161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0549 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0549  Flp pilus assembly protein CpaB  100 
 
 		 283 aa  562  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0656  pilus assembly transmembrane protein  75 
 
 		 288 aa  410  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.360259 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5320  Flp pilus assembly protein CpaB  65.26 
 
 		 282 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  hitchhiker  0.00316438 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4613  Flp pilus assembly protein CpaB  68.12 
 
 		 269 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.310892 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6373  Flp pilus assembly protein CpaB  63.76 
 
 		 279 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  0.913106 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5499  Flp pilus assembly CpaB  63.76 
 
 		 279 aa  332  3e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0386531  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6785  Flp pilus assembly CpaB  63.76 
 
 		 279 aa  332  3e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0900902  normal  0.253203 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0592  Flp pilus assembly protein CpaB  62.72 
 
 		 283 aa  326  2.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.579977  normal  0.0629925 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7202  Flp pilus assembly CpaB  62.37 
 
 		 279 aa  325  5e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.190401  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2267  pilus assembly protein  64.24 
 
 		 279 aa  323  2e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2643  Flp pilus assembly CpaB  62.07 
 
 		 280 aa  318  7.999999999999999e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.729326  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1311  pilus assembly transmembrane protein  63.07 
 
 		 281 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3084  putative pilus assembly protein CpaB  63.07 
 
 		 281 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.208838  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2959  putative pilus assembly protein CpaB  63.07 
 
 		 281 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0648  Flp pilus assembly CpaB  64.11 
 
 		 281 aa  309  2.9999999999999997e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130635  normal  0.420596 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6291  Flp pilus assembly CpaB  62.28 
 
 		 281 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0737796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2548  Flp pilus assembly CpaB  65.4 
 
 		 284 aa  306  2.0000000000000002e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.185177  normal  0.0976482 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5995  Flp pilus assembly protein CpaB  61.94 
 
 		 281 aa  306  3e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0325272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0792  Flp pilus assembly CpaB  55.78 
 
 		 286 aa  286  4e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0325336  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1518  Flp pilus assembly protein CpaB  54.01 
 
 		 280 aa  276  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2361  Flp pilus assembly CpaB  53.63 
 
 		 261 aa  251  9.000000000000001e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0660  pilus assembly protein CpaB  45.99 
 
 		 262 aa  198  7e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.0982675 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0800  pilus assembly protein CpaB  48.42 
 
 		 266 aa  187  2e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0799  Flp pilus assembly protein CpaB  45.95 
 
 		 263 aa  186  3e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.761688  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1492  SAF domain-containing protein  34.9 
 
 		 292 aa  152  5.9999999999999996e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1746  Flp pilus assembly protein CpaB  36.75 
 
 		 272 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3969  SAF domain-containing protein  40.44 
 
 		 322 aa  145  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.174798  normal  0.640767 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1837  Flp pilus assembly protein CpaB  37.76 
 
 		 289 aa  139  6e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2704  SAF domain-containing protein  40.1 
 
 		 291 aa  137  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1058  Flp pilus assembly protein CpaB  38.91 
 
 		 291 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3203  Flp pilus assembly protein CpaB  41.38 
 
 		 291 aa  136  4e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.200873 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1168  Flp pilus assembly protein CpaB  35.52 
 
 		 295 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000250468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2828  Flp pilus assembly CpaB  38.73 
 
 		 307 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1113  SAF domain-containing protein  32.98 
 
 		 272 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376133  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2916  Flp pilus assembly protein CpaB  37.75 
 
 		 307 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2742  Flp pilus assembly protein CpaB  35.81 
 
 		 274 aa  123  4e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2566  Flp pilus assembly protein CpaB  39.8 
 
 		 307 aa  123  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4404  Flp pilus assembly protein CpaB  37.63 
 
 		 305 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2012  SAF domain-containing protein  34.8 
 
 		 272 aa  120  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002643  flp pilus assembly protein RcpC/CpaB  38.56 
 
 		 251 aa  119  4.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2359  putative pilus assembly protein CpaB  36.92 
 
 		 272 aa  119  7e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.934464  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2372  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  36.12 
 
 		 274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.267894  normal  0.976652 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3006  Flp pilus assembly protein CpaB  38.4 
 
 		 309 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1515  Flp pilus assembly CpaB  34.63 
 
 		 260 aa  103  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.670297  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7030  putative pilus assembly protein, cpaB  34.9 
 
 		 249 aa  103  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.383931  normal  0.799048 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0418  Flp pilus assembly CpaB  33.33 
 
 		 278 aa  102  5e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2826  Flp pilus assembly protein CpaB  35.9 
 
 		 267 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0218  component of type IV pilus  33.77 
 
 		 269 aa  99.8  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2385  Flp pilus assembly protein CpaB  35.9 
 
 		 268 aa  99  8e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0504616  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4869  SAF domain-containing protein  34.17 
 
