More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0574 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0574  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 435 aa  855    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3496  bacteriophytochrome protein  36.74 
 
 		 852 aa  114  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552776  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3364  response regulator  36.62 
 
 		 847 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.427552 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2394  putative GAF sensor protein  36.62 
 
 		 847 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.25898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4618  signal transduction histidine kinase  34.16 
 
 		 454 aa  109  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.723174  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5742  signal transduction histidine kinase  31.07 
 
 		 398 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4781  signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 		 356 aa  106  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.252184  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2574  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  36.45 
 
 		 844 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.969915 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5776  putative PAS/PAC sensor protein  33.84 
 
 		 1160 aa  104  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.491611  normal  0.0137055 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2814  putative sensor histidine kinase  33.91 
 
 		 505 aa  103  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5235  signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 		 571 aa  103  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.878632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2586  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  35.68 
 
 		 847 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251983 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1390  signal transduction histidine kinase  35.03 
 
 		 484 aa  102  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.38029 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1241  signal transduction histidine kinase  31.08 
 
 		 631 aa  102  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0246477 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0905  putative PAS/PAC sensor protein  35.08 
 
 		 1170 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.968727 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1753  sensor histidine kinase  35.75 
 
 		 364 aa  100  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.405521 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7680  hypothetical protein  34.22 
 
 		 320 aa  100  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3835  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  36.22 
 
 		 1167 aa  100  7e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6901  signal transduction histidine kinase  31.98 
 
 		 465 aa  99.8  8e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0094  signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 		 929 aa  99.8  8e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1395  signal transduction histidine kinase  34.01 
 
 		 304 aa  99.8  9e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.695001  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1677  signal transduction histidine kinase  37.93 
 
 		 840 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0559  HWE histidine kinase  36.26 
 
 		 337 aa  99  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.690554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2229  methylesterase CheB/methylase CheR  35.08 
 
 		 1170 aa  99.4  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.840236  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4430  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  34.76 
 
 		 1158 aa  99  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1213  signal transduction histidine kinase  36.08 
 
 		 603 aa  99  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0288  signal transduction histidine kinase  34.67 
 
 		 514 aa  99.4  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.328365  normal  0.664954 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5729  signal transduction histidine kinase  32.94 
 
 		 352 aa  99  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2264  putative PAS/PAC sensor protein  35.08 
 
 		 1165 aa  99  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.620072  normal  0.0600346 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0950  Signal transduction histidine kinase protein  38.34 
 
 		 334 aa  99  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29493  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1074  signal transduction histidine kinase  32.67 
 
 		 481 aa  98.6  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.984755 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3662  alcohol dehydrogenase  31.84 
 
 		 733 aa  98.6  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.899908  normal  0.588935 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2563  signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 		 409 aa  98.2  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0310  MCP methyltransferase, CheR-type  34.76 
 
 		 1149 aa  98.2  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.512157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6181  signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 		 1191 aa  97.4  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.299797 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2344  signal transduction histidine kinase  36.92 
 
 		 500 aa  96.7  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00211814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4209  signal transduction histidine kinase  32.83 
 
 		 631 aa  96.7  7e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4495  signal transduction histidine kinase  38.55 
 
 		 571 aa  96.7  7e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3974  signal transduction histidine kinase  34.17 
 
 		 635 aa  96.3  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0272817 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0507  signal transduction histidine kinase  34.34 
 
 		 336 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3126  signal transduction histidine kinase  35.05 
 
 		 352 aa  95.1  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5756  signal transduction histidine kinase  36.63 
 
 		 347 aa  95.1  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.170851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3264  HWE histidine kinase  33.47 
 
 		 261 aa  95.5  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00440778 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3344  signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 		 336 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3500  signal transduction histidine kinase  36.99 
 
 		 583 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.319784  normal  0.0807687 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0167  signal transduction histidine kinase  32.99 
 
 		 336 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5515  hypothetical protein  33.66 
 
 		 703 aa  94.7  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5262  signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 		 338 aa  94  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3300  PAS sensor protein  37.57 
 
 		 583 aa  94  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.928069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3623  signal transduction histidine kinase  37.57 
 
