More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0316 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0316  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 287 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0777924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0304  polysaccharide deacetylase  92.33 
 
 		 287 aa  503  1e-141  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2684  polysaccharide deacetylase  73.79 
 
 		 294 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.569149 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6095  polysaccharide deacetylase  75 
 
 		 297 aa  384  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.233371  normal  0.603331 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2151  polysaccharide deacetylase  75.36 
 
 		 294 aa  384  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.342073  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2765  polysaccharide deacetylase  75.36 
 
 		 294 aa  384  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.468013  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0428  hypothetical protein  73.14 
 
 		 287 aa  369  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.249302  normal  0.885456 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2817  polysaccharide deacetylase  74.36 
 
 		 300 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3302  polysaccharide deacetylase  64.5 
 
 		 272 aa  328  8e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.229858  normal  0.446106 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1373  polysaccharide deacetylase  62.6 
 
 		 267 aa  314  9.999999999999999e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00379023 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2751  transmembrane protein  57.66 
 
 		 283 aa  297  1e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4706  polysaccharide deacetylase  59.77 
 
 		 286 aa  296  3e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0236101 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5979  polysaccharide deacetylase  54.8 
 
 		 285 aa  295  8e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.185285  normal  0.666429 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2215  putative transmembrane protein  58.04 
 
 		 288 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.814206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3928  polysaccharide deacetylase  60.38 
 
 		 289 aa  278  5e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.284883  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3983  polysaccharide deacetylase  55.86 
 
 		 284 aa  270  2e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4179  polysaccharide deacetylase  55.38 
 
 		 266 aa  269  4e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1323  polysaccharide deacetylase family protein  59.92 
 
 		 300 aa  256  4e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2675  polysaccharide deacetylase  57.71 
 
 		 280 aa  244  9e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0615547  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0920  polysaccharide deacetylase family protein  53.93 
 
 		 270 aa  237  1e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0930  polysaccharide deacetylase  47.23 
 
 		 246 aa  202  7e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0787  polysaccharide deacetylase family protein  47.23 
 
 		 349 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.29381  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1557  acetylxylan esterase  40.42 
 
 		 275 aa  150  3e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.956674  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1497  polysaccharide deacetylase  40 
 
 		 275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.507826  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3369  polysaccharide deacetylase  40.18 
 
 		 259 aa  142  9e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.792887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1987  polysaccharide deacetylase  43.87 
 
 		 256 aa  139  7.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02423  acetylxylan esterase  42.35 
 
 		 260 aa  128  9.000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  33.18 
 
 		 261 aa  125  6e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2113  GlcNAc deacetylase-related protein carbohydrate esterase family 4 protein  37.2 
 
 		 259 aa  121  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.228742  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03855  polysaccharide deacetylase, putative  31.1 
 
 		 258 aa  117  3e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1541  polysaccharide deacetylase  41.67 
 
 		 280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0577624  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2417  polysaccharide deacetylase  44.38 
 
 		 280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108367  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  31.19 
 
 		 251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  35.03 
 
 		 387 aa  109  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1868  polysaccharide deacetylase  34.78 
 
 		 258 aa  108  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  30.16 
 
 		 373 aa  108  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  27.83 
 
 		 368 aa  108  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1446  polysaccharide deacetylase  38.57 
 
 		 280 aa  106  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.781341  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_959  glycosyl transferase  30.95 
 
 		 479 aa  106  5e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0970  polysaccharide deacetylase  32.45 
 
 		 479 aa  105  7e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.064586  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0643  polysaccharide deacetylase  35.75 
 
 		 425 aa  104  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5206  polysaccharide deacetylase  39.88 
 
 		 259 aa  103  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  32.85 
 
 		 220 aa  103  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1257  polysaccharide deacetylase  37.22 
 
 		 235 aa  103  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  33.16 
 
 		 213 aa  102  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  33.16 
 
 		 213 aa  102  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  33.16 
 
 		 213 aa  102  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0647  polysaccharide deacetylase  36.41 
 
 		 204 aa  102  8e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1912  polysaccharide deacetylase  37.02 
 
 		 232 aa  102  9e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  32.37 
 
 		 241 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  32.85 
 
 		 241 aa  101  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4717  polysaccharide deacetylase  35 
 
 		 285 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  32.64 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3012  polysaccharide deacetylase  35.9 
 
 		 263 aa  101  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000529365  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  31.88 
 
 		 241 aa  101  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1141  glycosyl transferase/polysaccharide deacetylase family protein  32.22 
 
 		 481 aa  100  3e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.226715  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0991  polysaccharide deacetylase family protein  29.29 
 
 		 244 aa  100  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01375  polysaccharide deacetylase  33.7 
 
 		 218 aa  100  3e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  31.4 
 
 		 299 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  32.47 
 
 		 324 aa  99.8  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6669  polysaccharide deacetylase  36.74 
 
 		 240 aa  99.4  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.422259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0255  polysaccharide deacetylase  32.97 
 
 		 199 aa  99  7e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  35.05 
 
 		 404 aa  99.4  7e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3642  putative polysaccharide deacetylase  31.88 
 
 		 217 aa  99  8e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1762  polysaccharide deacetylase  30.09 
 
 		 243 aa  98.6  9e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  29.47 
 
 		 275 aa  99  9e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3637  polysaccharide deacetylase, putative  32.32 
 
 		 244 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2298  polysaccharide deacetylase  32.75 
 
 		 372 aa  98.2  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00169633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  32.32 
 
 		 241 aa  98.2  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1224  polysaccharide deacetylase  37.5 
 
 		 392 aa  98.6  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.533397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  30.06 
 
 		 221 aa  98.6  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  30.29 
 
 		 301 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  29.85 
 
 		 277 aa  97.8  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  28.99 
 
 		 275 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2057  polysaccharide deacetylase  38.06 
 
 		 252 aa  97.4  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129437  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0633  polysaccharide deacetylase  31.94 
 
 		 247 aa  96.7  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.256712 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  28.02 
 
 		 275 aa  96.3  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  28.5 
 
 		 276 aa  96.3  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0200  polysaccharide deacetylase  35.71 
 
 		 240 aa  95.9  6e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  33.55 
 
 		 417 aa  96.3  6e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  31.48 
 
 		 247 aa  95.9  6e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  27.27 
 
 		 321 aa  95.9  7e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  38.96 
 
 		 542 aa  95.5  8e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  27.8 
 
 		 275 aa  95.5  9e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  28.02 
 
 		 275 aa  95.5  9e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  28.02 
 
 		 275 aa  95.5  9e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  28.02 
 
 		 275 aa  95.5  9e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  27.8 
 
 		 275 aa  95.5  9e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0646  polysaccharide deacetylase  34.16 
 
 		 275 aa  95.1  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1462  polysaccharide deacetylase  29.14 
 
 		 255 aa  95.1  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0336  polysaccharide deacetylase  32.22 
 
 		 284 aa  94.7  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3879  polysaccharide deacetylase  36.9 
 
 		 289 aa  94.4  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0628  polysaccharide deacetylase  33.51 
 
 		 268 aa  94.7  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0237416 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1932  polysaccharide deacetylase  30.8 
 
 		 522 aa  94.4  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.461546  normal  0.430114 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  27.75 
 
 		 275 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4749  polysaccharide deacetylase  30.68 
 
 		 240 aa  94.4  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  31.48 
 
 		 305 aa  94  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  29.76 
 
 		 405 aa  93.6  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  28.02 
 
 		 372 aa  94  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  33.53 
 
 		 244 aa  93.2  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>