94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2144 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2144  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 177 aa  362  1e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0843453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3280  MarR family transcriptional regulator  83.62 
 
 		 177 aa  304  5.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.48286  normal  0.011902 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3908  transcriptional regulator, MarR family  81.13 
 
 		 195 aa  261  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3135  MarR family transcriptional regulator  66.85 
 
 		 184 aa  242  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4699  hypothetical protein  43.57 
 
 		 160 aa  120  7e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.158619  normal  0.0406729 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0087  MarR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 168 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.383416 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0501  MarR family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 168 aa  107  6e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0851191  normal  0.700871 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0324  regulatory protein, MarR  41.1 
 
 		 169 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0540  transcriptional regulator, MarR family  38.04 
 
 		 170 aa  104  7e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2134  regulatory protein, MarR  33.53 
 
 		 176 aa  87  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2290  transcriptional regulator, MarR family  33.53 
 
 		 176 aa  87  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.851644  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1790  transcriptional regulator, MarR family  29.88 
 
 		 174 aa  84  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2296  transcriptional regulator, MarR family  29.29 
 
 		 173 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2140  regulatory protein, MarR  29.29 
 
 		 173 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0379  MarR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2413  MarR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 180 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1514  homoprotocatechuate degradative operon repressor  28.7 
 
 		 145 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0687296  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1141  homoprotocatechuate degradative operon repressor  28.7 
 
 		 145 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132048  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1022  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  28.7 
 
 		 145 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.299298  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0099  homoprotocatechuate degradative operon repressor  28.7 
 
 		 145 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0937  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  28.7 
 
 		 145 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2262  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  28.7 
 
 		 145 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 150 aa  52.8  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3287  MarR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 146 aa  52  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.341859  normal  0.150177 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4230  MarR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 155 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0771683 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4136  MarR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 155 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.332929  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1736  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  27.83 
 
 		 145 aa  52  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0455429  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3824  MarR family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 180 aa  51.6  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.765459  normal  0.539735 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1784  MarR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 155 aa  51.2  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.902391  normal  0.204207 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3652  MarR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 155 aa  51.2  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0021  MarR family transcriptional regulator  29 
 
 		 178 aa  51.6  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4026  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 204 aa  51.2  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4375  MarR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 148 aa  51.2  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.906445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3697  MarR family transcriptional regulator  22.81 
 
 		 180 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.815296 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4666  MarR family transcriptional regulator  22.81 
 
 		 180 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.846899  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2470  transcriptional regulator, TrmB  33.04 
 
 		 162 aa  50.1  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4126  MarR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 146 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.486697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0803  transcriptional regulator, MarR family protein  26.03 
 
 		 148 aa  48.9  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4564  Transcriptional regulators-like protein  29.58 
 
 		 261 aa  48.9  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal  0.0271107 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3626  regulatory protein, MarR  31.58 
 
 		 157 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000021465  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3966  MarR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 152 aa  48.5  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529361  normal  0.146935 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3866  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 150 aa  48.5  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  25.47 
 
 		 156 aa  47.8  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1719  MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 145 aa  46.6  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0232  MarR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 152 aa  45.8  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3208  MarR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 165 aa  45.8  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3311  MarR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 165 aa  45.1  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1808  MarR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 159 aa  45.1  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  24.58 
 
 		 141 aa  45.4  0.0005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4464  MarR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 143 aa  45.1  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1768  transcriptional regulator, MarR family  30.7 
 
 		 157 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3415  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 		 149 aa  45.1  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0058743 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0578  transcriptional regulator, MarR family protein  30.91 
 
 		 163 aa  44.3  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3546  MarR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 143 aa  44.7  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0914  MarR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 143 aa  44.7  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.423224  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_003296  RS01785  transcription regulator protein  28.74 
 
 		 158 aa  44.3  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4558  MarR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 150 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4312  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 150 aa  43.9  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 157 aa  43.9  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0544  regulatory protein MarR  31.11 
 
 		 144 aa  43.9  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0815  MarR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 165 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000550088 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4428  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 137 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.400041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3929  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 137 aa  43.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000979996 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0025  transcriptional regulator, MarR family  27.67 
 
 		 172 aa  43.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.209709 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1113  transcriptional regulator, TrmB  27.82 
 
 		 191 aa  43.5  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0810  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 184 aa  42.7  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0300222  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0977  MarR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 165 aa  42.7  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3996  MarR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 154 aa  42.7  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000674162  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 151 aa  42.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2133  MarR family transcriptional regulator  33 
 
 		 137 aa  42.7  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1943  transcriptional regulator, MarR family protein  35 
 
 		 161 aa  42.4  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0012648  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1540  regulatory protein, MarR  24.05 
 
 		 175 aa  42.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0757127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1303  MarR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 137 aa  42.4  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.55267 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3666  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 156 aa  42.4  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6111  regulatory protein, MarR  26.12 
 
 		 158 aa  42  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2306  putative transcriptional regulator  25.49 
 
 		 151 aa  42  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15300  transcriptional regulator, MarR family  27.96 
 
 		 162 aa  42  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408936  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2313  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 147 aa  42  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.708353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1336  MarR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 161 aa  41.6  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.137049 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2951  MarR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 162 aa  42  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5762  MarR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 137 aa  41.6  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1302  MarR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 154 aa  41.6  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 146 aa  41.6  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0719  transcriptional regulator, MarR family  26.52 
 
 		 142 aa  41.6  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0806783  normal  0.0372337 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 145 aa  41.6  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03887  transcriptional regulator MarR family  22.73 
 
 		 152 aa  41.6  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0799  MarR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 161 aa  41.2  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  25.93 
 
 		 157 aa  41.2  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1396  hypothetical protein  28.44 
 
 		 160 aa  41.2  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0691  transcriptional regulator, MarR family  27.59 
 
 		 142 aa  40.8  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3592  MarR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 153 aa  40.8  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.568766 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2845  transcriptional regulator, MarR family  34.72 
 
 		 145 aa  40.8  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.648486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4542  MarR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 158 aa  40.8  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  0.070316 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3826  MarR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 158 aa  40.8  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>