202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3206 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3206  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  100 
 
 		 414 aa  830    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3426  hypothetical protein  90.1 
 
 		 414 aa  758    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.467651  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0396  hypothetical protein  69.02 
 
 		 412 aa  543  1e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00684947  normal  0.451981 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0342  DNA primase, small subunit  68.51 
 
 		 412 aa  537  1e-151  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.938834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4154  DNA primase small subunit  68.75 
 
 		 408 aa  537  1e-151  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.348836  normal  0.978255 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0360  hypothetical protein  65.85 
 
 		 434 aa  525  1e-148  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0482134  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0370  hypothetical protein  65.85 
 
 		 434 aa  525  1e-148  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0349  DNA primase, small subunit  64.76 
 
 		 434 aa  527  1e-148  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10273  hypothetical protein  65.99 
 
 		 397 aa  514  1e-144  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0854972 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2830  DNA primase small subunit  55.75 
 
 		 427 aa  418  1e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6628  DNA primase small subunit  55.95 
 
 		 358 aa  328  8e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0103402  hitchhiker  0.0000202322 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3833  DNA primase small subunit  55.15 
 
 		 380 aa  322  9.000000000000001e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1378  hypothetical protein  53.24 
 
 		 339 aa  310  2e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.200655  normal  0.549475 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6714  DNA primase small subunit  52.3 
 
 		 334 aa  307  3e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0437742  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1543  DNA primase, small subunit  50.17 
 
 		 341 aa  299  7e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.881236  normal  0.307141 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1571  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  53.87 
 
 		 330 aa  297  3e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2258  DNA polymerase LigD polymerase domain-containing subunit  50.88 
 
 		 332 aa  295  9e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.20495 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2095  DNA primase, small subunit  48.39 
 
 		 360 aa  291  1e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.59622  normal  0.161983 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5542  hypothetical protein  50 
 
 		 349 aa  290  2e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1486  DNA polymerase LigD polymerase subunit  48.85 
 
 		 341 aa  290  4e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00018157 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1274  DNA primase, small subunit  49.33 
 
 		 349 aa  289  6e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.558044  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2236  DNA primase small subunit  48.06 
 
 		 323 aa  288  2e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.848931  normal  0.182306 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2445  putative DNA ligase (ATP), C-terminal  48.43 
 
 		 326 aa  286  4e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.858354  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1675  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  48.91 
 
 		 371 aa  286  4e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0584  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  47.94 
 
 		 354 aa  283  6.000000000000001e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0275907  hitchhiker  0.000216971 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3272  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  48.38 
 
 		 328 aa  281  1e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.161629  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0664  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  48.4 
 
 		 334 aa  278  1e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.286197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0584  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  48.26 
 
 		 329 aa  278  2e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4915  hypothetical protein  48.15 
 
 		 347 aa  277  2e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0135401  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5004  hypothetical protein  48.15 
 
 		 347 aa  277  2e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.761919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5283  DNA primase, small subunit  48.15 
 
 		 347 aa  278  2e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13762  hypothetical protein  49 
 
 		 346 aa  277  3e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.798941 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5867  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  47.24 
 
 		 357 aa  273  6e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.890125  normal  0.143768 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1945  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  44.09 
 
 		 355 aa  272  9e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000971032  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0652  DNA primase small subunit  48.22 
 
 		 341 aa  268  1e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.515323  normal  0.0515309 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2946  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  46.15 
 
 		 314 aa  265  1e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3665  hypothetical protein  47.1 
 
 		 360 aa  265  2e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0491  DNA primase small subunit  44.86 
 
 		 361 aa  261  2e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.209898  normal  0.702763 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1787  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  46.83 
 
 		 340 aa  258  2e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000694862 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0821  DNA primase small subunit  45.13 
 
 		 360 aa  256  5e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2031  hypothetical protein  44.72 
 
 		 340 aa  246  6.999999999999999e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.232126  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4038  DNA primase small subunit  43.85 
 
 		 364 aa  244  1.9999999999999999e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5821  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  45.76 
 
 		 352 aa  243  7e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.305654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0416  DNA primase small subunit  41.35 
 
 		 360 aa  237  3e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15620  DNA polymerase LigD, polymerase domain  43.31 
 
 		 353 aa  234  3e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.19081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0598  hypothetical protein  40.48 
 
 		 314 aa  204  2e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.479165  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1124  hypothetical protein  35.74 
 
 		 303 aa  203  4e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2082  hypothetical protein  37.59 
 
 		 306 aa  196  8.000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2067  hypothetical protein  36 
 
