More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3058 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3058  beta-lactamase  100 
 
 		 398 aa  826    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2827  beta-lactamase  41.45 
 
 		 410 aa  301  1e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.620293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1528  beta-lactamase  42.74 
 
 		 410 aa  298  2e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1554  beta-lactamase  43.34 
 
 		 410 aa  296  5e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1519  beta-lactamase  43.35 
 
 		 410 aa  290  2e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0095  beta-lactamase  38.62 
 
 		 580 aa  273  6e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09928  putative non-ribosomal peptide synthetase  39.47 
 
 		 483 aa  248  1e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.206304  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00893  putative non-ribosomal peptide synthetase  37.76 
 
 		 504 aa  233  4.0000000000000004e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3669  beta-lactamase  34.12 
 
 		 507 aa  217  2e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3450  putative penicillin-binding protein  31.38 
 
 		 345 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3161  beta-lactamase  28.7 
 
 		 345 aa  181  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.513254  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1798  putative penicillin-binding protein  30.79 
 
 		 345 aa  180  4e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3224  penicillin-binding protein  28.4 
 
 		 374 aa  177  4e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000147452  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3251  penicillin-binding protein  28.7 
 
 		 374 aa  176  5e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3506  penicillin-binding protein  28.7 
 
 		 345 aa  176  5e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3466  putative penicillin-binding protein  28.4 
 
 		 345 aa  176  8e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3457  penicillin-binding protein, putative  29.03 
 
 		 345 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0846079  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3157  beta-lactamase  30.89 
 
 		 345 aa  172  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00126272  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1905  beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins  32.68 
 
 		 389 aa  167  2e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.0068252  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2997  beta-lactamase  32.31 
 
 		 513 aa  161  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2953  beta-lactamase  32.42 
 
 		 513 aa  161  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2932  penicillin-binding protein  32.31 
 
 		 513 aa  159  8e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3243  beta-lactamase family protein  32 
 
 		 513 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3873  amino acid adenylation domain protein  29.48 
 
 		 5698 aa  149  6e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.166545 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4833  beta-lactamase  30.88 
 
 		 405 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3010  penicillin-binding protein, N-terminus  33.86 
 
 		 285 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3500  beta-lactamase  27.59 
 
 		 600 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623073  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0612  beta-lactamase  26.09 
 
 		 391 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1311  beta-lactamase  30 
 
 		 669 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9203  beta-lactamase  28.86 
 
 		 635 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2602  beta-lactamase  30.61 
 
 		 778 aa  110  5e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  24.25 
 
 		 595 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0963  beta-lactamase  31.98 
 
 		 423 aa  108  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.146357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  25.3 
 
 		 533 aa  107  3e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5771  beta-lactamase  30.62 
 
 		 711 aa  106  9e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2659  beta-lactamase  27.6 
 
 		 662 aa  102  9e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0318  beta-lactamase  25.63 
 
 		 365 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180634 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4308  beta-lactamase  27.6 
 
 		 650 aa  98.6  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.805936  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11747  penicillin-binding protein  25.14 
 
 		 539 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.47398 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41280  putative beta-lactamase  24.86 
 
 		 610 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.607486 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2360  beta-lactamase  25.23 
 
 		 494 aa  97.8  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.908213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  28.46 
 
 		 498 aa  97.4  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0467  beta-lactamase  27.54 
 
 		 637 aa  96.7  6e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  26.37 
 
 		 559 aa  95.1  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1946  Beta-lactamase  29.05 
 
 		 588 aa  95.1  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1375  beta-lactamase  31.07 
 
 		 491 aa  95.5  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4219  beta-lactamase  23.65 
 
 		 395 aa  94.4  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.310233  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8144  beta-lactamase  27.92 
 
 		 674 aa  94  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  25.22 
 
 		 601 aa  93.6  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3830  beta-lactamase  27.56 
 
 		 658 aa  93.6  6e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223137  normal  0.372687 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  24.2 
 
