202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3833 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3833  DNA primase small subunit  100 
 
 		 380 aa  763    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2830  DNA primase small subunit  59.7 
 
 		 427 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6628  DNA primase small subunit  59.57 
 
 		 358 aa  369  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0103402  hitchhiker  0.0000202322 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1378  hypothetical protein  55.45 
 
 		 339 aa  363  4e-99  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.200655  normal  0.549475 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6714  DNA primase small subunit  54.52 
 
 		 334 aa  361  1e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0437742  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2258  DNA polymerase LigD polymerase domain-containing subunit  53.31 
 
 		 332 aa  352  7e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.20495 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1543  DNA primase, small subunit  53.94 
 
 		 341 aa  347  2e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.881236  normal  0.307141 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1571  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  55.25 
 
 		 330 aa  345  8.999999999999999e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1486  DNA polymerase LigD polymerase subunit  53.94 
 
 		 341 aa  345  8.999999999999999e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00018157 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13762  hypothetical protein  54.68 
 
 		 346 aa  345  1e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.798941 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0360  hypothetical protein  54.01 
 
 		 434 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0482134  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0370  hypothetical protein  54.01 
 
 		 434 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0349  DNA primase, small subunit  53.85 
 
 		 434 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3426  hypothetical protein  53.22 
 
 		 414 aa  334  1e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.467651  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1675  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  51.91 
 
 		 371 aa  331  1e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5542  hypothetical protein  52.11 
 
 		 349 aa  331  1e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4915  hypothetical protein  52.41 
 
 		 347 aa  330  2e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0135401  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5004  hypothetical protein  52.41 
 
 		 347 aa  330  2e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.761919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5283  DNA primase, small subunit  52.41 
 
 		 347 aa  330  2e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1274  DNA primase, small subunit  52.41 
 
 		 349 aa  329  6e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.558044  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0396  hypothetical protein  52.98 
 
 		 412 aa  326  3e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00684947  normal  0.451981 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10273  hypothetical protein  55.07 
 
 		 397 aa  326  3e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0854972 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0584  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  49.86 
 
 		 354 aa  326  4.0000000000000003e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0275907  hitchhiker  0.000216971 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0342  DNA primase, small subunit  55.29 
 
 		 412 aa  325  1e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.938834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1945  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  47.59 
 
 		 355 aa  323  3e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000971032  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3206  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  55.15 
 
 		 414 aa  321  1.9999999999999998e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0491  DNA primase small subunit  49.43 
 
 		 361 aa  316  6e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.209898  normal  0.702763 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5821  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  51.98 
 
 		 352 aa  312  4.999999999999999e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.305654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5867  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  48 
 
 		 357 aa  311  1e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.890125  normal  0.143768 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4154  DNA primase small subunit  55.15 
 
 		 408 aa  309  5.9999999999999995e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.348836  normal  0.978255 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0652  DNA primase small subunit  51.83 
 
 		 341 aa  308  1.0000000000000001e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.515323  normal  0.0515309 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0416  DNA primase small subunit  47.08 
 
 		 360 aa  307  2.0000000000000002e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0664  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  50.64 
 
 		 334 aa  298  1e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.286197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2031  hypothetical protein  46.55 
 
 		 340 aa  297  2e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.232126  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0821  DNA primase small subunit  46.29 
 
 		 360 aa  295  1e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3272  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  48.72 
 
 		 328 aa  294  2e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.161629  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1787  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  45.65 
 
 		 340 aa  293  3e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000694862 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2095  DNA primase, small subunit  48.54 
 
 		 360 aa  293  4e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.59622  normal  0.161983 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2946  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  49.84 
 
 		 314 aa  290  2e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3665  hypothetical protein  46.29 
 
 		 360 aa  288  2e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2236  DNA primase small subunit  47.9 
 
 		 323 aa  286  2.9999999999999996e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.848931  normal  0.182306 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0584  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  48.58 
 
 		 329 aa  286  5.999999999999999e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2445  putative DNA ligase (ATP), C-terminal  49.35 
 
 		 326 aa  281  2e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.858354  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15620  DNA polymerase LigD, polymerase domain  42.77 
 
 		 353 aa  259  8e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.19081  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4038  DNA primase small subunit  43.66 
 
 		 364 aa  255  9e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1124  hypothetical protein  34.35 
 
 		 303 aa  200  3.9999999999999996e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0598  hypothetical protein  40.61 
 
 		 314 aa  199  5e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.479165  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2082  hypothetical protein  38.64 
 
 		 306 aa  197  3e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0998  DNA ligase D  35.93 
 
