283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0956 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_0964  TrkA domain-containing protein  98.43 
 
 		 574 aa  1108    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0665  TrkA domain-containing protein  77.35 
 
 		 574 aa  874    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0956  TrkA-C domain protein  100 
 
 		 574 aa  1118    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0961  TrkA-C  80.14 
 
 		 574 aa  912    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3070  TrkA domain-containing protein  91.46 
 
 		 574 aa  953    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.748598 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0902  TrkA domain-containing protein  91.46 
 
 		 574 aa  954    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3185  TrkA domain-containing protein  79.79 
 
 		 574 aa  878    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0865  TrkA domain-containing protein  91.64 
 
 		 574 aa  962    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3041  TrkA domain-containing protein  95.64 
 
 		 574 aa  1049    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0930  TrkA domain-containing protein  98.61 
 
 		 574 aa  1110    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3406  TrkA domain-containing protein  98.43 
 
 		 574 aa  1107    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0422  ion transporter superfamily protein  53.42 
 
 		 575 aa  575  1.0000000000000001e-163  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001705  sulfate permease Trk-type  53 
 
 		 574 aa  578  1.0000000000000001e-163  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00768  hypothetical protein  52.47 
 
 		 574 aa  550  1e-155  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2889  putative sodium/sulfate symporter  48.88 
 
 		 583 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2959  TrkA domain-containing protein  47.39 
 
 		 575 aa  457  1e-127  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2986  TrkA domain-containing protein  46.42 
 
 		 575 aa  442  1e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479743  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2144  putative transporter  46.42 
 
 		 575 aa  439  9.999999999999999e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1499  TrkA-C domain protein  45.77 
 
 		 579 aa  439  9.999999999999999e-123  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96712  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1688  TrkA domain-containing protein  45.64 
 
 		 575 aa  429  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0799  potasium uptake protein  44.31 
 
 		 575 aa  424  1e-117  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00652417 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1424  TrkA domain-containing protein  44.08 
 
 		 575 aa  415  1e-114  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0976124  normal  0.0212336 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1395  TrkA-C domain protein  45.86 
 
 		 578 aa  384  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.096414  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1647  TrkA-C  43.56 
 
 		 575 aa  379  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02717  putative transporter  41.37 
 
 		 574 aa  365  2e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1530  TrkA-C domain protein  35.76 
 
 		 591 aa  336  7.999999999999999e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1684  TrkA-like protein  36.52 
 
 		 588 aa  325  2e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2793  TrkA domain-containing protein  33.74 
 
 		 588 aa  313  3.9999999999999997e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2621  TrkA domain-containing protein  36.71 
 
 		 588 aa  313  4.999999999999999e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0998803  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1175  TrkA-C, di- and tricarboxylate transporters  36.07 
 
 		 589 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1106  TrkA-like protein  35.79 
 
 		 589 aa  301  2e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1857  TrkA-C domain protein  34.98 
 
 		 591 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1749  TrkA-C domain protein  34.19 
 
 		 593 aa  284  4.0000000000000003e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.0276756 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4989  Citrate transporter  34.08 
 
 		 592 aa  283  8.000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.516998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2351  TrkA domain-containing protein  34.69 
 
 		 588 aa  277  3e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119552  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2347  TrkA domain-containing protein  33.79 
 
 		 588 aa  275  2.0000000000000002e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_1343  DASS family transporter: sodium ion/sulfate  33.94 
 
 		 583 aa  272  9e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.351628  normal  0.572139 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1861  citrate transporter  32.52 
 
 		 587 aa  270  4e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2312  DASS family sodium/sulfate transporter  33.28 
 
 		 605 aa  258  2e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.160189 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0381  DASS family sodium/sulfate transporter  32.42 
 
 		 601 aa  253  9.000000000000001e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2317  TrkA domain-containing protein  31.63 
 
 		 588 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2066  TrkA domain-containing protein  34.41 
 
 		 598 aa  244  1.9999999999999999e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233721 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01481  DASS family sodium/sulfate transporter  31.28 
 
 		 605 aa  237  5.0000000000000005e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1447  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  31.28 
 
 		 605 aa  236  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.629217  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2448  TrkA domain-containing protein  33.7 
 
 		 575 aa  233  5e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00921  DASS family sodium/sulfate transporter  31.9 
 
 		 609 aa  233  7.000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4947  TrkA-C domain protein  30.73 
 
 		 597 aa  232  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.816628 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39202  DASS family transporter: sodium ion/sulfate  31.31 
 
