More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5701 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5701  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  100 
 
 		 607 aa  1232    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.167771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4518  extracellular solute-binding protein family 5  41.67 
 
 		 615 aa  421  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.872953 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1656  HAD superfamily ATPase  59.6 
 
 		 941 aa  280  5e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.113065  normal  0.455529 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1796  extracellular solute-binding protein  28.75 
 
 		 616 aa  168  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000801458  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0901  extracellular solute-binding protein family 5  26.71 
 
 		 675 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2233  extracellular solute-binding protein family 5  25.39 
 
 		 735 aa  135  3e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.039331  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1142  extracellular solute-binding protein family 5  25.68 
 
 		 616 aa  127  5e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163498  normal  0.236826 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1189  extracellular solute-binding protein family 5  25.19 
 
 		 621 aa  124  4e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.105584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1305  extracellular solute-binding protein family 5  25.76 
 
 		 693 aa  124  5e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2073  extracellular solute-binding protein family 5  24.76 
 
 		 627 aa  123  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0694715  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0050  extracellular solute-binding protein family 5  24.76 
 
 		 628 aa  120  6e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.600017  normal  0.630489 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2585  extracellular solute-binding protein family 5  23.81 
 
 		 603 aa  119  9.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3798  extracellular solute-binding protein family 5  25.33 
 
 		 557 aa  119  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5668  extracellular solute-binding protein family 5  25.24 
 
 		 557 aa  117  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0545  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  24.33 
 
 		 545 aa  116  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000683285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0171  extracellular solute-binding protein family 5  27.96 
 
 		 540 aa  114  5e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6684  extracellular solute-binding protein family 5  25.49 
 
 		 548 aa  111  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.692475 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0398  extracellular solute-binding protein  26.25 
 
 		 559 aa  109  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.333674  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1595  extracellular solute-binding protein  24.25 
 
 		 557 aa  108  4e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0133917  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1545  extracellular solute-binding protein  24.06 
 
 		 557 aa  108  4e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.2137  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5780  extracellular solute-binding protein family 5  25.1 
 
 		 548 aa  107  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0222518  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2397  extracellular solute-binding protein  23.37 
 
 		 597 aa  107  6e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4764  extracellular solute-binding protein  27.79 
 
 		 539 aa  105  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20180  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  23.74 
 
 		 551 aa  104  4e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1485  extracellular solute-binding protein family 5  24.26 
 
 		 579 aa  104  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0132  extracellular solute-binding protein  27.25 
 
 		 532 aa  104  5e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2624  extracellular solute-binding protein family 5  23.8 
 
 		 547 aa  104  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.276954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2745  extracellular solute-binding protein  24.31 
 
 		 551 aa  104  5e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1553  extracellular solute-binding protein  23.63 
 
 		 559 aa  103  1e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.208561  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3400  extracellular solute-binding protein family 5  24.18 
 
 		 567 aa  102  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.110204  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1398  extracellular solute-binding protein family 5  24.57 
 
 		 562 aa  102  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.986828  normal  0.969327 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1678  extracellular solute-binding protein family 5  24.3 
 
 		 553 aa  102  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.495361  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0910  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, periplasmic components  23.58 
 
 		 572 aa  101  5e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.293935  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0482  extracellular solute-binding protein family 5  22.89 
 
 		 693 aa  99.8  1e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.181954  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0510  extracellular solute-binding protein  29.09 
 
 		 510 aa  99.4  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0306064  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4667  extracellular solute-binding protein family 5  23.12 
 
 		 587 aa  98.6  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0482  extracellular solute-binding protein  23.39 
 
 		 531 aa  97.4  6e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0312851  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1397  extracellular solute-binding protein family 5  22.18 
 
 		 567 aa  97.4  7e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.75572 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  25.65 
 
 		 542 aa  96.3  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2512  extracellular solute-binding protein family 5  23.77 
 
 		 565 aa  95.9  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.012201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0785  extracellular solute-binding protein  27.84 
 
 		 512 aa  95.5  3e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0600833  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0106  extracellular solute-binding protein family 5  23.91 
 
 		 533 aa  94.7  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0909337  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4290  extracellular solute-binding protein  23.81 
 
 		 530 aa  94.4  5e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00787986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2501  extracellular solute-binding protein family 5  26.02 
 
 		 608 aa  93.6  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0403  extracellular solute-binding protein family 5  24.55 
 
 		 565 aa  93.6  9e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.189174  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2749  extracellular solute-binding protein family 5  22.96 
 
 		 645 aa  93.6  9e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.655087  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7456  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  22.85 
 
 		 563 aa  92.4  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.388989 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03423  hypothetical protein  25.12 
 
 		 560 aa  92.8  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3887  extracellular solute-binding protein family 5  23.26 
 
