More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_03240 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2324  helicase domain protein  73.11 
 
 		 1095 aa  1495    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0464  helicase domain protein  42.84 
 
 		 1044 aa  705    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03240  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  100 
 
 		 1028 aa  2088    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2729  helicase-like  42.07 
 
 		 1165 aa  704    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.36993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2545  helicase domain protein  41.76 
 
 		 1038 aa  716    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0721063  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0811  helicase-like protein  50.77 
 
 		 1201 aa  974    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2726  helicase domain protein  42.63 
 
 		 1057 aa  694    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.48932 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4785  helicase domain-containing protein  54.66 
 
 		 724 aa  753    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0599344  normal  0.582969 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0827  helicase domain-containing protein  50.77 
 
 		 1201 aa  974    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3846  helicase domain-containing protein  38.1 
 
 		 1058 aa  610  1e-173  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.064852 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5359  helicase domain protein  37.11 
 
 		 1049 aa  607  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3680  SNF2-related:helicase, C-terminal  38.61 
 
 		 1045 aa  594  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1177  helicase domain-containing protein  38.57 
 
 		 1031 aa  594  1e-168  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.304258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2198  helicase domain-containing protein  37.46 
 
 		 1046 aa  593  1e-168  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.33194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4787  DEAD-like helicases-like protein  74.57 
 
 		 338 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.111321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1325  SNF2-related helicase  32.51 
 
 		 1082 aa  421  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1271  helicase domain-containing protein  31.17 
 
 		 1177 aa  386  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0219  helicase-like  31.03 
 
 		 840 aa  270  1e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000357618  hitchhiker  0.00781123 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  33.73 
 
 		 919 aa  226  1e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  29.31 
 
 		 988 aa  208  3e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  30.31 
 
 		 969 aa  202  1.9999999999999998e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  29.58 
 
 		 971 aa  202  3e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1416  helicase domain protein  28.27 
 
 		 945 aa  197  7e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1355  helicase domain-containing protein  28.03 
 
 		 954 aa  197  9e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  30.23 
 
 		 933 aa  196  2e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  29.33 
 
 		 969 aa  194  5e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2075  hypothetical protein  29.21 
 
 		 835 aa  194  9e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.989433  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2010  hypothetical protein  29.21 
 
 		 1144 aa  194  1e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0196  helicase domain-containing protein  30.3 
 
 		 1167 aa  191  8e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.037499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0745  helicase domain protein  33.39 
 
 		 1094 aa  190  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  25.73 
 
 		 1138 aa  190  1e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  31.27 
 
 		 1172 aa  190  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  29.84 
 
 		 1172 aa  189  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3885  helicase domain-containing protein  27.59 
 
 		 952 aa  189  3e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.929535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  28.16 
 
 		 941 aa  188  4e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4828  helicase family protein  27.77 
 
 		 952 aa  188  4e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5808  helicase family protein  27.77 
 
 		 952 aa  188  4e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  28.16 
 
 		 941 aa  188  4e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  29.34 
 
 		 962 aa  187  9e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4894  helicase family protein  27.61 
 
 		 952 aa  186  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3989  helicase domain-containing protein  28.69 
 
 		 1145 aa  186  3e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.164502 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0680  helicase domain-containing protein  31.61 
 
 		 1167 aa  186  3e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.272356 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2988  helicase domain-containing protein  30.49 
 
 		 1167 aa  185  5.0000000000000004e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249556  normal  0.0303963 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  30.83 
 
 		 1116 aa  182  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2099  helicase domain protein  32.04 
 
 		 1194 aa  182  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1609  helicase domain-containing protein  29.74 
 
 		 1129 aa  182  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  31.18 
 
 		 1170 aa  181  5.999999999999999e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  27.89 
 
 		 966 aa  181  8e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1301  helicase domain protein  29.24 
 
 		 1062 aa  180  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.483393  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  29.28 
 
 		 1170 aa  180  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  30.92 
 
 		 1168 aa  177  7e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  30.77 
 
 		 1160 aa  177  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1526  helicase domain-containing protein  29.61 
 
