More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4732 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4732  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 257 aa  525  1e-148  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6337  transcriptional regulator, AraC family  45.1 
 
 		 259 aa  193  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.40361  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2035  AraC family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 243 aa  159  3e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.854548 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1421  transcriptional regulator, AraC family  42.02 
 
 		 277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0543  AraC family transcriptional regulator  43.68 
 
 		 285 aa  146  4.0000000000000006e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0588  AraC family transcriptional regulator  43.68 
 
 		 285 aa  146  4.0000000000000006e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0256  AraC family transcriptional regulator  41.85 
 
 		 295 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.88341  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1118  AraC family transcriptional regulator  41.85 
 
 		 300 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3375  AraC family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 295 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0121717  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3411  AraC family transcriptional regulator  41.85 
 
 		 295 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2522  AraC family transcriptional regulator  41.85 
 
 		 295 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2344  AraC family transcriptional regulator  42.08 
 
 		 247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3418  AraC family transcriptional regulator  42.08 
 
 		 247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1236  AraC family transcriptional regulator  41.85 
 
 		 319 aa  140  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000472369  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2960  AraC family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 306 aa  135  5e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0210112 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6701  transcriptional regulator, AraC family  39.31 
 
 		 279 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3237  AraC family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 276 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0744536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3390  AraC family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2712  helix-turn-helix domain-containing protein  38.42 
 
 		 273 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.741725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4731  AraC family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 289 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.944783  normal  0.659396 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2151  transcriptional regulator, AraC family  38.42 
 
 		 293 aa  124  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3528  AraC family transcriptional regulator  44.94 
 
 		 312 aa  123  3e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.680996  normal  0.733506 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3398  AraC family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 273 aa  122  4e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.61994  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2287  transcriptional regulator, AraC family  36 
 
 		 284 aa  122  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3555  AraC family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 273 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.152356 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0117  AraC family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 281 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2564  AraC family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 349 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.972599 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3471  AraC family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 344 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3559  AraC family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 349 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3961  AraC family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 349 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0742642 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5293  AraC family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 344 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.273034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5115  AraC family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 333 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0388343  normal  0.0650522 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4168  helix-turn-helix domain-containing protein  35.58 
 
 		 329 aa  115  7.999999999999999e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal  0.28666 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1449  transcriptional regulator, AraC family  38.02 
 
 		 320 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.380314 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1407  transcriptional regulator, AraC family  38.02 
 
 		 320 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.51399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2186  AraC family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 289 aa  113  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0548516  normal  0.0213407 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6348  transcriptional regulator, AraC family  38.18 
 
 		 301 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5103  helix-turn-helix domain-containing protein  37.37 
 
 		 307 aa  113  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1911  AraC family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 300 aa  112  6e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1435  transcriptional regulator, AraC family  36.73 
 
 		 324 aa  112  6e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215963  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2606  transcriptional regulator, AraC family  38.36 
 
 		 331 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4522  AraC family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 344 aa  111  9e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2354  AraC family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 318 aa  111  9e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0793456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1684  transcriptional regulator, AraC family  38.42 
 
 		 334 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.943057  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2496  helix-turn-helix domain-containing protein  35.35 
 
 		 308 aa  110  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0383135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3284  helix-turn-helix domain-containing protein  35.94 
 
 		 327 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2267  AraC family transcriptional regulator  38.42 
 
 		 334 aa  109  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0311911  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0842  transcriptional regulator, AraC family  34.5 
 
 		 318 aa  108  7.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.404534  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3619  histidine kinase  40.94 
 
 		 292 aa  108  8.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.499169  normal  0.14127 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0815  AraC family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 275 aa  108  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224567  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1600  helix-turn-helix domain-containing protein  39.11 
 
 		 356 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1608  transcriptional regulator, AraC family  37.85 
 
 		 334 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.889742  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4365  helix-turn-helix domain-containing protein  36.63 
 
 		 301 aa  107  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.822927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1450  transcriptional regulator, AraC family  34.48 
 
 		 301 aa  107  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.342314 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6076  transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 		 349 aa  106  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.132925 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4841  transcriptional regulator, AraC family  36.05 
 
 		 301 aa  106  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.579562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2971  AraC family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 330 aa  105  6e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.785867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2206  AraC family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 320 aa  105  7e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.933189  normal  0.0786322 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7240  AraC family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 199 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321623  normal  0.193055 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6195  AraC family transcriptional regulator  38 
 
 		 299 aa  102  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.781051 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4609  transcriptional regulator, AraC family  33.84 
 
 		 318 aa  101  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1134  transcriptional regulator, AraC family  37.74 
 
 		 329 aa  101  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.330045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2108  AraC family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 320 aa  100  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.472449  normal  0.965322 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2770  helix-turn-helix domain-containing protein  31.25 
 
 		 328 aa  100  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1477  AraC family transcriptional regulator  32.96 
 
 		 214 aa  100  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03650  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  39.07 
 
 		 338 aa  100  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1005  helix-turn-helix domain-containing protein  38.41 
 
 		 327 aa  99.8  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0991  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 315 aa  99.4  5e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0397421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3354  transcriptional regulator, AraC family  32.81 
 
 		 234 aa  99.4  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000174628 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4545  AraC family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 311 aa  98.6  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7382  transcriptional regulator AraC family  32.96 
 
 		 329 aa  97.8  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1900  AraC family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 316 aa  97.4  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00385171  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8693  transcriptional regulator, AraC family  32.38 
 
 		 313 aa  97.4  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1378  transcriptional regulator, AraC family  33.14 
 
 		 304 aa  97.1  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5186  putative AraC-like transcription regulator  33.89 
 
 		 335 aa  97.1  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3116  helix-turn-helix domain-containing protein  34.78 
 
 		 301 aa  97.4  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1659  transcriptional regulator, AraC family  38.2 
 
 		 348 aa  97.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.278996 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0292  transcriptional regulator, AraC family  35.9 
 
 		 359 aa  97.4  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4277  transcriptional regulator, AraC family  35.93 
 
 		 315 aa  97.4  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.421015 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1588  transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 		 325 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2439  transcriptional regulator, AraC family  33.9 
 
 		 325 aa  96.3  4e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241537 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0254  AraC family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 311 aa  96.7  4e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.215368  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1829  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 319 aa  96.3  5e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3616  GGDEF  43.59 
 
 		 124 aa  95.5  6e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.142982 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3366  transcriptional regulator, AraC family  31.16 
 
 		 309 aa  95.9  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.608408  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2897  transcriptional regulator, AraC family  33.52 
 
 		 329 aa  95.9  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.825187  normal  0.500009 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2110  AraC family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 299 aa  95.5  7e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28970  transcriptional regulator, AraC family  39.72 
 
 		 310 aa  95.5  8e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91786  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4765  AraC family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 312 aa  95.1  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1077  AraC family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 320 aa  94.7  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4179  AraC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 288 aa  94.7  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2206  AraC family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 317 aa  94.4  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1077  AraC family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 320 aa  94.7  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7171  AraC family transcriptional regulator  32.96 
 
 		 335 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2777  AraC family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 325 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0453  AraC family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 281 aa  93.6  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3301  transcriptional regulator, AraC family  32.14 
 
 		 331 aa  93.6  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.688791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0402  AraC family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 303 aa  92.8  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0455578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2093  helix-turn-helix domain-containing protein  31.49 
 
 		 303 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3499  AraC family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 281 aa  92.8  5e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>