202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_0349 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0360  hypothetical protein  99.54 
 
 		 434 aa  872    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0482134  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0370  hypothetical protein  99.54 
 
 		 434 aa  872    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0396  hypothetical protein  78.24 
 
 		 412 aa  642    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00684947  normal  0.451981 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0349  DNA primase, small subunit  100 
 
 		 434 aa  878    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0342  DNA primase, small subunit  77.75 
 
 		 412 aa  640    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.938834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10273  hypothetical protein  73.45 
 
 		 397 aa  594  1e-169  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0854972 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3426  hypothetical protein  65.24 
 
 		 414 aa  537  1e-151  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.467651  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4154  DNA primase small subunit  66.75 
 
 		 408 aa  535  1e-151  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.348836  normal  0.978255 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3206  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  64.76 
 
 		 414 aa  527  1e-148  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2830  DNA primase small subunit  57.49 
 
 		 427 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6628  DNA primase small subunit  57.05 
 
 		 358 aa  342  7e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0103402  hitchhiker  0.0000202322 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3833  DNA primase small subunit  53.85 
 
 		 380 aa  338  9.999999999999999e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1378  hypothetical protein  48.68 
 
 		 339 aa  295  1e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.200655  normal  0.549475 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6714  DNA primase small subunit  48.18 
 
 		 334 aa  283  4.0000000000000003e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0437742  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2258  DNA polymerase LigD polymerase domain-containing subunit  47.14 
 
 		 332 aa  279  7e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.20495 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1571  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  49.83 
 
 		 330 aa  275  1.0000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1543  DNA primase, small subunit  46.77 
 
 		 341 aa  269  5.9999999999999995e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.881236  normal  0.307141 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0584  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  46.01 
 
 		 329 aa  263  6.999999999999999e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2095  DNA primase, small subunit  44.37 
 
 		 360 aa  262  6.999999999999999e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.59622  normal  0.161983 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3272  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  45.31 
 
 		 328 aa  261  1e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.161629  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0664  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  45.34 
 
 		 334 aa  262  1e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.286197  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0491  DNA primase small subunit  44.79 
 
 		 361 aa  261  2e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.209898  normal  0.702763 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1675  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  46.32 
 
 		 371 aa  260  3e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1486  DNA polymerase LigD polymerase subunit  45.81 
 
 		 341 aa  260  3e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00018157 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0584  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  44.94 
 
 		 354 aa  259  9e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0275907  hitchhiker  0.000216971 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3665  hypothetical protein  46.3 
 
 		 360 aa  259  9e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2236  DNA primase small subunit  44.34 
 
 		 323 aa  258  1e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.848931  normal  0.182306 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13762  hypothetical protein  46.82 
 
 		 346 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.798941 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5867  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  43.81 
 
 		 357 aa  253  5.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.890125  normal  0.143768 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2946  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  43.99 
 
 		 314 aa  253  6e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1274  DNA primase, small subunit  45.64 
 
 		 349 aa  253  6e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.558044  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1945  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  41.74 
 
 		 355 aa  252  9.000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000971032  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2445  putative DNA ligase (ATP), C-terminal  43.81 
 
 		 326 aa  251  2e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.858354  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4915  hypothetical protein  45.18 
 
 		 347 aa  249  7e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0135401  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5004  hypothetical protein  45.18 
 
 		 347 aa  249  7e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.761919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5283  DNA primase, small subunit  45.48 
 
 		 347 aa  249  7e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5542  hypothetical protein  45.67 
 
 		 349 aa  249  8e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0821  DNA primase small subunit  41.67 
 
 		 360 aa  243  7e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0652  DNA primase small subunit  45.78 
 
 		 341 aa  238  1e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.515323  normal  0.0515309 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5821  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  43.81 
 
 		 352 aa  236  7e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.305654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1787  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  42.86 
 
 		 340 aa  233  7.000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000694862 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2031  hypothetical protein  39.94 
 
 		 340 aa  228  2e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.232126  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0416  DNA primase small subunit  40.38 
 
 		 360 aa  227  3e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15620  DNA polymerase LigD, polymerase domain  40.76 
 
 		 353 aa  225  1e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.19081  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4038  DNA primase small subunit  40.72 
 
 		 364 aa  220  5e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1124  hypothetical protein  32.26 
 
 		 303 aa  179  1e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2082  hypothetical protein  35.06 
 
 		 306 aa  178  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0598  hypothetical protein  33.78 
 
 		 314 aa  175  9.999999999999999e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.479165  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2067  hypothetical protein  34.12 
 
