203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_1007 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009675  Anae109_1007  DNA polymerase LigD polymerase subunit  100 
 
 		 305 aa  619  1e-176  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.104732  hitchhiker  0.00609843 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0962  hypothetical protein  76.64 
 
 		 313 aa  455  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.612546  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1023  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  75.66 
 
 		 313 aa  448  1e-125  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1020  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  75 
 
 		 313 aa  445  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00719502  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2863  DNA primase-like  64.29 
 
 		 352 aa  412  1e-114  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.355668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4308  DNA polymerase LigD polymerase subunit  61.95 
 
 		 306 aa  386  1e-106  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4716  DNA ligase D  57.69 
 
 		 815 aa  331  9e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.795355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4351  DNA polymerase LigD polymerase subunit  53.69 
 
 		 303 aa  305  7e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34930  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  55.93 
 
 		 303 aa  303  2.0000000000000002e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564701  normal  0.292075 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3967  DNA primase, small subunit  54.03 
 
 		 302 aa  298  7e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.641256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3453  DNA primase, small subunit  51.54 
 
 		 301 aa  292  6e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2991  DNA polymerase LigD polymerase domain-containing subunit  52.38 
 
 		 293 aa  270  2e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5249  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  47.89 
 
 		 292 aa  262  4e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.398866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1207  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  49 
 
 		 302 aa  261  6.999999999999999e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.560779  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2233  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  47.26 
 
 		 858 aa  240  2e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07110  ATP-dependent DNA ligase  45.58 
 
 		 847 aa  228  8e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0201  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  43.49 
 
 		 778 aa  227  2e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.173659  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1237  ATP dependent DNA ligase  45.7 
 
 		 304 aa  226  4e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13060  DNA ligase D/DNA polymerase LigD  43.06 
 
 		 852 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03410  DNA polymerase LigD polymerase domain protein  35.71 
 
 		 313 aa  220  1.9999999999999999e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2815  DNA polymerase LigD, polymerase domain-containing protein  42.23 
 
 		 305 aa  216  2.9999999999999998e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1584  DNA polymerase LigD polymerase subunit  43.88 
 
 		 309 aa  215  8e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0991666  normal  0.0697444 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2802  DNA polymerase LigD, polymerase domain-containing protein  41.53 
 
 		 302 aa  213  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0918963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2121  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  45.9 
 
 		 306 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0598  hypothetical protein  41.78 
 
 		 314 aa  206  4e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.479165  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10956  ATP-dependent DNA ligase  44.29 
 
 		 759 aa  206  6e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3303  ATP dependent DNA ligase  36.08 
 
 		 855 aa  205  8e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300283  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4532  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  40.78 
 
 		 797 aa  204  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.684574  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0128  ATP-dependent DNA ligase  43.17 
 
 		 831 aa  202  4e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0294  ATP-dependent DNA ligase  40.74 
 
 		 845 aa  202  7e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0520  ATP-dependent DNA ligase  41.3 
 
 		 828 aa  200  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2837  ATP-dependent DNA ligase  33.1 
 
 		 896 aa  200  3e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1828  ATP-dependent DNA ligase  42.41 
 
 		 766 aa  200  3e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19790  ATP-dependent DNA ligase  43.13 
 
 		 878 aa  196  3e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.874876  normal  0.0111766 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0139  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  35.12 
 
 		 306 aa  194  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2067  hypothetical protein  38.62 
 
 		 312 aa  193  3e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0552463 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4915  ATP-dependent DNA ligase  42.25 
 
 		 763 aa  193  3e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735483  normal  0.531274 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1986  DNA primase, small subunit  33.99 
 
 		 303 aa  192  8e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.328453  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2082  hypothetical protein  36.71 
 
 		 306 aa  191  1e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0128  DNA ligase D  37.17 
 
 		 871 aa  191  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1124  hypothetical protein  34.13 
 
 		 303 aa  190  2e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4732  ATP-dependent DNA ligase  41.34 
 
 		 758 aa  189  4e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.333349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4352  ATP-dependent DNA ligase  41.34 
 
 		 758 aa  189  5e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4438  ATP-dependent DNA ligase  41.34 
 
 		 758 aa  189  5e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0862477 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0653  ATP-dependent DNA ligase  40 
 
 		 816 aa  189  5.999999999999999e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0109  DNA ligase D  37.29 
 
 		 872 aa  187  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0363186 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6404  DNA ligase D  33.8 
 
 		 646 aa  186  4e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0822092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3085  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  30.91 
 
 		 299 aa  182  6e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.884253 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0365  DNA ligase D  33.8 
 
 		 902 aa  181  9.000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.215692 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1670  DNA primase-like  35.35 
 
