More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0206 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0206  UspA domain-containing protein  100 
 
 
294 aa  580  1e-164  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  31.16 
 
 
292 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  31.16 
 
 
292 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  31.16 
 
 
292 aa  75.9  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12063  hypothetical protein  29.45 
 
 
294 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  28.47 
 
 
294 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  28.47 
 
 
294 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5820  UspA domain-containing protein  28.15 
 
 
318 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.131616 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  27.8 
 
 
294 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4985  UspA domain-containing protein  28.81 
 
 
275 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0866  UspA domain protein  29.55 
 
 
280 aa  68.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.111703  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  28.62 
 
 
294 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  28.62 
 
 
294 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  28.62 
 
 
294 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1415  UspA domain-containing protein  29.63 
 
 
295 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542243  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08260  universal stress protein UspA-like protein  28.46 
 
 
309 aa  67  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144181  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6247  UspA domain-containing protein  31.2 
 
 
313 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.887249 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  32.32 
 
 
288 aa  65.9  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2210  universal stress protein UspA  31.01 
 
 
149 aa  65.5  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  27.8 
 
 
295 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  27.8 
 
 
295 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  27.8 
 
 
295 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0991  hypothetical protein  25.08 
 
 
294 aa  64.7  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  31.52 
 
 
297 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  30.05 
 
 
289 aa  63.5  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  28.48 
 
 
293 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  27.24 
 
 
290 aa  62.4  0.000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12642  hypothetical protein  27.57 
 
 
297 aa  62  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  25.83 
 
 
297 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  30.1 
 
 
293 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  30.1 
 
 
293 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  26.26 
 
 
293 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12037  hypothetical protein  28.52 
 
 
295 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  27.08 
 
 
305 aa  60.8  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  30.1 
 
 
293 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  26.67 
 
 
145 aa  60.5  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  24.76 
 
 
300 aa  60.1  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  28.25 
 
 
303 aa  60.1  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5604  UspA domain protein  26.07 
 
 
317 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.945797  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  35.07 
 
 
140 aa  60.5  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5362  UspA domain-containing protein  29.12 
 
 
341 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  31.49 
 
 
297 aa  59.7  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  30.11 
 
 
304 aa  59.7  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4981  hypothetical protein  29.12 
 
 
341 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5069  UspA domain-containing protein  29.12 
 
 
341 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  24.44 
 
 
449 aa  59.3  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  27.55 
 
 
277 aa  58.5  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4978  UspA domain-containing protein  27.74 
 
 
293 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3063  hypothetical protein  27.07 
 
 
297 aa  58.9  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0105  universal stress protein  27.19 
 
 
319 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22880  universal stress protein UspA-like protein  26.47 
 
 
303 aa  58.2  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.538505  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5277  UspA domain protein  27.1 
 
 
308 aa  57.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1525  universal stress family protein  27.19 
 
 
315 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1610  universal stress family protein  27.19 
 
 
315 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2716  UspA domain protein  31.41 
 
 
154 aa  57.4  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  26.92 
 
 
295 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0989  UspA domain-containing protein  29.51 
 
 
300 aa  57  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  31.11 
 
 
140 aa  57  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  28.39 
 
 
288 aa  57  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1409  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  28.67 
 
 
152 aa  56.6  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.108766  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3304  UspA domain protein  35.51 
 
 
144 aa  56.6  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4059  UspA domain protein  31.8 
 
 
288 aa  55.8  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  25.16 
 
 
415 aa  55.8  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  30.37 
 
 
277 aa  55.8  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  32.17 
 
 
153 aa  55.8  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3034  hypothetical protein  29.9 
 
 
314 aa  55.8  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.941383  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  27.94 
 
 
280 aa  55.8  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1892  UspA domain-containing protein  29.7 
 
 
294 aa  55.8  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281928  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  29.97 
 
 
292 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2564  UspA domain protein  28.65 
 
 
282 aa  55.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.143275  normal  0.0151057 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6234  UspA domain-containing protein  25.83 
 
 
316 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.894885  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1288  UspA domain protein  27.24 
 
 
292 aa  55.1  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.428871 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  29.84 
 
 
293 aa  55.5  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  34.31 
 
 
159 aa  55.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  27.21 
 
 
145 aa  55.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  27.36 
 
 
291 aa  55.5  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4870  UspA domain-containing protein  31.07 
 
 
276 aa  55.5  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2614  universal stress protein  29.9 
 
 
280 aa  54.7  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  32.62 
 
 
141 aa  55.1  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1257  UspA domain protein  41.46 
 
 
136 aa  53.9  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  30.71 
 
 
142 aa  53.9  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3452  UspA domain-containing protein  28.36 
 
 
289 aa  54.3  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2091  UspA domain-containing protein  35.51 
 
 
140 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10254  normal  0.0585614 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  31.16 
 
 
145 aa  53.5  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2567  UspA domain protein  26.97 
 
 
325 aa  53.5  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5174  hypothetical protein  31.65 
 
 
147 aa  53.5  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3112  UspA domain-containing protein  23.74 
 
 
290 aa  53.5  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615607  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0948  UspA domain-containing protein  27.59 
 
 
290 aa  53.5  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00710468  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0101  UspA domain protein  31.43 
 
 
141 aa  53.1  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3441  UspA domain-containing protein  25.34 
 
 
271 aa  53.1  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.118762  normal  0.680607 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  27.21 
 
 
145 aa  53.5  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1268  universal stress protein  25.62 
 
 
315 aa  53.1  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3774  UspA domain-containing protein  25.23 
 
 
317 aa  53.1  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143188  normal  0.471237 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0292  UspA domain protein  28.12 
 
 
303 aa  53.1  0.000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  27.01 
 
 
314 aa  53.1  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  27.21 
 
 
145 aa  53.1  0.000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19610  universal stress protein UspA-like protein  27.6 
 
 
306 aa  52.8  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.697757  normal  0.0279477 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  34.04 
 
 
158 aa  53.1  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1242  UspA domain protein  28.53 
 
 
294 aa  52.8  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.683026  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  26.28 
 
 
307 aa  52.8  0.000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>