More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0806 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_0806  secretion protein HlyD  100 
 
 		 371 aa  740    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1117  efflux transporter, RND family, MFP subunit  55.81 
 
 		 376 aa  373  1e-102  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0140148  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1564  RND family efflux transporter MFP subunit  51.25 
 
 		 369 aa  354  1e-96  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000112948  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1433  efflux transporter, RND family, MFP subunit  50.82 
 
 		 373 aa  323  4e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.195416  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1400  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.76 
 
 		 399 aa  323  4e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000127527  normal  0.840586 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1067  efflux transporter, RND family, MFP subunit  50.45 
 
 		 391 aa  320  3e-86  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000252486  hitchhiker  0.000793327 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1204  secretion protein HlyD  47.65 
 
 		 395 aa  311  1e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.377097  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2783  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.96 
 
 		 393 aa  291  9e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00987855 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2259  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.95 
 
 		 397 aa  291  1e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.141283  normal  0.411522 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3575  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.09 
 
 		 379 aa  290  2e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0183852  normal  0.158176 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4132  RND family efflux transporter MFP subunit  40.81 
 
 		 384 aa  284  2.0000000000000002e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4299  RND family efflux transporter MFP subunit  41.18 
 
 		 405 aa  279  6e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6106  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.97 
 
 		 378 aa  278  1e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0822  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.81 
 
 		 390 aa  270  2.9999999999999997e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191782  normal  0.633382 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3019  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.95 
 
 		 378 aa  269  7e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.809394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1188  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.38 
 
 		 389 aa  264  1e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1247  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.57 
 
 		 389 aa  263  2e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.374762  normal  0.534332 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2173  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.18 
 
 		 393 aa  260  3e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4802  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.33 
 
 		 398 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000012488 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0292  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.26 
 
 		 366 aa  242  7e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.390239  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10068  Secretion protein HlyD  39.22 
 
 		 367 aa  239  5e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.305445  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5537  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.41 
 
 		 375 aa  236  5.0000000000000005e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.728308  normal  0.481729 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3228  RND family efflux transporter MFP subunit  36.27 
 
 		 378 aa  220  1.9999999999999999e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0806  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.24 
 
 		 380 aa  220  3.9999999999999997e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3340  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.36 
 
 		 371 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0315517 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4642  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.79 
 
 		 383 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.195012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2953  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.91 
 
 		 360 aa  194  2e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6592  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.92 
 
 		 378 aa  192  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5179  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.62 
 
 		 361 aa  189  8e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00472624 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4863  RND family efflux transporter MFP subunit  33.44 
 
 		 360 aa  184  2.0000000000000003e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.176323  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3238  RND family efflux transporter MFP subunit  32.1 
 
 		 368 aa  176  6e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5359  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.15 
 
 		 360 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.954819  normal  0.588118 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1458  RND family efflux transporter MFP subunit  34.31 
 
 		 422 aa  173  5e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.235103  hitchhiker  0.000537348 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1728  secretion protein HlyD  30.31 
 
 		 363 aa  172  5.999999999999999e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0143164  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2230  RND family efflux transporter MFP subunit  30.94 
 
 		 362 aa  171  3e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0809  secretion protein HlyD  33.07 
 
 		 392 aa  171  3e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.165865 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0537  HlyD family multidrug resistance protein  32.58 
 
 		 381 aa  168  1e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.996753  normal  0.690705 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0374  secretion protein HlyD  29.59 
 
 		 368 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0795061 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2947  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.94 
 
 		 363 aa  164  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4407  RND family efflux transporter MFP subunit  32.32 
 
 		 360 aa  161  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003895  membrane fusion protein of RND family multidrug efflux pump  29.95 
 
 		 379 aa  158  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00341624  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3715  RND family efflux transporter MFP subunit  31.87 
 
 		 382 aa  158  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.970475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3680  secretion protein HlyD family protein  31.46 
 
 		 405 aa  157  4e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1026  RND family efflux transporter MFP subunit  30.73 
 
 		 384 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.933063 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4070  secretion protein HlyD  31.13 
 
 		 405 aa  156  5.0000000000000005e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.409958  normal  0.154431 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4007  secretion protein HlyD  29.55 
 
 		 386 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.430649  normal  0.0665893 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1701  secretion protein HlyD  31.89 
 
 		 412 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.17328  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4303  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.55 
 
 		 386 aa  153  4e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4427  RND family efflux transporter MFP subunit  30.17 
 