 		 312 aa  187  3e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0552463 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0998  DNA ligase D  35.52 
 
 		 861 aa  186  8e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2837  ATP-dependent DNA ligase  34.52 
 
 		 896 aa  184  3e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3303  ATP dependent DNA ligase  33.94 
 
 		 855 aa  183  4.0000000000000006e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300283  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6404  DNA ligase D  32.63 
 
 		 646 aa  176  9e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0822092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1986  DNA primase, small subunit  33.57 
 
 		 303 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.328453  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3085  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  34.07 
 
 		 299 aa  171  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.884253 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0939  DNA ligase D  40.38 
 
 		 847 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1702  DNA ligase D  34.62 
 
 		 877 aa  169  6e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170827  hitchhiker  0.00786599 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0109  DNA ligase D  34.16 
 
 		 872 aa  169  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0363186 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0365  DNA ligase D  33.45 
 
 		 902 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.215692 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0128  DNA ligase D  33.1 
 
 		 871 aa  167  4e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1670  DNA primase-like  33.92 
 
 		 527 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.447053  hitchhiker  0.00316977 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0139  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  31.38 
 
 		 306 aa  165  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2863  DNA primase-like  31.02 
 
 		 352 aa  162  8.000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.355668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5249  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  33.79 
 
 		 292 aa  159  9e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.398866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7647  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  35.11 
 
 		 544 aa  157  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03410  DNA polymerase LigD polymerase domain protein  30.8 
 
 		 313 aa  156  8e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3248  DNA polymerase LigD polymerase subunit  33.56 
 
 		 328 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2135  DNA ligase D  31.48 
 
 		 815 aa  153  5e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2631  DNA ligase D  32.98 
 
 		 865 aa  153  5e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1020  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  34.49 
 
 		 313 aa  153  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00719502  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1828  ATP-dependent DNA ligase  32.2 
 
 		 766 aa  152  8e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0884  ATP dependent DNA ligase  38.95 
 
 		 726 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.911309  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4716  DNA ligase D  33.69 
 
 		 815 aa  152  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.795355  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0201  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  33.33 
 
 		 778 aa  152  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.173659  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0932  DNA ligase D, 3'-phosphoesterase domain protein  39.55 
 
 		 737 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.819515  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1729  DNA ligase D  33.57 
 
 		 813 aa  151  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0256122  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7781  putative DNA ligase-like protein  33.23 
 
 		 317 aa  151  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0711104  normal  0.114107 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0935  DNA ligase D, 3'-phosphoesterase domain protein  39.55 
 
 		 789 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0727399  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5610  ATP dependent DNA ligase  34.66 
 
 		 932 aa  150  5e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.706105 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10956  ATP-dependent DNA ligase  33.57 
 
 		 759 aa  149  6e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0962  hypothetical protein  34.15 
 
 		 313 aa  149  7e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.612546  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1023  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  34.49 
 
 		 313 aa  149  7e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4352  ATP-dependent DNA ligase  32.27 
 
 		 758 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4438  ATP-dependent DNA ligase  32.27 
 
 		 758 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0862477 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4308  DNA polymerase LigD polymerase subunit  31.63 
 
 		 306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0817  DNA ligase D, 3'-phosphoesterase domain protein  32.87 
 
 		 522 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.138014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4351  DNA polymerase LigD polymerase subunit  34.59 
 
 		 303 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0784  ATP dependent DNA ligase  34.24 
 
 		 658 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4424  ATP-dependent DNA ligase  34.7 
 
 		 825 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0379748  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4732  ATP-dependent DNA ligase  31.91 
 
 		 758 aa  146  6e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.333349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0366  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  29.12 
 
 		 304 aa  146  6e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00411082  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6340  DNA ligase D  34.3 
 
 		 949 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.15116 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0981  DNA ligase D  32.13 
 
 		 954 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2815  DNA polymerase LigD, polymerase domain-containing protein  33.33 
 
 		 305 aa  146  8.000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4915  ATP-dependent DNA ligase  33.21 
 
 		 763 aa  145  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735483  normal  0.531274 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3112  DNA ligase D  35.09 
 
 		 1157 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0919454  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0568  DNA ligase D  32.28 
 
 		 818 aa  144  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000109107  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2802  DNA polymerase LigD, polymerase domain-containing protein  33.8 
 
 		 302 aa  144  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0918963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6073  DNA ligase D  34.85 
 
 		 927 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0510863 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0832  DNA ligase D  33.82 
 
 		 656 aa  144  3e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>