129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0650 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0650  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 323 aa  652    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3245  UspA domain-containing protein  43.61 
 
 		 314 aa  263  2e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1290  UspA domain-containing protein  41.36 
 
 		 313 aa  234  1.0000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.85216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3226  UspA domain-containing protein  41.41 
 
 		 313 aa  232  6e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1330  UspA domain-containing protein  41.19 
 
 		 307 aa  218  1e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1790  UspA domain-containing protein  37.03 
 
 		 310 aa  212  4.9999999999999996e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.238158  normal  0.669645 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0808  UspA domain-containing protein  38.05 
 
 		 309 aa  212  5.999999999999999e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.188689  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1331  UspA domain-containing protein  35 
 
 		 303 aa  192  8e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1329  UspA domain-containing protein  31.85 
 
 		 307 aa  138  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.457435  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1866  UspA domain-containing protein  26.71 
 
 		 310 aa  94.7  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1288  UspA domain protein  26.91 
 
 		 292 aa  87.8  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.428871 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0534  UspA domain protein  34.21 
 
 		 151 aa  86.3  6e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1237  hypothetical protein  24.38 
 
 		 313 aa  86.3  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.454178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0701  UspA domain protein  24.76 
 
 		 288 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0159  UspA domain-containing protein  32.69 
 
 		 157 aa  79.7  0.00000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000906584  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2678  UspA domain-containing protein  23.82 
 
 		 318 aa  77.4  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.159389 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0181  UspA domain-containing protein  31.71 
 
 		 162 aa  77  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.243572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  26.1 
 
 		 304 aa  74.7  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  26.46 
 
 		 320 aa  72.8  0.000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2062  UspA domain protein  32.52 
 
 		 163 aa  68.6  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1094  hypothetical protein  30 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.604509  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  34.67 
 
 		 141 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1042  UspA domain-containing protein  29.11 
 
 		 150 aa  63.5  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0801176  hitchhiker  0.000626372 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2870  UspA domain-containing protein  27.14 
 
 		 288 aa  61.2  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  26.79 
 
 		 291 aa  61.6  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2375  UspA domain protein  29.78 
 
 		 169 aa  59.7  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.561206  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1759  universal stress protein  24.09 
 
 		 298 aa  56.2  0.0000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2309  hypothetical protein  22.78 
 
 		 295 aa  55.1  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  25.16 
 
 		 145 aa  54.7  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  29.41 
 
 		 140 aa  54.7  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  24.76 
 
 		 293 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1268  universal stress protein  26.4 
 
 		 315 aa  52  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3847  UspA domain protein  30.63 
 
 		 145 aa  52.4  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000916772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  29.68 
 
 		 143 aa  52  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1177  UspA domain protein  29.21 
 
 		 211 aa  51.2  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.368824  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0497  UspA domain protein  30.77 
 
 		 310 aa  50.8  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  30.77 
 
 		 139 aa  50.4  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4632  UspA domain protein  26.07 
 
 		 309 aa  50.1  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4568  hypothetical protein  29.94 
 
 		 173 aa  50.1  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3774  UspA domain-containing protein  25.3 
 
 		 317 aa  49.7  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143188  normal  0.471237 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0036  universal stress protein  29.94 
 
 		 155 aa  49.3  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  25.25 
 
 		 296 aa  49.3  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0954  UspA domain protein  25 
 
 		 140 aa  49.3  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.548739  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  24.55 
 
 		 305 aa  48.9  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  29.33 
 
 		 160 aa  49.3  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0762  UspA domain protein  25.9 
 
 		 148 aa  48.9  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5068  Universal stress protein  23.17 
 
 		 284 aa  48.9  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  25.85 
 
 		 290 aa  48.9  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3112  UspA domain-containing protein  24.85 
 
 		 290 aa  48.1  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615607  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3816  UspA domain protein  25.5 
 
 		 142 aa  47.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0222227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  33.7 
 
 		 141 aa  48.1  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2770  UspA domain protein  26.37 
 
 		 298 aa  48.1  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0325172  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2330  UspA domain protein  28.46 
 
 		 157 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0361  UspA domain protein  28.12 
 
 		 293 aa  47.8  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2381  UspA domain protein  28.46 
 
 		 157 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.726392 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  27.67 
 
 		 150 aa  47.4  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0206  UspA domain-containing protein  23.42 
 
 		 294 aa  47.4  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  25.88 
 
 		 164 aa  47.4  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0105  universal stress protein  25.31 
 
 		 319 aa  47  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  29.03 
 
 		 140 aa  47  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1525  universal stress family protein  25.62 
 
 		 315 aa  47  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2716  UspA domain protein  24.38 
 
 		 154 aa  47.4  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2222  hypothetical protein  27.22 
 
 		 156 aa  46.6  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.544254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  22.37 
 
 		 288 aa  47  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0032  universal stress protein  31.18 
 
 		 155 aa  46.6  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0048  hypothetical protein  23.97 
 
 		 313 aa  46.6  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2091  UspA domain-containing protein  29.05 
 
 		 140 aa  46.6  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10254  normal  0.0585614 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2228  UspA domain-containing protein  24.9 
 
 		 278 aa  46.6  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.424583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1185  universal stress protein  31.18 
 
 		 155 aa  46.6  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1465  universal stress protein  31.18 
 
 		 155 aa  46.6  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1610  universal stress family protein  25.31 
 
 		 315 aa  46.6  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0038  universal stress protein  31.18 
 
 		 155 aa  46.6  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1517  UspA domain protein  26.45 
 
 		 148 aa  46.2  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.346414  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  33.7 
 
 		 140 aa  46.2  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5241  UspA domain protein  27.7 
 
 		 154 aa  46.2  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639442 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0023  universal stress protein  28.57 
 
 		 137 aa  45.4  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1409  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  35.29 
 
 		 152 aa  45.8  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.108766  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0038  universal stress family protein  31.18 
 
 		 155 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.98264  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1124  UspA domain-containing protein  25.32 
 
 		 282 aa  45.8  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  30.26 
 
 		 138 aa  45.8  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1686  UspA domain protein  28.22 
 
 		 141 aa  45.4  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00978672  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  46.51 
 
 		 143 aa  44.7  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3786  UspA domain-containing protein  23.82 
 
 		 311 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5324  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  23.72 
 
 		 305 aa  44.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4253  UspA domain-containing protein  23.96 
 
 		 314 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0870  UspA domain protein  26.28 
 
 		 140 aa  44.3  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3480  UspA domain protein  27.92 
 
 		 155 aa  44.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1677  hypothetical protein  27.4 
 
 		 150 aa  44.3  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0048801  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3063  hypothetical protein  24.29 
 
 		 297 aa  43.9  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  27.92 
 
 		 148 aa  44.3  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  24.16 
 
 		 143 aa  43.9  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0052  universal stress protein  30.59 
 
 		 155 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  29.73 
 
 		 142 aa  44.3  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  27.44 
 
 		 147 aa  44.3  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  27.74 
 
 		 141 aa  44.3  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0641  UspA domain-containing protein  28.87 
 
 		 314 aa  43.9  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4478  UspA domain-containing protein  29.01 
 
 		 164 aa  43.9  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108103 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0391  UspA domain-containing protein  28.12 
 
 		 142 aa  43.9  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.308438 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4785  UspA domain protein  24.03 
 
 		 157 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2777  hypothetical protein  27.75 
 
 		 307 aa  43.9  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>