203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1020 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1020  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  100 
 
 
313 aa  629  1e-179  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00719502  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1023  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  98.08 
 
 
313 aa  617  1e-176  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0962  hypothetical protein  97.44 
 
 
313 aa  587  1e-167  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.612546  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1007  DNA polymerase LigD polymerase subunit  75 
 
 
305 aa  441  1e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.104732  hitchhiker  0.00609843 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2863  DNA primase-like  62.33 
 
 
352 aa  410  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.355668  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4308  DNA polymerase LigD polymerase subunit  57.33 
 
 
306 aa  357  9.999999999999999e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4716  DNA ligase D  56.95 
 
 
815 aa  326  4.0000000000000003e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.795355  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34930  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  57 
 
 
303 aa  312  5.999999999999999e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564701  normal  0.292075 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4351  DNA polymerase LigD polymerase subunit  53 
 
 
303 aa  299  3e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3967  DNA primase, small subunit  52.33 
 
 
302 aa  291  1e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.641256  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3453  DNA primase, small subunit  50.51 
 
 
301 aa  282  5.000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2991  DNA polymerase LigD polymerase domain-containing subunit  53.58 
 
 
293 aa  280  2e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1207  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  51.16 
 
 
302 aa  275  7e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.560779  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5249  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  48.45 
 
 
292 aa  272  4.0000000000000004e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.398866  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2233  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  49.36 
 
 
858 aa  259  5.0000000000000005e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0201  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  45.57 
 
 
778 aa  246  3e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.173659  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1237  ATP dependent DNA ligase  46.98 
 
 
304 aa  238  1e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13060  DNA ligase D/DNA polymerase LigD  46.18 
 
 
852 aa  237  2e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2815  DNA polymerase LigD, polymerase domain-containing protein  45.64 
 
 
305 aa  236  3e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07110  ATP-dependent DNA ligase  46.38 
 
 
847 aa  231  2e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2121  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  46 
 
 
306 aa  228  9e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2802  DNA polymerase LigD, polymerase domain-containing protein  43.87 
 
 
302 aa  227  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0918963  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1584  DNA polymerase LigD polymerase subunit  46.26 
 
 
309 aa  223  3e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0991666  normal  0.0697444 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03410  DNA polymerase LigD polymerase domain protein  35.14 
 
 
313 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2837  ATP-dependent DNA ligase  35.25 
 
 
896 aa  216  4e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0598  hypothetical protein  41.5 
 
 
314 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.479165  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4532  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  44.23 
 
 
797 aa  214  1.9999999999999998e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.684574  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0294  ATP-dependent DNA ligase  43.54 
 
 
845 aa  211  9e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0653  ATP-dependent DNA ligase  42.8 
 
 
816 aa  211  2e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1124  hypothetical protein  37.37 
 
 
303 aa  210  2e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0520  ATP-dependent DNA ligase  43.99 
 
 
828 aa  206  4e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0128  ATP-dependent DNA ligase  43.53 
 
 
831 aa  204  1e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0939  DNA ligase D  43.55 
 
 
847 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19790  ATP-dependent DNA ligase  43.14 
 
 
878 aa  200  3e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.874876  normal  0.0111766 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3303  ATP dependent DNA ligase  34.63 
 
 
855 aa  200  3e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300283  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0128  DNA ligase D  38.44 
 
 
871 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4915  ATP-dependent DNA ligase  42.9 
 
 
763 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735483  normal  0.531274 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0109  DNA ligase D  38.75 
 
 
872 aa  199  5e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0363186 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1828  ATP-dependent DNA ligase  41.23 
 
 
766 aa  199  7e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3085  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  32.23 
 
 
299 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.884253 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6404  DNA ligase D  34.15 
 
 
646 aa  194  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0822092  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10956  ATP-dependent DNA ligase  42.18 
 
 
759 aa  194  2e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4732  ATP-dependent DNA ligase  41.55 
 
 
758 aa  192  4e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.333349  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4352  ATP-dependent DNA ligase  41.55 
 
 
758 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4438  ATP-dependent DNA ligase  41.55 
 
 
758 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0862477 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2082  hypothetical protein  34.84 
 
 
306 aa  190  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0365  DNA ligase D  34.15 
 
 
902 aa  191  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.215692 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1986  DNA primase, small subunit  34.8 
 
 
303 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.328453  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0139  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  35.12 
 
 
306 aa  187  3e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2067  hypothetical protein  37.1 
 
