203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_1023 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_1023  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  100 
 
 
313 aa  627  1e-179  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0962  hypothetical protein  98.72 
 
 
313 aa  621  1e-177  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.612546  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1020  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  98.08 
 
 
313 aa  617  1e-176  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00719502  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1007  DNA polymerase LigD polymerase subunit  75.66 
 
 
305 aa  445  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.104732  hitchhiker  0.00609843 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2863  DNA primase-like  63.33 
 
 
352 aa  414  9.999999999999999e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.355668  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4308  DNA polymerase LigD polymerase subunit  57.48 
 
 
306 aa  357  1.9999999999999998e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4716  DNA ligase D  59.51 
 
 
815 aa  330  3e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.795355  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34930  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  57 
 
 
303 aa  310  2e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564701  normal  0.292075 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4351  DNA polymerase LigD polymerase subunit  53 
 
 
303 aa  295  8e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3967  DNA primase, small subunit  53.02 
 
 
302 aa  288  1e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.641256  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3453  DNA primase, small subunit  50.85 
 
 
301 aa  280  3e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2991  DNA polymerase LigD polymerase domain-containing subunit  53.24 
 
 
293 aa  276  4e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1207  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  50.83 
 
 
302 aa  269  4e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.560779  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5249  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  48.45 
 
 
292 aa  267  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.398866  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2233  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  49.04 
 
 
858 aa  253  3e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0201  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  45.25 
 
 
778 aa  244  9.999999999999999e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.173659  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1237  ATP dependent DNA ligase  46.98 
 
 
304 aa  236  3e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2815  DNA polymerase LigD, polymerase domain-containing protein  45.64 
 
 
305 aa  234  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13060  DNA ligase D/DNA polymerase LigD  45.85 
 
 
852 aa  232  6e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2121  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  46 
 
 
306 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1584  DNA polymerase LigD polymerase subunit  46.94 
 
 
309 aa  225  6e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0991666  normal  0.0697444 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07110  ATP-dependent DNA ligase  46.05 
 
 
847 aa  225  8e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2802  DNA polymerase LigD, polymerase domain-containing protein  43.55 
 
 
302 aa  222  6e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0918963  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03410  DNA polymerase LigD polymerase domain protein  34.8 
 
 
313 aa  217  2e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4532  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  44.23 
 
 
797 aa  213  4.9999999999999996e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.684574  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2837  ATP-dependent DNA ligase  35.25 
 
 
896 aa  212  5.999999999999999e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0653  ATP-dependent DNA ligase  43.54 
 
 
816 aa  209  4e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0598  hypothetical protein  41.5 
 
 
314 aa  209  5e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.479165  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0294  ATP-dependent DNA ligase  43.2 
 
 
845 aa  209  5e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1124  hypothetical protein  37.37 
 
 
303 aa  207  2e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0520  ATP-dependent DNA ligase  43.64 
 
 
828 aa  201  9e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0128  ATP-dependent DNA ligase  43.17 
 
 
831 aa  201  9e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3303  ATP dependent DNA ligase  35.54 
 
 
855 aa  201  9.999999999999999e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300283  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19790  ATP-dependent DNA ligase  43.46 
 
 
878 aa  198  7.999999999999999e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.874876  normal  0.0111766 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4915  ATP-dependent DNA ligase  42.72 
 
 
763 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735483  normal  0.531274 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0939  DNA ligase D  43.15 
 
 
847 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0128  DNA ligase D  38.44 
 
 
871 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0109  DNA ligase D  38.75 
 
 
872 aa  196  6e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0363186 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1828  ATP-dependent DNA ligase  41.23 
 
 
766 aa  195  6e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3085  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  33.11 
 
 
299 aa  194  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.884253 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10956  ATP-dependent DNA ligase  42.12 
 
 
759 aa  192  6e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4732  ATP-dependent DNA ligase  42.11 
 
 
758 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.333349  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6404  DNA ligase D  34.15 
 
 
646 aa  191  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0822092  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4352  ATP-dependent DNA ligase  41.9 
 
 
758 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4438  ATP-dependent DNA ligase  41.9 
 
 
758 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0862477 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0139  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  34.45 
 
 
306 aa  188  9e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2082  hypothetical protein  34.84 
 
 
306 aa  186  6e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0365  DNA ligase D  33.8 
 
 
902 aa  185  7e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.215692 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1986  DNA primase, small subunit  34.46 
 
 
303 aa  182  7e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.328453  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2067  hypothetical protein  36.97 
 
