175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6301 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007336  Reut_C6301  nitroreductase  100 
 
 		 245 aa  514  1.0000000000000001e-145  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540366  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2142  nitroreductase  67.63 
 
 		 236 aa  332  4e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000385966  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3085  nitroreductase  68.72 
 
 		 258 aa  325  5e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000834764  normal  0.027265 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1615  nitroreductase  66.08 
 
 		 257 aa  314  7e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00251246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1410  nitroreductase  58.74 
 
 		 231 aa  278  6e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0222  putative nitroreductase  55.65 
 
 		 229 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1938  nitroreductase  52.47 
 
 		 235 aa  235  4e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.255877  hitchhiker  0.00446173 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1610  nitroreductase  52.21 
 
 		 235 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367755  normal  0.918275 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0682  nitroreductase  55.41 
 
 		 249 aa  233  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00504715  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6222  nitroreductase  53.64 
 
 		 246 aa  232  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7105  nitroreductase  53.74 
 
 		 229 aa  230  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4912  nitroreductase  52.27 
 
 		 247 aa  230  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1203  nitroreductase  52.61 
 
 		 231 aa  230  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000186245  normal  0.254827 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1608  oxidoreductase protein  52.21 
 
 		 235 aa  227  1e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000515625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2436  nitroreductase  52.85 
 
 		 242 aa  227  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3050  nitroreductase  52.85 
 
 		 242 aa  227  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.908871  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3069  nitroreductase  52.85 
 
 		 242 aa  226  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2073  nitroreductase  51.36 
 
 		 242 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6397  nitroreductase  53.25 
 
 		 242 aa  226  4e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6027  nitroreductase  50.9 
 
 		 254 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5783  nitroreductase  50.45 
 
 		 254 aa  223  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3657  nitrobenzoate reductase, putative  50.91 
 
 		 224 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.583331  normal  0.143139 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5940  nitroreductase  51.36 
 
 		 237 aa  221  9e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.118292  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3047  nitroreductase  54.19 
 
 		 239 aa  216  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.496767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1481  nitroreductase  48.65 
 
 		 236 aa  211  7.999999999999999e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2908  nitroreductase  48.21 
 
 		 239 aa  204  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0573  nitroreductase family protein  44.93 
 
 		 228 aa  195  7e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0345  nitroreductase  48.66 
 
 		 228 aa  194  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196416  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2263  nitroreductase  48.44 
 
 		 224 aa  192  4e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513133 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47250  Nitroreductase  46.46 
 
 		 224 aa  189  4e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3352  nitroreductase  46.03 
 
 		 233 aa  188  5e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0408  nitroreductase  44.74 
 
 		 223 aa  188  5.999999999999999e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.341785  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3737  NADH dehydrogenase  45.37 
 
 		 221 aa  188  8e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2012  nitroreductase  45.66 
 
 		 223 aa  183  3e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0926  nitroreductase  43.56 
 
 		 223 aa  177  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6984  nitroreductase  39.11 
 
 		 229 aa  155  6e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.795076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5984  nitroreductase  40.25 
 
 		 228 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0282838  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3982  nitroreductase  39.04 
 
 		 233 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8469  nitroreductase  38.91 
 
 		 240 aa  145  6e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1690  nitroreductase  37.16 
 
 		 230 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3603  nitroreductase  37.05 
 
 		 232 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0181645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3607  nitroreductase  38.33 
 
 		 223 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.127181  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1917  nitroreductase  39.09 
 
 		 225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.805688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2316  nitroreductase  39.83 
 
 		 232 aa  138  6e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.999623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1911  nitroreductase  34.23 
 
 		 232 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3999  nitroreductase  37.44 
 
 		 223 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0200  nitroreductase  40.81 
 
 		 225 aa  134  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.878675  normal  0.802011 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1543  nitroreductase  39.24 
 
 		 232 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.973718  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7115  hypothetical protein  35.14 
 
 		 215 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1036  nitroreductase  33.47 
 
