203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2031 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2031  hypothetical protein  100 
 
 		 340 aa  687    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.232126  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1787  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  83.24 
 
 		 340 aa  593  1e-168  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000694862 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15620  DNA polymerase LigD, polymerase domain  55.4 
 
 		 353 aa  383  1e-105  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.19081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1543  DNA primase, small subunit  55.25 
 
 		 341 aa  348  6e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.881236  normal  0.307141 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1486  DNA polymerase LigD polymerase subunit  55.25 
 
 		 341 aa  347  2e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00018157 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1571  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  51.94 
 
 		 330 aa  337  1.9999999999999998e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1378  hypothetical protein  52.98 
 
 		 339 aa  336  2.9999999999999997e-91  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.200655  normal  0.549475 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5867  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  50.3 
 
 		 357 aa  333  2e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.890125  normal  0.143768 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6714  DNA primase small subunit  50.74 
 
 		 334 aa  332  5e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0437742  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0491  DNA primase small subunit  51.63 
 
 		 361 aa  329  4e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.209898  normal  0.702763 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3665  hypothetical protein  52.21 
 
 		 360 aa  325  8.000000000000001e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2258  DNA polymerase LigD polymerase domain-containing subunit  51.08 
 
 		 332 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.20495 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1675  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  50 
 
 		 371 aa  320  1.9999999999999998e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4038  DNA primase small subunit  49.72 
 
 		 364 aa  319  3.9999999999999996e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4915  hypothetical protein  49.41 
 
 		 347 aa  318  6e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0135401  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5004  hypothetical protein  49.41 
 
 		 347 aa  318  6e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.761919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5542  hypothetical protein  50.3 
 
 		 349 aa  318  6e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5283  DNA primase, small subunit  49.41 
 
 		 347 aa  318  6e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1945  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  46.44 
 
 		 355 aa  318  7e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000971032  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13762  hypothetical protein  50.15 
 
 		 346 aa  318  1e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.798941 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0652  DNA primase small subunit  51.54 
 
 		 341 aa  317  2e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.515323  normal  0.0515309 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0584  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  48.67 
 
 		 354 aa  316  3e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0275907  hitchhiker  0.000216971 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1274  DNA primase, small subunit  49.11 
 
 		 349 aa  312  5.999999999999999e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.558044  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0416  DNA primase small subunit  49.09 
 
 		 360 aa  311  7.999999999999999e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0821  DNA primase small subunit  49.29 
 
 		 360 aa  310  2e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3833  DNA primase small subunit  46.55 
 
 		 380 aa  298  1e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2830  DNA primase small subunit  44.01 
 
 		 427 aa  272  7e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6628  DNA primase small subunit  44.64 
 
 		 358 aa  266  4e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0103402  hitchhiker  0.0000202322 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5821  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  43.28 
 
 		 352 aa  263  4e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.305654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2095  DNA primase, small subunit  44.03 
 
 		 360 aa  259  6e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.59622  normal  0.161983 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3272  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  45.83 
 
 		 328 aa  255  6e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.161629  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2445  putative DNA ligase (ATP), C-terminal  47.18 
 
 		 326 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.858354  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0664  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  46.78 
 
 		 334 aa  252  6e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.286197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3426  hypothetical protein  45.77 
 
 		 414 aa  250  2e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.467651  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0342  DNA primase, small subunit  44.86 
 
 		 412 aa  248  2e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.938834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4154  DNA primase small subunit  43.32 
 
 		 408 aa  247  2e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.348836  normal  0.978255 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2236  DNA primase small subunit  42.3 
 
 		 323 aa  247  2e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.848931  normal  0.182306 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3206  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  44.72 
 
 		 414 aa  246  4.9999999999999997e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0584  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  44.37 
 
 		 329 aa  244  9.999999999999999e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2946  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  45.05 
 
 		 314 aa  243  3.9999999999999997e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10273  hypothetical protein  43.6 
 
 		 397 aa  239  6.999999999999999e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0854972 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0396  hypothetical protein  43.01 
 
 		 412 aa  236  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00684947  normal  0.451981 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0360  hypothetical protein  39.94 
 
 		 434 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0482134  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0370  hypothetical protein  39.94 
 
 		 434 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0349  DNA primase, small subunit  39.94 
 
 		 434 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1124  hypothetical protein  33.1 
 
 		 303 aa  181  2e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2082  hypothetical protein  34.95 
 
 		 306 aa  177  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0598  hypothetical protein  37.24 
 
