More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3808 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3808  carboxyl-terminal protease  100 
 
 		 401 aa  818    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.756218 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4472  C-terminal processing peptidase  68.33 
 
 		 401 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0890612  hitchhiker  0.000000524725 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4879  carboxyl-terminal protease  65.66 
 
 		 401 aa  541  1e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0045  carboxyl-terminal protease  62.06 
 
 		 401 aa  523  1e-147  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000223993 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0041  carboxyl-terminal protease  61.81 
 
 		 401 aa  522  1e-147  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4334  carboxyl-terminal protease  62.06 
 
 		 401 aa  523  1e-147  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0045  carboxyl-terminal protease  61.56 
 
 		 401 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000144504 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4219  carboxyl-terminal protease  62.56 
 
 		 401 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0043  C-terminal processing peptidase-3  60.3 
 
 		 401 aa  482  1e-135  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000408883 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0049  C-terminal processing peptidase-3  59.8 
 
 		 401 aa  482  1e-135  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000124234 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0041  C-terminal processing peptidase-3  59.55 
 
 		 401 aa  479  1e-134  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.660161  hitchhiker  0.00325128 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0047  carboxyl-terminal protease, putative  59.79 
 
 		 402 aa  474  1e-132  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0038  carboxyl-terminal protease  60.8 
 
 		 402 aa  474  1e-132  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3700  carboxyl-terminal protease  54.36 
 
 		 401 aa  457  1e-127  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0058  C-terminal processing peptidase  58.4 
 
 		 398 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.871061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  39.08 
 
 		 446 aa  283  4.0000000000000003e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  37.7 
 
 		 432 aa  268  2e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  38.64 
 
 		 426 aa  267  2.9999999999999995e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  38.78 
 
 		 440 aa  266  5e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  39.73 
 
 		 445 aa  265  8e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0923  carboxyl-terminal protease  38.21 
 
 		 428 aa  265  1e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.315177  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  37.53 
 
 		 428 aa  265  1e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0643  carboxyl-terminal protease  37.23 
 
 		 447 aa  261  2e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  38.78 
 
 		 440 aa  260  3e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  41.85 
 
 		 462 aa  260  3e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  39.88 
 
 		 433 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  40.42 
 
 		 438 aa  258  1e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0896  carboxyl-terminal protease  38.65 
 
 		 443 aa  257  3e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000020194  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2562  carboxyl-terminal protease  36.49 
 
 		 440 aa  257  3e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2287  carboxyl-terminal protease  36.49 
 
 		 440 aa  257  3e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0166  carboxyl-terminal protease  37.9 
 
 		 452 aa  256  5e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.97074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1210  carboxyl-terminal protease  37.28 
 
 		 415 aa  256  7e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  41.37 
 
 		 445 aa  255  8e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2244  carboxyl-terminal protease  36.22 
 
 		 440 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0625684  normal  0.355809 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  37.63 
 
 		 458 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1949  carboxyl-terminal protease  37.24 
 
 		 477 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  38.07 
 
 		 456 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  42.06 
 
 		 445 aa  253  3e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0098  carboxyl-terminal protease  36.22 
 
 		 446 aa  253  3e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  37.47 
 
 		 451 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  37.63 
 
 		 457 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  39.75 
 
 		 436 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  39.75 
 
 		 436 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  36.11 
 
 		 441 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1437  carboxyl-terminal protease  39.69 
 
 		 429 aa  253  6e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00028594  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4487  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  40.99 
 
 		 444 aa  252  8.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  37.29 
 
 		 438 aa  252  9.000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  40 
 
 		 423 aa  252  9.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  38.91 
 
 		 438 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  38.53 
 
 		 468 aa  251  1e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2868  carboxyl-terminal protease  40.06 
 
 		 423 aa  251  1e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  38.91 
 
 		 438 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  41.23 
 
 		 451 aa  251  1e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0539  carboxyl-terminal protease  38.17 
 