 		 923 aa  176  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.796043  normal  0.0729049 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3743  helicase domain protein  27.89 
 
 		 973 aa  176  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2539  helicase domain-containing protein  29.85 
 
 		 969 aa  176  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000371025  decreased coverage  0.000313651 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3005  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  30.26 
 
 		 1212 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  29.91 
 
 		 952 aa  176  2.9999999999999996e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3088  helicase domain-containing protein  26.82 
 
 		 956 aa  175  3.9999999999999995e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01898 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  30.43 
 
 		 1170 aa  174  9e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  29.78 
 
 		 1169 aa  172  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3376  helicase domain-containing protein  28 
 
 		 877 aa  172  3e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35220  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  27.61 
 
 		 960 aa  171  4e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.608461 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  30.87 
 
 		 1170 aa  172  4e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0826  helicase domain-containing protein  28.72 
 
 		 1136 aa  171  8e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2069  SNF2-related protein  26.58 
 
 		 964 aa  171  8e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0017  helicase/SNF2 family domain protein  28.88 
 
 		 801 aa  170  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1957  helicase domain-containing protein  29.27 
 
 		 968 aa  169  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  29.3 
 
 		 1147 aa  169  2.9999999999999998e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2591  helicase domain protein  29.44 
 
 		 957 aa  167  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000604323 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  28.62 
 
 		 972 aa  166  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1019  helicase domain protein  29.66 
 
 		 1160 aa  166  2.0000000000000002e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  29.03 
 
 		 1169 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2671  helicase domain protein  28.93 
 
 		 949 aa  165  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.672635 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0352  helicase domain protein  26.8 
 
 		 937 aa  165  5.0000000000000005e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0461  helicase domain-containing protein  29.47 
 
 		 986 aa  164  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.838477  unclonable  0.0000248811 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0725  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  31.95 
 
 		 949 aa  163  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4903  type III restriction enzyme, res subunit  26.42 
 
 		 963 aa  162  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.891445  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1328  helicase domain protein  30.32 
 
 		 916 aa  161  5e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1426  helicase domain protein  30.32 
 
 		 915 aa  161  6e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0958  SNF2-related protein  26.99 
 
 		 975 aa  161  6e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.106346  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2524  SNF2-related helicase-like  30.14 
 
 		 915 aa  160  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.180515  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0233  Type III restriction enzyme, res subunit  28.28 
 
 		 900 aa  159  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179652  decreased coverage  0.00064314 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0273  helicase domain-containing protein  26.89 
 
 		 919 aa  159  3e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7832  helicase domain protein  28.09 
 
 		 941 aa  157  8e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1096  helicase domain-containing protein  29.9 
 
 		 964 aa  157  8e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1596  helicase domain-containing protein  28.78 
 
 		 1137 aa  157  9e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1660  helicase/SNF2 family domain protein  27.35 
 
 		 805 aa  157  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1341  helicase domain-containing protein  28.36 
 
 		 921 aa  157  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.134377 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5420  helicase domain-containing protein  28.63 
 
 		 1046 aa  155  4e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1086  helicase-like  30.08 
 
 		 829 aa  155  4e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1538  helicase domain-containing protein  25.54 
 
 		 963 aa  155  4e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2648  helicase domain protein  28.77 
 
 		 950 aa  155  5e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2959  helicase domain-containing protein  26.77 
 
 		 937 aa  153  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.789708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1805  helicase domain-containing protein  25.84 
 
 		 1013 aa  151  5e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4128  helicase domain protein  29.62 
 
 		 1131 aa  149  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33452  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0353  helicase-like  28.57 
 
 		 933 aa  147  8.000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5353  helicase domain protein  27 
 
 		 894 aa  147  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.157102 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1422  helicase domain protein  27.22 
 
 		 958 aa  147  1e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1953  helicase domain-containing protein  24.56 
 
 		 967 aa  146  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0592  helicase domain-containing protein  27.16 
 
 		 955 aa  145  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>