235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3303 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3303  putative aldose-1-epimerase  100 
 
 
297 aa  598  1e-170  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1897  aldose 1-epimerase  58.9 
 
 
290 aa  329  4e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2432  aldose 1-epimerase  47.21 
 
 
301 aa  251  1e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0573284  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2182  Aldose 1-epimerase  45.89 
 
 
299 aa  221  9.999999999999999e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000157648 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1225  Aldose 1-epimerase  42.76 
 
 
302 aa  201  9.999999999999999e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1278  Aldose 1-epimerase  41.67 
 
 
307 aa  200  1.9999999999999998e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.265427  normal  0.286232 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8681  Aldose 1-epimerase  41.47 
 
 
303 aa  196  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626175  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12920  galactose mutarotase-like enzyme  42.19 
 
 
321 aa  194  2e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0901551  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1836  Aldose 1-epimerase  40 
 
 
315 aa  192  6e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2454  aldose 1-epimerase  41.2 
 
 
307 aa  192  7e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4435  Aldose 1-epimerase  41.91 
 
 
303 aa  191  9e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.340797 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33650  galactose mutarotase-like enzyme  40.67 
 
 
318 aa  188  8e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2973  Aldose 1-epimerase  42.14 
 
 
303 aa  188  8e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000377273  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2489  Aldose 1-epimerase  37.76 
 
 
308 aa  185  6e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0426  aldose 1-epimerase  37.33 
 
 
308 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2997  Aldose 1-epimerase  40.8 
 
 
302 aa  182  5.0000000000000004e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0514  aldose 1-epimerase  38 
 
 
327 aa  181  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.165305  decreased coverage  0.000622322 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4402  aldose-1-epimerase family protein  36.97 
 
 
300 aa  179  4e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1267  Aldose 1-epimerase  37.8 
 
 
301 aa  179  4.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.560353  hitchhiker  0.00115827 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1083  putative aldose-1-epimerase  40.07 
 
 
305 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.145719  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03764  predicted aldose-1-epimerase  37.32 
 
 
308 aa  177  1e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4107  Aldose 1-epimerase  37.32 
 
 
308 aa  177  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03713  hypothetical protein  37.32 
 
 
308 aa  177  1e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3398  aldose 1-epimerase  39.73 
 
 
294 aa  177  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226465  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5326  aldose-1-epimerase family protein  36.97 
 
 
300 aa  177  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.6155 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1019  Aldose 1-epimerase  38 
 
 
299 aa  176  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.584137  hitchhiker  0.000443551 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0866  Aldose 1-epimerase  40.13 
 
 
306 aa  176  6e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104082  normal  0.0514904 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4264  aldose-1-epimerase family protein  36.62 
 
 
299 aa  166  4e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4297  aldose-1-epimerase family protein  35.71 
 
 
295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4252  aldose-1-epimerase family protein  35.71 
 
 
295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4343  aldose-1-epimerase family protein  35.71 
 
 
295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1674  aldose 1-epimerase  33.88 
 
 
325 aa  158  9e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.416242  hitchhiker  0.00123529 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1235  Aldose 1-epimerase  39.26 
 
 
319 aa  158  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000417318 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0225  galactose mutarotase  34.87 
 
 
314 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000500571  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05040  galactose mutarotase-like enzyme  36.24 
 
 
323 aa  150  2e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.556037  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0044  Aldose 1-epimerase  35.88 
 
 
311 aa  148  9e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4408  aldose-1-epimerase family protein  34.98 
 
 
280 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4230  aldose-1-epimerase family protein  33.1 
 
 
280 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1163  aldose 1-epimerase  36.12 
 
 
323 aa  146  5e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.887027  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0854  Aldose 1-epimerase  34.74 
 
 
300 aa  142  7e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0393175  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0523  Aldose 1-epimerase  34.11 
 
 
290 aa  140  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1522  Aldose 1-epimerase  34.9 
 
 
293 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0226  galactose mutarotase  32.11 
 
 
318 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00706113  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5039  Aldose 1-epimerase  29.08 
 
 
312 aa  115  8.999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0559  Aldose 1-epimerase  25.62 
 
 
262 aa  92  1e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.480763  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0726  Aldose 1-epimerase  29.39 
 
 
328 aa  90.1  4e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1127  aldose 1-epimerase  29.19 
 
 
269 aa  87.4  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0176464  normal  0.584187 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1458  aldose 1-epimerase  29.11 
 
 
263 aa  86.7  4e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1585  Aldose 1-epimerase  29.23 
 