 		 332 aa  98.2  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3712  Flp pilus assembly CpaB  33.16 
 
 		 265 aa  97.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.241083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1785  Flp pilus assembly CpaB  33.16 
 
 		 265 aa  95.5  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.634606  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3519  Flp pilus assembly CpaB  33.16 
 
 		 266 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5682  putative pilus assembly protein cpaB  35.6 
 
 		 266 aa  95.1  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.212256 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1080  Flp pilus assembly CpaB  30.38 
 
 		 342 aa  94  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0392  Flp pilus assembly CpaB  33.85 
 
 		 260 aa  93.2  5e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.373428  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2407  Flp pilus assembly protein CpaB  34.67 
 
 		 260 aa  93.2  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2479  Flp pilus assembly protein CpaB  32.66 
 
 		 261 aa  92.8  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.801269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2702  Flp pilus assembly protein CpaB  32.66 
 
 		 261 aa  92.4  8e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.964618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1130  Flp pilus assembly CpaB  33.33 
 
 		 345 aa  92  9e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0287562  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0302  Flp pilus assembly CpaB  32.81 
 
 		 275 aa  90.9  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2114  SAF domain-containing protein  31.47 
 
 		 234 aa  90.5  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1130  SAF domain protein  29.79 
 
 		 280 aa  89  8e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4194  Flp pilus assembly protein CpaB  26.69 
 
 		 296 aa  88.6  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2345  Flp pilus assembly CpaB  28.79 
 
 		 287 aa  87.8  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.358123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4615  Flp pilus assembly protein CpaB  32.12 
 
 		 270 aa  85.9  7e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.706062  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2318  Flp pilus assembly protein CpaB  28.88 
 
 		 233 aa  84.3  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0232  SAF domain-containing protein  32.2 
 
 		 250 aa  84  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4187  Flp pilus assembly protein CpaB  31.19 
 
 		 271 aa  84  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0722  SAF domain-containing protein  32.49 
 
 		 271 aa  84  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.268977  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3996  pilus assembly protein cpaB  34.65 
 
 		 270 aa  83.2  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0998  Flp pilus assembly CpaB  25.65 
 
 		 274 aa  82.4  0.000000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394807  normal  0.82555 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4475  Flp pilus assembly protein CpaB  32.18 
 
 		 271 aa  80.9  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.156663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3790  Flp pilus assembly protein CpaB  34.01 
 
 		 271 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.658434 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0609  putative CpaB2 pilus assembly protein  32.66 
 
 		 267 aa  80.1  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.620793  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0309  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  30.33 
 
 		 274 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3351  SAF domain-containing protein  30.85 
 
 		 269 aa  79.3  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3790  Flp pilus assembly protein CpaB  34.31 
 
 		 264 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2058  Flp pilus assembly CpaB  30.99 
 
 		 342 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308551  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2020  SAF domain-containing protein  30.84 
 
 		 275 aa  77  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1039  Flp pilus assembly protein CpaB  32.04 
 
 		 233 aa  75.9  0.0000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.268471  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1402  CpaB family Flp pilus assembly protein  30.73 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.168447  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1910  putative Flp pilus assembly protein CpaB  27.01 
 
 		 274 aa  72.4  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0558  putative Flp pilus assembly protein CpaB  27.01 
 
 		 274 aa  72.4  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3486  Flp pilus assembly protein CpaB  33.52 
 
 		 292 aa  72.4  0.000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0314928 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1733  Flp pilus assembly protein CpaB  28.06 
 
 		 313 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0619975  hitchhiker  0.0000143429 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3420  Flp pilus assembly CpaB  30.05 
 
 		 342 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.915611  normal  0.685338 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1652  Flp pilus assembly protein CpaB  29.11 
 
 		 316 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.695685  normal  0.658487 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3927  Flp pilus assembly protein CpaB  30.05 
 
 		 342 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.152772  normal  0.4164 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1442  Flp pilus assembly protein CpaB  26.56 
 
 		 311 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.257298 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5126  SAF domain-containing protein  30.26 
 
 		 263 aa  67.4  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0670857 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1940  CpaB family Flp pilus assembly protein  31.09 
 
 		 348 aa  67  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0235089  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1767  putative pilus assembly protein CpaB  31.09 
 
 		 299 aa  67  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.726426  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1788  putative pilus assembly protein CpaB  31.09 
 
 		 299 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2543  CpaB family Flp pilus assembly protein  28.27 
 
 		 292 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2799  putative signal peptide protein, CpaB like  30 
 
 		 316 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0750  Flp pilus assembly protein CpaB  24.26 
 
 		 298 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5408  Flp pilus assembly CpaB  30.05 
 
 		 318 aa  65.9  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.842409  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1779  hypothetical protein  30.57 
 
 		 299 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0116  hypothetical protein  30.57 
 
 		 299 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>