204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0824 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0824  arginine biosynthesis bifunctional glutamate N-acetyltransferase/amino-acid acetyltransferase  100 
 
 		 708 aa  1446    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0582843  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6419  von Willebrand factor type A  45.08 
 
 		 706 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.803942 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4506  von Willebrand factor type A  57.96 
 
 		 698 aa  561  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.407878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1049  von Willebrand factor, type A  58.51 
 
 		 555 aa  538  1e-151  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.691019  normal  0.362005 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5984  von Willebrand factor type A  56.52 
 
 		 654 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.045393  normal  0.108716 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1015  von Willebrand (VWA) domain-containing protein  54.8 
 
 		 651 aa  510  1e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0841  von Willebrand factor, type A  53.97 
 
 		 686 aa  511  1e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.306061 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3424  von Willebrand factor type A  54.95 
 
 		 592 aa  509  1e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2675  von Willebrand factor, type A  54.16 
 
 		 651 aa  509  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.260015 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1139  von Willebrand factor type A  50.48 
 
 		 642 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1105  von Willebrand factor type A  50.19 
 
 		 642 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3252  von Willebrand factor type A  50.86 
 
 		 627 aa  484  1e-135  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00246065 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3319  von Willebrand factor type A  51.99 
 
 		 640 aa  481  1e-134  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.041713  hitchhiker  0.00219291 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1077  von Willebrand factor, type A  50.83 
 
 		 612 aa  479  1e-134  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0195033  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1038  von Willebrand factor type A  49.62 
 
 		 642 aa  478  1e-133  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0158  von Willebrand factor type A  51.03 
 
 		 625 aa  473  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3153  von Willebrand factor, type A  50.21 
 
 		 613 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.573485  normal  0.703806 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3055  von Willebrand factor, type A  43.5 
 
 		 625 aa  462  1e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.548122 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1043  von Willebrand factor, type A  48.65 
 
 		 633 aa  464  1e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.359154  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3552  von Willebrand factor type A domain-containing protein  48.03 
 
 		 621 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2973  von Willebrand factor, type A  43.19 
 
 		 624 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00160061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0183  von Willebrand factor, type A  48.95 
 
 		 563 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.174598  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1196  von Willebrand factor type A  50.95 
 
 		 639 aa  450  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3075  von Willebrand factor, type A  49.06 
 
 		 536 aa  440  9.999999999999999e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0477  von Willebrand factor, type A  47.47 
 
 		 571 aa  440  9.999999999999999e-123  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2700  von Willebrand factor, type A  48.4 
 
 		 566 aa  429  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.557808  normal  0.158328 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0187  von Willebrand factor type A  48.76 
 
 		 613 aa  426  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.592381 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5035  von Willebrand factor, type A  48.75 
 
 		 709 aa  425  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.668602  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1986  von Willebrand factor type A  47.75 
 
 		 792 aa  422  1e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.093276 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1387  von Willebrand factor type A  44.98 
 
 		 575 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.336718  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2426  von Willebrand factor type A domain-containing protein  44.21 
 
 		 588 aa  402  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2419  von Willebrand factor type A domain-containing protein  44.98 
 
 		 575 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.433183  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2659  von Willebrand factor, type A  43.61 
 
 		 593 aa  399  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.101316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2451  von Willebrand factor type A domain protein  43.4 
 
 		 598 aa  398  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0263  von Willebrand factor type A  43.16 
 
 		 551 aa  353  7e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17360  uncharacterized protein containing a von Willebrand factor type A (vWA) domain  43.35 
 
 		 629 aa  325  2e-87  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.390594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1063  von Willebrand factor type A  45.71 
 
 		 555 aa  323  9.000000000000001e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000708626 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01616  von Willebrand factor type A domain protein  48.85 
 
 		 350 aa  303  6.000000000000001e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6907  von Willebrand factor type A  37.42 
 
 		 588 aa  286  8e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.131426 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2141  von Willebrand factor type A  35.91 
 
 		 610 aa  274  4.0000000000000004e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7212  von Willebrand factor type A domain protein  34.97 
 
 		 490 aa  235  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548543  normal  0.0992669 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0155  von Willebrand factor type A  38.02 
 
 		 500 aa  234  3e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0565906 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0325  von Willebrand factor type A  28.7 
 
 		 859 aa  174  6.999999999999999e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313972 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5407  von Willebrand factor type A  35.23 
 
 		 935 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.462507 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4385  von Willebrand factor type A domain-containing protein  26.74 
 
 		 451 aa  96.7  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1306  von Willebrand factor type A domain-containing protein  25.88 
 
 		 460 aa  95.9  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.478577  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0254  von Willebrand factor, type A  31.16 
 
 		 615 aa  95.1  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000406076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1416  von Willebrand factor type A  25.88 
 
