More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0514 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0514  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
409 aa  829    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2330  Extracellular ligand-binding receptor  34.15 
 
 
386 aa  208  2e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1675  Extracellular ligand-binding receptor  30.39 
 
 
387 aa  187  2e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0898959 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1941  Extracellular ligand-binding receptor  25.62 
 
 
416 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2285  extracellular ligand-binding receptor  26.25 
 
 
417 aa  103  7e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0806  leucine-, isoleucine-, valine-, threonine-, and alanine-binding protein  40.28 
 
 
162 aa  101  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.743706  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1455  extracellular ligand-binding receptor  26.85 
 
 
402 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179211  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2019  extracellular ligand-binding receptor  28.88 
 
 
374 aa  100  5e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1418  extracellular ligand-binding receptor  28.34 
 
 
404 aa  97.1  5e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1815  extracellular ligand-binding receptor  24.37 
 
 
419 aa  96.7  7e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00146471 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0314  extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 
397 aa  95.5  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.568066  normal  0.496718 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0219  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.76 
 
 
376 aa  95.1  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00187981  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1439  Extracellular ligand-binding receptor  27.18 
 
 
383 aa  94.4  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.249756  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1534  Extracellular ligand-binding receptor  26.92 
 
 
383 aa  94  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.688038  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2424  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  27.18 
 
 
383 aa  94  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.806831  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0932  Extracellular ligand-binding receptor  29.14 
 
 
376 aa  93.2  8e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000568006  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1580  Extracellular ligand-binding receptor  24.47 
 
 
394 aa  92.8  9e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3294  hypothetical protein  28.53 
 
 
383 aa  92  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.953272  normal  0.0380984 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0317  extracellular ligand-binding receptor  25.36 
 
 
382 aa  90.9  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00438106  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4089  putative branched-chain amino acid ABC transporter (substrate-binding protein)  23.76 
 
 
428 aa  90.9  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120438  normal  0.0681352 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2005  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  26.2 
 
 
385 aa  90.5  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.635473  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2965  extracellular ligand-binding receptor  24.13 
 
 
413 aa  90.1  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.820015  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0836  extracellular ligand-binding receptor  26.8 
 
 
390 aa  89.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0783302 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0064  Extracellular ligand-binding receptor  21.53 
 
 
421 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2023  Extracellular ligand-binding receptor  26.94 
 
 
415 aa  89  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4759  extracellular ligand-binding receptor  23.02 
 
 
421 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4762  extracellular ligand-binding receptor  22.78 
 
 
424 aa  86.7  7e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.78314 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3994  extracellular ligand-binding receptor  28.57 
 
 
339 aa  85.9  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000070067  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0805  Extracellular ligand-binding receptor  26.55 
 
 
384 aa  85.1  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.822655  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6002  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component  26.51 
 
 
389 aa  83.2  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.0284097 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0853  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  25.85 
 
 
381 aa  83.2  0.000000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.18061  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1830  Extracellular ligand-binding receptor  24.21 
 
 
381 aa  82.4  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000559355  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1490  Extracellular ligand-binding receptor  25.61 
 
 
397 aa  82  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2499  twin-arginine translocation pathway signal  25.57 
 
 
407 aa  81.3  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2502  Extracellular ligand-binding receptor  27.6 
 
 
400 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4443  extracellular ligand-binding receptor  26.72 
 
 
413 aa  80.5  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2425  extracellular ligand-binding receptor  27.37 
 
 
411 aa  80.5  0.00000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1392  Extracellular ligand-binding receptor  24.75 
 
 
382 aa  80.1  0.00000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.54413  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2303  extracellular ligand-binding receptor  25.31 
 
 
432 aa  80.1  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.620777 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0635  Extracellular ligand-binding receptor  25.06 
 
 
378 aa  79.7  0.00000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000043194  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3837  extracellular ligand-binding receptor  39.68 
 
 
395 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3558  Extracellular ligand-binding receptor  25.14 
 
 
415 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.987899  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1137  Extracellular ligand-binding receptor  25.59 
 
 
393 aa  79  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0165472  normal  0.816566 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2607  Extracellular ligand-binding receptor  26.6 
 
 
372 aa  79  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1972  extracellular ligand-binding receptor  26.9 
 
 
403 aa  79.3  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0326  extracellular ligand-binding receptor  24.07 
 
 
441 aa  78.6  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.933316  normal  0.182521 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2165  extracellular ligand-binding receptor  41.88 
 
 
390 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1830  Extracellular ligand-binding receptor  23.95 
 
 
375 aa  78.6  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.290342  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2556  branched chain amino acid ABC transporter (substrate-binding protein)  26.65 
 
 
392 aa  78.6  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00169682  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2306  Extracellular ligand-binding receptor  25.84 
 
