202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0584 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_0584  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  100 
 
 		 354 aa  710    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0275907  hitchhiker  0.000216971 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1675  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  80.58 
 
 		 371 aa  543  1e-153  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1945  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  73.18 
 
 		 355 aa  504  9.999999999999999e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000971032  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0491  DNA primase small subunit  70.49 
 
 		 361 aa  484  1e-135  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.209898  normal  0.702763 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1543  DNA primase, small subunit  60.86 
 
 		 341 aa  414  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.881236  normal  0.307141 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1486  DNA polymerase LigD polymerase subunit  61.58 
 
 		 341 aa  417  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00018157 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2236  DNA primase small subunit  63.64 
 
 		 323 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.848931  normal  0.182306 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2095  DNA primase, small subunit  64.67 
 
 		 360 aa  404  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.59622  normal  0.161983 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1378  hypothetical protein  57.1 
 
 		 339 aa  389  1e-107  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.200655  normal  0.549475 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2258  DNA polymerase LigD polymerase domain-containing subunit  55.75 
 
 		 332 aa  380  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.20495 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3665  hypothetical protein  58.99 
 
 		 360 aa  381  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6714  DNA primase small subunit  54.7 
 
 		 334 aa  374  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0437742  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1571  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  57.14 
 
 		 330 aa  371  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0652  DNA primase small subunit  58.36 
 
 		 341 aa  370  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.515323  normal  0.0515309 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4038  DNA primase small subunit  56.27 
 
 		 364 aa  363  3e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0821  DNA primase small subunit  54.8 
 
 		 360 aa  357  9.999999999999999e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5867  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  52.05 
 
 		 357 aa  351  8.999999999999999e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.890125  normal  0.143768 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0416  DNA primase small subunit  53.07 
 
 		 360 aa  342  5.999999999999999e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1274  DNA primase, small subunit  52.59 
 
 		 349 aa  334  1e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.558044  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5542  hypothetical protein  52.3 
 
 		 349 aa  332  5e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3272  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  54.77 
 
 		 328 aa  331  1e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.161629  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13762  hypothetical protein  52 
 
 		 346 aa  331  1e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.798941 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5283  DNA primase, small subunit  52.02 
 
 		 347 aa  330  2e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4915  hypothetical protein  52.02 
 
 		 347 aa  330  3e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0135401  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5004  hypothetical protein  52.02 
 
 		 347 aa  330  3e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.761919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3833  DNA primase small subunit  49.86 
 
 		 380 aa  327  2.0000000000000001e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2946  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  55.1 
 
 		 314 aa  319  6e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2031  hypothetical protein  48.67 
 
 		 340 aa  316  3e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.232126  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2830  DNA primase small subunit  50 
 
 		 427 aa  315  6e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1787  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  48.52 
 
 		 340 aa  315  8e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000694862 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0584  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  52.63 
 
 		 329 aa  315  9.999999999999999e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2445  putative DNA ligase (ATP), C-terminal  50.15 
 
 		 326 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.858354  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3426  hypothetical protein  49.84 
 
 		 414 aa  293  2e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.467651  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0664  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  51.42 
 
 		 334 aa  290  2e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.286197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3206  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  47.94 
 
 		 414 aa  283  5.000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15620  DNA polymerase LigD, polymerase domain  45.61 
 
 		 353 aa  281  9e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.19081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6628  DNA primase small subunit  45.69 
 
 		 358 aa  275  7e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0103402  hitchhiker  0.0000202322 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5821  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  42.69 
 
 		 352 aa  271  9e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.305654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4154  DNA primase small subunit  44.62 
 
 		 408 aa  267  2e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.348836  normal  0.978255 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0342  DNA primase, small subunit  45.63 
 
 		 412 aa  262  6.999999999999999e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.938834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0349  DNA primase, small subunit  44.94 
 
 		 434 aa  259  7e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0360  hypothetical protein  44.94 
 
 		 434 aa  258  8e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0482134  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0370  hypothetical protein  44.94 
 
 		 434 aa  258  8e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0396  hypothetical protein  43.87 
 
 		 412 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00684947  normal  0.451981 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10273  hypothetical protein  45.08 
 
 		 397 aa  253  3e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0854972 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2067  hypothetical protein  36.81 
 
 		 312 aa  184  1.0000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0552463 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1124  hypothetical protein  32.63 
 
 		 303 aa  182  9.000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2082  hypothetical protein  35.62 
 
 		 306 aa  181  2e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03410  DNA polymerase LigD polymerase domain protein  29.29 
 
