283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1381 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1381  type II and III secretion system protein  100 
 
 		 759 aa  1537    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.918953  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1029  Type II secretory pathway component PulD-like  36.33 
 
 		 588 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0448021 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4445  type II and III secretion system protein  31.21 
 
 		 457 aa  70.1  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4661  Flp pilus assembly protein secretin CpaC  28.96 
 
 		 443 aa  67.8  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000794738  hitchhiker  0.00340482 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1112  competence protein E  26.54 
 
 		 377 aa  67.4  0.0000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0144354  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1497  type II and III secretion system protein  28.57 
 
 		 443 aa  67  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0318341  hitchhiker  0.0000037114 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1041  type II and III secretion system protein  28.57 
 
 		 443 aa  67  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00604679  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1521  type II and III secretion system protein  28.57 
 
 		 443 aa  67  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00384422  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02594  outer membrane channel signal peptide protein  30.1 
 
 		 454 aa  66.2  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2321  type II and III secretion system protein  29.57 
 
 		 452 aa  65.9  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.278369 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4358  type II and III secretion system protein  29.23 
 
 		 454 aa  66.2  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.970058 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4248  type II and III secretion system protein  29.23 
 
 		 454 aa  66.2  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.218711 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0471  type IV pilus biogenesis protein PilQ  24.44 
 
 		 706 aa  65.5  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.986864  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4391  type II and III secretion system protein  28.57 
 
 		 416 aa  65.1  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.260079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1653  type II and III secretion system protein  28.19 
 
 		 468 aa  65.5  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.745375 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1836  type II and III secretion system protein  28.64 
 
 		 494 aa  64.3  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2798  putative outer membrane channel signal peptide protein, CpaC like  27.66 
 
 		 454 aa  64.3  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.395631 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2255  type II and III secretion system protein  29.73 
 
 		 372 aa  64.3  0.000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.936423  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0003  general secretion pathway protein D  25.71 
 
 		 655 aa  62.8  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0438473 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4851  bacterial type II/III secretion system protein  28 
 
 		 419 aa  63.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0322  outer membrane porin HofQ  30 
 
 		 386 aa  62.8  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000700239  normal  0.175294 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1642  type II and III secretion system protein  29.41 
 
 		 453 aa  63.2  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00375821  normal  0.501633 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3687  outer membrane porin HofQ  30.63 
 
 		 389 aa  62.4  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00260345  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2542  type II/III secretion system protein  29.48 
 
 		 441 aa  62.4  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3794  outer membrane porin HofQ  30.63 
 
 		 426 aa  62.4  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.566687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3587  outer membrane porin HofQ  30 
 
 		 412 aa  62.8  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000785668  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3760  outer membrane porin HofQ  30.63 
 
 		 426 aa  62.4  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00726017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2162  type II and III secretion system protein  27.63 
 
 		 428 aa  62  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.080237 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4150  general secretion pathway protein D  26.84 
 
 		 829 aa  61.6  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0456168  hitchhiker  0.0000162446 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1309  general secretion pathway protein D  22.18 
 
 		 819 aa  61.6  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0418049  normal  0.0430257 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03243  predicted fimbrial transporter  30 
 
 		 412 aa  60.8  0.00000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00734996  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0322  type IV pilus secretin PilQ  30 
 
 		 412 aa  61.2  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000212409  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03195  hypothetical protein  30 
 
 		 412 aa  60.8  0.00000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0104711  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3667  outer membrane porin HofQ  30 
 
 		 412 aa  60.8  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000045876  normal  0.0733814 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3861  outer membrane porin HofQ  30 
 
 		 412 aa  61.2  0.00000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000844499  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4695  outer membrane porin HofQ  30 
 
 		 412 aa  61.2  0.00000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00163721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2326  type II and III secretion system protein  30.29 
 
 		 478 aa  60.8  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.434108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2704  type II/III secretion system protein  30.29 
 
 		 478 aa  60.8  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1778  type II/III secretion system protein  29.48 
 
 		 441 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3768  outer membrane porin HofQ  30 
 
 		 412 aa  60.5  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000640301  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1290  type II/III secretion system protein  29.48 
 
 		 432 aa  60.8  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1941  type II/III secretion system protein  29.48 
 
 		 441 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0187984  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1789  type II/III secretion system protein  29.48 
 
 		 432 aa  60.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0848  type II and III secretion system protein  25.75 
 
 		 419 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1048  type II/III secretion system protein  29.48 
 
 		 432 aa  60.8  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.827787  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1768  type II/III secretion system protein  29.48 
 
 		 441 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.477043  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0117  type II/III secretion system protein  29.48 
 
 		 441 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.821295  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3269  general secretion pathway protein D  25.52 
 
 		 640 aa  60.1  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000207036  hitchhiker  0.00000000000000178028 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1004  general secretion pathway protein D  25.52 
 
