134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0694 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0694  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 242 aa  498  1e-140  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3348  transcriptional regulator, LuxR family  60.76 
 
 		 238 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0097  transcriptional regulator, LuxR family  43.97 
 
 		 244 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0920  LuxR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 268 aa  190  1e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.81926  normal  0.148698 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5194  LuxR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 242 aa  105  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0681352 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3102  LuxR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 239 aa  96.3  4e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.644499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2210  LuxR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 240 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2852  transcriptional regulator  28.77 
 
 		 236 aa  85.1  8e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5781  response regulator receiver protein  27.16 
 
 		 243 aa  83.6  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305702  hitchhiker  0.00700374 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0122  LuxR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 233 aa  82  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1758  autoinducer-binding domain-containing protein  31.74 
 
 		 233 aa  82  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2028  LuxR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 242 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1709  autoinducer-binding domain-containing protein  32.34 
 
 		 233 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.781724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1559  regulatory protein LuxR  26.36 
 
 		 246 aa  70.5  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.509292 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5762  LuxR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 242 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.225342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2667  transcriptional regulator, LuxR family  25.62 
 
 		 241 aa  64.3  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.530563  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2928  transcriptional regulator, LuxR family  25.21 
 
 		 241 aa  63.5  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.258432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1709  transcriptional regulator, LuxR family  25.55 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4359  regulatory protein, LuxR  32.09 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3098  transcriptional regulator, LuxR family  27.17 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.521704  normal  0.269359 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4168  transcriptional regulator, LuxR family  27.51 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1890  transcriptional regulator LuxR family  30.85 
 
 		 246 aa  57.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.546749  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0110  LuxR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.514691  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0119  LuxR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.608376  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0402  regulatory protein, LuxR  30.43 
 
 		 242 aa  55.8  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0307  transcriptional regulator, LuxR family  28.9 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3500  LuxR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 247 aa  55.1  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.547243 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0339  transcriptional regulator, LuxR family  28.9 
 
 		 248 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.872821  normal  0.0558568 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0505  transcriptional regulator, LuxR family  32.54 
 
 		 244 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0627  LuxR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 241 aa  53.5  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.253164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1935  LuxR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 254 aa  53.9  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0226826  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1003  transcriptional regulator, LuxR family  26.72 
 
 		 245 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383688  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0418  LuxR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 242 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0359  LuxR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 248 aa  53.5  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.870907  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4224  regulatory protein LuxR  29.41 
 
 		 260 aa  53.5  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.525332  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2417  LuxR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 244 aa  53.1  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4114  putative transcriptional activator  30.59 
 
 		 213 aa  52.4  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.605496  normal  0.314154 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0943  transcriptional regulator, LuxR family  32.31 
 
 		 242 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0460  transcriptional regulator, LuxR family  28.89 
 
 		 253 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.343765 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0548  transcriptional regulator, LuxR family  31.97 
 
 		 244 aa  50.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.216848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4065  transcriptional regulator LuxR family  28.37 
 
 		 251 aa  50.4  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3118  transcriptional regulator, LuxR family  43.75 
 
 		 391 aa  49.3  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2996  two component LuxR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 595 aa  48.5  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.896317  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3291  response regulator receiver domain-containing protein  40.91 
 
 		 592 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2084  LuxR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 269 aa  48.1  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.730902  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2026  Two-component protein Kinase  40.91 
 
 		 595 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3228  Two-component protein Kinase  40.91 
 
 		 595 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3810  LuxR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 242 aa  47.8  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0244  response regulator receiver protein  29.11 
 
 		 247 aa  48.1  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.50277 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4539  transcriptional regulator, LuxR family, autoinducer-regulated  31.11 
 
 		 254 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.542388  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1513  LuxR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 246 aa  47.4  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4980  LuxR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 237 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3180  LuxR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 237 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.100011 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0918  transcriptional regulator LuxR family  47.54 
 
 		 230 aa  47.4  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2952  transcriptional regulator, LuxR family  44.26 
 
 		 207 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0281323  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4299  LuxR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 237 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.190696 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0323  transcriptional regulator, LuxR family  48.39 
 
 		 243 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4216  regulatory protein, LuxR  27.03 
 
 		 254 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39980  putative transcriptional regulator  32.06 
 
 		 237 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0441  regulatory protein LuxR  32.28 
 
 		 286 aa  47  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.923746  normal  0.0183899 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2409  LuxR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 272 aa  46.6  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0440  regulatory protein LuxR  43.55 
 
 		 246 aa  46.2  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0539143 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2846  two component LuxR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 209 aa  46.2  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4514  autoinducer-binding domain-containing protein  45.9 
 
 		 243 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.447162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5029  transcriptional regulator, LuxR family  45.9 
 
 		 243 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.771298  normal  0.575652 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4435  LuxR family transcriptional regulator  23.4 
 
 		 231 aa  45.8  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4977  transcriptional regulator, LuxR family  45.9 
 
 		 243 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.142556 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5725  DNA-binding HTH domain-containing protein  35.62 
 
 		 307 aa  45.8  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000726612  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3287  transcriptional activator SOLR transcription regulator protein  39.06 
 
 		 236 aa  45.4  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.840181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3321  LuxR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 240 aa  45.4  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.214587 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4116  LuxR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 239 aa  45.4  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0201758  hitchhiker  0.00877352 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1989  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.62 
 
 		 229 aa  45.4  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3395  LuxR family transcriptional regulator  23.41 
 
 		 260 aa  45.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4396  LuxR family transcriptional regulator  22.4 
 
 		 228 aa  45.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6040  LuxR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 228 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.917081 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4327  ATP-dependent transcription regulator LuxR  38.71 
 
 		 1021 aa  44.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5810  LuxR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 228 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.809704  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01929  transcriptional activator of quorum sensing autoinducer synthesis transcription regulator protein  35.29 
 
 		 248 aa  44.3  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.746701 
 
 
-
 
NC_004310  BR0190  LuxR family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 235 aa  43.9  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.195449  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1891  transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 230 aa  43.9  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00164243  normal  0.142555 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45960  transcriptional regulator LasR  25.4 
 
 		 239 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0940  response regulator receiver protein  42.62 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5675  transcriptional regulator, LuxR family  37.1 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3112  regulatory protein, LuxR  40.98 
 
 		 250 aa  44.3  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1997  regulatory protein, LuxR  36.49 
 
 		 278 aa  44.3  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2601  regulatory protein LuxR  44.26 
 
 		 247 aa  43.9  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1766  transcriptional regulator, LuxR family  24.37 
 
 		 244 aa  44.3  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182775  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3386  putative transcriptional regulator  31.3 
 
 		 237 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.247592  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3898  transcriptional regulator LasR  25.4 
 
 		 239 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.219668  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4852  LuxR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0262091 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3716  two component LuxR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 209 aa  44.3  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.576881  normal  0.099275 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5462  LuxR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 245 aa  43.9  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.191354 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4581  LuxR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 239 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000141763  hitchhiker  0.0000089809 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5466  transcriptional regulator, LuxR family  37.1 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.21524 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3840  transcriptional regulator, LuxR family  24.06 
 
 		 251 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1863  ATP-dependent transcription regulator LuxR  40.62 
 
 		 394 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00465528  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2957  transcriptional regulator protein  35.71 
 
 		 243 aa  43.5  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.923766  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0183  LuxR family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 235 aa  43.5  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0816251  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0791  LuxR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 236 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0904596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4277  transcriptional regulator, LuxR family  21.72 
 
 		 234 aa  43.5  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.343912 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>