More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_2044 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0162  TonB-dependent receptor  53.62 
 
 		 817 aa  646    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  77.59 
 
 		 841 aa  1018    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  75.27 
 
 		 843 aa  999    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  81.6 
 
 		 853 aa  1068    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2044  TonB-dependent receptor, plug  100 
 
 		 709 aa  1445    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0644838  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  83.72 
 
 		 853 aa  1089    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  76.64 
 
 		 839 aa  1014    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  83.18 
 
 		 855 aa  1100    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2075  TonB-dependent receptor  83.18 
 
 		 855 aa  1084    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00318528  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  83.72 
 
 		 853 aa  1089    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  73.91 
 
 		 842 aa  996    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  72.07 
 
 		 836 aa  965    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  80.66 
 
 		 853 aa  1073    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  87.39 
 
 		 838 aa  1174    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  83.72 
 
 		 853 aa  1090    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  42.79 
 
 		 869 aa  481  1e-134  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  42.11 
 
 		 873 aa  450  1e-125  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  42.71 
 
 		 873 aa  445  1e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1655  TonB-dependent receptor  35.24 
 
 		 930 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375074  normal  0.0861797 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1621  TonB-dependent receptor  35.24 
 
 		 930 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00153762  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2722  TonB-dependent receptor  35.24 
 
 		 930 aa  388  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000264454  hitchhiker  0.00000515529 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  35.61 
 
 		 935 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  35.61 
 
 		 935 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  35.61 
 
 		 935 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2627  TonB-dependent receptor  35.77 
 
 		 937 aa  382  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000622883  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  35.09 
 
 		 933 aa  374  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1822  TonB-dependent receptor, putative  34.81 
 
 		 936 aa  367  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3082  TonB-dependent receptor  34.83 
 
 		 965 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000538952  decreased coverage  0.0000060064 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  34.97 
 
 		 904 aa  344  2.9999999999999997e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  35.07 
 
 		 904 aa  344  2.9999999999999997e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02820  TonB-dependent receptor  35.2 
 
 		 935 aa  342  1e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00655846  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3509  TonB-dependent receptor  35.33 
 
 		 904 aa  341  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  35.18 
 
 		 904 aa  337  7e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3309  TonB-dependent receptor  32.99 
 
 		 981 aa  335  2e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.018449  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2411  TonB-dependent receptor  34.55 
 
 		 901 aa  310  6.999999999999999e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135227  normal  0.143367 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  31.96 
 
 		 897 aa  303  6.000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  32.84 
 
 		 907 aa  298  2e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2535  TonB-dependent receptor  31.52 
 
 		 966 aa  298  3e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00182165  unclonable  0.0000531763 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3757  TonB-dependent receptor  33.66 
 
 		 924 aa  297  4e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19794  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  31.77 
 
 		 953 aa  288  2e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2467  TonB-dependent receptor  31.64 
 
 		 907 aa  286  7e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000162909  hitchhiker  0.00002571 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0250  TonB-dependent receptor  30.72 
 
 		 952 aa  285  3.0000000000000004e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0819  TonB-dependent receptor plug  30.8 
 
 		 974 aa  280  8e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.712019 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1633  TonB-dependent receptor  31.12 
 
 		 938 aa  279  1e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000109848  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3061  TonB-dependent receptor plug  29.78 
 
 		 985 aa  276  8e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00588952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2404  TonB-dependent receptor  30.94 
 
 		 872 aa  270  8e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0820  TonB-dependent receptor  29.27 
 
 		 975 aa  264  4.999999999999999e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3556  TonB-dependent receptor  28.65 
 
 		 944 aa  263  1e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3424  TonB-dependent receptor  30.49 
 
 		 944 aa  262  1e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00012336  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1632  TonB-dependent receptor, plug  30.73 
 
 		 929 aa  260  7e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000717844  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2469  TonB-dependent receptor  31.09 
 
 		 891 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  31.61 
 
 		 869 aa  253  8.000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3083  TonB-dependent receptor  29.21 
 
 		 912 aa  253  1e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000522801  decreased coverage  0.000005339 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2373  TonB-dependent receptor  30.17 
 
 		 966 aa  252  1e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1868  TonB-dependent receptor  30.33 
 
 		 935 aa  252  2e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31102  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5429  TonB-dependent receptor  29.86 
 
