203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5004 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4915  hypothetical protein  100 
 
 		 347 aa  706    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0135401  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5004  hypothetical protein  100 
 
 		 347 aa  706    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.761919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5542  hypothetical protein  92.77 
 
 		 349 aa  657    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5283  DNA primase, small subunit  99.71 
 
 		 347 aa  703    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1274  DNA primase, small subunit  91.04 
 
 		 349 aa  644    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.558044  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13762  hypothetical protein  77.91 
 
 		 346 aa  546  1e-154  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.798941 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0416  DNA primase small subunit  62.5 
 
 		 360 aa  454  1.0000000000000001e-126  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0652  DNA primase small subunit  63.75 
 
 		 341 aa  418  1e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.515323  normal  0.0515309 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1378  hypothetical protein  60.66 
 
 		 339 aa  401  1e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.200655  normal  0.549475 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6714  DNA primase small subunit  60.18 
 
 		 334 aa  385  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0437742  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1571  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  58.56 
 
 		 330 aa  379  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1543  DNA primase, small subunit  57.96 
 
 		 341 aa  363  2e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.881236  normal  0.307141 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1486  DNA polymerase LigD polymerase subunit  57.96 
 
 		 341 aa  362  4e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00018157 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2258  DNA polymerase LigD polymerase domain-containing subunit  56.59 
 
 		 332 aa  362  7.0000000000000005e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.20495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5867  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  54.62 
 
 		 357 aa  361  8e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.890125  normal  0.143768 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0821  DNA primase small subunit  52.22 
 
 		 360 aa  349  3e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3665  hypothetical protein  51.81 
 
 		 360 aa  344  1e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1675  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  52.86 
 
 		 371 aa  339  5e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0491  DNA primase small subunit  51.27 
 
 		 361 aa  333  2e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.209898  normal  0.702763 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3833  DNA primase small subunit  52.41 
 
 		 380 aa  332  7.000000000000001e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1945  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  51.29 
 
 		 355 aa  330  2e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000971032  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0584  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  52.02 
 
 		 354 aa  330  2e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0275907  hitchhiker  0.000216971 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2031  hypothetical protein  49.41 
 
 		 340 aa  318  6e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.232126  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1787  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  49.41 
 
 		 340 aa  313  1.9999999999999998e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000694862 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4038  DNA primase small subunit  48.85 
 
 		 364 aa  313  2.9999999999999996e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15620  DNA polymerase LigD, polymerase domain  48.16 
 
 		 353 aa  311  1e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.19081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2830  DNA primase small subunit  48.82 
 
 		 427 aa  307  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6628  DNA primase small subunit  50.45 
 
 		 358 aa  305  9.000000000000001e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0103402  hitchhiker  0.0000202322 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3272  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  53.69 
 
 		 328 aa  303  4.0000000000000003e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.161629  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2095  DNA primase, small subunit  49.53 
 
 		 360 aa  298  8e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.59622  normal  0.161983 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0584  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  51.44 
 
 		 329 aa  297  2e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2236  DNA primase small subunit  48.04 
 
 		 323 aa  293  2e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.848931  normal  0.182306 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5821  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  47.59 
 
 		 352 aa  293  3e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.305654  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0664  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  50.16 
 
 		 334 aa  285  9e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.286197  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2946  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  48.72 
 
 		 314 aa  283  4.0000000000000003e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3426  hypothetical protein  47.27 
 
 		 414 aa  282  5.000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.467651  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3206  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  48.15 
 
 		 414 aa  277  2e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2445  putative DNA ligase (ATP), C-terminal  49.68 
 
 		 326 aa  276  3e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.858354  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0396  hypothetical protein  46.69 
 
 		 412 aa  270  4e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00684947  normal  0.451981 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0342  DNA primase, small subunit  46.33 
 
 		 412 aa  265  1e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.938834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10273  hypothetical protein  46.38 
 
 		 397 aa  260  2e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0854972 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4154  DNA primase small subunit  46.56 
 
 		 408 aa  258  9e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.348836  normal  0.978255 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0349  DNA primase, small subunit  45.18 
 
 		 434 aa  249  5e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0360  hypothetical protein  45.48 
 
 		 434 aa  249  6e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0482134  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0370  hypothetical protein  45.48 
 
 		 434 aa  249  6e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0998  DNA ligase D  33.89 
 
 		 861 aa  182  9.000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1124  hypothetical protein  34.46 
 
 		 303 aa  180  2.9999999999999997e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0598  hypothetical protein  38.14 
 
