More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0770 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  54.39 
 
 		 971 aa  650    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0770  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 894 aa  1788    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2316  translation initiation factor IF-2  62.75 
 
 		 1116 aa  954    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.100815  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0457  translation initiation factor IF-2  42.72 
 
 		 1161 aa  641    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  52.24 
 
 		 884 aa  632  1e-180  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  54.77 
 
 		 692 aa  632  1e-180  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  52.76 
 
 		 883 aa  632  1e-179  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  43.71 
 
 		 985 aa  630  1e-179  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  51.79 
 
 		 986 aa  626  1e-178  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  51.79 
 
 		 980 aa  627  1e-178  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  51.98 
 
 		 882 aa  625  1e-177  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  53.18 
 
 		 921 aa  619  1e-176  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  54.28 
 
 		 739 aa  618  1e-175  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  43.19 
 
 		 903 aa  617  1e-175  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  47.31 
 
 		 1029 aa  615  9.999999999999999e-175  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  40.06 
 
 		 882 aa  612  9.999999999999999e-175  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  52.87 
 
 		 732 aa  611  1e-173  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1669  translation initiation factor IF-2  51.36 
 
 		 949 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1051  translation initiation factor IF-2  40.11 
 
 		 845 aa  602  1.0000000000000001e-171  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1435  translation initiation factor IF-2  39.4 
 
 		 860 aa  596  1e-169  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0755934  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0814  translation initiation factor IF-2  39.44 
 
 		 882 aa  597  1e-169  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0318288 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2774  translation initiation factor IF-2  52.14 
 
 		 1131 aa  595  1e-168  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0650084  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  51.46 
 
 		 947 aa  593  1e-168  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  43.79 
 
 		 822 aa  591  1e-167  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1940  translation initiation factor IF-2  51.13 
 
 		 679 aa  591  1e-167  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.995818  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1658  translation initiation factor IF-2  51.13 
 
 		 679 aa  591  1e-167  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  45.98 
 
 		 888 aa  586  1e-166  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0747  translation initiation factor IF-2  47.15 
 
 		 964 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152188  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0830  translation initiation factor IF-2  50.26 
 
 		 879 aa  583  1.0000000000000001e-165  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.122611  unclonable  0.0000000598475 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07840  translation initiation factor IF-2  51.2 
 
 		 686 aa  583  1.0000000000000001e-165  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  51.84 
 
 		 720 aa  581  1e-164  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0991  translation initiation factor 2  52.92 
 
 		 1035 aa  580  1e-164  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0315386  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1779  translation initiation factor IF-2  48.2 
 
 		 915 aa  582  1e-164  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0123912  normal  0.0703365 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1309  translation initiation factor IF-2  50.6 
 
 		 924 aa  582  1e-164  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0121044  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1810  translation initiation factor IF-2  49.48 
 
 		 920 aa  580  1e-164  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0893364  normal  0.24179 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl295  translation initiation factor IF-2  49.51 
 
 		 629 aa  577  1.0000000000000001e-163  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000364465  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0699  translation initiation factor IF-2  50.09 
 
 		 752 aa  578  1.0000000000000001e-163  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000680705  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0609  translation initiation factor IF-2  49.13 
 
 		 711 aa  576  1.0000000000000001e-163  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000891187  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1333  translation initiation factor IF-2  51.65 
 
 		 688 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0112644  hitchhiker  0.000569775 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0367  translation initiation factor IF-2  49.74 
 
 		 936 aa  576  1.0000000000000001e-163  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000368497  normal  0.59996 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1355  translation initiation factor IF-2  50.51 
 
 		 705 aa  573  1.0000000000000001e-162  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.657841  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2165  translation initiation factor IF-2  48.71 
 
 		 959 aa  575  1.0000000000000001e-162  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.34369  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1329  translation initiation factor IF-2  50.51 
 
 		 705 aa  573  1.0000000000000001e-162  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2077  translation initiation factor IF-2  48.71 
 
 		 990 aa  573  1.0000000000000001e-162  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146331  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  50.61 
 
 		 689 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0169  translation initiation factor IF-2  43.36 
 
 		 926 aa  571  1e-161  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0300  translation initiation factor IF-2  50.09 
 
 		 952 aa  570  1e-161  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0137727  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  50.96 
 
 		 686 aa  569  1e-160  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3635  translation initiation factor IF-2  50.78 
 
 		 688 aa  568  1e-160  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0196676  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  50.96 
 
 		 686 aa  568  1e-160  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  50.96 
 
 		 686 aa  567  1e-160  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  51.13 
 
 		 686 aa  568  1e-160  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  51.13 
 
