253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0371 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0371  putative signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 325 aa  659    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2768  signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 		 333 aa  159  5e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000214374 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5012  putative sensory transduction histidine kinase  35.13 
 
 		 333 aa  159  6e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235153  normal  0.174809 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3818  signal transduction histidine kinase  35.13 
 
 		 333 aa  142  9e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.883776  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1213  signal transduction histidine kinase  28.87 
 
 		 603 aa  112  8.000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5005  signal transduction histidine kinase  37.2 
 
 		 334 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6624  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6901  signal transduction histidine kinase  32.12 
 
 		 465 aa  104  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3802  signal transduction histidine kinase  35.68 
 
 		 574 aa  99.8  6e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.560077  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4209  signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 631 aa  97.8  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1395  signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 		 304 aa  95.9  8e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.695001  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4317  sensor histidine kinase  34.15 
 
 		 499 aa  95.9  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4618  signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 		 454 aa  94.4  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.723174  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0620  signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 		 725 aa  94  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1483  signal transduction histidine kinase  32 
 
 		 391 aa  94  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0707  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  35.1 
 
 		 1190 aa  93.6  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4430  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  31.43 
 
 		 1158 aa  93.2  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6262  sensor histidine kinase  29.47 
 
 		 1202 aa  93.2  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0163021  normal  0.538502 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0875  PAS sensor protein  27.74 
 
 		 488 aa  92  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.111744 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1628  sensor histidine protein kinase  31.43 
 
 		 332 aa  92.4  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.560713  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5905  signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 		 601 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.584764  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0835  signal transduction histidine kinase  27.74 
 
 		 488 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3331  signal transduction histidine kinase  28.81 
 
 		 503 aa  89.7  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0288  signal transduction histidine kinase  27.36 
 
 		 514 aa  89  9e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.328365  normal  0.664954 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0310  MCP methyltransferase, CheR-type  28.53 
 
 		 1149 aa  89  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.512157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3500  signal transduction histidine kinase  32.56 
 
 		 583 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.319784  normal  0.0807687 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0471  signal transduction histidine kinase  32.24 
 
 		 349 aa  87.4  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4605  MCP methyltransferase, CheR-type  34.74 
 
 		 1092 aa  86.3  6e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.315944  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5219  signal transduction histidine kinase  31.27 
 
 		 512 aa  86.3  7e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.673975 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5742  signal transduction histidine kinase  30.39 
 
 		 398 aa  86.3  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3623  signal transduction histidine kinase  32.71 
 
 		 583 aa  85.9  9e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5290  signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 		 662 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3300  PAS sensor protein  32.71 
 
 		 583 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.928069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1881  PAS sensor protein  31.73 
 
 		 872 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3974  signal transduction histidine kinase  32.06 
 
 		 635 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0272817 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0965  signal transduction histidine kinase  33.73 
 
 		 850 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1677  signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 		 840 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0827  signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 		 512 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2344  signal transduction histidine kinase  27.09 
 
 		 500 aa  84.3  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00211814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0801  signal transduction histidine kinase  27.58 
 
 		 488 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185769  normal  0.110715 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3739  MCP methyltransferase, CheR-type  29.86 
 
 		 1045 aa  84  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5776  putative PAS/PAC sensor protein  34.76 
 
 		 1160 aa  83.6  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.491611  normal  0.0137055 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4495  signal transduction histidine kinase  29.76 
 
 		 571 aa  82.8  0.000000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2563  signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 		 409 aa  82.4  0.000000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0588  sensory box protein  25.88 
 
 		 463 aa  81.6  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0554  sensory box protein  25.88 
 
 		 463 aa  82  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3652  signal transduction histidine kinase  25.24 
 
 		 491 aa  82  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0094  signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 		 929 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9007  two component sensor kinase  30 
 
 		 359 aa  81.3  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5584  signal transduction histidine kinase  28.75 
 
 		 586 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4932  signal transduction histidine kinase  29.44 
 
