More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2185 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2185  Beta-glucosidase  100 
 
 		 884 aa  1812    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122477  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3170  glycosyl hydrolase, family 3  84.52 
 
 		 897 aa  1562    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.541746  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3318  beta-glucosidase  46.54 
 
 		 913 aa  740    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00176622  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3694  glycosyl hydrolase, family 3  69.69 
 
 		 772 aa  1148    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.923315  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1781  Beta-glucosidase  68.71 
 
 		 906 aa  1290    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.104106 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3035  glycoside hydrolase family protein  85.08 
 
 		 913 aa  1574    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115679  normal  0.109477 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3153  Beta-glucosidase  46.3 
 
 		 913 aa  744    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.139372  normal  0.15667 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4152  glycoside hydrolase family protein  36.13 
 
 		 831 aa  500  1e-140  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198899  normal  0.318604 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3480  glycoside hydrolase family 3 protein  34.85 
 
 		 915 aa  449  1e-125  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409586 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0919  glycoside hydrolase family 3 protein  34.85 
 
 		 914 aa  446  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1691  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.86 
 
 		 814 aa  419  9.999999999999999e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2674  ribosome-binding factor A  33.14 
 
 		 866 aa  419  9.999999999999999e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3058  Beta-glucosidase  32.21 
 
 		 857 aa  412  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.44664  normal  0.0198614 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2379  glycosy hydrolase family protein  32.33 
 
 		 870 aa  393  1e-108  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1307  Beta-glucosidase  30.65 
 
 		 887 aa  387  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6257  hypothetical protein  31.78 
 
 		 823 aa  385  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.234906  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4787  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.29 
 
 		 820 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294133  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3692  glycosy hydrolase family protein  30.85 
 
 		 832 aa  380  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00712  Beta-glucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BFG8]  31.74 
 
 		 845 aa  371  1e-101  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.480043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2069  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.18 
 
 		 839 aa  345  2e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41452  beta-glucosidase  31.16 
 
 		 851 aa  343  1e-92  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02612  Putative beta-glucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BA18]  29.37 
 
 		 838 aa  342  2e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.314197 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4330  glycoside hydrolase family 3 protein  30.33 
 
 		 836 aa  339  9.999999999999999e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.248566 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1089  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  31.01 
 
 		 818 aa  336  1e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.946532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_65767  beta-glucosidase  30.93 
 
 		 839 aa  332  2e-89  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.893568 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03856  glucan 1,4-beta-glucosidase  30.14 
 
 		 904 aa  325  2e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51227  beta-glucosidase  29.94 
 
 		 843 aa  318  2e-85  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34123  beta-glucosidase  29.41 
 
 		 843 aa  308  3e-82  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0475476 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2625  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  31.18 
 
 		 820 aa  305  2.0000000000000002e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.416366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1217  glycoside hydrolase family 3 protein  30.94 
 
 		 966 aa  301  5e-80  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000342609  normal  0.287325 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0260  Beta-glucosidase  31.3 
 
 		 832 aa  300  6e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0568  glycoside hydrolase family 3 protein  31.47 
 
 		 927 aa  298  4e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6130  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.31 
 
 		 813 aa  290  6e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0369131  decreased coverage  0.00080917 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1659  Beta-glucosidase  31.9 
 
 		 897 aa  290  1e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.287347  normal  0.593766 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07865  beta-glucosidase (Eurofung)  29.73 
 
 		 850 aa  289  2e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.533103  normal  0.802716 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3883  glycoside hydrolase family 3 protein  30.34 
 
 		 875 aa  285  2.0000000000000002e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.128454  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61725  beta-glucosidase  30.78 
 
 		 738 aa  283  1e-74  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.614554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2042  glycoside hydrolase family 3 protein  28.71 
 
 		 886 aa  283  1e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.198368  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00370  beta-glucosidase, putative  28.47 
 
 		 852 aa  282  2e-74  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_1541  beta-glucosidase  30.88 
 
 		 738 aa  282  2e-74  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.36185  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4044  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.6 
 
 		 874 aa  277  6e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2633  hypothetical protein  29.32 
 
 		 805 aa  273  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.732413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1929  Beta-glucosidase  27.89 
 
 		 882 aa  272  2e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2378  Beta-glucosidase  29.45 
 
 		 902 aa  270  8.999999999999999e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0896649  normal  0.197642 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2005  Beta-glucosidase  27.62 
 
 		 882 aa  266  1e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.346494  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01638  glucan 1,4-beta-glucosidase  28.82 
 
 		 889 aa  265  3e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1487  Beta-glucosidase  28.08 
 
 		 893 aa  257  7e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00296047  normal  0.272235 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2419  Beta-glucosidase  28.17 
 