 		 241 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5417  nitroreductase  37.39 
 
 		 226 aa  133  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1973  nitroreductase  34.25 
 
 		 244 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2969  nitroreductase  38.05 
 
 		 235 aa  132  5e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.788882  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4839  nitroreductase  33.88 
 
 		 238 aa  129  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0536307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0170  nitroreductase  35.09 
 
 		 221 aa  128  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.834926  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6296  nitroreductase  33.03 
 
 		 228 aa  125  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2199  nitroreductase  32.74 
 
 		 231 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.396094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2388  nitroreductase  38.25 
 
 		 226 aa  124  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4924  nitroreductase  34.53 
 
 		 222 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5013  nitroreductase  34.53 
 
 		 222 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3698  nitroreductase  31.53 
 
 		 231 aa  122  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1048  nitroreductase  37.33 
 
 		 219 aa  122  4e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.043093 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0966  nitroreductase  36.87 
 
 		 219 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.247672  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5454  nitroreductase  36.57 
 
 		 221 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111331  normal  0.0192138 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5306  nitroreductase  34.08 
 
 		 222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2312  nitroreductase  35.56 
 
 		 220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.501363  normal  0.270967 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5185  nitroreductase  34.08 
 
 		 221 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0863183  normal  0.13215 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0519  nitroreductase  30.49 
 
 		 225 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000999564  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4604  nitroreductase  35.14 
 
 		 241 aa  118  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.278026  normal  0.441291 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1213  nitroreductase  37.02 
 
 		 221 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718567 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4473  nitroreductase  34.78 
 
 		 225 aa  115  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7293  nitroreductase  31.84 
 
 		 228 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.367017 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5533  nitroreductase  32.44 
 
 		 230 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2041  nitroreductase  28.83 
 
 		 220 aa  108  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.505491  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2168  nitroreductase  30.67 
 
 		 224 aa  101  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0723  p-nitrobenzoate reductase  30.09 
 
 		 221 aa  97.4  2e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0055643  normal  0.275976 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3141  nitroreductase  29.26 
 
 		 237 aa  91.3  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1327  nitroreductase family protein  31.6 
 
 		 270 aa  89.4  6e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0563  p-nitrobenzoate reductase  28.71 
 
 		 218 aa  83.6  0.000000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000325568  hitchhiker  0.0000528283 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2325  nitroreductase  28.5 
 
 		 234 aa  81.6  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  0.241368 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01216  putative oxidoreductase  27.6 
 
 		 223 aa  81.6  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3631  nitroreductase  26.79 
 
 		 225 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0024  hypothetical protein  29.02 
 
 		 225 aa  80.5  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.369937  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1408  nitroreductase  27.6 
 
 		 217 aa  79.3  0.00000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2473  nitroreductase  27.95 
 
 		 235 aa  76.3  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0563773  normal  0.616707 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3154  nitroreductase  28.31 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.297718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1205  nitroreductase  27.56 
 
 		 229 aa  72.4  0.000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1796  nitroreductase  24.55 
 
 		 227 aa  67.8  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.539857  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2827  nitroreductase  27.38 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.374853  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2206  nitroreductase family protein  27.38 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00142362  hitchhiker  5.10468e-16 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3031  NAD  28.31 
 
 		 212 aa  62  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3044  nitroreductase  27.38 
 
 		 212 aa  62  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2798  NAD(P)H nitroreductase  27.38 
 
 		 212 aa  61.6  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2761  NAD(P)H nitroreductase  27.38 
 
 		 212 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3075  nitroreductase family protein  25.23 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.1167  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3070  nitroreductase family protein  26.79 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.511917  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1885  nitroreductase  21.5 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.208432  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1724  nitroreductase  24.88 
 
 		 265 aa  55.1  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2744  nitroreductase  23.11 
 
 		 205 aa  54.3  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.613458  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1846  nitroreductase  23 
 
 		 206 aa  53.1  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>