 
312 aa  186  4e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0552463 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1670  DNA primase-like  35.35 
 
 
527 aa  182  9.000000000000001e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.447053  hitchhiker  0.00316977 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1702  DNA ligase D  35.54 
 
 
877 aa  181  1e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170827  hitchhiker  0.00786599 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0998  DNA ligase D  32.57 
 
 
861 aa  181  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0366  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  35 
 
 
304 aa  179  5.999999999999999e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00411082  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1543  DNA primase, small subunit  38.76 
 
 
341 aa  179  5.999999999999999e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.881236  normal  0.307141 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1486  DNA polymerase LigD polymerase subunit  38.82 
 
 
341 aa  176  3e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00018157 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1378  hypothetical protein  35.54 
 
 
339 aa  176  4e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.200655  normal  0.549475 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3330  DNA ligase D  38.1 
 
 
896 aa  176  6e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.580871  normal  0.138663 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3248  DNA polymerase LigD polymerase subunit  37.82 
 
 
328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2946  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  36.58 
 
 
314 aa  167  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1571  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  37.31 
 
 
330 aa  166  4e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2258  DNA polymerase LigD polymerase domain-containing subunit  35.69 
 
 
332 aa  165  8e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.20495 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2445  putative DNA ligase (ATP), C-terminal  35.25 
 
 
326 aa  165  9e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.858354  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1675  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  35.53 
 
 
371 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3426  hypothetical protein  35.19 
 
 
414 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.467651  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4154  DNA primase small subunit  37.79 
 
 
408 aa  162  7e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.348836  normal  0.978255 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2856  DNA primase-like  34.54 
 
 
455 aa  162  8.000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.101034  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3206  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  34.49 
 
 
414 aa  162  9e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0584  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  35.55 
 
 
354 aa  161  1e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0275907  hitchhiker  0.000216971 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0584  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  34.55 
 
 
329 aa  161  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5283  DNA primase, small subunit  35.85 
 
 
347 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4915  hypothetical protein  35.85 
 
 
347 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0135401  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5004  hypothetical protein  35.85 
 
 
347 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.761919  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0026  DNA ligase D  35.62 
 
 
825 aa  160  3e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.282762  hitchhiker  0.00000000359668 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5542  hypothetical protein  35.63 
 
 
349 aa  159  4e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0652  DNA primase small subunit  37.5 
 
 
341 aa  159  7e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.515323  normal  0.0515309 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13762  hypothetical protein  36.4 
 
 
346 aa  158  9e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.798941 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3272  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  33.11 
 
 
328 aa  157  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.161629  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1218  ATP dependent DNA ligase  38.43 
 
 
846 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.257773 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6714  DNA primase small subunit  33.33 
 
 
334 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0437742  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6628  DNA primase small subunit  38.02 
 
 
358 aa  157  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0103402  hitchhiker  0.0000202322 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1945  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  33.94 
 
 
355 aa  156  3e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000971032  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5282  DNA ligase D  34.06 
 
 
658 aa  156  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.889453 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1274  DNA primase, small subunit  34.87 
 
 
349 aa  156  4e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.558044  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0817  DNA ligase D, 3'-phosphoesterase domain protein  35 
 
 
522 aa  156  4e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.138014  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0935  DNA ligase D, 3'-phosphoesterase domain protein  37.06 
 
 
789 aa  156  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0727399  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0342  DNA primase, small subunit  37.55 
 
 
412 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.938834  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2977  DNA ligase D  34.24 
 
 
845 aa  156  5.0000000000000005e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.246159 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3112  DNA ligase D  36.99 
 
 
1157 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0919454  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0491  DNA primase small subunit  34.42 
 
 
361 aa  154  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.209898  normal  0.702763 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5821  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  36.08 
 
 
352 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.305654  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2631  DNA ligase D  34.62 
 
 
865 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7647  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  34.71 
 
 
544 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0932  DNA ligase D, 3'-phosphoesterase domain protein  36.36 
 
 
737 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.819515  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3663  DNA primase, small subunit  37.69 
 
 
339 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.735103  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2830  DNA primase small subunit  36.54 
 
 
427 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1335  ATP-dependent DNA ligase  36.59 
 
 
980 aa  153  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4039  DNA polymerase LigD polymerase subunit  35.79 
 
 
319 aa  152  8.999999999999999e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.437287  normal  0.0570226 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1150  ATP dependent DNA ligase  36.4 
 
 
845 aa  151  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5867  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  34.78 
 
 
357 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.890125  normal  0.143768 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>