128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_0098 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_0098  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 186 aa  378  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0095  transcriptional regulator, MarR family  95.7 
 
 		 186 aa  362  1e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0093  MarR family transcriptional regulator  95.7 
 
 		 186 aa  361  3e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4256  MarR family transcriptional regulator  95.16 
 
 		 186 aa  358  2e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0075  MarR family transcriptional regulator  86.23 
 
 		 143 aa  244  4e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0096  MarR family transcriptional regulator  76.06 
 
 		 142 aa  229  1e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0090  MarR family transcriptional regulator  76.06 
 
 		 142 aa  228  4e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0095  MarR family transcriptional regulator  75.35 
 
 		 142 aa  226  1e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2185  MarR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0547398  normal  0.15658 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2254  MarR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 144 aa  94  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2400  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 137 aa  81.6  0.000000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2687  transcriptional regulator, MarR family  38.81 
 
 		 137 aa  80.1  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.588117  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2391  transcriptional regulator, MarR family protein  31.88 
 
 		 143 aa  72  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.515688  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0312  MarR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3065  transcriptional regulator, MarR family protein  26.92 
 
 		 140 aa  63.5  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0022  transcriptional regulator, MarR family  32.77 
 
 		 146 aa  57  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4725  transcriptional regulator, MarR family  30.46 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01480  transcriptional regulator  27.01 
 
 		 169 aa  52.4  0.000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4041  transcriptional regulator, MarR family  27.83 
 
 		 148 aa  51.2  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00474505 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2289  transcriptional regulator, MarR family  31.07 
 
 		 141 aa  51.2  0.000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4315  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 193 aa  50.8  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  26.52 
 
 		 283 aa  50.4  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0083  transcriptional regulator SlyA  24.82 
 
 		 144 aa  49.3  0.00003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.404027  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6948  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 159 aa  49.7  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0124  MarR family transcriptional regulator  22.02 
 
 		 148 aa  48.9  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2015  GCN5-related N-acetyltransferase  23.78 
 
 		 306 aa  48.5  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6482  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 172 aa  48.5  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618469  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6388  transcriptional regulator, MarR family  29.89 
 
 		 149 aa  48.1  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4463  hypothetical protein  27.78 
 
 		 137 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0202449  hitchhiker  0.00964161 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3004  repressor of mar (multiple antibiotic resistance) operon  27.87 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2224  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 179 aa  46.6  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4174  MarR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 186 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.482122  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3476  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1747  transcriptional regulator, MarR family  31.19 
 
 		 144 aa  47  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17088  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  24.29 
 
 		 150 aa  47  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4805  transcriptional regulator, MarR family  28.39 
 
 		 163 aa  46.6  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5298  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 155 aa  46.2  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3635  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 158 aa  45.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0286016 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02537  putative regulatory protein, MarR  26.67 
 
 		 137 aa  45.8  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000779312  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  24.82 
 
 		 151 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2229  MarR family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 154 aa  45.4  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1807  transcriptional regulator, MarR family  25.81 
 
 		 163 aa  45.4  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  26.61 
 
 		 169 aa  45.4  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3163  transcriptional regulator MarR family  26.19 
 
 		 154 aa  45.4  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165579  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5805  transcriptional regulator, MarR family  26 
 
 		 164 aa  45.1  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 137 aa  45.1  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0331  hypothetical protein  30.17 
 
 		 165 aa  44.7  0.0007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  28.89 
 
 		 157 aa  44.7  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1137  MarR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 174 aa  44.7  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  28.71 
 
 		 157 aa  44.7  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4190  transcriptional regulator, MarR family  30.61 
 
 		 158 aa  44.7  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2483  transcriptional regulator, MarR family  28.74 
 
 		 156 aa  44.7  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.758038  normal  0.560924 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1560  MarR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 163 aa  44.7  0.0009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.853327  normal  0.443205 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4501  MarR family transcriptional regulator  24.03 
 
 		 336 aa  44.7  0.0009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3612  MarR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 171 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463026  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0666  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 169 aa  44.3  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5446  MarR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 219 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.668367 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4043  MarR family transcriptional regulator  24.03 
 
 		 326 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5843  MarR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 200 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4933  MarR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 157 aa  43.9  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 165 aa  44.3  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  27.78 
 
 		 164 aa  44.3  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2935  transcriptional regulator, MarR family  24.32 
 
 		 154 aa  43.9  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00693661  hitchhiker  0.00247077 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0761  MarR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 145 aa  43.1  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0154826  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2559  MarR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 155 aa  43.5  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5487  Transcriptional regulators-like protein  24.38 
 
 		 169 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0138039 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0263  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 151 aa  43.1  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4487  MarR family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 180 aa  43.5  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975501  hitchhiker  0.000429514 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05520  multidrug resistance operon repressor MexR  27.82 
 
 		 147 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2336  MarR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 309 aa  43.5  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2466  Transcriptional regulators-like protein  29.25 
 
 		 145 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0878491 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0709  MarR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 146 aa  43.1  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.699549  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4466  transcriptional regulator, MarR family  27.68 
 
 		 179 aa  43.5  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.120137  normal  0.0735358 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2270  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 172 aa  43.5  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.689924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2828  MarR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 142 aa  43.5  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3117  MarR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 156 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3893  transcriptional regulator, MarR family  27.1 
 
 		 149 aa  43.5  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.12829  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1642  transcriptional regulator, MarR family  22.22 
 
 		 150 aa  43.5  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2762  MarR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 142 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2575  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 139 aa  42.7  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000352452  normal  0.108495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0701  transcriptional regulator, MarR family  24.56 
 
 		 148 aa  42.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.255287  normal  0.732921 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0337  MarR family transcriptional regulator  23.58 
 
 		 191 aa  43.1  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.732334  normal  0.045327 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0853  HxlR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 159 aa  42.7  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.841358  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4161  transcriptional regulator, MarR family  27.52 
 
 		 155 aa  42.7  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000235966  normal  0.7718 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1805  transcriptional regulator SlyA  24.09 
 
 		 146 aa  43.1  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.734426  hitchhiker  0.00344529 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0728  MarR/EmrR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 168 aa  42.7  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4486  transcriptional regulator, MarR family  24.72 
 
 		 147 aa  42.7  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.021686  normal  0.0998703 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3012  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 163 aa  43.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2635  transcriptional regulator, MarR family  25.33 
 
 		 168 aa  42.7  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2749  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 163 aa  43.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0199  transcriptional regulator, MarR family  24.11 
 
 		 165 aa  42.7  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0737  MarR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 322 aa  42.4  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1325  MarR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 168 aa  42.4  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2881  MarR family transcriptional regulator  21.24 
 
 		 152 aa  42.4  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  23.44 
 
 		 142 aa  42.4  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1546  MarR family transcriptional regulator  22.41 
 
 		 161 aa  42  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.22368  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0762  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 		 178 aa  42  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  25.38 
 
 		 171 aa  42  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2856  transcriptional regulator, MarR family  26.26 
 
 		 193 aa  42  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2761  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  25.52 
 
 		 305 aa  42  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690582  normal  0.688792 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>