 		 583 aa  94  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6552  signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 		 489 aa  94  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0743  HWE histidine kinase  35.11 
 
 		 483 aa  93.6  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1483  signal transduction histidine kinase  28.84 
 
 		 391 aa  93.2  8e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2607  signal transduction histidine kinase  34.34 
 
 		 489 aa  92.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1888  PAS sensor protein  33.53 
 
 		 326 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6244  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  36.98 
 
 		 849 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5219  signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 512 aa  92.4  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.673975 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0875  PAS sensor protein  33.66 
 
 		 488 aa  92  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.111744 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0835  signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 		 488 aa  92  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5584  signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 		 586 aa  92.4  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1333  signal transduction histidine kinase  36.04 
 
 		 346 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0112868 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5905  signal transduction histidine kinase  35.15 
 
 		 601 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.584764  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0007  signal transduction histidine kinase  35.45 
 
 		 482 aa  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.489749  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0487  signal transduction histidine kinase  34.5 
 
 		 555 aa  91.3  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0801  signal transduction histidine kinase  33.99 
 
 		 488 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185769  normal  0.110715 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2090  signal transduction histidine kinase  37.8 
 
 		 372 aa  90.9  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.893944 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3802  signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 		 574 aa  90.9  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.560077  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5012  putative sensory transduction histidine kinase  33.66 
 
 		 333 aa  90.9  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235153  normal  0.174809 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1700  signal transduction histidine kinase  34.52 
 
 		 339 aa  90.1  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.193151  normal  0.0718068 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3090  signal transduction histidine kinase  31.68 
 
 		 575 aa  90.5  6e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0895303  normal  0.0359946 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0965  signal transduction histidine kinase  34.52 
 
 		 850 aa  90.1  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0471  signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 		 349 aa  89.7  8e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5593  two component sensor kinase  32.93 
 
 		 352 aa  90.1  8e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5290  signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 		 662 aa  89.7  8e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5589  sensor histidine kinase  33.96 
 
 		 632 aa  89.7  9e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4826  signal transduction histidine kinase  34.33 
 
 		 553 aa  89.7  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.788722  normal  0.27838 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5560  signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 		 341 aa  89.7  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256684  normal  0.0162393 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3105  PAS sensor protein  30.46 
 
 		 728 aa  89.4  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4458  putative GAF sensor protein  32.37 
 
 		 844 aa  89.4  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3834  signal transduction histidine kinase  30.46 
 
 		 728 aa  89.4  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.284621 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3444  signal transduction histidine kinase  32.47 
 
 		 572 aa  89  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.753856 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1377  putative sensor histidine kinase  30.66 
 
 		 561 aa  88.2  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.351027  normal  0.486528 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6531  signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 		 344 aa  88.2  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14349  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6933  signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 		 488 aa  88.2  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2544  Signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 		 489 aa  87.8  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5922  signal transduction histidine kinase  34.16 
 
 		 346 aa  87.8  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2024  signal transduction histidine kinase  24.66 
 
 		 497 aa  87.4  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.149212  normal  0.406004 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4932  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 907 aa  87.4  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.752686 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1301  signal transduction histidine kinase  34.69 
 
 		 588 aa  87.4  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1881  PAS sensor protein  34.18 
 
 		 872 aa  87  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01099  bacteriophytochrome protein  31.21 
 
 		 822 aa  86.3  9e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.506628  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5005  signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 		 334 aa  86.3  9e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6624  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0707  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  28.17 
 
 		 1190 aa  86.3  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1628  sensor histidine protein kinase  33.85 
 
 		 332 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.560713  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2160  signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 		 263 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.31354  normal  0.0264622 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1944  signal transduction histidine kinase  32.83 
 
 		 507 aa  86.3  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0183597  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9083  bacteriophytochrome protein  32.27 
 
 		 856 aa  85.1  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3978  signal transduction histidine kinase  32.66 
 
 		 577 aa  85.1  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3034  putative PAS/PAC sensor protein  30.43 
 
 		 856 aa  85.5  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0858916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4278  putative PAS/PAC sensor protein  30.35 
 
 		 1027 aa  85.1  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>