More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4719 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



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Replicon accession
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Alignment on homolog gene
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Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4692  ROK family protein  96.12 
 
 		 412 aa  729    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.476494 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4719  ROK family protein  100 
 
 		 412 aa  831    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7333  transcriptional regulator ROK family  59.85 
 
 		 412 aa  442  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.777394  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0149  ROK family protein  41.82 
 
 		 418 aa  295  1e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.421428 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2135  ROK family protein  39.03 
 
 		 402 aa  223  4.9999999999999996e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335233  normal  0.0971048 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2445  ROK family protein  34.87 
 
 		 417 aa  207  3e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0101  ROK family protein  31.46 
 
 		 409 aa  175  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00205324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1757  ROK family protein  31.88 
 
 		 404 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1656  ROK family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 416 aa  168  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0287  transcription regulator ROK family protein  30.51 
 
 		 416 aa  168  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0198  ROK family protein  30.51 
 
 		 416 aa  168  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6013  ROK family protein  30.89 
 
 		 410 aa  163  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.627937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0212  transcription regulator ROK family protein  31.51 
 
 		 416 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.404806  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3595  ROK family protein  30.34 
 
 		 416 aa  160  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.227419  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0125  ROK family protein  29.38 
 
 		 415 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1710  ROK family protein  32.64 
 
 		 416 aa  160  5e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.965382  normal  0.0458779 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4684  ROK family protein  32.73 
 
 		 415 aa  157  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00733962  normal  0.0776986 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7454  transcriptional regulator ROK family  31.51 
 
 		 421 aa  157  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1426  ROK family protein  32.21 
 
 		 415 aa  157  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155028  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1520  ROK family protein  32.21 
 
 		 415 aa  156  6e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0198401  normal  0.0199627 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1064  ROK domain-containing protein  32.21 
 
 		 415 aa  155  9e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.561211  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1544  ROK family protein  32.21 
 
 		 415 aa  155  9e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0384623  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5972  transcriptional regulator ROK family  29.49 
 
 		 409 aa  155  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.248958  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1466  ROK family protein  31.95 
 
 		 415 aa  155  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2486  ROK family protein  32.12 
 
 		 417 aa  154  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0124  ROK family protein  28.96 
 
 		 415 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84663  normal  0.565594 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03610  ROK (Repressor, ORF, Kinase) domain protein  30.03 
 
 		 406 aa  153  4e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.759282  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2298  ROK family protein  32.37 
 
 		 391 aa  154  4e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2607  ROK family protein  30.63 
 
 		 404 aa  152  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1899  ROK  31.69 
 
 		 409 aa  151  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0996868  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0068  ROK family protein  29.09 
 
 		 439 aa  150  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.657288  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0891  ROK  30.08 
 
 		 413 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4578  ROK family protein  29.85 
 
 		 408 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.104261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5676  ROK family protein  29.06 
 
 		 400 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0716593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0536  ROK family protein  31.44 
 
 		 410 aa  147  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6619  ROK family protein  28.72 
 
 		 400 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.326282  normal  0.212393 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0367  ROK domain-containing protein  29.55 
 
 		 413 aa  144  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00665  transcriptional regulator, ROK family protein  30.08 
 
 		 390 aa  143  5e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2418  ROK family protein  29.77 
 
 		 410 aa  138  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.149199  normal  0.233455 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2225  ROK family protein  29.29 
 
 		 422 aa  136  7.000000000000001e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158605 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0665  ROK family protein  27.4 
 
 		 376 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3351  ROK family protein  31.09 
 
 		 407 aa  135  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1654  ROK  32.13 
 
 		 420 aa  134  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.431815  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5303  transcriptional regulator ROK family  30.14 
 
 		 379 aa  132  7.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0991  ROK family transcriptional regulator  27.25 
 
 		 407 aa  132  9e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.819596  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2651  ROK family protein  27.25 
 
 		 407 aa  132  9e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1372  ROK  28.43 
 
 		 398 aa  131  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.436863  normal  0.250954 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4501  ROK  26.3 
 
 		 376 aa  130  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0233  ROK family protein  26.57 
 
