More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4017 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4017  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 306 aa  635    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.176614  hitchhiker  0.00151279 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2093  transcriptional regulator, AraC family  65.9 
 
 		 306 aa  430  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2347  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  66.56 
 
 		 299 aa  414  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.482923  normal  0.205256 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3525  transcriptional regulator, AraC family  63.37 
 
 		 305 aa  404  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.96413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4692  helix-turn-helix domain-containing protein  63.28 
 
 		 304 aa  403  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.873868  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1989  AraC family transcriptional regulator  62.95 
 
 		 301 aa  399  9.999999999999999e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.484982  normal  0.116886 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2643  transcriptional regulator, AraC family  62.71 
 
 		 305 aa  399  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0795381 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5616  transcriptional regulator, AraC family  62.3 
 
 		 306 aa  395  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3816  transcriptional regulator, AraC family  61.46 
 
 		 302 aa  391  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000942469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0841  transcriptional regulator, AraC family  61.56 
 
 		 302 aa  379  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.489932  normal  0.458947 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1767  transcriptional regulator, AraC family  60.73 
 
 		 300 aa  374  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2468  transcriptional regulator, AraC family  58.36 
 
 		 304 aa  370  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.409061 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3745  helix-turn-helix domain-containing protein  57.05 
 
 		 303 aa  367  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6274  transcriptional regulator, AraC family  58.36 
 
 		 305 aa  367  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0452758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2714  transcriptional regulator, AraC family  57.48 
 
 		 308 aa  363  1e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4324  transcriptional regulator, AraC family  58.36 
 
 		 302 aa  363  1e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.405995  normal  0.0331702 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4380  transcriptional regulator, AraC family  57.63 
 
 		 304 aa  354  1e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.072515  decreased coverage  0.000817798 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1859  transcriptional regulator, AraC family  57.58 
 
 		 306 aa  343  1e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2324  helix-turn-helix domain-containing protein  56.9 
 
 		 306 aa  337  9.999999999999999e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0313  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  53.18 
 
 		 311 aa  311  1e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.593516  normal  0.0908723 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4319  transcriptional regulator, AraC family  51.62 
 
 		 306 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.414094  normal  0.0857311 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3644  transcriptional regulator, AraC family  51.33 
 
 		 306 aa  305  4.0000000000000004e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0477  helix-turn-helix domain-containing protein  50 
 
 		 304 aa  298  8e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2529  transcriptional regulator, AraC family  50.83 
 
 		 312 aa  294  2e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.252181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5133  transcriptional regulator, AraC family  49.5 
 
 		 307 aa  293  2e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0705999  normal  0.246476 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4108  transcriptional regulator, AraC family  49.49 
 
 		 305 aa  291  8e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00405906 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5664  transcriptional regulator, AraC family  49.67 
 
 		 305 aa  291  1e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.169654  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1308  helix-turn-helix domain-containing protein  49 
 
 		 306 aa  288  7e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2655  transcriptional regulator, AraC family  49.83 
 
 		 304 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.5275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6699  transcriptional regulator, AraC family  46.89 
 
 		 303 aa  285  7e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5730  transcriptional regulator, AraC family  45.76 
 
 		 305 aa  277  1e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.861702 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2111  transcriptional regulator, AraC family  45.87 
 
 		 304 aa  276  4e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0317919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5696  transcriptional regulator, AraC family  47.3 
 
 		 301 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.673835  normal  0.549107 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3135  transcriptional regulator, AraC family  47.96 
 
 		 307 aa  272  5.000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.91659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6134  transcriptional regulator, AraC family  46.46 
 
 		 305 aa  264  2e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1405  transcriptional regulator, AraC family  45.97 
 
 		 305 aa  263  2e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.099769  normal  0.282714 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4836  transcriptional regulator, AraC family  45.08 
 
 		 300 aa  256  5e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.335383  hitchhiker  0.00000110136 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6183  transcriptional regulator, AraC family  46.28 
 
 		 302 aa  255  6e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0614415 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3787  transcriptional regulator, AraC family  43.05 
 
 		 298 aa  249  4e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0143656 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10093  putative AraC family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 304 aa  241  1e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6702  transcriptional regulator, AraC family  44.4 
 
 		 303 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2759  transcriptional regulator, AraC family  40.67 
 
 		 300 aa  229  4e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.260442 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00465  transcriptional regulator  40.47 
 
 		 303 aa  227  1e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0169  helix-turn-helix domain-containing protein  42.37 
 
 		 297 aa  228  1e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1007  transcriptional regulator, AraC family  40.82 
 
 		 298 aa  221  9.999999999999999e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2180  transcriptional regulator, AraC family  40.21 
 
 		 295 aa  213  2.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.20744 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5741  transcriptional regulator, AraC family  38.23 
 
 		 295 aa  212  5.999999999999999e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0188023  normal  0.762448 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1306  transcriptional regulator, AraC family  39.25 
 
 		 305 aa  209  6e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.272206 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3929  transcriptional regulator, AraC family  38.31 
 