 		 861 aa  192  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2067  hypothetical protein  38.7 
 
 		 312 aa  189  5e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0552463 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2837  ATP-dependent DNA ligase  33.56 
 
 		 896 aa  183  3e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3303  ATP dependent DNA ligase  34.84 
 
 		 855 aa  176  8e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300283  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6404  DNA ligase D  34.31 
 
 		 646 aa  175  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0822092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1986  DNA primase, small subunit  33.33 
 
 		 303 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.328453  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0365  DNA ligase D  34.01 
 
 		 902 aa  175  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.215692 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0109  DNA ligase D  34.47 
 
 		 872 aa  171  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0363186 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0128  DNA ligase D  34.63 
 
 		 871 aa  169  7e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03410  DNA polymerase LigD polymerase domain protein  33.21 
 
 		 313 aa  168  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3085  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  33.82 
 
 		 299 aa  167  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.884253 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1702  DNA ligase D  32.23 
 
 		 877 aa  167  4e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170827  hitchhiker  0.00786599 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0939  DNA ligase D  37.33 
 
 		 847 aa  166  9e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0139  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  30.85 
 
 		 306 aa  160  4e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0201  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  34.86 
 
 		 778 aa  155  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.173659  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2863  DNA primase-like  34.84 
 
 		 352 aa  154  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.355668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5249  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  36.16 
 
 		 292 aa  154  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.398866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1207  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  35.33 
 
 		 302 aa  151  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.560779  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4351  DNA polymerase LigD polymerase subunit  37.21 
 
 		 303 aa  151  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4308  DNA polymerase LigD polymerase subunit  35.5 
 
 		 306 aa  150  3e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1670  DNA primase-like  34.04 
 
 		 527 aa  149  7e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.447053  hitchhiker  0.00316977 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4716  DNA ligase D  34.34 
 
 		 815 aa  147  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.795355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7781  putative DNA ligase-like protein  35.84 
 
 		 317 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0711104  normal  0.114107 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2802  DNA polymerase LigD, polymerase domain-containing protein  34.48 
 
 		 302 aa  144  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0918963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34930  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  34.77 
 
 		 303 aa  143  5e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564701  normal  0.292075 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3248  DNA polymerase LigD polymerase subunit  33.63 
 
 		 328 aa  142  7e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2135  DNA ligase D  31.32 
 
 		 815 aa  141  9.999999999999999e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3967  DNA primase, small subunit  35.47 
 
 		 302 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.641256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0832  DNA ligase D  35.94 
 
 		 656 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3663  DNA primase, small subunit  37.55 
 
 		 339 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.735103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2631  DNA ligase D  32.04 
 
 		 865 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19790  ATP-dependent DNA ligase  35.14 
 
 		 878 aa  140  3e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.874876  normal  0.0111766 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0011  ATP-dependent DNA ligase  31.82 
 
 		 864 aa  140  3e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0339968 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2856  DNA primase-like  34.04 
 
 		 455 aa  140  4.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.101034  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13060  DNA ligase D/DNA polymerase LigD  33.8 
 
 		 852 aa  139  6e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0520  ATP-dependent DNA ligase  33.44 
 
 		 828 aa  138  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0817  DNA ligase D, 3'-phosphoesterase domain protein  34.63 
 
 		 522 aa  139  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.138014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0981  DNA ligase D  33.56 
 
 		 954 aa  138  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4424  ATP-dependent DNA ligase  34.39 
 
 		 825 aa  138  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0379748  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4532  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  33.08 
 
 		 797 aa  138  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.684574  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1337  ATP dependent DNA ligase  33.33 
 
 		 868 aa  138  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.402102 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4772  DNA ligase D  35.04 
 
 		 651 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4352  ATP-dependent DNA ligase  31.6 
 
 		 758 aa  136  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4438  ATP-dependent DNA ligase  31.6 
 
 		 758 aa  136  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0862477 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7647  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  32.93 
 
 		 544 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4732  ATP-dependent DNA ligase  31.6 
 
 		 758 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.333349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1729  DNA ligase D  32.06 
 
 		 813 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0256122  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1237  ATP dependent DNA ligase  34.93 
 
 		 304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4303  DNA ligase D  35.64 
 
 		 817 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.400493 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2679  ATP-dependent DNA ligase  32.59 
 
 		 868 aa  133  6e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0784  ATP dependent DNA ligase  34.53 
 
 		 658 aa  132  9e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0294  ATP-dependent DNA ligase  33.68 
 
 		 845 aa  132  9e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>