124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_3643 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4093  hypothetical protein  84.75 
 
 		 1390 aa  2381    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0527  hypothetical protein  71.77 
 
 		 1454 aa  2085    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3329  hypothetical protein  45.32 
 
 		 1419 aa  1162    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3467  hypothetical protein  93.08 
 
 		 1416 aa  2613    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0484  hypothetical protein  93.58 
 
 		 1417 aa  2627    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.814446 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3733  hypothetical protein  49.2 
 
 		 1443 aa  1427    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3643  hypothetical protein  100 
 
 		 1417 aa  2874    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.247251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0472  membrane protein  45.96 
 
 		 1515 aa  773    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.50538 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3817  hypothetical protein  72.07 
 
 		 1459 aa  2097    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0408  hypothetical protein  53.68 
 
 		 1436 aa  1524    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0579  hypothetical protein  71.1 
 
 		 1383 aa  2082    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0502  hypothetical protein  72.07 
 
 		 1441 aa  2083    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0563  hypothetical protein  51.94 
 
 		 1419 aa  1491    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72639  normal  0.280407 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3749  hypothetical protein  51.25 
 
 		 1439 aa  1460    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0523  hypothetical protein  71.02 
 
 		 1446 aa  2080    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4397  hypothetical protein  52.56 
 
 		 1392 aa  1477    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.963583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0188  hypothetical protein  28.67 
 
 		 1301 aa  568  1e-160  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2839  hypothetical protein  27.34 
 
 		 1291 aa  502  1e-140  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00269  putative protease  27.38 
 
 		 1331 aa  481  1e-134  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002388  possible exported protein  27.25 
 
 		 1301 aa  482  1e-134  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.267234  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03680  hypothetical protein  26.82 
 
 		 1266 aa  477  1e-133  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4555  putative protease  25.85 
 
 		 1323 aa  455  1.0000000000000001e-126  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0488  hypothetical protein  25.31 
 
 		 1287 aa  421  1e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.135683  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1127  membrane protein-like protein  26.1 
 
 		 1294 aa  423  1e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.334782  normal  0.712644 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4406  hypothetical protein  26.09 
 
 		 1291 aa  418  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.213897  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0257  hypothetical protein  24.73 
 
 		 1276 aa  403  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0268  hypothetical protein  25.02 
 
 		 1276 aa  400  9.999999999999999e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1193  hypothetical protein  25.55 
 
 		 1307 aa  400  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.879408  hitchhiker  0.00193389 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3682  hypothetical protein  23.98 
 
 		 1265 aa  388  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3830  hypothetical protein  24.53 
 
 		 1284 aa  386  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.238588  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3672  hypothetical protein  24.29 
 
 		 1277 aa  381  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3435  hypothetical protein  23.71 
 
 		 1266 aa  381  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3541  hypothetical protein  23.79 
 
 		 1266 aa  380  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03105  conserved membrane protein, predicted transporter  23.93 
 
 		 1266 aa  380  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0723003  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03056  hypothetical protein  23.93 
 
 		 1266 aa  380  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.102838  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0461  hypothetical protein  23.63 
 
 		 1266 aa  379  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00853598  normal  0.775435 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3561  hypothetical protein  24.77 
 
 		 1266 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3728  hypothetical protein  23.67 
 
 		 1266 aa  374  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4562  hypothetical protein  23.56 
 
 		 1266 aa  375  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0190737  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0461  conserved hypothetical protein  23.67 
 
 		 1266 aa  373  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.049997  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3560  hypothetical protein  24.9 
 
 		 1266 aa  372  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3729  hypothetical protein  24.9 
 
 		 1266 aa  373  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.424475  normal  0.178844 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3277  hypothetical protein  23.63 
 
 		 1266 aa  372  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.682788  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3632  hypothetical protein  24.83 
 
 		 1266 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.357405  normal  0.0273308 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3667  hypothetical protein  24.9 
 
 		 1266 aa  372  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0403  hypothetical protein  26.4 
 
 		 1305 aa  290  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0470  hypothetical protein  26.4 
 
 		 1307 aa  287  8e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.196897  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1744  hypothetical protein  22.28 
 
 		 1284 aa  267  1e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0306491 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1719  hypothetical protein  21.39 
 
 		 1273 aa  258  8e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1719  hypothetical protein  21.13 
 
 		 1273 aa  251  7e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4158  hypothetical protein  22.69 
 
