse gyrase  32.9 
 
 		 1149 aa  548  1e-154  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.21829  normal  0.0908503 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1381  DNA topoisomerase I  35.46 
 
 		 695 aa  283  2e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.500118 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1027  DNA topoisomerase I  35.53 
 
 		 702 aa  276  1.0000000000000001e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1700  DNA topoisomerase I  34.52 
 
 		 693 aa  274  6e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00616947  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1956  DNA topoisomerase I  34.65 
 
 		 700 aa  273  2e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0600  DNA topoisomerase I  33.45 
 
 		 711 aa  271  5e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00101448  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0666  DNA topoisomerase I  35.02 
 
 		 633 aa  271  5.9999999999999995e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000220674  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1674  DNA topoisomerase I  34.82 
 
 		 700 aa  271  5.9999999999999995e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1551  DNA topoisomerase I  33.73 
 
 		 689 aa  268  4e-70  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0690  DNA topoisomerase I  34.9 
 
 		 633 aa  268  4e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000142344  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07540  DNA topoisomerase I  33.56 
 
 		 691 aa  268  5e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00641456  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1026  DNA topoisomerase I  33.56 
 
 		 697 aa  268  5.999999999999999e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00786254  unclonable  0.0000000108626 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1526  DNA topoisomerase I  35.54 
 
 		 696 aa  267  8e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000864041  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2296  DNA topoisomerase I  33.74 
 
 		 704 aa  266  2e-69  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2181  DNA topoisomerase I  32.71 
 
 		 693 aa  265  3e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0024842  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0171  DNA topoisomerase I  33.56 
 
 		 743 aa  262  3e-68  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0083  DNA topoisomerase I  32.59 
 
 		 751 aa  261  5.0000000000000005e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1289  DNA topoisomerase I  33.05 
 
 		 684 aa  261  5.0000000000000005e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.781177  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1984  DNA topoisomerase I  33.9 
 
 		 710 aa  260  1e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.073944  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0460  DNA topoisomerase I  33.16 
 
 		 702 aa  259  2e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.159815  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0161  DNA topoisomerase I  33.74 
 
 		 695 aa  259  3e-67  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1678  DNA topoisomerase I  33.05 
 
 		 700 aa  258  3e-67  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1430  DNA topoisomerase I  32.45 
 
 		 789 aa  258  5e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000308935  decreased coverage  0.00155997 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1024  DNA topoisomerase I  35.37 
 
 		 696 aa  257  1.0000000000000001e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.352033  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4636  DNA topoisomerase I  33.33 
 
 		 894 aa  256  1.0000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0358  DNA topoisomerase I  34.43 
 
 		 683 aa  257  1.0000000000000001e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000301729  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1854  DNA topoisomerase I  33.22 
 
 		 700 aa  256  2.0000000000000002e-66  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1690  DNA topoisomerase I  32.57 
 
 		 836 aa  256  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0132784  unclonable  0.00000000244427 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3717  DNA topoisomerase I  31.96 
 
 		 696 aa  256  2.0000000000000002e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000589001  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1021  DNA topoisomerase I  32.65 
 
 		 669 aa  256  2.0000000000000002e-66  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0905515  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0571  DNA topoisomerase I  33.45 
 
 		 702 aa  255  4.0000000000000004e-66  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1223  DNA topoisomerase I  32.66 
 
 		 697 aa  254  5.000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0106  DNA topoisomerase I  33.16 
 
 		 747 aa  254  8.000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2058  DNA topoisomerase I  33.11 
 
 		 700 aa  253  1e-65  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1102  DNA topoisomerase I  34.01 
 
 		 691 aa  253  1e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000153126  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2230  DNA topoisomerase I  32.99 
 
 		 694 aa  251  4e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0011  DNA topoisomerase I  32.65 
 
 		 760 aa  251  5e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2069  DNA topoisomerase I  32.64 
 
 		 758 aa  251  6e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2056  DNA topoisomerase I  33.28 
 
 		 706 aa  251  8e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2741  DNA topoisomerase I  31.83 
 
 		 746 aa  250  8e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.123661  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1704  DNA topoisomerase I  31.77 
 
 		 858 aa  250  9e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.11411  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0779  DNA topoisomerase I  33.05 
 