 		 421 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.585824 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3207  hypothetical protein  27.63 
 
 		 414 aa  129  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0193804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2864  ROK family protein  28.72 
 
 		 411 aa  129  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1870  ROK family protein  28.16 
 
 		 375 aa  125  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0169  ROK family protein  29.22 
 
 		 397 aa  124  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2182  transcriptional regulator ROK family  26.94 
 
 		 382 aa  124  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2589  ROK  26.7 
 
 		 389 aa  119  7.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0163398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2352  ROK family protein  25.95 
 
 		 383 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.305071  normal  0.103428 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10150  transcriptional regulator/sugar kinase  31.3 
 
 		 429 aa  117  5e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484549  normal  0.536351 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2090  ROK family protein  27.42 
 
 		 374 aa  116  6e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2054  ROK family protein  26.16 
 
 		 370 aa  116  8.999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2166  ROK family protein  26.16 
 
 		 370 aa  116  8.999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.259459  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4127  ROK family protein  27.99 
 
 		 367 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  24.67 
 
 		 399 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3120  ROK family protein  28.83 
 
 		 401 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3392  ROK family protein  29.67 
 
 		 401 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  26.57 
 
 		 414 aa  113  8.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03328  ROK family protein  25.54 
 
 		 382 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  23.99 
 
 		 410 aa  110  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2381  ROK family protein  27.64 
 
 		 398 aa  110  7.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4558  ROK family protein  28.21 
 
 		 409 aa  109  8.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.864466 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1608  putative xylose repressor  29.97 
 
 		 416 aa  108  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000726705  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1760  ROK family protein  31.74 
 
 		 425 aa  107  4e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.533551  normal  0.0181472 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0506  ROK family protein  26.72 
 
 		 396 aa  107  5e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  26.78 
 
 		 417 aa  103  5e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  26.97 
 
 		 391 aa  103  8e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4996  ROK family protein  27.82 
 
 		 420 aa  103  8e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1432  ROK family protein  25.4 
 
 		 381 aa  102  8e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00411657  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  25.52 
 
 		 395 aa  101  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03375  transcriptional regulator  24.39 
 
 		 387 aa  100  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2190  ROK family protein  23.14 
 
 		 374 aa  100  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1215  ROK family protein  25.98 
 
 		 393 aa  100  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4825  ROK family protein  30.43 
 
 		 417 aa  100  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0159  ROK family protein  24.94 
 
 		 400 aa  99.8  9e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1304  ROK family protein  29.2 
 
 		 393 aa  99  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.445462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0352  ROK family protein  31.2 
 
 		 391 aa  97.8  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00770  ROK family protein  24.27 
 
 		 378 aa  97.8  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000483979  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2328  ROK family protein  25.69 
 
 		 404 aa  97.8  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0550455  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2208  xylose repressor  26.8 
 
 		 364 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308125  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2379  ROK family protein  27.2 
 
 		 417 aa  97.1  6e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.257768  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1583  ROK protein  26.29 
 
 		 387 aa  97.1  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.821608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1925  ROK family protein  23.26 
 
 		 388 aa  96.7  7e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.300813  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3375  ROK family protein  26.16 
 
 		 389 aa  96.3  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.711006 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  23.62 
 
 		 400 aa  95.9  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0731  ROK family protein  21.45 
 
 		 372 aa  94.7  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5295  ROK family protein  26.4 
 
 		 404 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.101654  normal  0.123744 
 
 
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NC_013595  Sros_3727  transcriptional repressor of the xylose operon  22.78 
 
 		 397 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00469917  normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  30.04 
 
 		 405 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal  1 
 
 
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NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  23 
 
 		 396 aa  95.1  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_1108  ROK family protein  31.66 
 
 		 382 aa  94.7  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.231439  normal  1 
 
 
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NC_011369  Rleg2_0260  ROK family protein  28.74 
 
 		 404 aa  94.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011368  Rleg2_4697  putative transcriptional regulator protein, ROK family  24.53 
 
 		 379 aa  94.4  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.925334 
 
 
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