 		 634 aa  230  4e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.21287 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1490  TrkA-C domain protein  29.75 
 
 		 624 aa  228  2e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.149438 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2309  TrkA domain-containing protein  30.38 
 
 		 592 aa  226  6e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.887231  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0656  sodium/sulphate symporter  30.38 
 
 		 592 aa  226  1e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0557  citrate transporter  30.53 
 
 		 596 aa  225  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015136 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3512  TrkA domain-containing protein  31.25 
 
 		 608 aa  224  2e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0576  TrkA domain-containing protein  31.24 
 
 		 592 aa  224  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.60388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02561  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  31.99 
 
 		 606 aa  224  4e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0606  putative membrane transport protein  29.84 
 
 		 588 aa  222  9.999999999999999e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252017  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00951  DASS family sodium/sulfate transporter  30.56 
 
 		 602 aa  217  4e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.8674  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0086  DASS family sodium/sulfate transporter  30.32 
 
 		 602 aa  216  7e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.121034  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00961  DASS family sodium/sulfate transporter  30.39 
 
 		 602 aa  215  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.531259  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1726  citrate transporter  29.36 
 
 		 588 aa  214  2.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22453  predicted protein  31.61 
 
 		 622 aa  214  3.9999999999999995e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4471  TrkA-C domain protein  29.28 
 
 		 596 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0475  citrate transporter  30.29 
 
 		 632 aa  211  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00931  DASS family sodium/sulfate transporter  31.37 
 
 		 602 aa  212  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.490599  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4408  TrkA-C domain protein  28.92 
 
 		 596 aa  211  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4508  TrkA domain-containing protein  28.75 
 
 		 592 aa  211  3e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.951327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3458  TrkA domain-containing protein  29.28 
 
 		 605 aa  207  5e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3383  TrkA-like  28.36 
 
 		 593 aa  206  7e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_14922  predicted protein  32.37 
 
 		 572 aa  206  8e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1899  TrkA-C  32.17 
 
 		 592 aa  206  9e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1409  citrate transporter  28.29 
 
 		 613 aa  204  3e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000118186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1941  TrkA-C domain protein  28.7 
 
 		 623 aa  203  6e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0038  TrkA-C domain protein  27.77 
 
 		 596 aa  202  9e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0040  TrkA-C domain protein  27.59 
 
 		 602 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2884  TrkA domain-containing protein  32.09 
 
 		 619 aa  199  1.0000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123208 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1558  TrkA domain-containing protein  29.21 
 
 		 613 aa  198  2.0000000000000003e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.256635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0766  Citrate transporter  27.63 
 
 		 621 aa  197  5.000000000000001e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2058  citrate transporter  29.98 
 
 		 609 aa  197  5.000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0867  TrkA-C domain protein  30.66 
 
 		 614 aa  196  1e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18544  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3033  citrate transporter  29.67 
 
 		 612 aa  196  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0170  Citrate transporter  25.25 
 
 		 619 aa  195  2e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0693  TrkA domain-containing protein  31.24 
 
 		 607 aa  194  3e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00166729  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1777  citrate transporter  29.04 
 
 		 609 aa  193  9e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1390  citrate transporter  32.51 
 
 		 581 aa  192  1e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1094  TrkA domain-containing protein  27.23 
 
 		 593 aa  191  2e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00281936  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0631  TrkA-C domain protein  28.6 
 
 		 599 aa  191  4e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3899  TrkA domain-containing protein  30.71 
 
 		 592 aa  189  1e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.345566  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2766  uncharacterized transporter  31.83 
 
 		 599 aa  187  4e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.14891 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1036  TrkA-C domain protein  29.19 
 
 		 627 aa  186  7e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.131112 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0844  Trk family potassium uptake protein  27.99 
 
 		 616 aa  186  8e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1238  hypothetical protein  26.3 
 
 		 590 aa  185  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1238  hypothetical protein  26.3 
 
 		 590 aa  184  3e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0636  Citrate transporter  30.74 
 
 		 616 aa  184  3e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315061  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0660  TrkA-C  31.33 
 
 		 596 aa  183  6e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.178336  normal  0.122015 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0635  Citrate transporter  27.65 
 
 		 622 aa  182  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3381  TrkA-like  26.54 
 
 		 591 aa  180  5.999999999999999e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3372  putative transporter  31.4 
 
 		 609 aa  180  7e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1240  citrate transporter  27.57 
 
 		 610 aa  179  1e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0417903 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2555  Citrate transporter  27.82 
 
 		 611 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0290  TrkA domain-containing protein  28.88 
 
 		 618 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>