203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2815 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2815  DNA polymerase LigD, polymerase domain-containing protein  100 
 
 		 305 aa  612  9.999999999999999e-175  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2802  DNA polymerase LigD, polymerase domain-containing protein  54.14 
 
 		 302 aa  313  1.9999999999999998e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0918963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3967  DNA primase, small subunit  53.14 
 
 		 302 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.641256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4351  DNA polymerase LigD polymerase subunit  51.49 
 
 		 303 aa  301  9e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1237  ATP dependent DNA ligase  46.6 
 
 		 304 aa  261  6.999999999999999e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1207  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  48.33 
 
 		 302 aa  261  1e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.560779  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34930  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  46.23 
 
 		 303 aa  253  3e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564701  normal  0.292075 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19790  ATP-dependent DNA ligase  48.62 
 
 		 878 aa  252  7e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.874876  normal  0.0111766 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2233  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  49.48 
 
 		 858 aa  249  3e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07110  ATP-dependent DNA ligase  45.83 
 
 		 847 aa  243  1.9999999999999999e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2991  DNA polymerase LigD polymerase domain-containing subunit  47.06 
 
 		 293 aa  243  3e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0294  ATP-dependent DNA ligase  43.85 
 
 		 845 aa  239  5.999999999999999e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0520  ATP-dependent DNA ligase  44.41 
 
 		 828 aa  237  2e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5249  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  42.76 
 
 		 292 aa  231  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.398866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13060  DNA ligase D/DNA polymerase LigD  43.62 
 
 		 852 aa  230  2e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2863  DNA primase-like  41.53 
 
 		 352 aa  224  1e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.355668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4732  ATP-dependent DNA ligase  42.86 
 
 		 758 aa  223  4e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.333349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4352  ATP-dependent DNA ligase  42.86 
 
 		 758 aa  222  6e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4438  ATP-dependent DNA ligase  42.86 
 
 		 758 aa  222  6e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0862477 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1020  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  45.64 
 
 		 313 aa  222  7e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00719502  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4308  DNA polymerase LigD polymerase subunit  41.83 
 
 		 306 aa  219  3e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1023  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  45.64 
 
 		 313 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0962  hypothetical protein  45.3 
 
 		 313 aa  219  5e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.612546  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0201  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  41.92 
 
 		 778 aa  215  9e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.173659  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10956  ATP-dependent DNA ligase  41.79 
 
 		 759 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1828  ATP-dependent DNA ligase  41.32 
 
 		 766 aa  212  7.999999999999999e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0653  ATP-dependent DNA ligase  44.91 
 
 		 816 aa  211  9e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4532  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  41.04 
 
 		 797 aa  210  2e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.684574  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1007  DNA polymerase LigD polymerase subunit  42.23 
 
 		 305 aa  206  6e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.104732  hitchhiker  0.00609843 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4915  ATP-dependent DNA ligase  40.75 
 
 		 763 aa  203  3e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735483  normal  0.531274 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4716  DNA ligase D  41.06 
 
 		 815 aa  202  5e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.795355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0128  ATP-dependent DNA ligase  39.5 
 
 		 831 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2121  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  45.73 
 
 		 306 aa  191  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3453  DNA primase, small subunit  37 
 
 		 301 aa  187  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1124  hypothetical protein  34.72 
 
 		 303 aa  186  3e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0109  DNA ligase D  35.09 
 
 		 872 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0363186 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2247  ATP-dependent DNA ligase  38.98 
 
 		 846 aa  172  9e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0128  DNA ligase D  34.72 
 
 		 871 aa  170  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2837  ATP-dependent DNA ligase  31.45 
 
 		 896 aa  168  8e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1584  DNA polymerase LigD polymerase subunit  39.87 
 
 		 309 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0991666  normal  0.0697444 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0784  ATP dependent DNA ligase  39.61 
 
 		 658 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1986  DNA primase, small subunit  33.56 
 
 		 303 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.328453  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2082  hypothetical protein  34.74 
 
 		 306 aa  160  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1378  hypothetical protein  36.3 
 
 		 339 aa  160  2e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.200655  normal  0.549475 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03410  DNA polymerase LigD polymerase domain protein  30.85 
 
 		 313 aa  160  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3112  DNA ligase D  38.65 
 
 		 1157 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0919454  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1335  ATP-dependent DNA ligase  38.65 
 
 		 980 aa  159  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2988  DNA ligase, ATP-dependent  38.65 
 
 		 1163 aa  159  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6714  DNA primase small subunit  36.27 
 
