280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2986 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1688  TrkA domain-containing protein  86.96 
 
 		 575 aa  963    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2959  TrkA domain-containing protein  89.91 
 
 		 575 aa  1018    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0799  potasium uptake protein  59.76 
 
 		 575 aa  659    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00652417 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1424  TrkA domain-containing protein  82.43 
 
 		 575 aa  911    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0976124  normal  0.0212336 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2986  TrkA domain-containing protein  100 
 
 		 575 aa  1137    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479743  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2144  putative transporter  53.04 
 
 		 575 aa  568  1e-161  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1647  TrkA-C  48.87 
 
 		 575 aa  515  1e-144  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02717  putative transporter  48.68 
 
 		 574 aa  490  1e-137  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0665  TrkA domain-containing protein  46.56 
 
 		 574 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1499  TrkA-C domain protein  44.74 
 
 		 579 aa  449  1e-125  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96712  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0961  TrkA-C  45.53 
 
 		 574 aa  449  1e-125  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3185  TrkA domain-containing protein  46.64 
 
 		 574 aa  425  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0422  ion transporter superfamily protein  44.31 
 
 		 575 aa  420  1e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3041  TrkA domain-containing protein  45.76 
 
 		 574 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001705  sulfate permease Trk-type  43.13 
 
 		 574 aa  414  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0956  TrkA-C domain protein  46.42 
 
 		 574 aa  409  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0964  TrkA domain-containing protein  46.25 
 
 		 574 aa  409  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0930  TrkA domain-containing protein  46.25 
 
 		 574 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3406  TrkA domain-containing protein  46.25 
 
 		 574 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00768  hypothetical protein  42.78 
 
 		 574 aa  395  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0865  TrkA domain-containing protein  45.99 
 
 		 574 aa  394  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3070  TrkA domain-containing protein  46.17 
 
 		 574 aa  391  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.748598 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0902  TrkA domain-containing protein  47.21 
 
 		 574 aa  392  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1395  TrkA-C domain protein  44.95 
 
 		 578 aa  389  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.096414  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2889  putative sodium/sulfate symporter  41.2 
 
 		 583 aa  377  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1530  TrkA-C domain protein  36.81 
 
 		 591 aa  347  4e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1175  TrkA-C, di- and tricarboxylate transporters  35.58 
 
 		 589 aa  316  6e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2621  TrkA domain-containing protein  33.92 
 
 		 588 aa  308  2.0000000000000002e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0998803  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1106  TrkA-like protein  32.21 
 
 		 589 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2351  TrkA domain-containing protein  35.23 
 
 		 588 aa  305  1.0000000000000001e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119552  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2347  TrkA domain-containing protein  34.46 
 
 		 588 aa  302  1e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2793  TrkA domain-containing protein  34.68 
 
 		 588 aa  296  7e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1684  TrkA-like protein  31.92 
 
 		 588 aa  287  2.9999999999999996e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1749  TrkA-C domain protein  34.62 
 
 		 593 aa  280  6e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.0276756 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4989  Citrate transporter  33.22 
 
 		 592 aa  276  1.0000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.516998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1857  TrkA-C domain protein  33.56 
 
 		 591 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1861  citrate transporter  33.27 
 
 		 587 aa  268  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2448  TrkA domain-containing protein  37.45 
 
 		 575 aa  264  3e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_1343  DASS family transporter: sodium ion/sulfate  31.35 
 
 		 583 aa  227  5.0000000000000005e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.351628  normal  0.572139 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4947  TrkA-C domain protein  29.31 
 
 		 597 aa  217  4e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.816628 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0381  DASS family sodium/sulfate transporter  30.51 
 
 		 601 aa  216  5.9999999999999996e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22453  predicted protein  31.08 
 
 		 622 aa  213  4.9999999999999996e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39202  DASS family transporter: sodium ion/sulfate  30 
 
 		 634 aa  213  9e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.21287 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2066  TrkA domain-containing protein  30.34 
 
 		 598 aa  210  7e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233721 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1036  TrkA-C domain protein  30.41 
 
 		 627 aa  206  9e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.131112 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2317  TrkA domain-containing protein  28.09 
 
 		 588 aa  205  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2312  DASS family sodium/sulfate transporter  29.83 
 
 		 605 aa  205  2e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.160189 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0635  Citrate transporter  29.35 
 
 		 622 aa  205  2e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1941  TrkA-C domain protein  29.81 
 
 		 623 aa  205  2e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0557  citrate transporter  30.51 
 
