More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0339 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0339  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 248 aa  504  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.872821  normal  0.0558568 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0307  transcriptional regulator, LuxR family  95.16 
 
 		 248 aa  483  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4065  transcriptional regulator LuxR family  60.08 
 
 		 251 aa  289  3e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0244  response regulator receiver protein  57.83 
 
 		 247 aa  276  2e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.50277 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0441  regulatory protein LuxR  42.24 
 
 		 286 aa  84.7  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.923746  normal  0.0183899 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0505  transcriptional regulator, LuxR family  42.37 
 
 		 244 aa  82.8  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0548  transcriptional regulator, LuxR family  43.48 
 
 		 244 aa  82.4  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.216848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0918  transcriptional regulator LuxR family  41.18 
 
 		 230 aa  82.4  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2601  regulatory protein LuxR  31.25 
 
 		 247 aa  80.5  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0440  regulatory protein LuxR  32.6 
 
 		 246 aa  77.8  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0539143 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2818  transcriptional regulator, LuxR family  33.95 
 
 		 241 aa  70.5  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0185947 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3087  transcriptional regulator, LuxR family  31.25 
 
 		 241 aa  67.8  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3273  transcriptional regulator LuxR family  34.18 
 
 		 241 aa  66.2  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0318  transcriptional regulator, LuxR family  25.97 
 
 		 234 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1003  transcriptional regulator, LuxR family  30.11 
 
 		 245 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383688  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0920  LuxR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 268 aa  62  0.000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.81926  normal  0.148698 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0287  transcriptional regulator, LuxR family  25.75 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6378  LuxR family transcriptional regulator  25 
 
 		 248 aa  58.5  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6408  LuxR family transcriptional regulator  25 
 
 		 248 aa  58.5  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5762  LuxR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 242 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.225342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0097  transcriptional regulator, LuxR family  31.29 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3118  transcriptional regulator, LuxR family  51.56 
 
 		 391 aa  57.4  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4359  regulatory protein, LuxR  46.88 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2120  LuxR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 244 aa  57  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0535979  normal  0.194929 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5781  response regulator receiver protein  32.24 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305702  hitchhiker  0.00700374 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3348  transcriptional regulator, LuxR family  31.07 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0965  transcriptional activator protein LuxR  29.69 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.266935  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3549  regulatory protein, LuxR  45.16 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0641  ATP-dependent transcription regulator LuxR  36.05 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0312274  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2798  ATP-dependent transcription regulator LuxR  36.05 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.675669  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2371  ATP-dependent transcription regulator LuxR  36.05 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.440892  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2915  ATP-dependent transcription regulator LuxR  36.05 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.454836  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2672  ATP-dependent transcription regulator LuxR  36.05 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2729  ATP-dependent transcription regulator LuxR  36.05 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0930619  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1686  ATP-dependent transcription regulator LuxR  36.05 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0643903  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1817  ATP-dependent transcription regulator LuxR  36.05 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.985291  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1997  autoinducer-binding transcriptional regulator, LuxR family  32.31 
 
 		 237 aa  54.7  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.448669  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0702  LuxR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 245 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1664  transcriptional regulator, LuxR family  32.31 
 
 		 237 aa  54.7  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.888844 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0119  LuxR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 259 aa  53.9  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.608376  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4539  transcriptional regulator, LuxR family, autoinducer-regulated  32.61 
 
 		 254 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.542388  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0694  transcriptional regulator, LuxR family  28.9 
 
 		 242 aa  54.3  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0110  LuxR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 268 aa  54.3  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.514691  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0958  transcriptional activator protein LuxR  27.37 
 
 		 247 aa  53.9  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4224  regulatory protein LuxR  34.48 
 
 		 260 aa  53.9  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.525332  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0460  transcriptional regulator, LuxR family  47.62 
 
 		 253 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.343765 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5462  LuxR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 245 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.191354 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0282  transcriptional regulator, LuxR family  29.59 
 
 		 246 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.419752  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5029  transcriptional regulator, LuxR family  26.86 
 
 		 243 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.771298  normal  0.575652 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0122  LuxR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 233 aa  53.1  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1815  putative transcriptional regulator  30.57 
 