 		 543 aa  91.7  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.816506 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3207  beta-lactamase  26.67 
 
 		 357 aa  92  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.916512  normal  0.585337 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  24.2 
 
 		 543 aa  91.7  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0603  beta-lactamase  27.27 
 
 		 409 aa  91.3  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.875784  normal  0.055059 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0674  beta-lactamase  27.62 
 
 		 715 aa  89.7  8e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.076052 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4262  beta-lactamase  26.2 
 
 		 695 aa  89  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4612  beta-lactamase  28.57 
 
 		 677 aa  87.8  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0634  beta-lactamase  27.55 
 
 		 661 aa  87.4  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.232968 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  26.79 
 
 		 966 aa  87.4  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1357  beta-lactamase  23.23 
 
 		 378 aa  86.7  6e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0467  beta-lactamase  25.73 
 
 		 520 aa  86.3  9e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  22.19 
 
 		 505 aa  85.9  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  23.78 
 
 		 447 aa  85.5  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  24.19 
 
 		 453 aa  85.9  0.000000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2916  penicillin-binding protein  24.46 
 
 		 691 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3823  beta-lactamase  26.67 
 
 		 398 aa  85.5  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1465  beta-lactamase  29.6 
 
 		 657 aa  85.5  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.16455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0471  beta-lactamase  24.84 
 
 		 616 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  24.79 
 
 		 477 aa  84.7  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3017  beta-lactamase  24.5 
 
 		 694 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151965  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3223  putative penicillin-binding protein  24.46 
 
 		 691 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3032  beta-lactamase  25.7 
 
 		 507 aa  84.3  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.436003 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2036  putative penicillin-binding protein  24.46 
 
 		 691 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0201  beta-lactamase  25.37 
 
 		 530 aa  84.3  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.494145 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0999  beta-lactamase  24.93 
 
 		 367 aa  84.3  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0117018 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2989  penicillin-binding protein  24.1 
 
 		 691 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3214  penicillin-binding protein  24.1 
 
 		 691 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38843  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2294  penicillin-binding protein, putative  24.12 
 
 		 434 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272122  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2400  penicillin-binding protein  25.6 
 
 		 481 aa  82  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443561  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2575  penicillin-binding protein  25.6 
 
 		 481 aa  82  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  28.79 
 
 		 476 aa  82  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2231  beta-lactamase  27.11 
 
 		 384 aa  82  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2579  penicillin-binding protein, putative  31.05 
 
 		 483 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0220569  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0098  beta-lactamase  27.81 
 
 		 691 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2587  putative penicillin-binding protein  24.78 
 
 		 463 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35213e-17 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0498  beta-lactamase  24.93 
 
 		 502 aa  80.9  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.472446  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1955  beta-lactamase  24.8 
 
 		 694 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.1377  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1923  beta-lactamase  24.56 
 
 		 389 aa  80.5  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1621  beta-lactamase  23.39 
 
 		 426 aa  80.5  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.193235  normal  0.330681 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2353  penicillin-binding protein  26.05 
 
 		 481 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000218323  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3564  beta-lactamase  28.63 
 
 		 397 aa  80.1  0.00000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0675  beta-lactamase  27.08 
 
 		 377 aa  80.1  0.00000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1671  beta-lactamase  24.25 
 
 		 633 aa  79.7  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2629  putative penicillin-binding protein  30.53 
 
 		 490 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0110315  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0723  beta-lactamase  25.73 
 
 		 511 aa  79.7  0.00000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000618645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2198  beta-lactamase  24.84 
 
 		 543 aa  79  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.176904  normal  0.0317754 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4591  beta-lactamase  21.61 
 
 		 675 aa  79.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.434255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2468  beta-lactamase  23.44 
 
 		 498 aa  79.3  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00176956  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3205  putative penicillin-binding protein  27.08 
 
 		 694 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3362  beta-lactamase  24.52 
 
 		 717 aa  79  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.450789  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>