 		 706 aa  250  1e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000394767  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1381  DNA topoisomerase I  32.14 
 
 		 696 aa  250  1e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0652  DNA topoisomerase I  31.99 
 
 		 703 aa  249  2e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.957627  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0747  DNA topoisomerase I  33.11 
 
 		 694 aa  249  2e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.894323  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1335  DNA topoisomerase I  32.08 
 
 		 691 aa  249  3e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.419976  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1310  DNA topoisomerase I  32.08 
 
 		 691 aa  249  3e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3437  DNA topoisomerase I  31.75 
 
 		 872 aa  247  6.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.500167 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1995  DNA topoisomerase I  32.54 
 
 		 691 aa  248  6.999999999999999e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2722  DNA topoisomerase I  32.87 
 
 		 690 aa  246  9.999999999999999e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000409136  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_624  topoisomerase IA  31.49 
 
 		 703 aa  246  9.999999999999999e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3656  DNA topoisomerase I  33.1 
 
 		 692 aa  245  3.9999999999999997e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000216314  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0485  DNA topoisomerase I  31.77 
 
 		 711 aa  245  3.9999999999999997e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0717  DNA topoisomerase I  31.32 
 
 		 703 aa  244  5e-63  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0604415  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0846  DNA topoisomerase I  29.92 
 
 		 877 aa  244  5e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3875  DNA topoisomerase I  32.93 
 
 		 692 aa  244  5e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000221974  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3684  DNA topoisomerase I  32.93 
 
 		 692 aa  244  5e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0116868  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3592  DNA topoisomerase I  32.93 
 
 		 692 aa  244  5e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00080901  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3971  DNA topoisomerase I  32.93 
 
 		 692 aa  244  5e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000571341  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3845  DNA topoisomerase I  32.93 
 
 		 692 aa  244  5e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.270330000000001e-60 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0334  DNA topoisomerase I  32.5 
 
 		 825 aa  244  7e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3574  DNA topoisomerase I  32.76 
 
 		 692 aa  244  9e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000026995  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3880  DNA topoisomerase I  32.76 
 
 		 692 aa  243  1e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000115411  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0873  DNA topoisomerase I  29.92 
 
 		 877 aa  244  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.143011 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0393  DNA topoisomerase I  30.69 
 
 		 884 aa  243  1e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000925228  unclonable  0.0000000013775 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2073  DNA topoisomerase I  32.17 
 
 		 802 aa  243  1e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2100  DNA topoisomerase I  32.72 
 
 		 765 aa  243  1e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000378679  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0213  DNA topoisomerase I  30.3 
 
 		 767 aa  243  1e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00304522  normal  0.312261 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0086  DNA topoisomerase I  33.11 
 
 		 765 aa  244  1e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000043689  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1312  DNA topoisomerase I  32.76 
 
 		 692 aa  242  2e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000876522  unclonable  7.60195e-25 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1347  DNA topoisomerase I  32.24 
 
 		 780 aa  243  2e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000873362  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2485  DNA topoisomerase I  32.43 
 
 		 692 aa  243  2e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000595417  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1208  DNA topoisomerase I  32.54 
 
 		 721 aa  242  2.9999999999999997e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000400838  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0816  DNA topoisomerase I  32.03 
 
 		 689 aa  242  2.9999999999999997e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.996687  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4389  DNA topoisomerase I  31.66 
 
 		 793 aa  241  4e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00166014  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1644  DNA topoisomerase I  32.81 
 
 		 762 aa  241  4e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0916  DNA topoisomerase I  32.47 
 
 		 693 aa  241  4e-62  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000916095  hitchhiker  0.000814664 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2328  DNA topoisomerase I  31.51 
 
 		 895 aa  241  5.999999999999999e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.664503  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0304  DNA topoisomerase I  32.35 
 
 		 748 aa  241  5.999999999999999e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000372801  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0914  DNA topoisomerase I  30.46 
 
 		 868 aa  241  5.999999999999999e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1660  DNA topoisomerase I  30.65 
 
 		 894 aa  241  5.999999999999999e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.367793  unclonable  0.0000368554 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1150  hypothetical protein  30.48 
 
 		 780 aa  241  5.999999999999999e-62  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1729  DNA topoisomerase I  30.65 
 
 		 894 aa  241  6.999999999999999e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0724746 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>