 		 686 aa  568  1e-160  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  50.96 
 
 		 686 aa  567  1e-160  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  51.13 
 
 		 686 aa  568  1e-160  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3930  translation initiation factor IF-2  48.11 
 
 		 856 aa  566  1e-160  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0369  translation initiation factor IF-2  47.3 
 
 		 991 aa  565  1e-160  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0109319  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0059  translation initiation factor IF-2  48.69 
 
 		 997 aa  565  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1106  translation initiation factor IF-2  51.21 
 
 		 896 aa  563  1.0000000000000001e-159  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0381  translation initiation factor IF-2  37.98 
 
 		 927 aa  565  1.0000000000000001e-159  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3441  translation initiation factor IF-2  48.71 
 
 		 885 aa  565  1.0000000000000001e-159  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  49.21 
 
 		 1079 aa  564  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2513  translation initiation factor IF-2  50.61 
 
 		 1079 aa  565  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1254  translation initiation factor IF-2  48.19 
 
 		 848 aa  565  1.0000000000000001e-159  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0383  translation initiation factor IF-2  49.32 
 
 		 943 aa  565  1.0000000000000001e-159  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  47.59 
 
 		 922 aa  560  1e-158  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0398  translation initiation factor IF-2  49.12 
 
 		 986 aa  560  1e-158  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0010836  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1462  translation initiation factor IF-2  49.21 
 
 		 1022 aa  559  1e-158  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.887341  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  48.19 
 
 		 907 aa  562  1e-158  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1228  translation initiation factor IF-2  46.07 
 
 		 962 aa  560  1e-158  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00145036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3628  translation initiation factor IF-2  47.01 
 
 		 887 aa  559  1e-157  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206324 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0440  translation initiation factor IF-2  47.61 
 
 		 883 aa  557  1e-157  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0402  translation initiation factor IF-2  49.21 
 
 		 911 aa  559  1e-157  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000176778  normal  0.341297 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0570  translation initiation factor IF-2  50.08 
 
 		 928 aa  558  1e-157  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2414  translation initiation factor IF-2  50.52 
 
 		 940 aa  558  1e-157  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1034  translation initiation factor IF-2  49.31 
 
 		 774 aa  557  1e-157  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  48.26 
 
 		 885 aa  555  1e-156  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1012  translation initiation factor IF-2  48.43 
 
 		 854 aa  555  1e-156  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000897592  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0225  translation initiation factor IF-2  47.51 
 
 		 887 aa  555  1e-156  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0600  translation initiation factor IF-2  46.92 
 
 		 886 aa  553  1e-156  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153879  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4387  translation initiation factor IF-2  46.83 
 
 		 917 aa  553  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.582492 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3221  translation initiation factor IF-2  48.09 
 
 		 815 aa  553  1e-156  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.109257 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0057  translation initiation factor IF-2  46.85 
 
 		 921 aa  552  1e-156  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1495  translation initiation factor IF-2  49.39 
 
 		 885 aa  555  1e-156  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0130747  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0495  translation initiation factor IF-2  49.12 
 
 		 892 aa  554  1e-156  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.221081  normal  0.759489 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2594  translation initiation factor IF-2  48.03 
 
 		 848 aa  554  1e-156  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.914394 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4067  translation initiation factor IF-2  46.83 
 
 		 917 aa  555  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3853  translation initiation factor IF-2  44.5 
 
 		 1058 aa  549  1e-155  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.329833 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0293  translation initiation factor IF-2  44.98 
 
 		 1083 aa  552  1e-155  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00928073 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1261  translation initiation factor IF-2  49.03 
 
 		 945 aa  551  1e-155  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.817984  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4217  translation initiation factor 2  46.69 
 
 		 1011 aa  551  1e-155  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.726068  normal  0.0540264 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2912  translation initiation factor IF-2  46.49 
 
 		 835 aa  550  1e-155  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.922149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  48.26 
 
 		 896 aa  551  1e-155  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0817  translation initiation factor IF-2  44.03 
 
 		 950 aa  550  1e-155  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  44.27 
 
 		 949 aa  551  1e-155  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2295  translation initiation factor IF-2  47.26 
 
 		 886 aa  551  1e-155  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0792369 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3781  translation initiation factor IF-2  44.88 
 
 		 873 aa  546  1e-154  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.322768  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0638  translation initiation factor IF-2  47.29 
 
 		 885 aa  548  1e-154  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.268252  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0231  translation initiation factor IF-2  46.75 
 
 		 883 aa  549  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0340219  normal  0.876251 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0489  translation initiation factor IF-2  47.57 
 
 		 895 aa  548  1e-154  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.160314 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>