 		 313 aa  170  3e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1986  DNA primase, small subunit  30.36 
 
 		 303 aa  166  4e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.328453  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6404  DNA ligase D  31.51 
 
 		 646 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0822092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2837  ATP-dependent DNA ligase  30.51 
 
 		 896 aa  164  3e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0998  DNA ligase D  31.6 
 
 		 861 aa  163  5.0000000000000005e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0598  hypothetical protein  34.75 
 
 		 314 aa  162  7e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.479165  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3303  ATP dependent DNA ligase  30.29 
 
 		 855 aa  162  8.000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300283  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2863  DNA primase-like  30.62 
 
 		 352 aa  156  5.0000000000000005e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.355668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1207  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  34.29 
 
 		 302 aa  155  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.560779  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0201  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  32.9 
 
 		 778 aa  154  2.9999999999999998e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.173659  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0139  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  28.81 
 
 		 306 aa  153  5e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4308  DNA polymerase LigD polymerase subunit  32.45 
 
 		 306 aa  152  7e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0366  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  28.47 
 
 		 304 aa  151  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00411082  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0962  hypothetical protein  35.55 
 
 		 313 aa  150  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.612546  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4716  DNA ligase D  33.56 
 
 		 815 aa  149  6e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.795355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1023  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  35.88 
 
 		 313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5249  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  35.25 
 
 		 292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.398866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34930  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  32.36 
 
 		 303 aa  147  3e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564701  normal  0.292075 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3085  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  28.77 
 
 		 299 aa  147  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.884253 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0981  DNA ligase D  34.15 
 
 		 954 aa  147  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0128  DNA ligase D  31.99 
 
 		 871 aa  147  3e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1020  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  35.55 
 
 		 313 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00719502  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1729  DNA ligase D  34.83 
 
 		 813 aa  146  5e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0256122  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1828  ATP-dependent DNA ligase  33.33 
 
 		 766 aa  145  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0365  DNA ligase D  28.23 
 
 		 902 aa  144  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.215692 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0939  DNA ligase D  33.21 
 
 		 847 aa  142  6e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1237  ATP dependent DNA ligase  34.91 
 
 		 304 aa  142  7e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3967  DNA primase, small subunit  34.19 
 
 		 302 aa  142  7e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.641256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4351  DNA polymerase LigD polymerase subunit  33.55 
 
 		 303 aa  142  7e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1670  DNA primase-like  31.89 
 
 		 527 aa  142  8e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.447053  hitchhiker  0.00316977 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19790  ATP-dependent DNA ligase  34.17 
 
 		 878 aa  142  9e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.874876  normal  0.0111766 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3982  DNA ligase D  33.08 
 
 		 837 aa  141  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.242041 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4915  ATP-dependent DNA ligase  32.65 
 
 		 763 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735483  normal  0.531274 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0109  DNA ligase D  31.51 
 
 		 872 aa  140  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0363186 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1218  ATP dependent DNA ligase  32.46 
 
 		 846 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.257773 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3248  DNA polymerase LigD polymerase subunit  32.99 
 
 		 328 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0011  ATP-dependent DNA ligase  32.56 
 
 		 864 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0339968 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4532  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  31.65 
 
 		 797 aa  138  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.684574  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4352  ATP-dependent DNA ligase  31.99 
 
 		 758 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4438  ATP-dependent DNA ligase  31.99 
 
 		 758 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0862477 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1007  DNA polymerase LigD polymerase subunit  32.78 
 
 		 305 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.104732  hitchhiker  0.00609843 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4732  ATP-dependent DNA ligase  31.99 
 
 		 758 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.333349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7647  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  32.45 
 
 		 544 aa  137  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07110  ATP-dependent DNA ligase  32.2 
 
 		 847 aa  137  4e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0832  DNA ligase D  32.97 
 
 		 656 aa  136  4e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1301  hypothetical protein  31.32 
 
 		 301 aa  136  5e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2631  DNA ligase D  30.72 
 
 		 865 aa  136  5e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2802  DNA polymerase LigD, polymerase domain-containing protein  32.35 
 
 		 302 aa  136  6.0000000000000005e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0918963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1337  ATP dependent DNA ligase  31.92 
 
 		 868 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.402102 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1584  DNA polymerase LigD polymerase subunit  36.63 
 
 		 309 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0991666  normal  0.0697444 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0568  DNA ligase D  31.46 
 
 		 818 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000109107  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2815  DNA polymerase LigD, polymerase domain-containing protein  33.33 
 
 		 305 aa  133  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>