 		 303 aa  209  6e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2240  transcriptional regulator, AraC family  29.3 
 
 		 312 aa  99.4  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4701  transcriptional regulator, AraC family  28.4 
 
 		 297 aa  94.4  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0913781  normal  0.069662 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4603  transcriptional regulator, AraC family  54.22 
 
 		 87 aa  87.8  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.463016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0275  transcriptional regulator, AraC family  24.83 
 
 		 314 aa  87.4  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0873  transcriptional regulator, AraC family  26.69 
 
 		 286 aa  86.7  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.947068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5414  transcriptional regulator, AraC family  25.65 
 
 		 296 aa  85.9  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00395268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2696  transcriptional regulator, AraC family  25.44 
 
 		 302 aa  85.5  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3756  transcriptional regulator, AraC family  26.85 
 
 		 285 aa  80.9  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.295664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3534  transcriptional regulator, AraC family  24.34 
 
 		 309 aa  76.6  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0611769  normal  0.445851 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6236  transcriptional regulator, AraC family  24.89 
 
 		 307 aa  75.5  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.573894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7190  transcriptional regulator, AraC family  27.2 
 
 		 305 aa  75.5  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0805  AraC family transcriptional regulator  24.47 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.998455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0769  transcriptional regulator, AraC family  25.83 
 
 		 292 aa  75.5  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0636487  normal  0.216955 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0470  transcriptional regulator, AraC family  23.94 
 
 		 314 aa  73.6  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3804  transcriptional regulator, AraC family  24.31 
 
 		 301 aa  72.4  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.476681  normal  0.0667593 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0180  helix-turn-helix domain-containing protein  25.82 
 
 		 259 aa  72.4  0.000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0485  transcriptional regulator, AraC family  23.62 
 
 		 309 aa  71.6  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.233629 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5517  transcriptional regulator, AraC family  23.94 
 
 		 303 aa  72  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0042541  normal  0.0106671 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1949  transcriptional regulator, AraC family  23.14 
 
 		 289 aa  70.5  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129512 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3722  helix-turn-helix domain-containing protein  35.4 
 
 		 305 aa  70.9  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0730  transcriptional regulator, AraC family  36.26 
 
 		 115 aa  70.9  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1738  transcriptional regulator, AraC family  24.33 
 
 		 283 aa  70.5  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2965  transcriptional regulator, AraC family  41.38 
 
 		 274 aa  70.5  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000197043  hitchhiker  0.00000564139 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5379  transcriptional regulator, AraC family  28.3 
 
 		 295 aa  70.5  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1116  transcriptional regulator, AraC family  23.76 
 
 		 300 aa  69.7  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.49707  normal  0.304596 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2146  transcriptional regulator, AraC family  43.21 
 
 		 286 aa  69.7  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00502673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1116  transcriptional regulator, AraC family  24.05 
 
 		 289 aa  69.3  0.00000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00899816  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4278  helix-turn-helix domain-containing protein  23.95 
 
 		 307 aa  69.3  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0702  AraC family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 293 aa  68.9  0.00000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.737092  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2329  transcriptional regulator, AraC family  41.46 
 
 		 773 aa  68.9  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1694  transcriptional regulator, AraC family  24.32 
 
 		 309 aa  68.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1608  transcriptional regulator, AraC family  24.62 
 
 		 279 aa  68.2  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.322364  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5912  transcriptional regulator, AraC family  24.83 
 
 		 290 aa  68.2  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.264328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1426  transcriptional regulator, AraC family  26.5 
 
 		 292 aa  67.8  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.065785  normal  0.0210351 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4897  transcriptional regulator, AraC family  27.31 
 
 		 289 aa  67.4  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4132  transcriptional regulator, AraC family  24.05 
 
 		 299 aa  67  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0973484 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3797  transcriptional regulator, AraC family  25.38 
 
 		 293 aa  67  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00910315  normal  0.099485 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1550  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 306 aa  66.6  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0774112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1732  AraC family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 286 aa  66.6  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6379  transcriptional regulator, AraC family  23.55 
 
 		 297 aa  66.6  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2197  transcriptional regulator, AraC family  39.62 
 
 		 282 aa  66.2  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0383  transcriptional regulator, AraC family  42.86 
 
 		 299 aa  65.9  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.28252 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6046  transcriptional regulator, AraC family  25.99 
 
 		 315 aa  65.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0485371 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5794  transcriptional regulator, AraC family  24.79 
 
 		 301 aa  65.1  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3758  transcriptional regulator, AraC family  23.74 
 
 		 289 aa  65.1  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4019  transcriptional regulator, AraC family  35.37 
 
 		 292 aa  65.1  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.992917  hitchhiker  0.00536454 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0346  AraC family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 295 aa  65.1  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4620  transcriptional regulator, AraC family  28.19 
 
 		 293 aa  64.7  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.142844 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0399  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 365 aa  64.7  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1302  transcriptional regulator, AraC family  26.41 
 
 		 289 aa  63.9  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1158  transcriptional regulator, AraC family  21.88 
 
 		 303 aa  63.9  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.365252 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>