 		 601 aa  91.3  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.544175  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0933  extracellular solute-binding protein family 5  22.6 
 
 		 561 aa  90.9  7e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002586  (GlcNAc)2 ABC transporter: substrate-binding protein  25.1 
 
 		 560 aa  90.1  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002959  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein OppA  27.8 
 
 		 558 aa  90.1  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5671  extracellular solute-binding protein  23.92 
 
 		 531 aa  89.7  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.880059  normal  0.0905991 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0149  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.16 
 
 		 556 aa  89.7  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0038  extracellular solute-binding protein family 5  25.08 
 
 		 568 aa  89  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1676  extracellular solute-binding protein  23.33 
 
 		 636 aa  89  3e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.24706  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1169  oligopeptide-binding protein of oligopeptide ABC transporter  23.71 
 
 		 587 aa  88.2  4e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.317639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1274  extracellular solute-binding protein  24.82 
 
 		 794 aa  87.4  7e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000437479 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06390  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  24.59 
 
 		 552 aa  87  8e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.963018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  23.47 
 
 		 551 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  23.66 
 
 		 544 aa  86.7  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1946  oligopeptide transport system permease protein B  27.12 
 
 		 554 aa  86.3  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2053  extracellular solute-binding protein  23.64 
 
 		 579 aa  85.1  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0131056  normal  0.653692 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2585  putative ABC transporter, substrate binding subunit  24.28 
 
 		 520 aa  84.7  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598963 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0617  extracellular solute-binding protein family 5  23.83 
 
 		 596 aa  84.7  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4404  extracellular solute-binding protein  26.84 
 
 		 536 aa  84.3  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6188  extracellular solute-binding protein family 5  23.4 
 
 		 560 aa  84.3  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.215725  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34930  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  24.42 
 
 		 563 aa  84  0.000000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.953561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2706  extracellular solute-binding protein  25.33 
 
 		 538 aa  84  0.000000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.723031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0875  extracellular solute-binding protein  24.16 
 
 		 774 aa  83.2  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2728  extracellular solute-binding protein family 5  26.59 
 
 		 568 aa  82.8  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.768674  normal  0.998981 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1900  extracellular solute-binding protein family 5  22.4 
 
 		 569 aa  82.4  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0147571  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1189  extracellular solute-binding protein  25.16 
 
 		 793 aa  82.8  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.109434  hitchhiker  0.000120302 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0398  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.89 
 
 		 527 aa  82  0.00000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4685  extracellular solute-binding protein  28.42 
 
 		 532 aa  82  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.192999  normal  0.292705 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0552  extracellular solute-binding protein  25.17 
 
 		 788 aa  81.3  0.00000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.295853 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1313  extracellular solute-binding protein  25.19 
 
 		 493 aa  80.9  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  23.47 
 
 		 524 aa  80.9  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001004  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein OppA  27.19 
 
 		 541 aa  80.9  0.00000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0146  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.1 
 
 		 539 aa  80.5  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17760  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  24.13 
 
 		 609 aa  80.5  0.00000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.321388  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0592  extracellular solute-binding protein  25.19 
 
 		 545 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1592  extracellular solute-binding protein  21.84 
 
 		 560 aa  80.1  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.382923  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4466  extracellular solute-binding protein family 5  22.51 
 
 		 564 aa  80.1  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0117733  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1411  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 791 aa  79.7  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.536726 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0654  extracellular solute-binding protein  25.84 
 
 		 810 aa  79  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0507861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0609  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  23.08 
 
 		 543 aa  79  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2437  extracellular solute-binding protein  22.52 
 
 		 554 aa  79  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0487  extracellular solute-binding protein family 5  21.08 
 
 		 592 aa  78.6  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.183361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0865  extracellular solute-binding protein  23.72 
 
 		 544 aa  79  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2475  extracellular solute-binding protein  28.27 
 
 		 521 aa  78.6  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0955412  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0546  4-phytase  24.59 
 
 		 552 aa  77.8  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.633185  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0623  4-phytase  24.59 
 
 		 552 aa  77.8  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000146122  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3512  extracellular solute-binding protein family 5  22.22 
 
 		 580 aa  78.2  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.290938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1315  extracellular solute-binding protein  23.66 
 
 		 788 aa  77.8  0.0000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.440295 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1663  extracellular solute-binding protein family 5  25.38 
 
 		 578 aa  77.8  0.0000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0397427  normal  0.183706 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3968  extracellular solute-binding protein  25.4 
 
 		 537 aa  77.4  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.252184  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0343  extracellular solute-binding protein family 5  23.13 
 
 		 537 aa  77.4  0.0000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0892  extracellular solute-binding protein  22.59 
 
 		 604 aa  77.4  0.0000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01310  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  21.77 
 
 		 564 aa  77.4  0.0000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.860675  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>