More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5012 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5012  putative sensory transduction histidine kinase  100 
 
 		 333 aa  676    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235153  normal  0.174809 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2768  signal transduction histidine kinase  64.97 
 
 		 333 aa  429  1e-119  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000214374 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3818  signal transduction histidine kinase  63.55 
 
 		 333 aa  378  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.883776  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1881  PAS sensor protein  36.14 
 
 		 872 aa  165  9e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0965  signal transduction histidine kinase  32.81 
 
 		 850 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4932  signal transduction histidine kinase  31.38 
 
 		 907 aa  161  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.752686 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0371  putative signal transduction histidine kinase  35.13 
 
 		 325 aa  159  6e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0875  PAS sensor protein  35.4 
 
 		 488 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.111744 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0835  signal transduction histidine kinase  35.4 
 
 		 488 aa  152  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4317  sensor histidine kinase  35.11 
 
 		 499 aa  151  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4618  signal transduction histidine kinase  37.9 
 
 		 454 aa  150  4e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.723174  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0801  signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 		 488 aa  149  7e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185769  normal  0.110715 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1483  signal transduction histidine kinase  39.9 
 
 		 391 aa  149  8e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5290  signal transduction histidine kinase  31.38 
 
 		 662 aa  144  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1677  signal transduction histidine kinase  32.28 
 
 		 840 aa  143  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1350  signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 		 1016 aa  142  9e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.597121 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5905  signal transduction histidine kinase  30.98 
 
 		 601 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.584764  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1190  PAS sensor protein  34.55 
 
 		 1041 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314947 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5584  signal transduction histidine kinase  30.91 
 
 		 586 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3048  signal transduction histidine kinase  35.62 
 
 		 1001 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.143163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0094  signal transduction histidine kinase  37.86 
 
 		 929 aa  139  7e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0172  signal transduction histidine kinase  33.13 
 
 		 897 aa  138  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3331  signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 		 503 aa  138  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0932  signal transduction histidine kinase  31.48 
 
 		 759 aa  137  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5742  signal transduction histidine kinase  38.39 
 
 		 398 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1130  signal transduction histidine kinase  36.25 
 
 		 1002 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.039296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4495  signal transduction histidine kinase  30.98 
 
 		 571 aa  135  9e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4368  signal transduction histidine kinase  39.42 
 
 		 934 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523014 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3338  hypothetical protein  36.24 
 
 		 333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.815822  normal  0.18159 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3897  PAS sensor protein  38.39 
 
 		 930 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.240133 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4265  signal transduction histidine kinase  38.39 
 
 		 930 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.588648  normal  0.462436 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6181  signal transduction histidine kinase  38.05 
 
 		 1191 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.299797 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3300  PAS sensor protein  31.52 
 
 		 583 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.928069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3623  signal transduction histidine kinase  31.52 
 
 		 583 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0950  Signal transduction histidine kinase protein  35.75 
 
 		 334 aa  126  4.0000000000000003e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29493  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3500  signal transduction histidine kinase  31.42 
 
 		 583 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.319784  normal  0.0807687 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0288  signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 514 aa  126  5e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.328365  normal  0.664954 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1984  signal transduction histidine kinase  30.71 
 
 		 713 aa  126  6e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1213  signal transduction histidine kinase  35.23 
 
 		 603 aa  126  6e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0825  signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 		 455 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.111815  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3974  signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 		 635 aa  125  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0272817 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5560  signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 		 341 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256684  normal  0.0162393 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2563  signal transduction histidine kinase  35.75 
 
 		 409 aa  124  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0588  sensory box protein  29.57 
 
 		 463 aa  122  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2022  PAS sensor protein  31.09 
 
 		 717 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3126  signal transduction histidine kinase  33.02 
 
 		 352 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2299  signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 		 713 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.924903  normal  0.101705 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1182  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  38.38 
 
 		 846 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.75997  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6933  signal transduction histidine kinase  39.49 
 