 		 596 aa  204  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015136 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4408  TrkA-C domain protein  29.12 
 
 		 596 aa  203  6e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01481  DASS family sodium/sulfate transporter  28.88 
 
 		 605 aa  202  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4471  TrkA-C domain protein  29.12 
 
 		 596 aa  201  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1447  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  28.7 
 
 		 605 aa  200  6e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.629217  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00921  DASS family sodium/sulfate transporter  29.86 
 
 		 609 aa  200  7e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0576  TrkA domain-containing protein  28.26 
 
 		 592 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.60388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02561  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  29.77 
 
 		 606 aa  198  3e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0656  sodium/sulphate symporter  27.27 
 
 		 592 aa  194  4e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2309  TrkA domain-containing protein  27.73 
 
 		 592 aa  194  5e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.887231  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0040  TrkA-C domain protein  26.61 
 
 		 602 aa  193  6e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3383  TrkA-like  29.02 
 
 		 593 aa  193  8e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1899  TrkA-C  28.18 
 
 		 592 aa  192  1e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00951  DASS family sodium/sulfate transporter  29.2 
 
 		 602 aa  192  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.8674  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0038  TrkA-C domain protein  26.44 
 
 		 596 aa  192  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00961  DASS family sodium/sulfate transporter  28.86 
 
 		 602 aa  190  5e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.531259  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0104  Citrate transporter  29.7 
 
 		 618 aa  190  5.999999999999999e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0660  TrkA-C  29.39 
 
 		 596 aa  189  9e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.178336  normal  0.122015 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0693  TrkA domain-containing protein  31.5 
 
 		 607 aa  188  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00166729  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0086  DASS family sodium/sulfate transporter  29.01 
 
 		 602 aa  188  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.121034  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1490  TrkA-C domain protein  29.95 
 
 		 624 aa  188  2e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.149438 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_14922  predicted protein  31.18 
 
 		 572 aa  188  2e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0606  putative membrane transport protein  28.04 
 
 		 588 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252017  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4508  TrkA domain-containing protein  26.42 
 
 		 592 aa  184  3e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.951327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3512  TrkA domain-containing protein  28.06 
 
 		 608 aa  182  1e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00931  DASS family sodium/sulfate transporter  30.4 
 
 		 602 aa  182  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.490599  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0636  Citrate transporter  29.28 
 
 		 616 aa  175  1.9999999999999998e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315061  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1726  citrate transporter  26.96 
 
 		 588 aa  171  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0766  Citrate transporter  28 
 
 		 621 aa  170  7e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1777  citrate transporter  28.21 
 
 		 609 aa  166  9e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0844  Trk family potassium uptake protein  26.29 
 
 		 616 aa  164  5.0000000000000005e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3754  TrkA domain-containing protein  27.53 
 
 		 590 aa  162  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.694568  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1409  citrate transporter  25.78 
 
 		 613 aa  163  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000118186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0631  TrkA-C domain protein  27.59 
 
 		 599 aa  161  3e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5704  TrkA-C domain protein  27.36 
 
 		 588 aa  160  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.859269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0621  TrkA family protein  27.53 
 
 		 590 aa  160  9e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0659  TrkA family protein  27.47 
 
 		 619 aa  158  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.702121  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3033  citrate transporter  28.02 
 
 		 612 aa  158  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2766  uncharacterized transporter  27.41 
 
 		 599 aa  157  4e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.14891 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1509  Citrate transporter  27.29 
 
 		 620 aa  157  4e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.355628  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2058  citrate transporter  27.75 
 
 		 609 aa  157  4e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1598  TrkA-C domain protein  25.92 
 
 		 593 aa  157  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.332959  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0867  TrkA-C domain protein  25.37 
 
 		 614 aa  157  6e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18544  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1558  TrkA domain-containing protein  28.28 
 
 		 613 aa  156  1e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.256635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0170  Citrate transporter  25.56 
 
 		 619 aa  154  5e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5342  TrkA-C domain protein  27.24 
 
 		 588 aa  154  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.270023 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4381  TrkA domain-containing protein  27.24 
 
 		 591 aa  154  5.9999999999999996e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.558265  normal  0.124287 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0475  citrate transporter  25.63 
 
 		 632 aa  153  8.999999999999999e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3899  TrkA domain-containing protein  26.86 
 
 		 592 aa  152  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.345566  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1094  TrkA domain-containing protein  25.48 
 
 		 593 aa  152  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00281936  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3445  TrkA domain-containing protein  26.15 
 
 		 587 aa  151  4e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>