 		 640 aa  59.3  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1743  type II and III secretion system protein  25.38 
 
 		 1302 aa  59.7  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0953  general secretion pathway protein D  25.52 
 
 		 640 aa  60.1  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.198389  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1403  type II and III secretion system protein  27.73 
 
 		 444 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0690  type IV pilus secretin PilQ  26.63 
 
 		 893 aa  58.9  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2795  type IV pilus secretin PilQ  24.41 
 
 		 523 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.747994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2072  type II and III secretion system protein  30.12 
 
 		 492 aa  58.5  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00565214  normal  0.624153 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0206  type IV pilus assembly protein PilQ  22.37 
 
 		 745 aa  57.8  0.0000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.292447  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0679  type IV pilus secretin PilQ  24.85 
 
 		 887 aa  57.8  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0645  type II and III secretion system protein, secretin  24.85 
 
 		 882 aa  57.8  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0679  type IV pilus secretin PilQ  24.85 
 
 		 887 aa  57.4  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1732  type II and III secretion system protein  27.59 
 
 		 443 aa  57  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793195  hitchhiker  0.00000430206 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2860  general secretion pathway protein D  23.68 
 
 		 640 aa  57.4  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4751  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  25.28 
 
 		 680 aa  57.4  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.552593 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001892  general secretion pathway protein D/type II secretion outermembrane pore forming protein (PulD)  26.34 
 
 		 672 aa  56.2  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0097  general secretion pathway protein D  24.55 
 
 		 662 aa  56.2  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.395857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3741  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  25.66 
 
 		 678 aa  55.8  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.452401  normal  0.0121623 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1443  type II and III secretion system protein  27.59 
 
 		 461 aa  55.8  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.549017 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4251  general secretion pathway protein D  24.64 
 
 		 660 aa  55.8  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0106048 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1384  type II and III secretion system protein  26.06 
 
 		 563 aa  55.8  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.157655  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2924  general secretion pathway protein D  25.41 
 
 		 675 aa  55.8  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5409  type II and III secretion system protein  28.48 
 
 		 469 aa  55.5  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.28985  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03956  general secretion pathway protein D  26.19 
 
 		 681 aa  55.1  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0648  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  27.11 
 
 		 601 aa  55.1  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.778085  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1056  type II and III secretion system protein  24.9 
 
 		 541 aa  55.1  0.000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.0036675  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2703  type II and III secretion system protein  28.14 
 
 		 499 aa  55.1  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.523249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1439  type II secretion system protein D  23.78 
 
 		 656 aa  55.1  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0989759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1412  general secretion pathway protein D  22.46 
 
 		 640 aa  55.1  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3728  putative outer membrane porin HofQ  24.52 
 
 		 500 aa  54.7  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000295342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0955  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.82 
 
 		 220 aa  54.7  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00601  general secretion pathway protein D  25.95 
 
 		 658 aa  54.7  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3815  TPR repeat-containing protein  27.91 
 
 		 399 aa  54.3  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1602  type II/III secretion system protein  27.11 
 
 		 599 aa  54.7  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.0044992  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2249  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  27.11 
 
 		 601 aa  54.7  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2165  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  27.11 
 
 		 599 aa  54.7  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0224  putative outer membrane porin HofQ  24.52 
 
 		 460 aa  54.7  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000817003  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0666  type II/III secretion system protein  27.11 
 
 		 599 aa  54.7  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1987  type II/III secretion system protein  27.11 
 
 		 599 aa  54.7  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.76891  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3967  putative outer membrane porin HofQ  24.52 
 
 		 458 aa  54.3  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171425  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4228  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  24.91 
 
 		 681 aa  54.3  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0070  type II and III secretion system protein  26.04 
 
 		 461 aa  54.3  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.838423 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2057  type II and III secretion system protein  29.49 
 
 		 460 aa  53.5  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.127382  normal  0.0564414 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1406  type II and III secretion system protein  26.96 
 
 		 538 aa  53.9  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.7882  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2013  type II and III secretion system protein  25.85 
 
 		 478 aa  53.5  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3804  outer membrane porin HofQ  27.22 
 
 		 413 aa  53.9  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0625572  normal  0.855535 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1994  type II and III secretion system protein  22.92 
 
 		 499 aa  53.9  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55920  putative type II secretion system protein  26.19 
 
 		 416 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0275442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0233  type II and III secretion system protein  25.62 
 
 		 491 aa  53.9  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2827  type II and III secretion system protein  25.63 
 
 		 494 aa  53.9  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.59291  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3213  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 227 aa  53.5  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0678  general secretion pathway protein D  24.72 
 
 		 720 aa  53.1  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00783707  decreased coverage  0.00018208 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1336  type II and III secretion system protein  27.38 
 
 		 653 aa  53.1  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.474923  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>