 		 265 aa  53.1  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.319475  normal  0.33301 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1758  autoinducer-binding domain-containing protein  35.11 
 
 		 233 aa  53.1  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4216  regulatory protein, LuxR  42.19 
 
 		 254 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4514  autoinducer-binding domain-containing protein  29.66 
 
 		 243 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.447162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2693  regulatory protein, LuxR  43.75 
 
 		 891 aa  52.8  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.602772  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1136  regulatory protein, LuxR  41.1 
 
 		 868 aa  52  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.87643 
 
 
-
 
NC_002936  DET0432  LuxR family DNA-binding response regulator  49.18 
 
 		 232 aa  51.6  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00543066  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3004  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 223 aa  51.6  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0522265  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4977  transcriptional regulator, LuxR family  29.66 
 
 		 243 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.142556 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_374  DNA-binding response regulator, LuxR family  47.54 
 
 		 232 aa  51.2  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000120759  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1390  two component LuxR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 225 aa  51.6  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0409  two component LuxR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 232 aa  51.6  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.135269  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3287  transcriptional activator SOLR transcription regulator protein  30.69 
 
 		 236 aa  50.4  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.840181  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01929  transcriptional activator of quorum sensing autoinducer synthesis transcription regulator protein  36.07 
 
 		 248 aa  50.8  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.746701 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2575  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  42.86 
 
 		 917 aa  50.8  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0258  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.31 
 
 		 200 aa  50.8  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4706  ATP-dependent transcription regulator LuxR  39.71 
 
 		 911 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157543 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4045  LuxR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.370155 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0808  ATP-dependent transcription regulator LuxR  39.71 
 
 		 905 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2311  LuxR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 265 aa  50.4  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1997  regulatory protein, LuxR  28.47 
 
 		 278 aa  50.4  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2084  LuxR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 269 aa  50.4  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.730902  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0142  N-acyl-homoserine lactone dependent regulatory protein  33.62 
 
 		 234 aa  50.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0163426  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2417  LuxR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 244 aa  50.4  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2179  LuxR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 239 aa  50.1  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1264  two component LuxR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 200 aa  50.4  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.86401 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0475  transcriptional regulator, LuxR family  44.26 
 
 		 123 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.282737  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0359  LuxR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 248 aa  50.1  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.870907  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1890  transcriptional regulator LuxR family  28.68 
 
 		 246 aa  50.4  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.546749  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3140  regulatory protein LuxR  31.01 
 
 		 246 aa  50.1  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1652  ATP-dependent transcription regulator LuxR  33.62 
 
 		 234 aa  50.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.643432  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1570  ATP-dependent transcription regulator LuxR  33.62 
 
 		 236 aa  50.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.778317  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0767  LuxR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 905 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1716  LuxR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 118 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0418  LuxR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 242 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1032  LuxR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 201 aa  49.7  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0621  two component LuxR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 212 aa  49.7  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0794  regulatory protein, LuxR  39.71 
 
 		 905 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.23816 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4066  transcriptional regulator LuxR family  43.86 
 
 		 248 aa  50.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.274649  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2811  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.26 
 
 		 217 aa  49.7  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.206772  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5725  DNA-binding HTH domain-containing protein  45.9 
 
 		 307 aa  49.3  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000726612  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0164  response regulator receiver protein  42.19 
 
 		 128 aa  49.7  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2317  hypothetical protein  40.32 
 
 		 267 aa  49.3  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0243  regulatory protein LuxR  43.86 
 
 		 245 aa  49.3  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.537224 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4374  transcriptional regulator LuxR family  29.46 
 
 		 246 aa  48.9  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0084  regulatory protein LuxR  43.55 
 
 		 267 aa  48.9  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1709  autoinducer-binding domain-containing protein  34.09 
 
 		 233 aa  48.9  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.781724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1300  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.62 
 
 		 215 aa  48.9  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.145336  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3810  LuxR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 242 aa  48.9  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3573  transcriptional regulator, LuxR family  31.17 
 
 		 189 aa  48.9  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>