More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0664 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0664  Signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 344 aa  689    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0298  signal transduction histidine kinase  57.27 
 
 		 349 aa  350  2e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228007  hitchhiker  0.00285782 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2784  signal transduction histidine kinase  55.85 
 
 		 354 aa  347  2e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5414  signal transduction histidine kinase  55.04 
 
 		 348 aa  346  3e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4873  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  55.59 
 
 		 348 aa  334  1e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5358  signal transduction histidine kinase  55.59 
 
 		 348 aa  334  2e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2424  signal transduction histidine kinase  50.45 
 
 		 354 aa  305  9.000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.790198 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2165  signal transduction histidine kinase  49.55 
 
 		 358 aa  301  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0384  two component sensor kinase  47.75 
 
 		 344 aa  290  3e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2710  signal transduction histidine kinase  44.99 
 
 		 363 aa  285  7e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.304131  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2428  signal transduction histidine kinase  44.41 
 
 		 360 aa  280  3e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.391955  decreased coverage  0.00462713 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3023  signal transduction histidine kinase  44.22 
 
 		 361 aa  276  5e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2192  signal transduction histidine kinase  43.68 
 
 		 362 aa  275  7e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1756  Signal transduction histidine kinase  42.36 
 
 		 362 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38054  normal  0.143124 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5952  signal transduction histidine kinase  50.58 
 
 		 355 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.113414 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4219  signal transduction histidine kinase  43.3 
 
 		 362 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2872  signal transduction histidine kinase  42.69 
 
 		 362 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.401413  normal  0.23232 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0148  Signal transduction histidine kinase  42.01 
 
 		 350 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.332902  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1781  signal transduction histidine kinase  42.01 
 
 		 350 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1343  signal transduction histidine kinase  42.01 
 
 		 350 aa  220  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.54395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2333  signal transduction histidine kinase  42.46 
 
 		 376 aa  203  3e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0515  signal transduction histidine kinase  35.17 
 
 		 416 aa  133  5e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.498763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3728  signal transduction histidine kinase  35.91 
 
 		 406 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.979777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1670  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  43.06 
 
 		 394 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261958  normal  0.184327 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3686  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.22 
 
 		 709 aa  125  9e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.206553 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  31.13 
 
 		 744 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3192  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.44 
 
 		 864 aa  120  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0309229 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0324  signal transduction histidine kinase  33.02 
 
 		 398 aa  117  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.732156  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1534  signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 		 414 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.076798 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0327  histidine kinase, dimerisation/phosphoacceptor  30.94 
 
 		 400 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0659976  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1659  sensor histidine kinase  36.44 
 
 		 476 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0498  signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 		 420 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.335667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 		 215 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0050  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  43.66 
 
 		 440 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1607  sensor histidine kinase  36.65 
 
 		 437 aa  114  3e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 		 382 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1538  signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 		 232 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307485  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5039  signal transduction histidine kinase  33.02 
 
 		 381 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1953  signal transduction histidine kinase  36.22 
 
 		 382 aa  110  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6649  signal transduction histidine kinase  37.98 
 
 		 739 aa  110  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  29.8 
 
 		 732 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2024  signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 		 497 aa  110  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.149212  normal  0.406004 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 		 439 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2444  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.14 
 
 		 721 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0911916  normal  0.976086 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  28.33 
 
 		 941 aa  110  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  32.4 
 
 		 872 aa  109  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 		 526 aa  109  6e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2279  signal transduction histidine kinase  32.56 
 
 		 392 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0130228 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4526  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  32.56 
 
 		 381 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.315667 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3529  signal transduction histidine kinase  29.59 
 
 		 405 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.170223 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  30.7 
 
 		 783 aa  109  8.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 		 1676 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  29.29 
 
 		 815 aa  108  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  28.51 
 
 		 1560 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3911  signal transduction histidine kinase  30.4 
 
 		 1093 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  0.0971599 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1099  signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 335 aa  107  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4986  signal transduction histidine kinase  32.56 
 
 		 381 aa  108  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0054  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40.14 
 
 		 467 aa  108  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1063  signal transduction histidine kinase  28.77 
 
 		 358 aa  106  5e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0212102 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4562  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.22 
 
 		 874 aa  106  5e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0865092  normal  0.846022 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 		 1093 aa  105  9e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  27.62 
 
 		 681 aa  105  9e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  27.85 
 
 		 1654 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  27.24 
 
 		 1239 aa  105  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  29.22 
 
 		 767 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 		 1093 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  31.98 
 
 		 674 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  29.25 
 
 		 2693 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  26.61 
 
 		 3706 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  30.9 
 
 		 771 aa  104  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  28.24 
 
 		 834 aa  103  3e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  28.06 
 
 		 1177 aa  103  4e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3525  signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 		 603 aa  103  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  29.8 
 
 		 347 aa  103  4e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11268  histidine kinase sensor protein  27.65 
 
 		 624 aa  103  4e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4081  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  34.04 
 
 		 895 aa  103  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.628066  normal  0.498394 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4449  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.04 
 
 		 875 aa  103  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4852  signal transduction histidine kinase  30.61 
 
 		 746 aa  103  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0325493 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  28.9 
 
 		 764 aa  103  5e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2288  signal transduction histidine kinase  30.38 
 
 		 400 aa  103  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.184339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 		 932 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  27.88 
 
 		 991 aa  102  8e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2255  signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 		 648 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.56353  normal  0.716596 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5893  signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 		 465 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  29.24 
 
 		 488 aa  102  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  33.72 
 
 		 1183 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6532  signal transduction histidine kinase  30.92 
 
 		 368 aa  100  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0793858  normal  0.366363 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1193  sensory transduction regulatory protein  31.86 
 
 		 391 aa  100  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  25.12 
 
 		 613 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  28.19 
 
 		 945 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  26.1 
 
 		 1227 aa  99.8  6e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  28.51 
 
 		 1714 aa  99.8  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  29.86 
 
 		 551 aa  99.8  7e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  30.81 
 
 		 532 aa  99.8  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1636  two component sensor kinase  33.85 
 
 		 342 aa  98.2  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.264656  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6722  signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 364 aa  98.2  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.16203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2946  signal transduction histidine kinase  32.45 
 
 		 349 aa  97.4  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.341682  normal  0.680161 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1628  Signal transduction histidine kinase  32.99 
 
 		 431 aa  97.8  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2086  signal transduction histidine kinase  27.19 
 
 		 756 aa  97.1  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4766  signal transduction histidine kinase  29.59 
 
 		 461 aa  97.1  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134291  normal  0.334258 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>