 		 488 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6262  sensor histidine kinase  30.15 
 
 		 1202 aa  121  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0163021  normal  0.538502 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0554  sensory box protein  29.57 
 
 		 463 aa  122  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1395  signal transduction histidine kinase  39 
 
 		 304 aa  121  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.695001  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5219  signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 		 512 aa  120  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.673975 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2344  signal transduction histidine kinase  29.1 
 
 		 500 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00211814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4215  signal transduction histidine kinase  33.68 
 
 		 582 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0433147 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3652  signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 		 491 aa  119  7.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3982  hypothetical protein  36.63 
 
 		 478 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2607  signal transduction histidine kinase  28.26 
 
 		 489 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5005  signal transduction histidine kinase  31.83 
 
 		 334 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6624  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2586  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  36.54 
 
 		 847 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251983 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1241  signal transduction histidine kinase  35.86 
 
 		 631 aa  115  7.999999999999999e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0246477 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0180  signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 		 380 aa  115  8.999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.012775  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2833  signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 		 738 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4826  signal transduction histidine kinase  38.5 
 
 		 553 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.788722  normal  0.27838 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3496  bacteriophytochrome protein  36.6 
 
 		 852 aa  114  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552776  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9007  two component sensor kinase  37.04 
 
 		 359 aa  114  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0310  MCP methyltransferase, CheR-type  29.33 
 
 		 1149 aa  114  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.512157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1628  sensor histidine protein kinase  32.26 
 
 		 332 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.560713  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6244  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  37.31 
 
 		 849 aa  112  6e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5729  signal transduction histidine kinase  34.44 
 
 		 352 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1635  signal transduction histidine kinase  32.79 
 
 		 362 aa  112  8.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.466466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3416  signal transduction histidine kinase  35.47 
 
 		 413 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.813211  normal  0.0120926 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0620  signal transduction histidine kinase  32.24 
 
 		 725 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4311  signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 		 365 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.801495  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2814  putative sensor histidine kinase  36.45 
 
 		 505 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0079  signal transduction histidine kinase  28.48 
 
 		 639 aa  110  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.464916 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5776  putative PAS/PAC sensor protein  34.43 
 
 		 1160 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.491611  normal  0.0137055 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5515  hypothetical protein  29.62 
 
 		 703 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3364  response regulator  34.3 
 
 		 847 aa  109  6e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.427552 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2394  putative GAF sensor protein  34.3 
 
 		 847 aa  109  6e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.25898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6901  signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 		 465 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3802  signal transduction histidine kinase  33.95 
 
 		 574 aa  109  8.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.560077  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5922  signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 		 346 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3264  HWE histidine kinase  28.84 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00440778 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6531  signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 		 344 aa  108  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14349  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5262  signal transduction histidine kinase  27.13 
 
 		 338 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6450  signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 		 635 aa  107  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2666  signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 		 446 aa  107  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.653198  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6552  signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 		 489 aa  107  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2090  signal transduction histidine kinase  31.92 
 
 		 372 aa  107  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.893944 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1700  signal transduction histidine kinase  30.2 
 
 		 339 aa  106  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.193151  normal  0.0718068 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4430  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  27.8 
 
 		 1158 aa  106  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4278  putative PAS/PAC sensor protein  32.03 
 
 		 1027 aa  106  7e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0358  signal transduction histidine kinase  35.68 
 
 		 602 aa  105  8e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6211  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  35.11 
 
 		 1061 aa  105  9e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.820077  normal  0.703655 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1333  signal transduction histidine kinase  33.99 
 
 		 346 aa  105  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0112868 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0007  signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 		 482 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.489749  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0615  signal transduction histidine kinase  29.68 
 
 		 258 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4209  signal transduction histidine kinase  35.64 
 
 		 631 aa  104  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3313  hypothetical protein  35.35 
 
 		 480 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.29262 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>