More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5742 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5742  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 398 aa  808    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1483  signal transduction histidine kinase  51.28 
 
 		 391 aa  396  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4618  signal transduction histidine kinase  40.78 
 
 		 454 aa  155  1e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.723174  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2768  signal transduction histidine kinase  41.06 
 
 		 333 aa  143  7e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000214374 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4781  signal transduction histidine kinase  37.33 
 
 		 356 aa  142  8e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.252184  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5012  putative sensory transduction histidine kinase  38.39 
 
 		 333 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235153  normal  0.174809 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1241  signal transduction histidine kinase  37.05 
 
 		 631 aa  136  5e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0246477 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3974  signal transduction histidine kinase  34.23 
 
 		 635 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0272817 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3496  bacteriophytochrome protein  32.61 
 
 		 852 aa  124  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552776  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6244  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  34.39 
 
 		 849 aa  123  5e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9007  two component sensor kinase  32.88 
 
 		 359 aa  120  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1213  signal transduction histidine kinase  37.56 
 
 		 603 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4317  sensor histidine kinase  37.07 
 
 		 499 aa  119  7e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4209  signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 		 631 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3818  signal transduction histidine kinase  39.42 
 
 		 333 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.883776  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1753  sensor histidine kinase  27.64 
 
 		 364 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.405521 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2330  putative bacteriophytochrome  33.66 
 
 		 842 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5922  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 346 aa  114  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1881  PAS sensor protein  33.18 
 
 		 872 aa  114  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5005  signal transduction histidine kinase  35.82 
 
 		 334 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6624  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3297  hypothetical protein  37.2 
 
 		 360 aa  113  5e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.747205  normal  0.456251 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5290  signal transduction histidine kinase  34.93 
 
 		 662 aa  113  5e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6211  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  31.98 
 
 		 1061 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.820077  normal  0.703655 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0288  signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 		 514 aa  112  8.000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.328365  normal  0.664954 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3623  signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 		 583 aa  112  9e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3300  PAS sensor protein  31.56 
 
 		 583 aa  112  9e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.928069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3090  signal transduction histidine kinase  30.24 
 
 		 575 aa  110  3e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0895303  normal  0.0359946 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5905  signal transduction histidine kinase  34.93 
 
 		 601 aa  110  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.584764  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0094  signal transduction histidine kinase  36.06 
 
 		 929 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6531  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 344 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14349  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2586  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  31.75 
 
 		 847 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251983 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1395  signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 		 304 aa  109  7.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.695001  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0905  putative PAS/PAC sensor protein  30.46 
 
 		 1170 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.968727 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4458  putative GAF sensor protein  32.76 
 
 		 844 aa  109  8.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5776  putative PAS/PAC sensor protein  33.66 
 
 		 1160 aa  109  8.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.491611  normal  0.0137055 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2394  putative GAF sensor protein  31.28 
 
 		 847 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.25898  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3364  response regulator  31.28 
 
 		 847 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.427552 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4430  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  34.33 
 
 		 1158 aa  109  9.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0471  signal transduction histidine kinase  34.76 
 
 		 349 aa  108  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3802  signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 		 574 aa  108  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.560077  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5539  signal transduction histidine kinase  35.68 
 
 		 677 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3500  signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 		 583 aa  109  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.319784  normal  0.0807687 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2574  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  33.33 
 
 		 844 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.969915 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2229  methylesterase CheB/methylase CheR  29.95 
 
 		 1170 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.840236  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6181  signal transduction histidine kinase  36.71 
 
 		 1191 aa  108  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.299797 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1182  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  36.41 
 
 		 846 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.75997  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5729  signal transduction histidine kinase  32.82 
 
 		 352 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4826  signal transduction histidine kinase  32 
 
 		 553 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.788722  normal  0.27838 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4495  signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 		 571 aa  107  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3978  signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 		 577 aa  107  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3897  PAS sensor protein  32.37 
 
 		 930 aa  107  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.240133 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1333  signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 		 346 aa  106  9e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0112868 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0707  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  30.13 
 
 		 1190 aa  106  9e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0801  signal transduction histidine kinase  29.64 
 
 		 488 aa  105  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185769  normal  0.110715 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0079  signal transduction histidine kinase  31.66 
 
 		 639 aa  105  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.464916 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6901  signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 		 465 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9083  bacteriophytochrome protein  33.17 
 
 		 856 aa  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0218  signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 		 867 aa  105  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269004 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5560  signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 		 341 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256684  normal  0.0162393 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0875  PAS sensor protein  31.58 
 
 		 488 aa  105  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.111744 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5593  two component sensor kinase  27.95 
 
 		 352 aa  105  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4265  signal transduction histidine kinase  31.95 
 
 		 930 aa  104  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.588648  normal  0.462436 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0835  signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 488 aa  105  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5756  signal transduction histidine kinase  29.87 
 
 		 347 aa  105  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.170851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0574  signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 		 435 aa  104  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1700  signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 		 339 aa  104  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.193151  normal  0.0718068 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0982  hypothetical protein  45.05 
 
 		 143 aa  104  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3755  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  27.27 
 
 		 1063 aa  104  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2070  signal transduction histidine kinase  33.93 
 
 		 358 aa  103  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.315094  normal  0.359428 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1677  signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 		 840 aa  103  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4278  putative PAS/PAC sensor protein  31.4 
 
 		 1027 aa  103  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3933  signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 		 579 aa  103  6e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.939914  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2814  putative sensor histidine kinase  32.17 
 
 		 505 aa  103  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5270  signal transduction histidine kinase  32.55 
 
 		 559 aa  103  6e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.909185 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0827  signal transduction histidine kinase  32.27 
 
 		 512 aa  103  8e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4368  signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 934 aa  103  8e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523014 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0167  signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 		 336 aa  102  9e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0950  Signal transduction histidine kinase protein  32.58 
 
 		 334 aa  102  9e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29493  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0358  signal transduction histidine kinase  36.41 
 
 		 602 aa  102  9e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3344  signal transduction histidine kinase  31.53 
 
 		 336 aa  102  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4536  signal transduction histidine kinase  34.93 
 
 		 430 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4215  signal transduction histidine kinase  33.02 
 
 		 582 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0433147 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0678  two-component sensor histidine kinase  31.86 
 
 		 460 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.320332 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5584  signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 		 586 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1350  signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 		 1016 aa  102  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.597121 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1190  PAS sensor protein  32.68 
 
 		 1041 aa  101  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314947 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01099  bacteriophytochrome protein  31.63 
 
 		 822 aa  102  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.506628  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0741  Signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 498 aa  101  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5262  signal transduction histidine kinase  33.92 
 
 		 338 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2090  signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 		 372 aa  101  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.893944 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0620  signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 725 aa  100  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4932  signal transduction histidine kinase  31.39 
 
 		 907 aa  100  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.752686 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0965  signal transduction histidine kinase  32.69 
 
 		 850 aa  100  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1888  PAS sensor protein  30.05 
 
 		 326 aa  100  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1069  signal transduction histidine kinase  28.84 
 
 		 387 aa  100  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.591232 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2344  signal transduction histidine kinase  31.08 
 
 		 500 aa  100  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00211814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2264  putative PAS/PAC sensor protein  28.43 
 
 		 1165 aa  100  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.620072  normal  0.0600346 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3034  putative PAS/PAC sensor protein  30.63 
 
 		 856 aa  100  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0858916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0172  signal transduction histidine kinase  32.24 
 
 		 897 aa  100  6e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5369  hypothetical protein  30.66 
 
 		 271 aa  99.8  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00338778 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>