 		 1271 aa  241  5e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3330  hypothetical protein  22.98 
 
 		 1307 aa  241  8e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000315008 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4467  hypothetical protein  22.5 
 
 		 1271 aa  236  3e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00502079  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0380  hypothetical protein  21.77 
 
 		 1265 aa  230  1e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1735  membrane protein-like protein  22.28 
 
 		 1346 aa  224  9.999999999999999e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0510  hypothetical protein  21.9 
 
 		 1261 aa  211  6e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0843  hypothetical protein  21.17 
 
 		 1267 aa  209  4e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.560634  normal  0.938035 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0410  hypothetical protein  21.78 
 
 		 1309 aa  206  2e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.103346 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0861  membrane protein-like protein  21.56 
 
 		 1273 aa  206  3e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.835961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4277  hypothetical protein  21.77 
 
 		 1269 aa  204  9e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2656  hypothetical protein  20.97 
 
 		 1288 aa  199  4.0000000000000005e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.37084  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1218  hypothetical protein  21.76 
 
 		 1341 aa  197  2e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0577669  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1057  hypothetical protein  21.76 
 
 		 1264 aa  190  2e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12700  hypothetical protein  21.41 
 
 		 1277 aa  180  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4831  hypothetical protein  22.65 
 
 		 1420 aa  178  6e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761382  normal  0.626491 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0938  hypothetical protein  21.19 
 
 		 1273 aa  175  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0849  hypothetical protein  21.55 
 
 		 1384 aa  175  5.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5090  hypothetical protein  21.51 
 
 		 1275 aa  174  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.340947  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0945  hypothetical protein  21.28 
 
 		 1271 aa  174  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5159  hypothetical protein  22.15 
 
 		 1394 aa  173  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2899  hypothetical protein  23.08 
 
 		 1283 aa  172  3e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0243  putative transmembrane protein  22.21 
 
 		 1472 aa  170  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.150673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0978  hypothetical protein  21.04 
 
 		 1271 aa  170  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1029  hypothetical protein  21.45 
 
 		 1419 aa  169  5e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58090  hypothetical protein  20.97 
 
 		 1276 aa  169  5e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3897  hypothetical protein  20.74 
 
 		 1379 aa  168  9e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.663381 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2894  putative transmembrane protein  21.78 
 
 		 1426 aa  166  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0993  hypothetical protein  21.28 
 
 		 1398 aa  158  6e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.193482 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4655  hypothetical protein  20.62 
 
 		 1441 aa  152  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.431718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0411  hypothetical protein  21.98 
 
 		 1274 aa  152  5e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.68904  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3829  hypothetical protein  22 
 
 		 1399 aa  151  7e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2488  hypothetical protein  21.44 
 
 		 1426 aa  149  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.297377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0659  hypothetical protein  22.25 
 
 		 1398 aa  146  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0634  hypothetical protein  22.36 
 
 		 1398 aa  146  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.913326  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3187  exonuclease VII, small subunit  21.24 
 
 		 1380 aa  145  4e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2643  hypothetical protein  21.75 
 
 		 1399 aa  145  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.73761 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0741  hypothetical protein  22.32 
 
 		 1399 aa  144  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.77418  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0257  hypothetical protein  22.21 
 
 		 1399 aa  142  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.866424  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0711  hypothetical protein  22.3 
 
 		 1399 aa  142  6e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.463012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0512  hypothetical protein  21.21 
 
 		 1153 aa  136  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.350168  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1645  hypothetical protein  21.45 
 
 		 1153 aa  137  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000756943  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3970  hypothetical protein  21.05 
 
 		 1430 aa  135  6.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.231617 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2657  hypothetical protein  20.72 
 
 		 1426 aa  134  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0471  hypothetical protein  20.9 
 
 		 1286 aa  130  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.356031  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2507  hypothetical protein  21.04 
 
 		 1419 aa  128  9e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1776  membrane protein-like protein  21.36 
 
 		 1384 aa  126  3e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2270  membrane protein-like protein  21.91 
 
 		 1304 aa  120  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4656  hypothetical protein  24.73 
 
 		 1425 aa  120  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3368  hypothetical protein  24.65 
 
 		 1378 aa  116  4.0000000000000004e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.48731  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4018  hypothetical protein  24.15 
 
 		 1418 aa  115  6e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.938248  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>