 		 472 aa  94.7  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2761  von Willebrand factor type A domain-containing protein  25.88 
 
 		 472 aa  94.4  6e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00899229  hitchhiker  0.00197042 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6336  von Willebrand factor type A  26.07 
 
 		 808 aa  91.7  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1234  von Willebrand factor type A  30.61 
 
 		 412 aa  87.4  8e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.723207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7173  von Willebrand factor type A  30.66 
 
 		 462 aa  87  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3380  von Willebrand factor, type A  31.5 
 
 		 459 aa  85.9  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178617  hitchhiker  0.00546751 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0166  von Willebrand factor type A  24.67 
 
 		 411 aa  85.5  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.345771 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2631  von Willebrand factor type A domain-containing protein  28.91 
 
 		 442 aa  84.3  0.000000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.813188  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6113  von Willebrand factor type A  29.64 
 
 		 430 aa  84.3  0.000000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2244  von Willebrand factor, type A  28.64 
 
 		 416 aa  83.6  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0785649  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1463  von Willebrand factor, type A  28.96 
 
 		 425 aa  82  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197313  normal  0.691375 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2162  von Willebrand factor type A  29.8 
 
 		 425 aa  79.3  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.314741  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5121  von Willebrand factor type A  25.38 
 
 		 419 aa  76.3  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.104188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3616  von Willebrand factor, type A  28.7 
 
 		 479 aa  76.3  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304653  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0262  von Willebrand factor type A  30.95 
 
 		 418 aa  74.7  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0264  von Willebrand factor type A  30.95 
 
 		 418 aa  74.3  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1308  von Willebrand factor, type A  28.65 
 
 		 427 aa  72.4  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3732  von Willebrand factor type A  26.15 
 
 		 418 aa  73.2  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.285175  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2950  von Willebrand factor type A  29.48 
 
 		 426 aa  72  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  31.03 
 
 		 418 aa  71.2  0.00000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0755  von Willebrand factor type A  27.78 
 
 		 418 aa  71.2  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.802956 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2768  von Willebrand factor, type A  24.48 
 
 		 412 aa  68.9  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1248  von Willebrand factor type A  23.7 
 
 		 592 aa  68.2  0.0000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3203  von Willebrand factor type A  32.52 
 
 		 421 aa  67.8  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0603  von Willebrand factor, type A  35.82 
 
 		 316 aa  66.6  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.623778  normal  0.0597521 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3922  vault protein inter-alpha-trypsin  25.35 
 
 		 701 aa  67  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3077  hypothetical protein  26.2 
 
 		 816 aa  64.7  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155814  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1307  von Willebrand factor, type A  32.74 
 
 		 418 aa  64.3  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0723  von Willebrand factor type A  29.02 
 
 		 419 aa  64.3  0.000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0959383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1735  von Willebrand factor type A  29.05 
 
 		 918 aa  64.3  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3690  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  28.49 
 
 		 680 aa  63.5  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4043  von Willebrand factor type A  25 
 
 		 423 aa  62.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4090  hypothetical protein  26.25 
 
 		 602 aa  62.4  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0826588 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2410  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  30.19 
 
 		 751 aa  62  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.177672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2277  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  28.57 
 
 		 755 aa  61.2  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0645539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2206  BatA  35.29 
 
 		 317 aa  60.8  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0553658  normal  0.0945164 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4210  von Willebrand factor type A  24.12 
 
 		 421 aa  60.5  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.466753  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4211  von Willebrand factor type A  26.48 
 
 		 415 aa  60.1  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.290242  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3969  von Willebrand factor type A  31.28 
 
 		 480 aa  59.3  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1806  hypothetical protein  30.46 
 
 		 316 aa  59.7  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.539334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2394  von Willebrand factor type A  23.83 
 
 		 412 aa  59.3  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1843  von Willebrand factor, type A  26.53 
 
 		 420 aa  58.9  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3260  von Willebrand factor type A  23.5 
 
 		 903 aa  58.2  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0740764 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2762  von Willebrand factor type A  24.68 
 
 		 452 aa  58.2  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.23614  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3551  von Willebrand factor type A  26.15 
 
 		 505 aa  57.8  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104304  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3275  von Willebrand factor type A  26.02 
 
 		 419 aa  57.8  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3755  von Willebrand factor type A  26.13 
 
 		 958 aa  57.4  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00649102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1641  von Willebrand factor type A  37.93 
 
 		 316 aa  56.6  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3544  von Willebrand factor, type A  30.27 
 
 		 966 aa  57  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2200  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  27.14 
 
 		 759 aa  55.8  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1877  cell wall anchor domain-containing protein  29.05 
 
 		 771 aa  56.6  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.581761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1994  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  26.74 
 
 		 671 aa  55.5  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.204714  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3119  von Willebrand factor type A  22.75 
 
 		 393 aa  55.5  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>