 
419 aa  77.8  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.110917  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1288  extracellular ligand-binding receptor  25.21 
 
 
415 aa  77  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.166473  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1450  Extracellular ligand-binding receptor  25.21 
 
 
415 aa  77  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.702119  normal  0.714217 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0350  extracellular ligand-binding receptor  26.18 
 
 
376 aa  77  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000281139  normal  0.291499 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2341  extracellular ligand-binding receptor  28.33 
 
 
405 aa  77.4  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.840598  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1478  Extracellular ligand-binding receptor  23.34 
 
 
376 aa  77  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2020  extracellular ligand-binding receptor  25.89 
 
 
384 aa  77  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.168799 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3401  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  24.86 
 
 
396 aa  77  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.232513  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3504  extracellular ligand-binding receptor  22.19 
 
 
392 aa  76.3  0.0000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0407454  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4471  extracellular ligand-binding receptor  29.48 
 
 
373 aa  76.3  0.0000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1095  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.76 
 
 
406 aa  75.5  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1524  extracellular ligand-binding receptor  24.59 
 
 
459 aa  75.9  0.000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0533175  normal  0.466259 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5857  extracellular ligand-binding receptor  26 
 
 
411 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.101493  normal  0.03083 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0398  ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  27.08 
 
 
391 aa  75.9  0.000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000849541  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2306  extracellular ligand-binding receptor  22.25 
 
 
376 aa  75.5  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1193  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  25.76 
 
 
406 aa  75.5  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31768  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0482  extracellular ligand-binding receptor  23.81 
 
 
412 aa  75.1  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1065  Extracellular ligand-binding receptor  24.86 
 
 
381 aa  75.5  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000196823  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2502  extracellular ligand-binding receptor  27.95 
 
 
399 aa  75.5  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.101059  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3645  extracellular ligand-binding receptor  25.71 
 
 
401 aa  74.7  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.218866  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3968  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  23.8 
 
 
417 aa  74.7  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0172  Extracellular ligand-binding receptor  25.91 
 
 
395 aa  74.3  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0221424  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4064  extracellular ligand-binding receptor  27.2 
 
 
401 aa  74.3  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00184477  normal  0.421947 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3551  extracellular ligand-binding receptor  24.86 
 
 
389 aa  74.7  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0154  extracellular ligand-binding receptor  25.91 
 
 
395 aa  74.3  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5340  Extracellular ligand-binding receptor  38.02 
 
 
396 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.200092  normal  0.984381 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4853  extracellular ligand-binding receptor  38.02 
 
 
396 aa  73.9  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2397  extracellular ligand-binding receptor  23.32 
 
 
372 aa  73.9  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.285564  normal  0.778884 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2302  Extracellular ligand-binding receptor  26.61 
 
 
410 aa  73.6  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5603  Extracellular ligand-binding receptor  26.57 
 
 
393 aa  73.6  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.442467  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2935  extracellular ligand-binding receptor  25.14 
 
 
386 aa  73.6  0.000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.412779  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2140  extracellular ligand-binding receptor  25.5 
 
 
407 aa  73.6  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.285517 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5105  extracellular ligand-binding receptor  24.1 
 
 
381 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.140418  decreased coverage  0.00222912 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0404  extracellular ligand-binding receptor  24.06 
 
 
409 aa  72.8  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0168747  normal  0.259327 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0645  extracellular ligand-binding receptor  34.65 
 
 
386 aa  72.8  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0857  extracellular ligand-binding receptor  24.92 
 
 
411 aa  72.4  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0612  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched chain amino acid-binding protein  24.53 
 
 
371 aa  72.8  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0531  extracellular ligand-binding receptor  22.66 
 
 
386 aa  72.4  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000267349  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1520  extracellular ligand-binding receptor  24.86 
 
 
381 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.657552  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3724  extracellular ligand-binding receptor  24.71 
 
 
384 aa  72.4  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.159594  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1544  extracellular ligand-binding receptor  24.88 
 
 
428 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0549  extracellular ligand-binding receptor  24.18 
 
 
413 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2945  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25 
 
 
377 aa  72  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.994918 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1966  Extracellular ligand-binding receptor  37.19 
 
 
396 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0542442 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2148  extracellular ligand-binding receptor  36.36 
 
 
390 aa  71.6  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5833  extracellular ligand-binding receptor  22.13 
 
 
382 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00373072 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4469  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.2 
 
 
404 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4100  extracellular ligand-binding receptor  22.25 
 
 
387 aa  71.2  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.199713  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4935  Extracellular ligand-binding receptor  23.05 
 
 
389 aa  71.2  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1322  extracellular ligand-binding receptor  23.92 
 
 
418 aa  70.9  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0679703  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3401  extracellular ligand-binding receptor  23.18 
 
 
381 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.526257  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>