192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1310 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG1310  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 182 aa  370  1e-102  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000104064  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0483  transcriptional regulator  29.7 
 
 		 172 aa  76.6  0.0000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000428437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0421  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 182 aa  75.1  0.0000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06360  transcriptional regulator  26.42 
 
 		 201 aa  60.8  0.000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.589658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0758  transcriptional regulator  21.64 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000100978  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0946  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.611956  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3662  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 178 aa  54.7  0.0000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0431  TetR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 174 aa  54.3  0.0000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0738  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 184 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0636696  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1009  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 184 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.874383  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0202  putative transcriptional regulator, TetR family  27.46 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5332  putative transcriptional regulator, TetR family  22.44 
 
 		 212 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.780657 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24160  hypothetical protein  42.31 
 
 		 194 aa  52.8  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3249  transcriptional regulator, putative  27.93 
 
 		 210 aa  51.6  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00603591  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1372  transcriptional regulator, TetR family  23.48 
 
 		 221 aa  51.2  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21730  transcriptional regulator  22.62 
 
 		 179 aa  50.8  0.000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000276333  normal  0.440212 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4929  putative transcriptional regulator, TetR family  20.54 
 
 		 205 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.182818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1302  putative transcriptional regulator, TetR family  25.6 
 
 		 180 aa  50.1  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.020943  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2544  transcriptional regulator, TetR family  34.33 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.49291 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02185  transcriptional regulator  31.18 
 
 		 196 aa  49.7  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.69519  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0128  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 196 aa  49.3  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.168138  normal  0.0601393 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2558  transcriptional regulator  21.47 
 
 		 175 aa  49.7  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4244  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 212 aa  49.3  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3307  transcriptional regulator, TetR family  18.13 
 
 		 180 aa  49.3  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0386151  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0963  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 214 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.553529  normal  0.247244 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3253  transcriptional regulator  31.63 
 
 		 194 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0516477  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  25.47 
 
 		 215 aa  48.9  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1632  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 239 aa  48.1  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4599  TetR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 220 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4896  AcrR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 184 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0774  transcriptional regulator, TetR family  23.31 
 
 		 171 aa  47  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000272103  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0610  TetR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 189 aa  47.4  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.442155  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 226 aa  46.2  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0736  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 194 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116381  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0015  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 189 aa  46.6  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0696  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3963  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 193 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1007  transcriptional regulator, TetR family  30.93 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.587433  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4037  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 193 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0287  hypothetical protein  20.99 
 
 		 199 aa  46.6  0.0002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.356291  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04120  hypothetical protein  22.7 
 
 		 195 aa  46.2  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.453544  normal  0.455959 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3977  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 193 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698976  normal  0.0354344 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5087  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 196 aa  46.2  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.305126  normal  0.842071 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03160  transcriptional regulator  36.51 
 
 		 175 aa  46.2  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3469  transcriptional regulator, TetR family  25.76 
 
 		 219 aa  46.2  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.930137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25250  transcriptional regulator  35.94 
 
 		 190 aa  45.4  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.862967  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5257  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 194 aa  45.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1647  TetR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 215 aa  45.4  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2411  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 205 aa  45.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.147912 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0868  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 222 aa  45.1  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000486929  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4466  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 193 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4314  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 212 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.316546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1759  transcriptional regulator, TetR family  28.45 
 
 		 217 aa  45.1  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2565  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 248 aa  45.1  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000672076  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0356  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 235 aa  44.7  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00145185  hitchhiker  0.0000223354 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4104  TetR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 438 aa  44.7  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11281  transcriptional regulator  23.97 
 
 		 202 aa  44.7  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.786647  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1941  hypothetical protein  27.2 
 
 		 200 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000561308 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5863  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 186 aa  43.9  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602897  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1053  hypothetical protein  23.39 
 
 		 188 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00146188  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4404  TetR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 213 aa  43.9  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  28.69 
 
 		 219 aa  44.3  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0171  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 189 aa  43.9  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0874  TetR family transcriptional regulator  23.39 
 
 		 188 aa  43.5  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0686  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 197 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.863349  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0053  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 188 aa  44.3  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.573004  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0699  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 197 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.682068  normal  0.380548 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0059  nucleoid occlusion protein  29.58 
 
 		 200 aa  44.3  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0445493  normal  0.11202 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0855  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 196 aa  44.3  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179371  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0605  transcriptional regulator, TetR family  23.9 
 
 		 204 aa  43.9  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0842361  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0679  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 197 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8152  putative transcriptional regulator, TetR family  20.53 
 
 		 174 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.687421 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2778  TetR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1674  TetR family transcriptional regulator  23.02 
 
 		 192 aa  44.3  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.344236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3329  TetR family transcriptional regulator  22.46 
 
 		 197 aa  43.9  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0147538 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3795  transcriptional regulator, TetR family  34 
 
 		 202 aa  43.9  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.277058  hitchhiker  0.000257317 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 236 aa  43.9  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2205  TetR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270822 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0620  nucleoid occlusion protein  32.81 
 
 		 197 aa  43.9  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000140669 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3656  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 207 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.311417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7073  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 248 aa  44.3  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.672487  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1669  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 225 aa  43.9  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0413702  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1367  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 181 aa  44.3  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0888  TetR family transcriptional regulator  23.39 
 
 		 188 aa  43.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.845655  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0869  TetR family transcriptional regulator  23.39 
 
 		 188 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1809  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.300582  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1133  hypothetical protein  23.39 
 
 		 188 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1856  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.337362 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3055  TetR family transcriptional regulator  21.28 
 
 		 197 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170203  normal  0.155543 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1790  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.305772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2228  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 206 aa  43.5  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3637  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 228 aa  43.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5333  transcriptional regulator, TetR family  27.43 
 
 		 216 aa  43.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0533  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 398 aa  43.5  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0165878  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0132  TetR family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 204 aa  43.1  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.410533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3625  regulatory protein TetR  32.79 
 
 		 191 aa  43.5  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1863  putative transcriptional regulator, TetR family  42.22 
 
 		 217 aa  43.5  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.318019 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1059  transcriptional regulator, TetR family  25.81 
 
 		 188 aa  42.7  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2257  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 202 aa  42.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.92818  normal  0.36633 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00610  transcriptional regulator  23.72 
 
 		 205 aa  42.7  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.309946  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>