 
312 aa  182  8.000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0552463 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1702  DNA ligase D  35.54 
 
 
877 aa  178  1e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170827  hitchhiker  0.00786599 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0366  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  35 
 
 
304 aa  178  1e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00411082  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0998  DNA ligase D  32.25 
 
 
861 aa  177  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1670  DNA primase-like  34.68 
 
 
527 aa  176  5e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.447053  hitchhiker  0.00316977 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1543  DNA primase, small subunit  38.76 
 
 
341 aa  175  8e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.881236  normal  0.307141 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1486  DNA polymerase LigD polymerase subunit  38.82 
 
 
341 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00018157 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1378  hypothetical protein  35.54 
 
 
339 aa  172  5e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.200655  normal  0.549475 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3248  DNA polymerase LigD polymerase subunit  37.14 
 
 
328 aa  172  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3330  DNA ligase D  37.7 
 
 
896 aa  169  4e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.580871  normal  0.138663 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4154  DNA primase small subunit  38.55 
 
 
408 aa  166  2.9999999999999998e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.348836  normal  0.978255 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0584  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  35.55 
 
 
354 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0275907  hitchhiker  0.000216971 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2946  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  36.24 
 
 
314 aa  162  8.000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3426  hypothetical protein  35.19 
 
 
414 aa  161  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.467651  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1571  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  36.92 
 
 
330 aa  161  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2258  DNA polymerase LigD polymerase domain-containing subunit  34.15 
 
 
332 aa  160  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.20495 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2445  putative DNA ligase (ATP), C-terminal  34.92 
 
 
326 aa  160  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.858354  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1675  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  35.2 
 
 
371 aa  160  3e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0584  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  34.88 
 
 
329 aa  159  4e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3206  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  34.49 
 
 
414 aa  159  9e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0026  DNA ligase D  35.62 
 
 
825 aa  158  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.282762  hitchhiker  0.00000000359668 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0652  DNA primase small subunit  37.5 
 
 
341 aa  157  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.515323  normal  0.0515309 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2977  DNA ligase D  34.58 
 
 
845 aa  156  3e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.246159 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4915  hypothetical protein  35.47 
 
 
347 aa  156  4e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0135401  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1945  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  33.11 
 
 
355 aa  156  4e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000971032  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5004  hypothetical protein  35.47 
 
 
347 aa  156  4e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.761919  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5283  DNA primase, small subunit  35.47 
 
 
347 aa  156  4e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1218  ATP dependent DNA ligase  39.18 
 
 
846 aa  156  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.257773 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2856  DNA primase-like  34.21 
 
 
455 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.101034  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5542  hypothetical protein  35.25 
 
 
349 aa  155  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3112  DNA ligase D  38.49 
 
 
1157 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0919454  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3272  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  33.11 
 
 
328 aa  154  2.9999999999999998e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.161629  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13762  hypothetical protein  36.02 
 
 
346 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.798941 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6714  DNA primase small subunit  32.99 
 
 
334 aa  153  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0437742  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10273  hypothetical protein  33.33 
 
 
397 aa  153  5e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0854972 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0491  DNA primase small subunit  34.42 
 
 
361 aa  152  7e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.209898  normal  0.702763 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6628  DNA primase small subunit  37.64 
 
 
358 aa  152  8e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0103402  hitchhiker  0.0000202322 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0981  DNA ligase D  34.92 
 
 
954 aa  151  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1335  ATP-dependent DNA ligase  38.08 
 
 
980 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0342  DNA primase, small subunit  37.15 
 
 
412 aa  152  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.938834  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1274  DNA primase, small subunit  34.48 
 
 
349 aa  151  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.558044  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3663  DNA primase, small subunit  37.69 
 
 
339 aa  152  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.735103  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5282  DNA ligase D  34.65 
 
 
658 aa  151  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.889453 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2631  DNA ligase D  34.62 
 
 
865 aa  152  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2830  DNA primase small subunit  36.15 
 
 
427 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0817  DNA ligase D, 3'-phosphoesterase domain protein  34.67 
 
 
522 aa  151  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.138014  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5821  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  34.75 
 
 
352 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.305654  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0935  DNA ligase D, 3'-phosphoesterase domain protein  36.71 
 
 
789 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0727399  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4039  DNA polymerase LigD polymerase subunit  35.79 
 
 
319 aa  150  4e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.437287  normal  0.0570226 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2988  DNA ligase, ATP-dependent  37.66 
 
 
1163 aa  149  8e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8017  ATP-dependent DNA ligase  34.43 
 
 
893 aa  148  9e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>