More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1483 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1483  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 391 aa  796    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5742  signal transduction histidine kinase  51.28 
 
 		 398 aa  396  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4618  signal transduction histidine kinase  42.93 
 
 		 454 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.723174  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5012  putative sensory transduction histidine kinase  39.9 
 
 		 333 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235153  normal  0.174809 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2768  signal transduction histidine kinase  37.34 
 
 		 333 aa  144  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000214374 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4781  signal transduction histidine kinase  34.5 
 
 		 356 aa  135  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.252184  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4608  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.04 
 
 		 1645 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.284957  normal  0.407853 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0707  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  34.78 
 
 		 1190 aa  128  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0965  signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 		 850 aa  125  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0950  Signal transduction histidine kinase protein  35.12 
 
 		 334 aa  125  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29493  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3331  signal transduction histidine kinase  31.34 
 
 		 503 aa  124  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0801  signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 		 488 aa  124  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185769  normal  0.110715 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5539  signal transduction histidine kinase  35.16 
 
 		 677 aa  124  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2344  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 500 aa  123  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00211814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1241  signal transduction histidine kinase  35.84 
 
 		 631 aa  123  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0246477 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4317  sensor histidine kinase  35.82 
 
 		 499 aa  123  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3974  signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 		 635 aa  122  8e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0272817 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0835  signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 		 488 aa  122  9e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0875  PAS sensor protein  33.17 
 
 		 488 aa  122  9e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.111744 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1213  signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 		 603 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2814  putative sensor histidine kinase  34.11 
 
 		 505 aa  122  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5756  signal transduction histidine kinase  34.06 
 
 		 347 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.170851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1677  signal transduction histidine kinase  35.87 
 
 		 840 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1337  signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 		 356 aa  122  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.552854 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3496  bacteriophytochrome protein  32.5 
 
 		 852 aa  121  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552776  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2875  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.56 
 
 		 1261 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.948484 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1753  sensor histidine kinase  29.57 
 
 		 364 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.405521 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1182  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  36.63 
 
 		 846 aa  120  6e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.75997  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3818  signal transduction histidine kinase  36.51 
 
 		 333 aa  119  7.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.883776  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1881  PAS sensor protein  32.88 
 
 		 872 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3500  signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 		 583 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.319784  normal  0.0807687 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0094  signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 		 929 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9007  two component sensor kinase  30.07 
 
 		 359 aa  118  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3623  signal transduction histidine kinase  34.76 
 
 		 583 aa  117  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3300  PAS sensor protein  34.76 
 
 		 583 aa  117  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.928069  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5560  signal transduction histidine kinase  35.21 
 
 		 341 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256684  normal  0.0162393 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1984  signal transduction histidine kinase  35.41 
 
 		 713 aa  117  5e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5290  signal transduction histidine kinase  36.89 
 
 		 662 aa  117  5e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1700  signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 		 339 aa  116  6.9999999999999995e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.193151  normal  0.0718068 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1395  signal transduction histidine kinase  37.75 
 
 		 304 aa  116  7.999999999999999e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.695001  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0156  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.18 
 
 		 720 aa  116  8.999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0620  signal transduction histidine kinase  29.19 
 
 		 725 aa  115  8.999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5593  two component sensor kinase  31.28 
 
 		 352 aa  115  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4278  putative PAS/PAC sensor protein  31.71 
 
 		 1027 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5905  signal transduction histidine kinase  35.44 
 
 		 601 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.584764  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4826  signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 		 553 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.788722  normal  0.27838 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4458  putative GAF sensor protein  34.48 
 
 		 844 aa  114  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3978  signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 		 577 aa  114  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5729  signal transduction histidine kinase  32.99 
 
 		 352 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0588  sensory box protein  31.98 
 
 		 463 aa  113  5e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0554  sensory box protein  31.98 
 
 		 463 aa  113  5e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1069  signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 		 387 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.591232 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3338  hypothetical protein  32.67 
 
 		 333 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.815822  normal  0.18159 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5005  signal transduction histidine kinase  35.86 
 
 		 334 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6624  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0079  signal transduction histidine kinase  34.36 
 
 		 639 aa  112  8.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.464916 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1333  signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 		 346 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0112868 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3652  signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 		 491 aa  112  8.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2022  PAS sensor protein  35.71 
 
 		 717 aa  112  9e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0905  putative PAS/PAC sensor protein  31.9 
 
 		 1170 aa  112  9e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.968727 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4368  signal transduction histidine kinase  35.06 
 
 		 934 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523014 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4495  signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 		 571 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2299  signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 713 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.924903  normal  0.101705 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2090  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 372 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.893944 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0932  signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 		 759 aa  111  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1628  sensor histidine protein kinase  33 
 
 		 332 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.560713  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0487  signal transduction histidine kinase  34.36 
 
 		 555 aa  111  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5776  putative PAS/PAC sensor protein  34.87 
 
 		 1160 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.491611  normal  0.0137055 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5262  signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 		 338 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6211  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  34.76 
 
 		 1061 aa  110  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.820077  normal  0.703655 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2229  methylesterase CheB/methylase CheR  31.43 
 
 		 1170 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.840236  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3297  hypothetical protein  34.62 
 
 		 360 aa  110  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.747205  normal  0.456251 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0741  signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 356 aa  111  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3105  PAS sensor protein  32.57 
 
 		 728 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6933  signal transduction histidine kinase  34.67 
 
 		 488 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3897  PAS sensor protein  30.53 
 
 		 930 aa  110  5e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.240133 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4265  signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 		 930 aa  110  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.588648  normal  0.462436 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3834  signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 		 728 aa  110  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.284621 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5584  signal transduction histidine kinase  34.95 
 
 		 586 aa  110  5e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2030  putative sensor histidine kinase  35.29 
 
 		 313 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3126  signal transduction histidine kinase  31.53 
 
 		 352 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5235  signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 571 aa  108  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.878632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3090  signal transduction histidine kinase  29.9 
 
 		 575 aa  108  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0895303  normal  0.0359946 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0827  signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 		 512 aa  109  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6552  signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 		 489 aa  108  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2563  signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 		 409 aa  107  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6901  signal transduction histidine kinase  30.24 
 
 		 465 aa  108  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2160  signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 		 263 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.31354  normal  0.0264622 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5171  histidine kinase  28.28 
 
 		 584 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.944283 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0471  signal transduction histidine kinase  35.41 
 
 		 349 aa  108  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4109  signal transduction histidine kinase  30.62 
 
 		 384 aa  107  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0421223  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6531  signal transduction histidine kinase  31.31 
 
 		 344 aa  107  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14349  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4536  signal transduction histidine kinase  36.18 
 
 		 430 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2103  PAS sensor protein  31.62 
 
 		 655 aa  107  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365518 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2379  signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 		 655 aa  107  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4209  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 631 aa  107  5e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0180  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 380 aa  107  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.012775  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2330  putative bacteriophytochrome  28.93 
 
 		 842 aa  106  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5219  signal transduction histidine kinase  33.16 
 
 		 512 aa  106  7e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.673975 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2264  putative PAS/PAC sensor protein  30 
 
 		 1165 aa  106  8e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.620072  normal  0.0600346 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5922  signal transduction histidine kinase  31.68 
 
 		 346 aa  104  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151215  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>