 		 1088 aa  252  2e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0208974 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2767  TonB-dependent receptor  29.24 
 
 		 924 aa  248  4e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0740261 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2688  TonB-dependent receptor  29.24 
 
 		 924 aa  248  4e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161731  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1696  TonB-dependent receptor  29.24 
 
 		 924 aa  248  4e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.438223  hitchhiker  0.000325998 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3385  TonB-dependent receptor  29.74 
 
 		 910 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1674  TonB-dependent receptor  29.78 
 
 		 951 aa  243  1e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.215373  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01035  TonB-dependent receptor  29.13 
 
 		 946 aa  239  1e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1859  TonB-dependent receptor  30.26 
 
 		 890 aa  239  1e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127168 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00638  iron transport protein  30.75 
 
 		 827 aa  239  1e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2119  TonB-dependent receptor  30.12 
 
 		 890 aa  237  6e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.817127  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2993  TonB-dependent receptor  30.68 
 
 		 966 aa  236  8e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000340556  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  29.76 
 
 		 875 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02600  TonB-dependent receptor  28.4 
 
 		 981 aa  234  3e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2471  TonB-dependent receptor  29.86 
 
 		 957 aa  234  5e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.464894  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0124  TonB-dependent receptor  29.45 
 
 		 951 aa  233  1e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000377031  unclonable  0.0000000000937896 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1914  TonB-dependent receptor  30.01 
 
 		 890 aa  232  1e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073326 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1503  outer membrane receptor protein  27.29 
 
 		 899 aa  233  1e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3760  TonB-dependent receptor  28.96 
 
 		 967 aa  232  2e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.155087  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2653  TonB-dependent receptor  28.8 
 
 		 948 aa  232  2e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0810982  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0341  TonB-dependent receptor  29.58 
 
 		 909 aa  231  4e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000307773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0516  TonB-dependent receptor  29.37 
 
 		 909 aa  229  1e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0428705 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0837  TonB-dependent receptor  29.89 
 
 		 855 aa  229  1e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111272  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3321  TonB-dependent receptor  27.85 
 
 		 987 aa  228  4e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0185531  normal  0.64896 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1569  TonB-dependent receptor  29.11 
 
 		 869 aa  227  6e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000550471  decreased coverage  0.0000000582733 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2875  TonB-dependent receptor plug  27.89 
 
 		 896 aa  225  2e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943225 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2393  TonB-dependent receptor  31.01 
 
 		 866 aa  224  4e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.228025  normal  0.562058 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2385  TonB-dependent receptor, plug  27.56 
 
 		 895 aa  223  9e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000246068  hitchhiker  0.00510046 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0738  TonB-dependent receptor  30.24 
 
 		 847 aa  221  3e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0108325  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1716  TonB-dependent receptor, plug  28.33 
 
 		 893 aa  220  6e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.716976  hitchhiker  0.000145025 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1513  TonB-dependent receptor  29.28 
 
 		 964 aa  218  2e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2263  TonB-dependent receptor  30.19 
 
 		 882 aa  218  2e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.594677  normal  0.894337 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0404  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 896 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0380405  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2049  TonB-dependent receptor  29.81 
 
 		 867 aa  217  5e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115789  normal  0.0404089 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1986  TonB-dependent receptor  29.5 
 
 		 867 aa  216  9e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.430479  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2001  TonB-dependent receptor  29.65 
 
 		 867 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00988263  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0477  TonB-dependent receptor  30.08 
 
 		 879 aa  216  9.999999999999999e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1691  TonB-dependent receptor  29.2 
 
 		 894 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4165  TonB-dependent receptor  28.91 
 
 		 947 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00322624  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2699  TonB-dependent receptor  30.59 
 
 		 886 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.475317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2338  TonB-dependent receptor  29.73 
 
 		 867 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.094918  normal  0.111511 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2335  TonB-dependent receptor  29.94 
 
 		 882 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0682535  normal  0.0458053 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1100  outer membrane receptor protein  29.15 
 
 		 922 aa  215  2.9999999999999995e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000948721  hitchhiker  0.00320832 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2624  TonB-dependent receptor  30.45 
 
 		 886 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0750923  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1810  TonB-dependent receptor, plug  28.21 
 
 		 961 aa  213  9e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0488165  normal  0.142718 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3740  TonB-dependent receptor  30.94 
 
 		 901 aa  211  5e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488195 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>