 		 527 aa  180  2e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.447053  hitchhiker  0.00316977 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0939  DNA ligase D  36.25 
 
 		 847 aa  178  9e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1486  DNA polymerase LigD polymerase subunit  37.59 
 
 		 341 aa  176  3e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00018157 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1702  DNA ligase D  33.8 
 
 		 877 aa  174  9.999999999999999e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170827  hitchhiker  0.00786599 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0366  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  34.72 
 
 		 304 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00411082  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1543  DNA primase, small subunit  36.88 
 
 		 341 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.881236  normal  0.307141 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0998  DNA ligase D  32.98 
 
 		 861 aa  169  6e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0817  DNA ligase D, 3'-phosphoesterase domain protein  36.7 
 
 		 522 aa  166  4e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.138014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3248  DNA polymerase LigD polymerase subunit  33.8 
 
 		 328 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0981  DNA ligase D  38.02 
 
 		 954 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4154  DNA primase small subunit  36.76 
 
 		 408 aa  160  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.348836  normal  0.978255 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1218  ATP dependent DNA ligase  37.11 
 
 		 846 aa  159  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.257773 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5821  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  35.84 
 
 		 352 aa  159  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.305654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3112  DNA ligase D  37.7 
 
 		 1157 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0919454  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1335  ATP-dependent DNA ligase  38.08 
 
 		 980 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3330  DNA ligase D  34.52 
 
 		 896 aa  157  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.580871  normal  0.138663 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1378  hypothetical protein  33.2 
 
 		 339 aa  157  3e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.200655  normal  0.549475 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0498  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  36.22 
 
 		 298 aa  157  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2988  DNA ligase, ATP-dependent  37.3 
 
 		 1163 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2258  DNA polymerase LigD polymerase domain-containing subunit  34.39 
 
 		 332 aa  154  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.20495 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0011  ATP-dependent DNA ligase  34.65 
 
 		 864 aa  154  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0339968 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0584  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  32.78 
 
 		 354 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0275907  hitchhiker  0.000216971 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1571  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  36.61 
 
 		 330 aa  153  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2856  DNA primase-like  35.66 
 
 		 455 aa  153  4e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.101034  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0342  DNA primase, small subunit  36.9 
 
 		 412 aa  152  5e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.938834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6073  DNA ligase D  36.84 
 
 		 927 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0510863 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1858  DNA ligase D  36.9 
 
 		 940 aa  151  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.170046  normal  0.216644 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1346  ATP dependent DNA ligase  36.84 
 
 		 936 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.893044  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6483  ATP dependent DNA ligase  36.84 
 
 		 936 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0603382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2247  ATP-dependent DNA ligase  35.48 
 
 		 846 aa  150  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2631  DNA ligase D  35.58 
 
 		 865 aa  150  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2328  putative ATP-dependent DNA ligase  36.9 
 
 		 1001 aa  150  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0455665  normal  0.455767 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3663  DNA primase, small subunit  37.45 
 
 		 339 aa  149  5e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.735103  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1660  ATP-dependent DNA ligase  33.58 
 
 		 847 aa  148  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.600549  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6628  DNA primase small subunit  36.04 
 
 		 358 aa  148  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0103402  hitchhiker  0.0000202322 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3426  hypothetical protein  33.81 
 
 		 414 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.467651  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1648  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  35.38 
 
 		 305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.520924  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1177  ATP-dependent DNA ligase  31.77 
 
 		 853 aa  147  3e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.601183  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3206  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  34.16 
 
 		 414 aa  146  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5079  ATP-dependent DNA ligase  34.25 
 
 		 901 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.795218  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1150  ATP dependent DNA ligase  36.69 
 
 		 845 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0026  DNA ligase D  33.22 
 
 		 825 aa  146  5e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.282762  hitchhiker  0.00000000359668 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2445  putative DNA ligase (ATP), C-terminal  34.48 
 
 		 326 aa  145  6e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.858354  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2523  ATP-dependent DNA ligase  35.68 
 
 		 837 aa  145  6e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000543878 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0396  hypothetical protein  35.21 
 
 		 412 aa  144  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00684947  normal  0.451981 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2946  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  34.65 
 
 		 314 aa  145  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3833  DNA primase small subunit  35.97 
 
 		 380 aa  144  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1337  ATP dependent DNA ligase  35.16 
 
 		 868 aa  143  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.402102 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2830  DNA primase small subunit  33.86 
 
 		 427 aa  144  3e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3272  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  31.45 
 
 		 328 aa  143  4e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.161629  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8017  ATP-dependent DNA ligase  35.11 
 
 		 893 aa  143  5e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>