 		 907 aa  80.5  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.752686 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5369  hypothetical protein  34.34 
 
 		 271 aa  80.1  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00338778 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6552  signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 		 489 aa  80.1  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0172  signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 		 897 aa  79.7  0.00000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0932  signal transduction histidine kinase  29.84 
 
 		 759 aa  79.7  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3338  hypothetical protein  27.75 
 
 		 333 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.815822  normal  0.18159 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4781  signal transduction histidine kinase  27.98 
 
 		 356 aa  78.6  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.252184  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9083  bacteriophytochrome protein  27.8 
 
 		 856 aa  78.2  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3034  putative PAS/PAC sensor protein  30.22 
 
 		 856 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0858916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5270  signal transduction histidine kinase  29.61 
 
 		 559 aa  77.8  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.909185 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2586  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  31.19 
 
 		 847 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251983 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5515  hypothetical protein  30.94 
 
 		 703 aa  77  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6181  signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 		 1191 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.299797 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3289  putative PAS/PAC sensor protein  31.72 
 
 		 855 aa  76.6  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.363327  normal  0.145052 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1182  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  36.26 
 
 		 846 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.75997  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5235  signal transduction histidine kinase  30.49 
 
 		 571 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.878632  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3364  response regulator  32.07 
 
 		 847 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.427552 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2394  putative GAF sensor protein  32.07 
 
 		 847 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.25898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4458  putative GAF sensor protein  31.07 
 
 		 844 aa  76.3  0.0000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2607  signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 		 489 aa  75.9  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3496  bacteriophytochrome protein  30.85 
 
 		 852 aa  74.3  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552776  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5794  signal transduction histidine kinase  25.91 
 
 		 717 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.63151  normal  0.343732 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1130  signal transduction histidine kinase  32.54 
 
 		 1002 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.039296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3264  HWE histidine kinase  28.97 
 
 		 261 aa  73.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00440778 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3048  signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 		 1001 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.143163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0915  PAS sensor protein  27.2 
 
 		 1132 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.476466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0574  signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 		 435 aa  73.2  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2574  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  32.97 
 
 		 844 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.969915 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3819  signal transduction histidine kinase  27.62 
 
 		 318 aa  73.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0180  signal transduction histidine kinase  29.61 
 
 		 380 aa  73.2  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.012775  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5262  signal transduction histidine kinase  27.98 
 
 		 338 aa  73.6  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0876  signal transduction histidine kinase  27.2 
 
 		 1132 aa  73.2  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.61927  normal  0.464028 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1350  signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 1016 aa  73.2  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.597121 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0358  signal transduction histidine kinase  31.1 
 
 		 602 aa  72.8  0.000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1337  signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 		 356 aa  73.2  0.000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.552854 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1190  PAS sensor protein  31.58 
 
 		 1041 aa  72.8  0.000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314947 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0487  signal transduction histidine kinase  31.16 
 
 		 555 aa  72.8  0.000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3626  signal transduction histidine kinase  30.4 
 
 		 792 aa  72.8  0.000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0746201  normal  0.0102319 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5589  sensor histidine kinase  29.1 
 
 		 632 aa  72.4  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0167  signal transduction histidine kinase  28.33 
 
 		 336 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6244  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  30.3 
 
 		 849 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4799  signal transduction histidine kinase  29.08 
 
 		 620 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5922  signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 		 346 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1241  signal transduction histidine kinase  31.95 
 
 		 631 aa  71.6  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0246477 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1333  signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 346 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0112868 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3835  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  30.98 
 
 		 1167 aa  71.6  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2814  putative sensor histidine kinase  35.79 
 
 		 505 aa  71.2  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3444  signal transduction histidine kinase  26.24 
 
 		 572 aa  71.2  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.753856 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3978  signal transduction histidine kinase  31.31 
 
 		 577 aa  70.1  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0851  signal transduction histidine kinase  25.84 
 
 		 1124 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.596817 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0007  signal transduction histidine kinase  30.62 
 
 		 482 aa  69.7  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.489749  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>