 		 312 aa  172  7.999999999999999e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0552463 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0109  DNA ligase D  35.03 
 
 		 872 aa  164  3e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0363186 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0998  DNA ligase D  33.21 
 
 		 861 aa  163  7e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0128  DNA ligase D  33.56 
 
 		 871 aa  160  4e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2837  ATP-dependent DNA ligase  31.63 
 
 		 896 aa  160  5e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3303  ATP dependent DNA ligase  32.04 
 
 		 855 aa  158  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300283  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0939  DNA ligase D  35.08 
 
 		 847 aa  157  4e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4351  DNA polymerase LigD polymerase subunit  35.62 
 
 		 303 aa  156  8e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2856  DNA primase-like  33.69 
 
 		 455 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.101034  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1670  DNA primase-like  32.98 
 
 		 527 aa  153  5e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.447053  hitchhiker  0.00316977 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1702  DNA ligase D  33.57 
 
 		 877 aa  152  8e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170827  hitchhiker  0.00786599 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3085  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  31.05 
 
 		 299 aa  151  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.884253 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0817  DNA ligase D, 3'-phosphoesterase domain protein  34.26 
 
 		 522 aa  151  3e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.138014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6404  DNA ligase D  32.16 
 
 		 646 aa  149  7e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0822092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7781  putative DNA ligase-like protein  32.92 
 
 		 317 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0711104  normal  0.114107 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34930  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  35.49 
 
 		 303 aa  148  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564701  normal  0.292075 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3967  DNA primase, small subunit  34.93 
 
 		 302 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.641256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5249  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  35.34 
 
 		 292 aa  147  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.398866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2863  DNA primase-like  29.88 
 
 		 352 aa  145  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.355668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03410  DNA polymerase LigD polymerase domain protein  28.37 
 
 		 313 aa  144  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2135  DNA ligase D  29.33 
 
 		 815 aa  143  5e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4716  DNA ligase D  34.17 
 
 		 815 aa  140  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.795355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0932  DNA ligase D, 3'-phosphoesterase domain protein  37.23 
 
 		 737 aa  140  6e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.819515  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0365  DNA ligase D  32.02 
 
 		 902 aa  140  6e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.215692 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0884  ATP dependent DNA ligase  35.9 
 
 		 726 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.911309  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1986  DNA primase, small subunit  28.67 
 
 		 303 aa  138  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.328453  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0935  DNA ligase D, 3'-phosphoesterase domain protein  36.86 
 
 		 789 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0727399  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2631  DNA ligase D  33.33 
 
 		 865 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4424  ATP-dependent DNA ligase  32.77 
 
 		 825 aa  137  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0379748  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1237  ATP dependent DNA ligase  34.42 
 
 		 304 aa  137  5e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4308  DNA polymerase LigD polymerase subunit  31.91 
 
 		 306 aa  134  3e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0139  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  27 
 
 		 306 aa  134  3e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0382  DNA ligase D  32.76 
 
 		 644 aa  132  7.999999999999999e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1828  ATP-dependent DNA ligase  30.69 
 
 		 766 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3248  DNA polymerase LigD polymerase subunit  32.75 
 
 		 328 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1729  DNA ligase D  29.71 
 
 		 813 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0256122  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0026  DNA ligase D  32.51 
 
 		 825 aa  130  3e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.282762  hitchhiker  0.00000000359668 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4915  ATP-dependent DNA ligase  30.71 
 
 		 763 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735483  normal  0.531274 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0520  ATP-dependent DNA ligase  32.89 
 
 		 828 aa  129  7.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0784  ATP dependent DNA ligase  34.66 
 
 		 658 aa  129  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1207  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  34.09 
 
 		 302 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.560779  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0832  DNA ligase D  34.66 
 
 		 684 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1876  ATP-dependent DNA ligase  31.27 
 
 		 914 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.907588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2802  DNA polymerase LigD, polymerase domain-containing protein  32.29 
 
 		 302 aa  128  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0918963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1020  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  35.11 
 
 		 313 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00719502  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7647  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  31.3 
 
 		 544 aa  127  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0836  DNA ligase D  34.66 
 
 		 683 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1337  ATP dependent DNA ligase  31.92 
 
 		 868 aa  127  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.402102 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0294  ATP-dependent DNA ligase  32.67 
 
 		 845 aa  126  6e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2679  ATP-dependent DNA ligase  31.54 
 
 		 868 aa  126  7e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4352  ATP-dependent DNA ligase  30.14 
 
 		 758 aa  126  7e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4438  ATP-dependent DNA ligase  30.14 
 
 		 758 aa  126  7e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0862477 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>