 		 384 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123796 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4337  RND family efflux transporter MFP subunit  30.19 
 
 		 384 aa  152  7e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.235617 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.87 
 
 		 395 aa  152  7e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.279031  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2369  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.32 
 
 		 433 aa  152  8e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.137399  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1386  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.19 
 
 		 384 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.178254 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1193  HlyD family secretion protein  30.4 
 
 		 386 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000622308  normal  0.342064 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0982  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.86 
 
 		 363 aa  152  8.999999999999999e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3063  secretion protein HlyD  33.43 
 
 		 412 aa  152  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000572272  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6463  RND family efflux transporter MFP subunit  31.22 
 
 		 418 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984064  normal  0.35165 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1849  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31 
 
 		 422 aa  150  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00425578 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0525  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexA precursor  30.52 
 
 		 442 aa  150  4e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2697  multidrug resistance protein  31.77 
 
 		 400 aa  149  8e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0906  RND family efflux transporter MFP subunit  29.88 
 
 		 391 aa  149  8e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2066  secretion protein HlyD  30.06 
 
 		 428 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.567226  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0011  acriflavin resistance lipoprotein A precursor  31.32 
 
 		 398 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.511373  normal  0.0259122 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3579  putative transmembrane multidrug efflux system transmembrane protein  32.59 
 
 		 414 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5599  secretion protein HlyD  30.66 
 
 		 418 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5963  RND family efflux transporter MFP subunit  30.66 
 
 		 418 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0363452 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1229  RND efflux system membrane fusion protein  31.14 
 
 		 428 aa  147  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0847833 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05530  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexA precursor  30.53 
 
 		 383 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44050  multidrug efflux pump membrane fusion protein  31.58 
 
 		 427 aa  147  4.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3586  RND family efflux transporter MFP subunit  30.66 
 
 		 386 aa  147  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4006  RND family efflux transporter MFP subunit  30.66 
 
 		 386 aa  146  5e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0295  HlyD family secretion protein  32.68 
 
 		 405 aa  146  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3601  secretion protein HlyD  28.61 
 
 		 386 aa  146  5e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.804898  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4918  RND family efflux transporter MFP subunit  32.59 
 
 		 405 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.890764  normal  0.731397 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3014  secretion protein HlyD  32.59 
 
 		 405 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5352  RND family efflux transporter MFP subunit  32.59 
 
 		 405 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.730017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3800  RND family efflux transporter MFP subunit  29.36 
 
 		 404 aa  145  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.582867  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0504  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.33 
 
 		 399 aa  145  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.196433  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5230  RND family efflux transporter MFP subunit  32.12 
 
 		 405 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0639393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4699  RND family efflux transporter MFP subunit  32.12 
 
 		 405 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1418  secretion protein HlyD  33.04 
 
 		 400 aa  144  3e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3493  RND family efflux transporter MFP subunit  29.59 
 
 		 381 aa  144  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0569  RND family efflux transporter MFP subunit  32.53 
 
 		 381 aa  143  4e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1836  multidrug efflux transport protein EefA  31.39 
 
 		 373 aa  142  8e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000609578 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1593  secretion protein HlyD  32.02 
 
 		 400 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000034507  unclonable  0.000000261884 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3923  multidrug efflux system protein  29.75 
 
 		 387 aa  141  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0287  acridine efflux pump  30.62 
 
 		 394 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1127  RND family efflux transporter MFP subunit  29.2 
 
 		 395 aa  141  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.295973  unclonable  0.0000000230672 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2106  RND family efflux transporter MFP subunit  32.68 
 
 		 408 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.553946  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5503  RND family efflux transporter MFP subunit  30.4 
 
 		 445 aa  140  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00522591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3367  RND family efflux transporter MFP subunit  27.81 
 
 		 480 aa  140  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.324035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0647  RND family efflux transporter MFP subunit  30.4 
 
 		 425 aa  140  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0849  secretion protein HlyD  28.88 
 
 		 441 aa  140  3e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3719  RND family efflux transporter MFP subunit  32.26 
 
 		 353 aa  140  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4831  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.06 
 
 		 424 aa  140  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.630346  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3468  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.81 
 
 		 393 aa  140  3.9999999999999997e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.143252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6992  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.97 
 
 		 415 aa  138  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0501  RND family efflux transporter MFP subunit  29.59 
 
 		 430 aa  139  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3456  RND family efflux transporter MFP subunit  31.25 
 
 		 391 aa  139  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3047  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.58 
 
 		 396 aa  138  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.376069  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>