 		 849 aa  248  4e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.326586  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3540  Beta-glucosidase  28.69 
 
 		 816 aa  246  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3246  Beta-glucosidase  27.88 
 
 		 881 aa  244  3.9999999999999997e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.190497  normal  0.145992 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3874  Beta-glucosidase  26.83 
 
 		 864 aa  237  7e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.20174  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0181  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.19 
 
 		 755 aa  231  4e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0270  glycoside hydrolase family 3 protein  40.54 
 
 		 685 aa  229  2e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0456  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.15 
 
 		 497 aa  222  1.9999999999999999e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.402353  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2785  glycoside hydrolase family 3 protein  39.2 
 
 		 762 aa  221  3.9999999999999997e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1256  glycoside hydrolase family protein  40.15 
 
 		 755 aa  220  1e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179739  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0219  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.68 
 
 		 749 aa  218  4e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0289  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.68 
 
 		 758 aa  217  5.9999999999999996e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0775  glycoside hydrolase family 3 protein  34.59 
 
 		 745 aa  217  7e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2404  Beta-glucosidase  27.08 
 
 		 898 aa  207  5e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0886  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.66 
 
 		 751 aa  207  1e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0456  glycoside hydrolase family 3 protein  37.35 
 
 		 760 aa  207  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2530  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.91 
 
 		 748 aa  206  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3389  glycoside hydrolase family 3 protein  31.85 
 
 		 738 aa  205  3e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.461339  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6030  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.85 
 
 		 780 aa  204  7e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0214  glycoside hydrolase family 3 protein  35.5 
 
 		 800 aa  201  3.9999999999999996e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2454  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.59 
 
 		 711 aa  201  3.9999999999999996e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000849999  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1839  glycoside hydrolase family 3 protein  36.39 
 
 		 750 aa  200  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.755932  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02227  Putative beta-glucosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFU7]  35.66 
 
 		 833 aa  199  2.0000000000000003e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0629653 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1569  Beta-glucosidase-related glycosidase  39.34 
 
 		 737 aa  199  2.0000000000000003e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3392  glycoside hydrolase family 3 protein  41.2 
 
 		 814 aa  198  5.000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.538659  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1311  glycoside hydrolase family 3 protein  36.77 
 
 		 708 aa  197  6e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.313843  normal  0.190988 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1022  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.57 
 
 		 758 aa  197  6e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534913  normal  0.0223661 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0447  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.6 
 
 		 734 aa  197  8.000000000000001e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3155  glycoside hydrolase family 3 protein  37.04 
 
 		 740 aa  196  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0875  Beta-glucosidase-related glycosidase  38.55 
 
 		 741 aa  197  1e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.155789  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2836  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31 
 
 		 757 aa  195  4e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.154925  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.1 
 
 		 933 aa  194  6e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0251  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.32 
 
 		 790 aa  194  7e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0332  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.79 
 
 		 757 aa  193  1e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.69655  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1945  beta-glucosidase-like glycosidase  39.62 
 
 		 757 aa  193  1e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0140662  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE05170  Beta-glucosidase precursor, putative  38.57 
 
 		 716 aa  192  2.9999999999999997e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.599947  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1431  glycoside hydrolase family 3 protein  34.19 
 
 		 749 aa  191  7e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3436  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.23 
 
 		 750 aa  190  1e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0398792  decreased coverage  0.00586208 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0920  glycoside hydrolase family 3 protein  31.33 
 
 		 721 aa  190  1e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1494  glycoside hydrolase family 3 protein  37.3 
 
 		 701 aa  190  1e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.643815  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0220  glycoside hydrolase family 3 protein  31.67 
 
 		 721 aa  189  2e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35340  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  41.3 
 
 		 777 aa  189  3e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.142302 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0287  glycoside hydrolase family 3 protein  30.88 
 
 		 717 aa  188  5e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0662  glycoside hydrolase family 3 protein  38.95 
 
 		 747 aa  188  5e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.409181  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2534  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.26 
 
 		 813 aa  186  2.0000000000000003e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  45.04 
 
 		 1072 aa  186  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2418  Beta-glucosidase  37.61 
 
 		 751 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.022971 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0898  glycoside hydrolase family 3 protein  32.12 
 
 		 722 aa  185  3e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2459  Beta-glucosidase  38.44 
 
 		 779 aa  185  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2324  Beta-glucosidase  38.37 
 
 		 748 aa  185  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.887692 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1802  Beta-glucosidase  37.57 
 
 		 751 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2414  Beta-glucosidase  37.57 
 
 		 751 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03903  beta-1,4-glucosidase (Eurofung)  26.26 
 
 		 578 aa  184  7e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.405433  normal  0.387102 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6143  hypothetical protein  35.84 
 
 		 693 aa  183  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601803  normal  0.287239 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>