 		 314 aa  176  4e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.479165  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0832  DNA ligase D  37.82 
 
 		 656 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1876  ATP-dependent DNA ligase  36.64 
 
 		 914 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.907588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2631  DNA ligase D  36.27 
 
 		 865 aa  171  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2135  DNA ligase D  31.18 
 
 		 815 aa  168  1e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4315  DNA ligase D  35.61 
 
 		 834 aa  165  8e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03410  DNA polymerase LigD polymerase domain protein  29.39 
 
 		 313 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1150  ATP dependent DNA ligase  36.5 
 
 		 845 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0981  DNA ligase D  35.64 
 
 		 954 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0998  DNA ligase D  30.53 
 
 		 861 aa  160  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4171  ATP-dependent DNA ligase  36.19 
 
 		 914 aa  159  9e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.497319  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1670  DNA primase-like  33.94 
 
 		 527 aa  158  1e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.447053  hitchhiker  0.00316977 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0382  DNA ligase D  35.17 
 
 		 644 aa  157  3e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6783  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  36.46 
 
 		 292 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.838138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3685  ATP-dependent DNA ligase  35.27 
 
 		 911 aa  156  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.865038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2067  hypothetical protein  31.83 
 
 		 312 aa  155  9e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0552463 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0448  ATP-dependent DNA ligase  34.81 
 
 		 866 aa  154  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6329  ATP-dependent DNA ligase  35.32 
 
 		 895 aa  154  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0632091 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2328  putative ATP-dependent DNA ligase  32.24 
 
 		 1001 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0455665  normal  0.455767 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6073  DNA ligase D  36.69 
 
 		 927 aa  153  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0510863 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3907  ATP-dependent DNA ligase  33.7 
 
 		 900 aa  153  5e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.989644  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1951  DNA ligase D  33.46 
 
 		 822 aa  152  7e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00524792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1346  ATP dependent DNA ligase  36.33 
 
 		 936 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.893044  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6483  ATP dependent DNA ligase  36.33 
 
 		 936 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0603382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1986  DNA primase, small subunit  29.25 
 
 		 303 aa  151  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.328453  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1858  DNA ligase D  32.65 
 
 		 940 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.170046  normal  0.216644 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2837  ATP-dependent DNA ligase  31.11 
 
 		 896 aa  150  2e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5608  DNA primase, small subunit  38.49 
 
 		 319 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.613871  normal  0.440344 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5638  ATP-dependent DNA ligase  36.43 
 
 		 882 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3248  DNA polymerase LigD polymerase subunit  32.97 
 
 		 328 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1702  DNA ligase D  30.74 
 
 		 877 aa  150  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170827  hitchhiker  0.00786599 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2239  DNA ligase D  35.16 
 
 		 856 aa  150  3e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.839838 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5228  hypothetical protein  37.63 
 
 		 310 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5316  hypothetical protein  37.63 
 
 		 310 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5610  ATP dependent DNA ligase  35.25 
 
 		 932 aa  149  5e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.706105 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0011  ATP-dependent DNA ligase  31.6 
 
 		 864 aa  149  5e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0339968 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0258  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  35.87 
 
 		 292 aa  149  5e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.863775  normal  0.0831069 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0568  DNA ligase D  30.11 
 
 		 818 aa  149  6e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000109107  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5875  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  35.14 
 
 		 297 aa  149  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1218  ATP dependent DNA ligase  37.64 
 
 		 846 aa  149  8e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.257773 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0488  DNA ligase D  34.89 
 
 		 867 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.160576  normal  0.373477 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6340  DNA ligase D  35.25 
 
 		 949 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.15116 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1337  ATP dependent DNA ligase  34.92 
 
 		 868 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.402102 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1335  ATP-dependent DNA ligase  34.41 
 
 		 980 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5705  ATP-dependent DNA ligase  34.64 
 
 		 883 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2519  ATP-dependent DNA ligase  33.33 
 
 		 939 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2802  DNA polymerase LigD, polymerase domain-containing protein  34.01 
 
 		 302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0918963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8275  ATP-dependent DNA ligase  33.33 
 
 		 383 aa  147  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0118926  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2523  ATP-dependent DNA ligase  32.65 
 
 		 837 aa  147  3e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000543878 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5282  DNA ligase D  32.96 
 
 		 658 aa  147  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.889453 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0832  DNA ligase D  34.18 
 
 		 684 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0139  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  27.3 
 
 		 306 aa  146  5e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8017  ATP-dependent DNA ligase  33.33 
 
 		 893 aa  146  5e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>