 
305 aa  82  0.000000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.309256 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27460  galactose mutarotase-like enzyme  29.91 
 
 
334 aa  80.1  0.00000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0656  aldose-1-epimerase  29.32 
 
 
314 aa  77  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.629793  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3046  Aldose 1-epimerase  27.11 
 
 
345 aa  76.3  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.813423  normal  0.148483 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4072  Aldose 1-epimerase  27.06 
 
 
360 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6635  Aldose 1-epimerase  25.73 
 
 
361 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.779767  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6330  aldose 1-epimerase  28.51 
 
 
362 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4184  Aldose 1-epimerase  27.06 
 
 
360 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2624  aldose 1-epimerase  28.82 
 
 
371 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1930  Aldose 1-epimerase  26.82 
 
 
316 aa  73.9  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.263285  normal  0.479856 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4205  aldose 1-epimerase  29.86 
 
 
362 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613008  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6508  aldose 1-epimerase  29.86 
 
 
362 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6742  aldose 1-epimerase  29.86 
 
 
362 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  normal  0.547611 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2336  aldose 1-epimerase  31.45 
 
 
376 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.360362  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6030  aldose 1-epimerase  28.07 
 
 
362 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808799  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6331  aldose 1-epimerase  31.64 
 
 
362 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51460  aldose 1-epimerase  28.85 
 
 
285 aa  72.8  0.000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0696  Aldose 1-epimerase  27.23 
 
 
306 aa  72  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00129327 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0702  Aldose 1-epimerase  28.86 
 
 
318 aa  70.1  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2798  aldose 1-epimerase  31.3 
 
 
321 aa  67.4  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1235  Aldose 1-epimerase  29.44 
 
 
387 aa  67.8  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2977  Aldose 1-epimerase  30.59 
 
 
397 aa  66.6  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.416586 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2344  aldose 1-epimerase  26.72 
 
 
363 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.145267 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0896  aldose 1-epimerase  26.02 
 
 
293 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.320638 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0474  Aldose 1-epimerase  30.77 
 
 
383 aa  62.8  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.561665  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1503  Aldose 1-epimerase  26.27 
 
 
317 aa  62.4  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.72169 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0149  Aldose 1-epimerase  30.35 
 
 
336 aa  62.4  0.000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0125238 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0803  aldose 1-epimerase  29.11 
 
 
289 aa  62  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5831  aldose 1-epimerase  25.29 
 
 
293 aa  61.6  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0718685  normal  0.204267 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1122  aldose 1-epimerase  30.17 
 
 
392 aa  60.5  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1431  Aldose 1-epimerase  29.48 
 
 
354 aa  60.1  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0799  aldose 1-epimerase  26.62 
 
 
397 aa  58.9  0.00000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1182  aldose 1-epimerase  23.33 
 
 
356 aa  58.5  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3963  aldose 1-epimerase  20.49 
 
 
286 aa  57.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.87118  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5648  Aldose 1-epimerase  27.68 
 
 
327 aa  57  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2057  aldose 1-epimerase  22.76 
 
 
305 aa  57.4  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.107394  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4277  aldose 1-epimerase  21.54 
 
 
289 aa  57  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.436668 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3076  aldose 1-epimerase  32.24 
 
 
362 aa  56.6  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal  0.313504 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2820  Aldose 1-epimerase  28.27 
 
 
380 aa  56.6  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2023  aldose 1-epimerase  27.64 
 
 
298 aa  56.2  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1743  hypothetical protein  19.72 
 
 
293 aa  56.2  0.0000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.574419  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0630  aldose 1-epimerase  23.05 
 
 
356 aa  56.2  0.0000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0655  aldose 1-epimerase  23.05 
 
 
356 aa  56.2  0.0000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2372  aldose 1-epimerase  29.06 
 
 
309 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0819  aldose 1-epimerase  27.03 
 
 
351 aa  55.8  0.0000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2506  aldose 1-epimerase  24.72 
 
 
355 aa  55.5  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288802  normal  0.200846 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2026  aldose 1-epimerase  26.74 
 
 
392 aa  55.5  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.564676  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2754  hypothetical protein  28.74 
 
 
296 aa  54.3  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.494847  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2660  aldose 1-epimerase  23.48 
 
 
306 aa  54.7  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0844306  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2682  aldose 1-epimerase  24.54 
 
 
406 aa  54.3  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0324  Aldose 1-epimerase  26.77 
 
 
299 aa  54.3  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.296431 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3405  Aldose 1-epimerase  29.74 
 
 
353 aa  54.3  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.237068  normal  0.0908294 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>