 		 444 aa  251  1e-65  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.206911  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4223  carboxyl-terminal protease  37.74 
 
 		 440 aa  251  1e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0618  carboxyl-terminal protease  38.44 
 
 		 444 aa  251  2e-65  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.982226  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4724  carboxyl-terminal protease  40.37 
 
 		 463 aa  251  2e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.458117  normal  0.0374379 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1420  carboxyl-terminal protease  38.17 
 
 		 444 aa  251  2e-65  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.14041  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  38.91 
 
 		 438 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  39.01 
 
 		 452 aa  251  2e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  39.82 
 
 		 437 aa  249  4e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  39.81 
 
 		 440 aa  249  7e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2159  carboxyl-terminal protease  39.5 
 
 		 422 aa  248  1e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1654  carboxyl-terminal protease  37.24 
 
 		 477 aa  248  2e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.9351 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  38.6 
 
 		 439 aa  247  2e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  35.66 
 
 		 439 aa  248  2e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0574  carboxyl-terminal protease  38.77 
 
 		 462 aa  248  2e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.529282 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2006  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  39.26 
 
 		 434 aa  247  2e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00114653  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  39.29 
 
 		 455 aa  247  3e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  40.25 
 
 		 443 aa  247  3e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  38.69 
 
 		 441 aa  246  4e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  36.5 
 
 		 410 aa  246  4e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  39.13 
 
 		 439 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03547  carboxyl-terminal protease  39.7 
 
 		 507 aa  246  6e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0944  carboxyl-terminal protease  36.84 
 
 		 437 aa  245  9e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000279506  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0848  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  39.76 
 
 		 419 aa  245  9.999999999999999e-64  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0053756  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4209  carboxyl-terminal protease  38.12 
 
 		 440 aa  243  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.194144 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3885  carboxyl-terminal protease  36.1 
 
 		 440 aa  244  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26921  normal  0.039138 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  36.34 
 
 		 443 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0091  carboxyl-terminal protease  36.59 
 
 		 445 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0132582  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0250  carboxyl-terminal protease  36.72 
 
 		 535 aa  242  7e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0381  carboxyl-terminal protease  37.19 
 
 		 441 aa  242  9e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2392  peptidase S41A, protease  34.96 
 
 		 468 aa  241  1e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  38.82 
 
 		 439 aa  241  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2453  carboxyl-terminal protease  41.05 
 
 		 455 aa  241  1e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493491  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0131  peptidoglycan associated lipoprotein  39.51 
 
 		 435 aa  241  2e-62  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00102865  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0932  S41 family peptidase  38.48 
 
 		 448 aa  241  2e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0235658  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2591  carboxyl-terminal protease  37.69 
 
 		 448 aa  241  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.837496  normal  0.635906 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2072  carboxyl-terminal protease  39.38 
 
 		 453 aa  241  2e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.323536 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1401  carboxyl-terminal protease  36.11 
 
 		 439 aa  241  2e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000562456  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0449  carboxy-terminal processing protease precursor  37.91 
 
 		 456 aa  240  2.9999999999999997e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3016  carboxyl-terminal protease  39.63 
 
 		 440 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2508  carboxyl-terminal protease  35.69 
 
 		 471 aa  240  2.9999999999999997e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  35.83 
 
 		 444 aa  239  4e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0492  peptidase S41A, C-terminal protease  35.81 
 
 		 439 aa  239  5e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  38.37 
 
 		 461 aa  239  5e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3021  carboxyl-terminal protease  37.72 
 
 		 472 aa  239  5.999999999999999e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.846777  normal  0.0258031 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1722  C-terminal processing peptidase  37.91 
 
 		 456 aa  239  8e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0055  C-terminal processing peptidase-3  39.33 
 
 		 463 aa  238  1e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0703  carboxyl-terminal protease  37.31 
 
 		 437 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>