 		 314 aa  180  2.9999999999999997e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.479165  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2082  hypothetical protein  36.64 
 
 		 306 aa  177  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2067  hypothetical protein  35.92 
 
 		 312 aa  171  3e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0552463 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2837  ATP-dependent DNA ligase  31.15 
 
 		 896 aa  169  5e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1986  DNA primase, small subunit  32.67 
 
 		 303 aa  168  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.328453  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0939  DNA ligase D  38.87 
 
 		 847 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03410  DNA polymerase LigD polymerase domain protein  32.87 
 
 		 313 aa  166  8e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0011  ATP-dependent DNA ligase  35.05 
 
 		 864 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0339968 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2631  DNA ligase D  35.69 
 
 		 865 aa  162  6e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3303  ATP dependent DNA ligase  34.3 
 
 		 855 aa  160  4e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300283  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1218  ATP dependent DNA ligase  37.01 
 
 		 846 aa  159  8e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.257773 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3248  DNA polymerase LigD polymerase subunit  32.52 
 
 		 328 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4308  DNA polymerase LigD polymerase subunit  33.46 
 
 		 306 aa  156  4e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4716  DNA ligase D  34.92 
 
 		 815 aa  154  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.795355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0365  DNA ligase D  32.25 
 
 		 902 aa  154  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.215692 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3085  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  30.93 
 
 		 299 aa  154  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.884253 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7781  putative DNA ligase-like protein  33.33 
 
 		 317 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0711104  normal  0.114107 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2802  DNA polymerase LigD, polymerase domain-containing protein  36.69 
 
 		 302 aa  153  4e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0918963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4424  ATP-dependent DNA ligase  34.25 
 
 		 825 aa  152  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0379748  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1337  ATP dependent DNA ligase  34.95 
 
 		 868 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.402102 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34930  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  34.34 
 
 		 303 aa  150  3e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564701  normal  0.292075 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6404  DNA ligase D  31.3 
 
 		 646 aa  149  5e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0822092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5249  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  34.81 
 
 		 292 aa  149  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.398866  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0201  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  33.21 
 
 		 778 aa  149  9e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.173659  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1729  DNA ligase D  33.44 
 
 		 813 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0256122  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0139  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  29.18 
 
 		 306 aa  147  3e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2679  ATP-dependent DNA ligase  34.26 
 
 		 868 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5875  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  34.84 
 
 		 297 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1301  hypothetical protein  33.69 
 
 		 301 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2328  putative ATP-dependent DNA ligase  35.02 
 
 		 1001 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0455665  normal  0.455767 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0981  DNA ligase D  34.59 
 
 		 954 aa  145  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0832  DNA ligase D  36.33 
 
 		 656 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1858  DNA ligase D  33.33 
 
 		 940 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.170046  normal  0.216644 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1020  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  35.47 
 
 		 313 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00719502  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4532  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  32.95 
 
 		 797 aa  143  4e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.684574  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3330  DNA ligase D  34.41 
 
 		 896 aa  143  4e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.580871  normal  0.138663 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2519  ATP-dependent DNA ligase  34.05 
 
 		 939 aa  143  5e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0962  hypothetical protein  35.47 
 
 		 313 aa  142  7e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.612546  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1769  ATP-dependent DNA ligase  33.88 
 
 		 918 aa  142  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.242945 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5705  ATP-dependent DNA ligase  32.99 
 
 		 883 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1670  DNA primase-like  31.29 
 
 		 527 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.447053  hitchhiker  0.00316977 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6783  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  34.52 
 
 		 292 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.838138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1207  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  35.34 
 
 		 302 aa  140  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.560779  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0258  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  37.23 
 
 		 292 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.863775  normal  0.0831069 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5638  ATP-dependent DNA ligase  32.89 
 
 		 882 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3490  ATP-dependent DNA ligase  32.57 
 
 		 930 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.505494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0568  DNA ligase D  32.67 
 
 		 818 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000109107  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1702  DNA ligase D  31.82 
 
 		 877 aa  139  6e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170827  hitchhiker  0.00786599 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5341  ATP-dependent DNA ligase  32.31 
 
 		 881 aa  139  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0581605 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4315  DNA ligase D  32.98 
 
 		 834 aa  139  6e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8275  ATP-dependent DNA ligase  33.55 
 
 		 383 aa  139  7e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0118926  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1023  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  35.09 
 
 		 313 aa  139  7e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1736  ATP-dependent DNA ligase  33.44 
 
 		 888 aa  138  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.946456 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>