 		 334 aa  159  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0437742  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1858  DNA ligase D  34.62 
 
 		 940 aa  158  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.170046  normal  0.216644 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0939  DNA ligase D  36.22 
 
 		 847 aa  157  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0832  DNA ligase D  38.04 
 
 		 684 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0598  hypothetical protein  34.26 
 
 		 314 aa  156  5.0000000000000005e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.479165  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0836  DNA ligase D  37.65 
 
 		 683 aa  155  6e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5476  DNA ligase D  36.43 
 
 		 927 aa  155  6e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00388357 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0817  DNA ligase D, 3'-phosphoesterase domain protein  36.27 
 
 		 522 aa  155  6e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.138014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2328  putative ATP-dependent DNA ligase  35.04 
 
 		 1001 aa  155  7e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0455665  normal  0.455767 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6404  DNA ligase D  30.03 
 
 		 646 aa  155  9e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0822092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0026  DNA ligase D  34.52 
 
 		 825 aa  155  9e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.282762  hitchhiker  0.00000000359668 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1660  ATP-dependent DNA ligase  32.16 
 
 		 847 aa  155  9e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.600549  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1670  DNA primase-like  34.6 
 
 		 527 aa  155  1e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.447053  hitchhiker  0.00316977 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0832  DNA ligase D  36.4 
 
 		 656 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1301  hypothetical protein  33.59 
 
 		 301 aa  154  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0981  DNA ligase D  34.17 
 
 		 954 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3003  ATP-dependent DNA ligase  34.2 
 
 		 882 aa  154  2.9999999999999998e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0636525  normal  0.554248 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3248  DNA polymerase LigD polymerase subunit  33.94 
 
 		 328 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0342  DNA primase, small subunit  35.61 
 
 		 412 aa  153  4e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.938834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0366  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  30 
 
 		 304 aa  152  5e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00411082  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3426  hypothetical protein  34.41 
 
 		 414 aa  152  8e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.467651  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0998  DNA ligase D  31.06 
 
 		 861 aa  151  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0498  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  36.55 
 
 		 298 aa  151  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2067  hypothetical protein  32.39 
 
 		 312 aa  151  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0552463 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6340  DNA ligase D  36.33 
 
 		 949 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.15116 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7582  DNA ligase D  33.82 
 
 		 651 aa  151  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.373122 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1695  ATP dependent DNA ligase  33.72 
 
 		 843 aa  150  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.616199  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4772  DNA ligase D  36.11 
 
 		 651 aa  150  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2445  putative DNA ligase (ATP), C-terminal  31.03 
 
 		 326 aa  149  4e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.858354  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3085  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  28.14 
 
 		 299 aa  149  8e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.884253 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1951  DNA ligase D  33.72 
 
 		 822 aa  148  1.0000000000000001e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00524792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1571  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  35.82 
 
 		 330 aa  148  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2523  ATP-dependent DNA ligase  34.56 
 
 		 837 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000543878 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6073  DNA ligase D  34.35 
 
 		 927 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0510863 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2856  DNA primase-like  34.86 
 
 		 455 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.101034  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2977  DNA ligase D  33.33 
 
 		 845 aa  147  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.246159 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3272  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  32.16 
 
 		 328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.161629  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1346  ATP dependent DNA ligase  32.98 
 
 		 936 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.893044  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6483  ATP dependent DNA ligase  32.98 
 
 		 936 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0603382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3303  ATP dependent DNA ligase  28.87 
 
 		 855 aa  147  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300283  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0664  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  31.82 
 
 		 334 aa  146  4.0000000000000006e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.286197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3206  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  33.33 
 
 		 414 aa  146  5e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7647  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  35.48 
 
 		 544 aa  145  6e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2519  ATP-dependent DNA ligase  35.09 
 
 		 939 aa  145  7.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0365  DNA ligase D  28.38 
 
 		 902 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.215692 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5610  ATP dependent DNA ligase  35.55 
 
 		 932 aa  145  9e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.706105 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2095  DNA primase, small subunit  33.89 
 
 		 360 aa  145  9e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.59622  normal  0.161983 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5867  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  33.67 
 
 		 357 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.890125  normal  0.143768 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4339  ATP-dependent DNA ligase  35.29 
 
 		 871 aa  145  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0275716 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0584  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  31.45 
 
 		 329 aa  145  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1177  ATP-dependent DNA ligase  34.44 
 
 		 853 aa  144  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.601183  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5875  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  34.65 
 
 		 297 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>