73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1307 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1307  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 483 aa  956    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1301  polysaccharide biosynthesis protein  97.72 
 
 		 483 aa  910    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0941  polysaccharide biosynthesis protein  96.69 
 
 		 483 aa  909    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0306  polysaccharide biosynthesis protein  49.03 
 
 		 467 aa  431  1e-119  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0582  polysaccharide biosynthesis protein  41.84 
 
 		 479 aa  390  1e-107  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0243  polysaccharide biosynthesis protein  26.51 
 
 		 472 aa  172  1e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117195 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0834  polysaccharide biosynthesis protein  29.29 
 
 		 471 aa  152  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00716427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2124  hypothetical protein  26.54 
 
 		 461 aa  144  5e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.553505 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1476  polysaccharide biosynthesis protein  31.34 
 
 		 478 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.41524 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0637  polysaccharide biosynthesis protein  26.24 
 
 		 468 aa  126  7e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0528  cytosol aminopeptidase  26.5 
 
 		 464 aa  121  3e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0621  polysaccharide biosynthesis protein  21.08 
 
 		 475 aa  94.7  3e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.914686  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0772  polysaccharide biosynthesis protein  23.24 
 
 		 488 aa  92.4  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330011  normal  0.358074 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0605  polysaccharide biosynthesis protein  26.79 
 
 		 474 aa  90.1  8e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000992142  hitchhiker  0.0000000137366 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2459  polysaccharide biosynthesis protein  25.13 
 
 		 490 aa  87.8  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0722  hypothetical protein  23.62 
 
 		 430 aa  80.1  0.00000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.443233  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3254  polysaccharide biosynthesis protein  23.49 
 
 		 482 aa  77.4  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1240  polysaccharide biosynthesis protein  23.46 
 
 		 493 aa  76.3  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.554345  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03555  polysaccharide biosynthesis protein  24.01 
 
 		 461 aa  75.9  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3014  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  21.76 
 
 		 422 aa  73.9  0.000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1162  polysaccharide biosynthesis protein CpsL  22.04 
 
 		 466 aa  72.4  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.333664  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0018  polysaccharide biosynthesis protein; permease component  23.58 
 
 		 506 aa  69.7  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0440  polysaccharide biosynthesis protein  24.23 
 
 		 501 aa  68.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.830934  normal  0.330866 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0406  polysaccharide biosynthesis protein  24.66 
 
 		 497 aa  68.6  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.260793 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1062  multi anti extrusion protein MatE  22.99 
 
 		 464 aa  67.8  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2128  polysaccharide biosynthesis protein  22.34 
 
 		 472 aa  66.2  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00415238  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1963  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  21.83 
 
 		 518 aa  65.5  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.876605  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2664  hypothetical protein  20.85 
 
 		 485 aa  65.9  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2862  polysaccharide biosynthesis protein  27.52 
 
 		 500 aa  64.3  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0804  hypothetical protein  23.33 
 
 		 493 aa  63.5  0.000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.288732 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2481  polysaccharide biosynthesis protein  21.98 
 
 		 477 aa  62.4  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206749  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1812  polysaccharide biosynthesis protein  22.2 
 
 		 482 aa  60.1  0.00000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.916384  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2100  putative polysaccharide biosynthesis protein  20.26 
 
 		 415 aa  60.1  0.00000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30181  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3259  polysaccharide biosynthesis protein  22.36 
 
 		 418 aa  59.3  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0336  polysaccharide biosynthesis protein  25.56 
 
 		 504 aa  59.3  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0302  putative polysaccharide biosynthesis protein  22.9 
 
 		 480 aa  58.2  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0469  polysaccharide biosynthesis protein  24.42 
 
 		 511 aa  57  0.0000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  20.79 
 
 		 517 aa  57  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1745  polysaccharide biosynthesis protein  23.53 
 
 		 507 aa  55.5  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.183747 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  26.3 
 
 		 423 aa  55.1  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0093  polysaccharide biosynthesis protein  20.75 
 
 		 496 aa  53.9  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  23.53 
 
 		 488 aa  53.9  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3073  polysaccharide biosynthesis protein  22.51 
 
 		 491 aa  53.9  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1481  polysaccharide biosynthesis protein  23.71 
 
 		 471 aa  53.5  0.000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.297126  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0341  polysaccharide biosynthesis protein  23.21 
 
 		 500 aa  52.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.467363  decreased coverage  0.0000100108 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1772  polysaccharide biosynthesis protein  23.45 
 
 		 496 aa  52  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  22.59 
 
 		 477 aa  52.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0438  polysaccharide biosynthesis protein  24.81 
 
 		 504 aa  51.6  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0414  polysaccharide biosynthesis protein  28.11 
 
 		 500 aa  51.6  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37906  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0744  polysaccharide biosynthesis protein  26.36 
 
 		 436 aa  51.2  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.923042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02224  hypothetical protein  21.64 
 
 		 473 aa  50.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2892  polysaccharide biosynthesis protein  26.46 
 
 		 429 aa  50.8  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1714  polysaccharide biosynthesis protein  24.64 
 
 		 483 aa  50.8  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0396788  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  23.62 
 
 		 444 aa  50.8  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0234  lipopolysaccharide O-side chain biosynthesis protein (O-antigen transpoter)  24.76 
 
 		 476 aa  50.8  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00421263  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1525  polysaccharide biosynthesis protein  20.64 
 
 		 475 aa  49.3  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5446  polysaccharide biosynthesis protein  23.58 
 
 		 511 aa  49.7  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.556135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003537  putative lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.77 
 
 		 476 aa  49.7  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2435  polysaccharide biosynthesis protein  22.49 
 
 		 481 aa  48.9  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0416  polysaccharide biosynthesis protein  24.43 
 
 		 506 aa  48.5  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.484223  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0508  polysaccharide biosynthesis protein  23.35 
 
 		 505 aa  48.9  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0417  polysaccharide biosynthesis protein  22.04 
 
 		 512 aa  48.9  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3842  polysaccharide biosynthesis protein  22.17 
 
 		 499 aa  48.9  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.289536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  23 
 
 		 444 aa  48.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0403  polysaccharide biosynthesis protein  21.71 
 
 		 504 aa  47.8  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.963909  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1078  polysaccharide biosynthesis protein  25.12 
 
 		 424 aa  46.2  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  21.92 
 
 		 483 aa  45.8  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0253  polysaccharide biosynthesis protein  23.83 
 
 		 435 aa  45.1  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000123579  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3876  polysaccharide biosynthesis protein  26.86 
 
 		 427 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1071  polysaccharide biosynthesis protein  26.46 
 
 		 489 aa  44.7  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  20.97 
 
 		 490 aa  44.3  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4497  polysaccharide biosynthesis protein  26.09 
 
 		 472 aa  43.9  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1495  polysaccharide biosynthesis protein  22.59 
 
 		 503 aa  43.9  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.994963  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>